MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 12139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007765	TCA	2	6	41440	41445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360309
1002	NC_007765	TAA	2	6	41489	41494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360309
1003	NC_007765	ACG	2	6	41500	41505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360309
1004	NC_007765	TCA	2	6	41512	41517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360309
1005	NC_007765	TCG	2	6	41568	41573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360309
1006	NC_007765	TGC	2	6	41603	41608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360309
1007	NC_007765	CTGG	2	8	41627	41634	0 %	25 %	50 %	25 %	86360309
1008	NC_007765	TGG	2	6	41656	41661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360309
1009	NC_007765	TCG	2	6	41695	41700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360309
1010	NC_007765	CTA	2	6	41702	41707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360309
1011	NC_007765	GGC	2	6	41735	41740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360309
1012	NC_007765	GCCC	2	8	41791	41798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1013	NC_007765	ATT	2	6	41958	41963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_007765	CGC	2	6	42002	42007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_007765	GTC	2	6	42095	42100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360310
1016	NC_007765	CGG	2	6	42109	42114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360310
1017	NC_007765	CGT	2	6	42121	42126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360310
1018	NC_007765	CGC	2	6	42157	42162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360310
1019	NC_007765	TCGATG	2	12	42243	42254	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86360310
1020	NC_007765	GGC	2	6	42322	42327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360310
1021	NC_007765	GAT	2	6	42380	42385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360310
1022	NC_007765	GAA	2	6	42419	42424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360310
1023	NC_007765	GCTG	2	8	42491	42498	0 %	25 %	50 %	25 %	86360311
1024	NC_007765	CAG	2	6	42499	42504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360311
1025	NC_007765	GAT	2	6	42574	42579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360311
1026	NC_007765	GTC	2	6	42635	42640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360311
1027	NC_007765	CTG	2	6	42682	42687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360311
1028	NC_007765	CTT	2	6	42733	42738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360311
1029	NC_007765	GCC	2	6	42756	42761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360311
1030	NC_007765	GCT	2	6	42796	42801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360312
1031	NC_007765	CGC	2	6	42803	42808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360312
1032	NC_007765	CCGCG	2	10	42809	42818	0 %	0 %	40 %	60 %	86360312
1033	NC_007765	GGT	2	6	42830	42835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360312
1034	NC_007765	AGC	2	6	42897	42902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360312
1035	NC_007765	GCA	2	6	42928	42933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360312
1036	NC_007765	GC	3	6	42951	42956	0 %	0 %	50 %	50 %	86360312
1037	NC_007765	CGTG	2	8	42965	42972	0 %	25 %	50 %	25 %	86360312
1038	NC_007765	CGA	2	6	43000	43005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360312
1039	NC_007765	GCCG	2	8	43040	43047	0 %	0 %	50 %	50 %	86360312
1040	NC_007765	GAG	2	6	43050	43055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360312
1041	NC_007765	GAT	2	6	43058	43063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360312
1042	NC_007765	GA	3	6	43077	43082	50 %	0 %	50 %	0 %	86360312
1043	NC_007765	GCA	2	6	43216	43221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360312
1044	NC_007765	TC	3	6	43233	43238	0 %	50 %	0 %	50 %	86360312
1045	NC_007765	CGC	2	6	43326	43331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_007765	CGC	2	6	43415	43420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360313
1047	NC_007765	GAT	2	6	43479	43484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360313
1048	NC_007765	CCTT	2	8	43498	43505	0 %	50 %	0 %	50 %	86360313
1049	NC_007765	GAT	2	6	43518	43523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360313
1050	NC_007765	TGATC	2	10	43532	43541	20 %	40 %	20 %	20 %	86360313
1051	NC_007765	GCC	2	6	43656	43661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360313
1052	NC_007765	ATG	2	6	43735	43740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360313
1053	NC_007765	CTG	2	6	43767	43772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1054	NC_007765	CGT	2	6	43835	43840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1055	NC_007765	CAG	2	6	43929	43934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1056	NC_007765	GAT	2	6	43977	43982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360313
1057	NC_007765	CTC	2	6	43992	43997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360313
1058	NC_007765	GGCGT	2	10	43999	44008	0 %	20 %	60 %	20 %	86360313
1059	NC_007765	GCG	2	6	44016	44021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360313
1060	NC_007765	GTC	2	6	44061	44066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1061	NC_007765	GCT	2	6	44084	44089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1062	NC_007765	GAA	2	6	44091	44096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360313
1063	NC_007765	GAT	2	6	44099	44104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360313
1064	NC_007765	CGG	2	6	44106	44111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360313
1065	NC_007765	GCT	2	6	44198	44203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1066	NC_007765	GGC	2	6	44217	44222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360313
1067	NC_007765	CGG	2	6	44227	44232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360313
1068	NC_007765	TCA	2	6	44237	44242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360313
1069	NC_007765	ACCG	2	8	44277	44284	25 %	0 %	25 %	50 %	86360313
1070	NC_007765	ACG	2	6	44320	44325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1071	NC_007765	TCG	2	6	44341	44346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1072	NC_007765	GC	3	6	44368	44373	0 %	0 %	50 %	50 %	86360313
1073	NC_007765	AGCGC	2	10	44426	44435	20 %	0 %	40 %	40 %	86360313
1074	NC_007765	CCGG	2	8	44477	44484	0 %	0 %	50 %	50 %	86360313
1075	NC_007765	GAG	2	6	44493	44498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360313
1076	NC_007765	ATC	2	6	44499	44504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360313
1077	NC_007765	GCCG	2	8	44517	44524	0 %	0 %	50 %	50 %	86360313
1078	NC_007765	CGG	2	6	44585	44590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360313
1079	NC_007765	TCG	2	6	44620	44625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1080	NC_007765	ATC	2	6	44638	44643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360313
1081	NC_007765	GAA	3	9	44691	44699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360313
1082	NC_007765	GCG	2	6	44724	44729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360313
1083	NC_007765	CGTC	2	8	44764	44771	0 %	25 %	25 %	50 %	86360313
1084	NC_007765	CGA	2	6	44852	44857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1085	NC_007765	CGA	2	6	44900	44905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1086	NC_007765	GGCG	2	8	44906	44913	0 %	0 %	75 %	25 %	86360313
1087	NC_007765	GTC	2	6	44919	44924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1088	NC_007765	GAC	2	6	44943	44948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1089	NC_007765	GC	3	6	44951	44956	0 %	0 %	50 %	50 %	86360313
1090	NC_007765	CTG	2	6	45039	45044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1091	NC_007765	CGA	2	6	45134	45139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1092	NC_007765	CCG	2	6	45178	45183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360313
1093	NC_007765	TGA	2	6	45227	45232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360313
1094	NC_007765	GCC	2	6	45290	45295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360313
1095	NC_007765	CGA	2	6	45356	45361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
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1097	NC_007765	GAC	2	6	45447	45452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1098	NC_007765	CGA	2	6	45464	45469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1099	NC_007765	GGC	3	9	45471	45479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360313
1100	NC_007765	GAT	2	6	45507	45512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360313
1101	NC_007765	CCG	2	6	45538	45543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360313
1102	NC_007765	GGGC	2	8	45548	45555	0 %	0 %	75 %	25 %	86360313
1103	NC_007765	GCC	2	6	45579	45584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360313
1104	NC_007765	TGG	2	6	45611	45616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360313
1105	NC_007765	CGG	2	6	45651	45656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360313
1106	NC_007765	GCA	2	6	45662	45667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1107	NC_007765	GCA	2	6	45698	45703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1108	NC_007765	CAC	2	6	45762	45767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360313
1109	NC_007765	GAA	2	6	45831	45836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360313
1110	NC_007765	ATC	2	6	45973	45978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360313
1111	NC_007765	CGA	2	6	45986	45991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1112	NC_007765	GCT	2	6	46007	46012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360313
1113	NC_007765	TTC	2	6	46024	46029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360313
1114	NC_007765	CGGGA	2	10	46106	46115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_007765	CCG	2	6	46148	46153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_007765	GCGA	2	8	46245	46252	25 %	0 %	50 %	25 %	86360314
1117	NC_007765	ATC	2	6	46260	46265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360314
1118	NC_007765	ATG	2	6	46272	46277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360314
1119	NC_007765	TCT	2	6	46285	46290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360314
1120	NC_007765	CGAG	2	8	46306	46313	25 %	0 %	50 %	25 %	86360314
1121	NC_007765	CGC	2	6	46450	46455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360314
1122	NC_007765	CGA	2	6	46459	46464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360314
1123	NC_007765	GC	3	6	46580	46585	0 %	0 %	50 %	50 %	86360314
1124	NC_007765	CAG	2	6	46658	46663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360314
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1126	NC_007765	CGC	2	6	46691	46696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360314
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1233	NC_007765	CGGT	2	8	50610	50617	0 %	25 %	50 %	25 %	86360317
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1241	NC_007765	ATCGAG	2	12	50768	50779	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86360317
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1243	NC_007765	CGA	2	6	50809	50814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360317
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1245	NC_007765	GCG	3	9	50845	50853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360317
1246	NC_007765	CGA	2	6	50905	50910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360317
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1249	NC_007765	AAGA	2	8	50936	50943	75 %	0 %	25 %	0 %	86360317
1250	NC_007765	TGC	2	6	50967	50972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360317
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