MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 1333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007765	CTTC	2	8	72	79	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007765	GGAA	2	8	124	131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007765	TTGC	2	8	221	228	0 %	50 %	25 %	25 %	86360279
4	NC_007765	GCTG	2	8	1051	1058	0 %	25 %	50 %	25 %	86360279
5	NC_007765	CGCC	2	8	1204	1211	0 %	0 %	25 %	75 %	86360279
6	NC_007765	TCCG	2	8	2350	2357	0 %	25 %	25 %	50 %	86360281
7	NC_007765	AGGC	2	8	2562	2569	25 %	0 %	50 %	25 %	86360281
8	NC_007765	GGCC	2	8	3172	3179	0 %	0 %	50 %	50 %	86360282
9	NC_007765	CGAT	2	8	3249	3256	25 %	25 %	25 %	25 %	86360282
10	NC_007765	CCGG	2	8	3986	3993	0 %	0 %	50 %	50 %	86360284
11	NC_007765	GGCA	2	8	4004	4011	25 %	0 %	50 %	25 %	86360284
12	NC_007765	AGGC	2	8	4299	4306	25 %	0 %	50 %	25 %	86360284
13	NC_007765	ACGC	2	8	5802	5809	25 %	0 %	25 %	50 %	86360285
14	NC_007765	GCCG	2	8	6540	6547	0 %	0 %	50 %	50 %	86360285
15	NC_007765	AGCC	2	8	7189	7196	25 %	0 %	25 %	50 %	86360286
16	NC_007765	TCGG	2	8	7397	7404	0 %	25 %	50 %	25 %	86360286
17	NC_007765	GCTC	2	8	9239	9246	0 %	25 %	25 %	50 %	86360286
18	NC_007765	CCGA	2	8	9282	9289	25 %	0 %	25 %	50 %	86360286
19	NC_007765	GCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	50 %	50 %	86360287
20	NC_007765	ACCG	2	8	10172	10179	25 %	0 %	25 %	50 %	86360287
21	NC_007765	CGGC	2	8	10540	10547	0 %	0 %	50 %	50 %	86360287
22	NC_007765	GCGG	2	8	10615	10622	0 %	0 %	75 %	25 %	86360287
23	NC_007765	GCGA	2	8	10839	10846	25 %	0 %	50 %	25 %	86360287
24	NC_007765	CCGG	2	8	11122	11129	0 %	0 %	50 %	50 %	86360287
25	NC_007765	CGCC	2	8	11444	11451	0 %	0 %	25 %	75 %	86360287
26	NC_007765	GCAC	2	8	11864	11871	25 %	0 %	25 %	50 %	86360288
27	NC_007765	CCGG	2	8	12035	12042	0 %	0 %	50 %	50 %	86360288
28	NC_007765	CGTT	2	8	12113	12120	0 %	50 %	25 %	25 %	86360288
29	NC_007765	TGGT	2	8	12263	12270	0 %	50 %	50 %	0 %	86360288
30	NC_007765	GCGG	2	8	12385	12392	0 %	0 %	75 %	25 %	86360288
31	NC_007765	CCGG	2	8	12489	12496	0 %	0 %	50 %	50 %	86360288
32	NC_007765	GTCG	2	8	12802	12809	0 %	25 %	50 %	25 %	86360288
33	NC_007765	GCCG	2	8	12961	12968	0 %	0 %	50 %	50 %	86360288
34	NC_007765	GCCG	2	8	13498	13505	0 %	0 %	50 %	50 %	86360288
35	NC_007765	GCCA	2	8	13993	14000	25 %	0 %	25 %	50 %	86360288
36	NC_007765	TTCG	2	8	14929	14936	0 %	50 %	25 %	25 %	86360288
37	NC_007765	CGGC	2	8	15546	15553	0 %	0 %	50 %	50 %	86360288
38	NC_007765	GCGA	2	8	15689	15696	25 %	0 %	50 %	25 %	86360288
39	NC_007765	TCGA	2	8	15908	15915	25 %	25 %	25 %	25 %	86360288
40	NC_007765	GGCG	2	8	16761	16768	0 %	0 %	75 %	25 %	86360288
41	NC_007765	GGTT	2	8	17306	17313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007765	CAGC	2	8	18097	18104	25 %	0 %	25 %	50 %	86360289
43	NC_007765	GGCA	2	8	18889	18896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007765	CGGC	2	8	19185	19192	0 %	0 %	50 %	50 %	86360291
45	NC_007765	CGTC	2	8	19506	19513	0 %	25 %	25 %	50 %	86360292
46	NC_007765	CTCC	2	8	19707	19714	0 %	25 %	0 %	75 %	86360292
47	NC_007765	AATT	2	8	20161	20168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007765	CTTC	2	8	20312	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	86360293
49	NC_007765	CCCG	2	8	20858	20865	0 %	0 %	25 %	75 %	86360293
50	NC_007765	GGCT	2	8	21103	21110	0 %	25 %	50 %	25 %	86360293
51	NC_007765	TCGG	2	8	22748	22755	0 %	25 %	50 %	25 %	86360294
52	NC_007765	CGGC	2	8	22854	22861	0 %	0 %	50 %	50 %	86360294
53	NC_007765	TGCG	2	8	23128	23135	0 %	25 %	50 %	25 %	86360295
54	NC_007765	GGCC	2	8	23279	23286	0 %	0 %	50 %	50 %	86360295
55	NC_007765	ATCC	2	8	23493	23500	25 %	25 %	0 %	50 %	86360295
56	NC_007765	CGGT	2	8	23578	23585	0 %	25 %	50 %	25 %	86360295
57	NC_007765	GGTA	2	8	24073	24080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007765	CGGT	2	8	24163	24170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007765	CCGG	2	8	24498	24505	0 %	0 %	50 %	50 %	86360296
60	NC_007765	GTTC	2	8	24663	24670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007765	GCAC	2	8	25291	25298	25 %	0 %	25 %	50 %	86360297
62	NC_007765	CCTG	2	8	25853	25860	0 %	25 %	25 %	50 %	86360297
63	NC_007765	CCGA	2	8	26080	26087	25 %	0 %	25 %	50 %	86360297
64	NC_007765	GCAT	2	8	26945	26952	25 %	25 %	25 %	25 %	86360298
65	NC_007765	ATCG	2	8	27043	27050	25 %	25 %	25 %	25 %	86360298
66	NC_007765	AGGA	2	8	27293	27300	50 %	0 %	50 %	0 %	86360298
67	NC_007765	GGGT	2	8	28841	28848	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007765	CGAC	2	8	28958	28965	25 %	0 %	25 %	50 %	86360299
69	NC_007765	CCTT	2	8	29198	29205	0 %	50 %	0 %	50 %	86360299
70	NC_007765	CCTC	2	8	29641	29648	0 %	25 %	0 %	75 %	86360300
71	NC_007765	TTTG	2	8	30033	30040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007765	TCGA	2	8	30267	30274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007765	GCCG	2	8	30621	30628	0 %	0 %	50 %	50 %	86360301
74	NC_007765	GCTC	3	12	31189	31200	0 %	25 %	25 %	50 %	86360301
75	NC_007765	GCGA	2	8	31248	31255	25 %	0 %	50 %	25 %	86360301
76	NC_007765	GCCG	2	8	31386	31393	0 %	0 %	50 %	50 %	86360301
77	NC_007765	CGGC	2	8	33078	33085	0 %	0 %	50 %	50 %	86360302
78	NC_007765	GTCG	2	8	33499	33506	0 %	25 %	50 %	25 %	86360302
79	NC_007765	AAAG	2	8	34344	34351	75 %	0 %	25 %	0 %	86360303
80	NC_007765	CCGG	2	8	34890	34897	0 %	0 %	50 %	50 %	86360303
81	NC_007765	GCGG	2	8	35611	35618	0 %	0 %	75 %	25 %	86360304
82	NC_007765	CGCC	2	8	36055	36062	0 %	0 %	25 %	75 %	86360305
83	NC_007765	CCAG	2	8	36067	36074	25 %	0 %	25 %	50 %	86360305
84	NC_007765	GGCC	2	8	36139	36146	0 %	0 %	50 %	50 %	86360305
85	NC_007765	CGGC	2	8	36645	36652	0 %	0 %	50 %	50 %	86360306
86	NC_007765	CGTG	2	8	36687	36694	0 %	25 %	50 %	25 %	86360306
87	NC_007765	CGGC	2	8	37592	37599	0 %	0 %	50 %	50 %	86360307
88	NC_007765	AGCC	2	8	38299	38306	25 %	0 %	25 %	50 %	86360307
89	NC_007765	TCTG	2	8	39027	39034	0 %	50 %	25 %	25 %	86360308
90	NC_007765	CGCT	2	8	40687	40694	0 %	25 %	25 %	50 %	86360309
91	NC_007765	CGGC	2	8	41408	41415	0 %	0 %	50 %	50 %	86360309
92	NC_007765	CTGG	2	8	41627	41634	0 %	25 %	50 %	25 %	86360309
93	NC_007765	GCCC	2	8	41791	41798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_007765	GCTG	2	8	42491	42498	0 %	25 %	50 %	25 %	86360311
95	NC_007765	CGTG	2	8	42965	42972	0 %	25 %	50 %	25 %	86360312
96	NC_007765	GCCG	2	8	43040	43047	0 %	0 %	50 %	50 %	86360312
97	NC_007765	CCTT	2	8	43498	43505	0 %	50 %	0 %	50 %	86360313
98	NC_007765	ACCG	2	8	44277	44284	25 %	0 %	25 %	50 %	86360313
99	NC_007765	CCGG	2	8	44477	44484	0 %	0 %	50 %	50 %	86360313
100	NC_007765	GCCG	2	8	44517	44524	0 %	0 %	50 %	50 %	86360313
101	NC_007765	CGTC	2	8	44764	44771	0 %	25 %	25 %	50 %	86360313
102	NC_007765	GGCG	2	8	44906	44913	0 %	0 %	75 %	25 %	86360313
103	NC_007765	GGGC	2	8	45548	45555	0 %	0 %	75 %	25 %	86360313
104	NC_007765	GCGA	2	8	46245	46252	25 %	0 %	50 %	25 %	86360314
105	NC_007765	CGAG	2	8	46306	46313	25 %	0 %	50 %	25 %	86360314
106	NC_007765	GCCG	3	12	47147	47158	0 %	0 %	50 %	50 %	86360314
107	NC_007765	CCGT	2	8	47579	47586	0 %	25 %	25 %	50 %	86360315
108	NC_007765	CGGC	2	8	47865	47872	0 %	0 %	50 %	50 %	86360315
109	NC_007765	GTCG	2	8	48493	48500	0 %	25 %	50 %	25 %	86360315
110	NC_007765	GGTG	2	8	48663	48670	0 %	25 %	75 %	0 %	86360316
111	NC_007765	TGGC	2	8	49604	49611	0 %	25 %	50 %	25 %	86360316
112	NC_007765	GGCG	2	8	49908	49915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007765	AGGA	2	8	50127	50134	50 %	0 %	50 %	0 %	86360317
114	NC_007765	AAAT	2	8	50361	50368	75 %	25 %	0 %	0 %	86360317
115	NC_007765	CCAT	2	8	50410	50417	25 %	25 %	0 %	50 %	86360317
116	NC_007765	TGCG	2	8	50566	50573	0 %	25 %	50 %	25 %	86360317
117	NC_007765	CGGT	2	8	50610	50617	0 %	25 %	50 %	25 %	86360317
118	NC_007765	CGGT	2	8	50742	50749	0 %	25 %	50 %	25 %	86360317
119	NC_007765	AAGA	2	8	50936	50943	75 %	0 %	25 %	0 %	86360317
120	NC_007765	GCCG	2	8	51493	51500	0 %	0 %	50 %	50 %	86360318
121	NC_007765	GCCG	2	8	51502	51509	0 %	0 %	50 %	50 %	86360318
122	NC_007765	GATC	2	8	52356	52363	25 %	25 %	25 %	25 %	86360319
123	NC_007765	ATGC	2	8	52420	52427	25 %	25 %	25 %	25 %	86360319
124	NC_007765	CTGC	2	8	53173	53180	0 %	25 %	25 %	50 %	86360319
125	NC_007765	CGGC	2	8	53232	53239	0 %	0 %	50 %	50 %	86360319
126	NC_007765	GCTG	2	8	53793	53800	0 %	25 %	50 %	25 %	86360319
127	NC_007765	GCGG	3	12	53871	53882	0 %	0 %	75 %	25 %	86360319
128	NC_007765	GCAG	2	8	53900	53907	25 %	0 %	50 %	25 %	86360319
129	NC_007765	CTGC	2	8	53949	53956	0 %	25 %	25 %	50 %	86360319
130	NC_007765	GCGG	2	8	54191	54198	0 %	0 %	75 %	25 %	86360320
131	NC_007765	GCCG	2	8	55616	55623	0 %	0 %	50 %	50 %	86360320
132	NC_007765	CTGG	2	8	56310	56317	0 %	25 %	50 %	25 %	86360321
133	NC_007765	GTCG	2	8	56952	56959	0 %	25 %	50 %	25 %	86360321
134	NC_007765	CGGC	2	8	57065	57072	0 %	0 %	50 %	50 %	86360321
135	NC_007765	GGCC	2	8	57161	57168	0 %	0 %	50 %	50 %	86360321
136	NC_007765	CGAT	2	8	58857	58864	25 %	25 %	25 %	25 %	86360322
137	NC_007765	CGAC	2	8	59244	59251	25 %	0 %	25 %	50 %	86360322
138	NC_007765	GCGG	2	8	59568	59575	0 %	0 %	75 %	25 %	86360323
139	NC_007765	GCCG	3	12	59747	59758	0 %	0 %	50 %	50 %	86360323
140	NC_007765	CGGC	2	8	59819	59826	0 %	0 %	50 %	50 %	86360323
141	NC_007765	AAGG	2	8	61096	61103	50 %	0 %	50 %	0 %	86360324
142	NC_007765	AACC	2	8	61448	61455	50 %	0 %	0 %	50 %	86360325
143	NC_007765	CTTC	2	8	61801	61808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007765	GGTT	2	8	61896	61903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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