MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 12139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007765	CGA	2	6	211182	211187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360458
5002	NC_007765	CGC	2	6	211323	211328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360458
5003	NC_007765	TCCAGC	2	12	211333	211344	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86360458
5004	NC_007765	CAG	2	6	211473	211478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360458
5005	NC_007765	GCA	2	6	211487	211492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360458
5006	NC_007765	GGC	2	6	211504	211509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360458
5007	NC_007765	CGC	3	9	211547	211555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360458
5008	NC_007765	CGC	2	6	211581	211586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360458
5009	NC_007765	GC	3	6	211598	211603	0 %	0 %	50 %	50 %	86360458
5010	NC_007765	TCG	2	6	211705	211710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360458
5011	NC_007765	CCA	2	6	211767	211772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360458
5012	NC_007765	AGC	2	6	211780	211785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360458
5013	NC_007765	AGG	2	6	211817	211822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360458
5014	NC_007765	CAG	2	6	211877	211882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360459
5015	NC_007765	CAG	2	6	211913	211918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360459
5016	NC_007765	ACC	2	6	212006	212011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360459
5017	NC_007765	TCG	2	6	212031	212036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360459
5018	NC_007765	CATC	2	8	212050	212057	25 %	25 %	0 %	50 %	86360459
5019	NC_007765	CAG	2	6	212078	212083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360459
5020	NC_007765	TTG	2	6	212130	212135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360459
5021	NC_007765	CCG	2	6	212136	212141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360459
5022	NC_007765	AACG	2	8	212207	212214	50 %	0 %	25 %	25 %	86360459
5023	NC_007765	ATG	2	6	212235	212240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360459
5024	NC_007765	TGT	2	6	212278	212283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360459
5025	NC_007765	AGC	2	6	212343	212348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360459
5026	NC_007765	CAA	2	6	212465	212470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360459
5027	NC_007765	ACG	3	9	212481	212489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360459
5028	NC_007765	GC	3	6	212510	212515	0 %	0 %	50 %	50 %	86360459
5029	NC_007765	GAA	2	6	212612	212617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360459
5030	NC_007765	GAAC	2	8	212644	212651	50 %	0 %	25 %	25 %	86360459
5031	NC_007765	GGC	2	6	212891	212896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360460
5032	NC_007765	CGA	2	6	212929	212934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5033	NC_007765	CGA	2	6	212956	212961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5034	NC_007765	GGAACG	2	12	212980	212991	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86360460
5035	NC_007765	TCT	2	6	213049	213054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360460
5036	NC_007765	CAG	2	6	213164	213169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5037	NC_007765	CCA	2	6	213213	213218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360460
5038	NC_007765	AT	3	6	213231	213236	50 %	50 %	0 %	0 %	86360460
5039	NC_007765	GCT	2	6	213252	213257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5040	NC_007765	CGA	2	6	213304	213309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5041	NC_007765	TCG	2	6	213324	213329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5042	NC_007765	GCA	2	6	213342	213347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5043	NC_007765	CGGC	2	8	213378	213385	0 %	0 %	50 %	50 %	86360460
5044	NC_007765	CGG	2	6	213431	213436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360460
5045	NC_007765	CAG	2	6	213446	213451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5046	NC_007765	AGT	2	6	213460	213465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360460
5047	NC_007765	CTT	2	6	213473	213478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360460
5048	NC_007765	CGG	3	9	213481	213489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360460
5049	NC_007765	GCC	2	6	213500	213505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360460
5050	NC_007765	CGAC	2	8	213571	213578	25 %	0 %	25 %	50 %	86360460
5051	NC_007765	GAA	2	6	213581	213586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360460
5052	NC_007765	GGC	2	6	213596	213601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360460
5053	NC_007765	CGA	2	6	213611	213616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5054	NC_007765	GGT	2	6	213626	213631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360460
5055	NC_007765	GAA	2	6	213665	213670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360460
5056	NC_007765	CGT	2	6	213698	213703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5057	NC_007765	ATC	2	6	213758	213763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360460
5058	NC_007765	TGA	2	6	213793	213798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360460
5059	NC_007765	GTG	2	6	213861	213866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360460
5060	NC_007765	GCGA	2	8	213912	213919	25 %	0 %	50 %	25 %	86360460
5061	NC_007765	CGA	2	6	213931	213936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360460
5062	NC_007765	TCT	2	6	214083	214088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360460
5063	NC_007765	GGC	2	6	214178	214183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360460
5064	NC_007765	CCA	2	6	214190	214195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360460
5065	NC_007765	TCC	2	6	214282	214287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_007765	CTC	2	6	214328	214333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_007765	AGAA	2	8	214363	214370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_007765	TG	3	6	214447	214452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_007765	ATTG	2	8	214469	214476	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_007765	GGA	2	6	214506	214511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_007765	GGC	2	6	214590	214595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360461
5072	NC_007765	CGA	2	6	214597	214602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360461
5073	NC_007765	GCG	2	6	214671	214676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360461
5074	NC_007765	GCA	2	6	214734	214739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360461
5075	NC_007765	CGC	2	6	214761	214766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360461
5076	NC_007765	GCT	2	6	215002	215007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360461
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5078	NC_007765	GC	3	6	215147	215152	0 %	0 %	50 %	50 %	86360461
5079	NC_007765	TTC	2	6	215186	215191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360461
5080	NC_007765	CAA	2	6	215227	215232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360461
5081	NC_007765	CCA	2	6	215385	215390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360461
5082	NC_007765	CCGTT	2	10	215400	215409	0 %	40 %	20 %	40 %	86360461
5083	NC_007765	AGTG	2	8	215442	215449	25 %	25 %	50 %	0 %	86360461
5084	NC_007765	CCA	2	6	215482	215487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_007765	AC	3	6	215513	215518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_007765	CAC	2	6	215570	215575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_007765	ATG	2	6	215582	215587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_007765	TCG	2	6	215596	215601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_007765	CAGC	2	8	215688	215695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_007765	AAG	2	6	215756	215761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_007765	GTT	2	6	215820	215825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_007765	T	6	6	215866	215871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_007765	GAC	2	6	215899	215904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_007765	CGG	2	6	215926	215931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_007765	GCGG	2	8	215939	215946	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_007765	CCT	2	6	216019	216024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_007765	ATC	2	6	216117	216122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_007765	CCG	2	6	216183	216188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_007765	CGG	2	6	216211	216216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_007765	GCC	2	6	216223	216228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_007765	GCC	2	6	216239	216244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_007765	CGG	2	6	216427	216432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_007765	CAC	2	6	216439	216444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_007765	GGC	2	6	216445	216450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_007765	GCA	2	6	216463	216468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_007765	TTGC	2	8	216563	216570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_007765	GGC	2	6	216573	216578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_007765	ATG	2	6	216701	216706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360462
5109	NC_007765	CG	3	6	216742	216747	0 %	0 %	50 %	50 %	86360462
5110	NC_007765	GGA	2	6	216765	216770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360462
5111	NC_007765	CGC	2	6	216773	216778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
5112	NC_007765	GCG	2	6	216795	216800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360462
5113	NC_007765	CGC	2	6	216874	216879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
5114	NC_007765	GCTG	2	8	216926	216933	0 %	25 %	50 %	25 %	86360462
5115	NC_007765	AGA	2	6	216953	216958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360462
5116	NC_007765	CGA	2	6	217059	217064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360462
5117	NC_007765	CCG	2	6	217083	217088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
5118	NC_007765	GC	3	6	217099	217104	0 %	0 %	50 %	50 %	86360462
5119	NC_007765	GCC	2	6	217123	217128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
5120	NC_007765	TCGACA	2	12	217160	217171	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86360462
5121	NC_007765	CCA	2	6	217200	217205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360462
5122	NC_007765	TGC	2	6	217220	217225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360462
5123	NC_007765	CATC	2	8	217242	217249	25 %	25 %	0 %	50 %	86360462
5124	NC_007765	CCG	2	6	217257	217262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
5125	NC_007765	CGG	2	6	217284	217289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360462
5126	NC_007765	GAA	2	6	217291	217296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360462
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5128	NC_007765	CGC	2	6	217428	217433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360462
5129	NC_007765	TG	3	6	217435	217440	0 %	50 %	50 %	0 %	86360462
5130	NC_007765	CGG	2	6	217468	217473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360462
5131	NC_007765	GCGG	2	8	217505	217512	0 %	0 %	75 %	25 %	86360462
5132	NC_007765	GGC	2	6	217524	217529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360462
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5134	NC_007765	TCA	2	6	217679	217684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5137	NC_007765	CCTC	2	8	217885	217892	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5138	NC_007765	GCTC	2	8	217903	217910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5139	NC_007765	CG	3	6	217942	217947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5140	NC_007765	CAA	2	6	217950	217955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_007765	TTCG	2	8	218024	218031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5142	NC_007765	GTCCCA	2	12	218192	218203	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5143	NC_007765	TCTT	2	8	218215	218222	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5144	NC_007765	TCG	2	6	218245	218250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5146	NC_007765	GCG	2	6	218311	218316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5147	NC_007765	ATGC	2	8	218349	218356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5148	NC_007765	TCG	2	6	218386	218391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5151	NC_007765	CGA	2	6	218550	218555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5152	NC_007765	TGC	2	6	218708	218713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5154	NC_007765	TC	3	6	218727	218732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5155	NC_007765	AG	3	6	218747	218752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5156	NC_007765	A	7	7	218793	218799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_007765	TATTG	2	10	218826	218835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_007765	GTC	2	6	218966	218971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5160	NC_007765	TG	3	6	219038	219043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_007765	AT	3	6	219156	219161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_007765	TAAA	2	8	219173	219180	75 %	25 %	0 %	0 %	86360463
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5164	NC_007765	CCAAA	2	10	219257	219266	60 %	0 %	0 %	40 %	86360463
5165	NC_007765	CG	3	6	219282	219287	0 %	0 %	50 %	50 %	86360463
5166	NC_007765	CGA	2	6	219313	219318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360463
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5210	NC_007765	CCGAG	2	10	222072	222081	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5211	NC_007765	CACC	2	8	222091	222098	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5212	NC_007765	CCG	2	6	222122	222127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360464
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5232	NC_007765	CTTC	2	8	222638	222645	0 %	50 %	0 %	50 %	86360464
5233	NC_007765	TGT	2	6	222668	222673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360464
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5240	NC_007765	GCC	2	6	222858	222863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5241	NC_007765	CGC	2	6	222942	222947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360465
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5243	NC_007765	CGG	2	6	223034	223039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360465
5244	NC_007765	CGG	2	6	223052	223057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360465
5245	NC_007765	CGT	2	6	223079	223084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360465
5246	NC_007765	TGC	2	6	223119	223124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360465
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5248	NC_007765	CCA	2	6	223174	223179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360465
5249	NC_007765	GCC	2	6	223180	223185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360465
5250	NC_007765	CGATGC	2	12	223195	223206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360465
5251	NC_007765	AGGA	2	8	223251	223258	50 %	0 %	50 %	0 %	86360465
5252	NC_007765	ATC	2	6	223287	223292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360465
5253	NC_007765	CGT	2	6	223328	223333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360465
5254	NC_007765	TCG	2	6	223338	223343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360465
5255	NC_007765	GAT	2	6	223346	223351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360465
5256	NC_007765	TGG	2	6	223369	223374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360465
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5272	NC_007765	CCAC	2	8	224006	224013	25 %	0 %	0 %	75 %	86360466
5273	NC_007765	ATC	2	6	224059	224064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360466
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5289	NC_007765	CG	3	6	224567	224572	0 %	0 %	50 %	50 %	86360466
5290	NC_007765	CGG	2	6	224601	224606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360466
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5293	NC_007765	CGA	2	6	224675	224680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360466
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5322	NC_007765	GAC	2	6	225704	225709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5324	NC_007765	CTT	2	6	225786	225791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5325	NC_007765	CGA	2	6	225800	225805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5363	NC_007765	TCC	2	6	227893	227898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5364	NC_007765	CTGC	2	8	227901	227908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5365	NC_007765	CTC	2	6	227909	227914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5366	NC_007765	CGG	2	6	227948	227953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5367	NC_007765	GCC	2	6	228003	228008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360469
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5369	NC_007765	CT	3	6	228036	228041	0 %	50 %	0 %	50 %	86360469
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5493	NC_007765	CTC	2	6	233346	233351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360472
5494	NC_007765	CTG	2	6	233358	233363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360472
5495	NC_007765	GCA	2	6	233473	233478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360472
5496	NC_007765	CAAG	2	8	233480	233487	50 %	0 %	25 %	25 %	86360472
5497	NC_007765	TG	3	6	233528	233533	0 %	50 %	50 %	0 %	86360472
5498	NC_007765	CTA	2	6	233695	233700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360473
5499	NC_007765	CGATG	2	10	233707	233716	20 %	20 %	40 %	20 %	86360473
5500	NC_007765	TGT	2	6	233737	233742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360473

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