MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 12139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007765	CTG	3	9	22592	22600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360294
502	NC_007765	CGC	3	9	22648	22656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360294
503	NC_007765	C	6	6	22668	22673	0 %	0 %	0 %	100 %	86360294
504	NC_007765	GCG	2	6	22721	22726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360294
505	NC_007765	GCC	2	6	22736	22741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360294
506	NC_007765	TCGG	2	8	22748	22755	0 %	25 %	50 %	25 %	86360294
507	NC_007765	CGG	2	6	22762	22767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360294
508	NC_007765	TCG	2	6	22770	22775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360294
509	NC_007765	GCA	2	6	22812	22817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360294
510	NC_007765	TTC	2	6	22832	22837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360294
511	NC_007765	GCC	2	6	22841	22846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360294
512	NC_007765	CGGC	2	8	22854	22861	0 %	0 %	50 %	50 %	86360294
513	NC_007765	TCT	2	6	22872	22877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360294
514	NC_007765	GCG	2	6	22910	22915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360294
515	NC_007765	TGG	2	6	23045	23050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360295
516	NC_007765	TGCG	2	8	23128	23135	0 %	25 %	50 %	25 %	86360295
517	NC_007765	CGA	2	6	23153	23158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360295
518	NC_007765	GAT	2	6	23238	23243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360295
519	NC_007765	ATC	2	6	23263	23268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360295
520	NC_007765	GGCC	2	8	23279	23286	0 %	0 %	50 %	50 %	86360295
521	NC_007765	GGA	2	6	23406	23411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360295
522	NC_007765	CCG	2	6	23430	23435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360295
523	NC_007765	CGA	2	6	23447	23452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360295
524	NC_007765	CGC	2	6	23462	23467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360295
525	NC_007765	GC	3	6	23466	23471	0 %	0 %	50 %	50 %	86360295
526	NC_007765	ATCC	2	8	23493	23500	25 %	25 %	0 %	50 %	86360295
527	NC_007765	GCC	2	6	23511	23516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360295
528	NC_007765	CGGT	2	8	23578	23585	0 %	25 %	50 %	25 %	86360295
529	NC_007765	GAT	2	6	23601	23606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360295
530	NC_007765	CGA	2	6	23615	23620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360295
531	NC_007765	GGC	2	6	23621	23626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360295
532	NC_007765	GC	3	6	23625	23630	0 %	0 %	50 %	50 %	86360295
533	NC_007765	TCA	2	6	23665	23670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360295
534	NC_007765	GGGCA	2	10	23671	23680	20 %	0 %	60 %	20 %	86360295
535	NC_007765	GAA	2	6	23742	23747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360295
536	NC_007765	GTC	2	6	23748	23753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360295
537	NC_007765	CTC	2	6	23856	23861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360295
538	NC_007765	GGC	3	9	23862	23870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360295
539	NC_007765	CCG	2	6	23877	23882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360295
540	NC_007765	TCC	2	6	23994	23999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_007765	CTT	2	6	24022	24027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_007765	GGTA	2	8	24073	24080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007765	CGG	2	6	24085	24090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_007765	GAC	2	6	24105	24110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_007765	CGGT	2	8	24163	24170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
546	NC_007765	GCT	2	6	24172	24177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_007765	CGC	2	6	24268	24273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_007765	A	6	6	24277	24282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_007765	GCC	2	6	24324	24329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360296
550	NC_007765	CGC	2	6	24446	24451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360296
551	NC_007765	GCC	2	6	24459	24464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360296
552	NC_007765	CGC	2	6	24482	24487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360296
553	NC_007765	GAT	2	6	24492	24497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360296
554	NC_007765	CCGG	2	8	24498	24505	0 %	0 %	50 %	50 %	86360296
555	NC_007765	TGA	2	6	24517	24522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360296
556	NC_007765	CG	3	6	24529	24534	0 %	0 %	50 %	50 %	86360296
557	NC_007765	CAA	2	6	24557	24562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360296
558	NC_007765	GCC	2	6	24565	24570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360296
559	NC_007765	GCT	2	6	24582	24587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360296
560	NC_007765	ATT	2	6	24589	24594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360296
561	NC_007765	AGG	2	6	24635	24640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_007765	GCA	2	6	24649	24654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_007765	GTTC	2	8	24663	24670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_007765	CGT	2	6	24735	24740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360297
565	NC_007765	TCG	2	6	24766	24771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360297
566	NC_007765	TTC	2	6	24817	24822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360297
567	NC_007765	CGC	2	6	24839	24844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360297
568	NC_007765	GAT	2	6	24849	24854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360297
569	NC_007765	GCA	2	6	24866	24871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360297
570	NC_007765	ATG	2	6	24874	24879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360297
571	NC_007765	TCG	2	6	24896	24901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360297
572	NC_007765	AGC	2	6	24940	24945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360297
573	NC_007765	TCG	2	6	25003	25008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360297
574	NC_007765	CCA	2	6	25031	25036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360297
575	NC_007765	GCTGGC	2	12	25058	25069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86360297
576	NC_007765	GCC	2	6	25083	25088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360297
577	NC_007765	ATG	2	6	25129	25134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360297
578	NC_007765	CGC	2	6	25158	25163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360297
579	NC_007765	CG	3	6	25178	25183	0 %	0 %	50 %	50 %	86360297
580	NC_007765	GCA	2	6	25247	25252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360297
581	NC_007765	GC	3	6	25265	25270	0 %	0 %	50 %	50 %	86360297
582	NC_007765	GCAC	2	8	25291	25298	25 %	0 %	25 %	50 %	86360297
583	NC_007765	GCC	2	6	25305	25310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360297
584	NC_007765	CTG	2	6	25326	25331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360297
585	NC_007765	CGT	2	6	25334	25339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360297
586	NC_007765	CG	3	6	25505	25510	0 %	0 %	50 %	50 %	86360297
587	NC_007765	GC	3	6	25591	25596	0 %	0 %	50 %	50 %	86360297
588	NC_007765	GAA	2	6	25638	25643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360297
589	NC_007765	CGA	2	6	25667	25672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360297
590	NC_007765	GCC	2	6	25710	25715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360297
591	NC_007765	GAC	2	6	25716	25721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360297
592	NC_007765	CGA	2	6	25757	25762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360297
593	NC_007765	CGC	2	6	25788	25793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360297
594	NC_007765	GTC	2	6	25827	25832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360297
595	NC_007765	CCTG	2	8	25853	25860	0 %	25 %	25 %	50 %	86360297
596	NC_007765	GC	3	6	25876	25881	0 %	0 %	50 %	50 %	86360297
597	NC_007765	GCA	2	6	25997	26002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360297
598	NC_007765	CAG	2	6	26013	26018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360297
599	NC_007765	AGC	2	6	26065	26070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360297
600	NC_007765	CCGA	2	8	26080	26087	25 %	0 %	25 %	50 %	86360297
601	NC_007765	GA	3	6	26086	26091	50 %	0 %	50 %	0 %	86360297
602	NC_007765	GCC	2	6	26150	26155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360297
603	NC_007765	GATGGC	2	12	26295	26306	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86360297
604	NC_007765	GGC	2	6	26310	26315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360297
605	NC_007765	GCC	2	6	26343	26348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360297
606	NC_007765	GAT	2	6	26379	26384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360297
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609	NC_007765	TCC	2	6	26518	26523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360297
610	NC_007765	CGATG	2	10	26525	26534	20 %	20 %	40 %	20 %	86360297
611	NC_007765	CGG	2	6	26553	26558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360297
612	NC_007765	GCG	2	6	26559	26564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360297
613	NC_007765	TCG	2	6	26612	26617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360297
614	NC_007765	TCC	2	6	26619	26624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_007765	GGT	2	6	26641	26646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_007765	CG	3	6	26648	26653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_007765	TC	3	6	26783	26788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_007765	TCG	2	6	26825	26830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360298
619	NC_007765	CCG	2	6	26870	26875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360298
620	NC_007765	CGA	2	6	26907	26912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360298
621	NC_007765	TTC	2	6	26913	26918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360298
622	NC_007765	CGA	2	6	26925	26930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360298
623	NC_007765	GCAT	2	8	26945	26952	25 %	25 %	25 %	25 %	86360298
624	NC_007765	CGA	2	6	26973	26978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360298
625	NC_007765	CGG	2	6	26994	26999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360298
626	NC_007765	GCG	2	6	27004	27009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360298
627	NC_007765	GGC	2	6	27037	27042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360298
628	NC_007765	ATCG	2	8	27043	27050	25 %	25 %	25 %	25 %	86360298
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630	NC_007765	TCG	2	6	27062	27067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360298
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