MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007766	AGCC	2	8	198972	198979	25 %	0 %	25 %	50 %	86360919
4502	NC_007766	GATC	2	8	199039	199046	25 %	25 %	25 %	25 %	86360919
4503	NC_007766	GGC	2	6	199074	199079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360919
4504	NC_007766	CG	3	6	199087	199092	0 %	0 %	50 %	50 %	86360919
4505	NC_007766	CGG	2	6	199143	199148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360919
4506	NC_007766	ATC	2	6	199196	199201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360919
4507	NC_007766	GCG	2	6	199216	199221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360919
4508	NC_007766	GA	3	6	199284	199289	50 %	0 %	50 %	0 %	86360919
4509	NC_007766	AGGC	2	8	199291	199298	25 %	0 %	50 %	25 %	86360919
4510	NC_007766	CTG	2	6	199347	199352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_007766	TTTC	2	8	199417	199424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_007766	AAAG	2	8	199426	199433	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_007766	ACG	2	6	199484	199489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360920
4514	NC_007766	GCTGGC	2	12	199503	199514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86360920
4515	NC_007766	TGA	2	6	199637	199642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360920
4516	NC_007766	ATC	2	6	199661	199666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360920
4517	NC_007766	TCG	2	6	199718	199723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360920
4518	NC_007766	CTG	2	6	199725	199730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360920
4519	NC_007766	GTCG	2	8	199731	199738	0 %	25 %	50 %	25 %	86360920
4520	NC_007766	GCG	3	9	199739	199747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360920
4521	NC_007766	TCT	2	6	199809	199814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360920
4522	NC_007766	AGG	2	6	199871	199876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360920
4523	NC_007766	CTTC	2	8	199895	199902	0 %	50 %	0 %	50 %	86360920
4524	NC_007766	CGT	2	6	199928	199933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360920
4525	NC_007766	TC	3	6	199940	199945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_007766	CGC	2	6	200017	200022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_007766	GCA	2	6	200037	200042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_007766	GAT	2	6	200058	200063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_007766	GCC	2	6	200092	200097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_007766	TGC	2	6	200149	200154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360921
4531	NC_007766	GAA	2	6	200163	200168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360921
4532	NC_007766	TTC	2	6	200169	200174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360921
4533	NC_007766	GC	3	6	200177	200182	0 %	0 %	50 %	50 %	86360921
4534	NC_007766	CGA	2	6	200189	200194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360921
4535	NC_007766	TCG	2	6	200350	200355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360921
4536	NC_007766	CCG	2	6	200366	200371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360921
4537	NC_007766	TGCA	2	8	200374	200381	25 %	25 %	25 %	25 %	86360921
4538	NC_007766	GCT	3	9	200405	200413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360921
4539	NC_007766	TTG	2	6	200440	200445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360921
4540	NC_007766	ACGC	2	8	200460	200467	25 %	0 %	25 %	50 %	86360921
4541	NC_007766	TCT	2	6	200489	200494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360921
4542	NC_007766	GCC	2	6	200503	200508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360921
4543	NC_007766	TCA	2	6	200546	200551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360921
4544	NC_007766	TTC	2	6	200602	200607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360921
4545	NC_007766	AGC	2	6	200696	200701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360921
4546	NC_007766	GAC	2	6	200739	200744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360921
4547	NC_007766	TCT	2	6	200965	200970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360922
4548	NC_007766	CGG	2	6	201065	201070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360922
4549	NC_007766	ATG	2	6	201072	201077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360922
4550	NC_007766	GAT	2	6	201098	201103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360922
4551	NC_007766	GCCGAA	2	12	201119	201130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360922
4552	NC_007766	CCGG	2	8	201237	201244	0 %	0 %	50 %	50 %	86360922
4553	NC_007766	GAG	2	6	201305	201310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360922
4554	NC_007766	GAA	2	6	201323	201328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360922
4555	NC_007766	CGG	2	6	201427	201432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360922
4556	NC_007766	TCG	2	6	201442	201447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360922
4557	NC_007766	TCA	2	6	201448	201453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360922
4558	NC_007766	CGA	2	6	201484	201489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360922
4559	NC_007766	GAA	2	6	201518	201523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360922
4560	NC_007766	AGC	2	6	201537	201542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360922
4561	NC_007766	CCAG	2	8	201547	201554	25 %	0 %	25 %	50 %	86360922
4562	NC_007766	ACG	2	6	201555	201560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360922
4563	NC_007766	GCG	2	6	201577	201582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360922
4564	NC_007766	CAT	2	6	201725	201730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_007766	GAA	2	6	201731	201736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_007766	TCG	2	6	201757	201762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_007766	CCGC	2	8	201862	201869	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4568	NC_007766	GGT	2	6	201877	201882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360923
4569	NC_007766	AGA	2	6	202028	202033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360923
4570	NC_007766	CGA	2	6	202095	202100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360923
4571	NC_007766	GAC	2	6	202101	202106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360923
4572	NC_007766	ATC	2	6	202140	202145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360923
4573	NC_007766	ACTTC	2	10	202172	202181	20 %	40 %	0 %	40 %	86360923
4574	NC_007766	AGGC	2	8	202205	202212	25 %	0 %	50 %	25 %	86360923
4575	NC_007766	GC	3	6	202211	202216	0 %	0 %	50 %	50 %	86360923
4576	NC_007766	CGG	2	6	202217	202222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360923
4577	NC_007766	CGA	2	6	202280	202285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360923
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4580	NC_007766	CAG	2	6	202340	202345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360923
4581	NC_007766	TAA	3	9	202354	202362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360923
4582	NC_007766	CATG	2	8	202418	202425	25 %	25 %	25 %	25 %	86360923
4583	NC_007766	GCCC	2	8	202434	202441	0 %	0 %	25 %	75 %	86360923
4584	NC_007766	TGA	2	6	202454	202459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360923
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4586	NC_007766	GCG	2	6	202571	202576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360923
4587	NC_007766	GTCG	2	8	202587	202594	0 %	25 %	50 %	25 %	86360923
4588	NC_007766	CAGC	2	8	202658	202665	25 %	0 %	25 %	50 %	86360923
4589	NC_007766	AGCG	2	8	202671	202678	25 %	0 %	50 %	25 %	86360923
4590	NC_007766	CGG	2	6	202682	202687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360923
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4592	NC_007766	TCG	2	6	202883	202888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360924
4593	NC_007766	CGG	2	6	202923	202928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360924
4594	NC_007766	TCG	2	6	202973	202978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360924
4595	NC_007766	CATG	2	8	203025	203032	25 %	25 %	25 %	25 %	86360924
4596	NC_007766	GCC	2	6	203042	203047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360924
4597	NC_007766	GCT	2	6	203073	203078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360924
4598	NC_007766	TCG	2	6	203093	203098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360924
4599	NC_007766	GTC	2	6	203188	203193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360924
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4601	NC_007766	TGGAT	2	10	203390	203399	20 %	40 %	40 %	0 %	86360925
4602	NC_007766	TCC	2	6	203406	203411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360925
4603	NC_007766	GCC	2	6	203456	203461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360925
4604	NC_007766	GGC	3	9	203489	203497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360925
4605	NC_007766	CG	3	6	203538	203543	0 %	0 %	50 %	50 %	86360925
4606	NC_007766	GTT	2	6	203555	203560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360925
4607	NC_007766	TTC	2	6	203570	203575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360925
4608	NC_007766	CAGC	2	8	203579	203586	25 %	0 %	25 %	50 %	86360925
4609	NC_007766	CGG	2	6	203611	203616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360925
4610	NC_007766	CGGC	2	8	203676	203683	0 %	0 %	50 %	50 %	86360925
4611	NC_007766	AGC	2	6	203694	203699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360925
4612	NC_007766	CGAG	2	8	203758	203765	25 %	0 %	50 %	25 %	86360925
4613	NC_007766	GCCT	2	8	203792	203799	0 %	25 %	25 %	50 %	86360925
4614	NC_007766	TCG	2	6	203832	203837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360925
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4618	NC_007766	CG	4	8	204086	204093	0 %	0 %	50 %	50 %	86360926
4619	NC_007766	GAA	2	6	204096	204101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360926
4620	NC_007766	CGA	2	6	204116	204121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360926
4621	NC_007766	CTT	2	6	204197	204202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360926
4622	NC_007766	CAG	2	6	204210	204215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360926
4623	NC_007766	TCG	2	6	204229	204234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360926
4624	NC_007766	GCG	2	6	204435	204440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360926
4625	NC_007766	CAT	2	6	204444	204449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360926
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4654	NC_007766	TCG	2	6	205456	205461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360927
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4692	NC_007766	GTC	2	6	206671	206676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360927
4693	NC_007766	ATC	2	6	206735	206740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360928
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4700	NC_007766	GCGCA	2	10	207004	207013	20 %	0 %	40 %	40 %	86360928
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4710	NC_007766	GCGGT	2	10	207213	207222	0 %	20 %	60 %	20 %	86360928
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4727	NC_007766	ACCGC	2	10	208224	208233	20 %	0 %	20 %	60 %	86360929
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4730	NC_007766	GAC	2	6	208281	208286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360929
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4733	NC_007766	ATG	2	6	208441	208446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360929
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4735	NC_007766	CGA	2	6	208511	208516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360929
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4737	NC_007766	TGC	2	6	208525	208530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360929
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4740	NC_007766	ACCGGA	2	12	208643	208654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360929
4741	NC_007766	CAT	2	6	208665	208670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360929
4742	NC_007766	GAT	2	6	208746	208751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360929
4743	NC_007766	CTC	2	6	208785	208790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360929
4744	NC_007766	GCGG	2	8	208794	208801	0 %	0 %	75 %	25 %	86360929
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4746	NC_007766	CGT	2	6	208823	208828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360929
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4871	NC_007766	TCG	2	6	214007	214012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360933
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4900	NC_007766	GTC	2	6	214985	214990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360934
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4985	NC_007766	ATC	2	6	219438	219443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360939
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4990	NC_007766	AGC	2	6	219651	219656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360939
4991	NC_007766	TCC	2	6	219665	219670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360940
4992	NC_007766	CCG	2	6	219671	219676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360940
4993	NC_007766	AGA	2	6	219702	219707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360940
4994	NC_007766	GAT	2	6	219721	219726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360940
4995	NC_007766	GTCGAA	2	12	219769	219780	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86360940
4996	NC_007766	CG	3	6	219789	219794	0 %	0 %	50 %	50 %	86360940
4997	NC_007766	TTG	2	6	219824	219829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360940
4998	NC_007766	AGATC	2	10	219843	219852	40 %	20 %	20 %	20 %	86360940
4999	NC_007766	GCATC	2	10	219861	219870	20 %	20 %	20 %	40 %	86360940
5000	NC_007766	ATG	2	6	219896	219901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360940

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