MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007764	CGC	2	6	22904	22909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360071
502	NC_007764	TGG	2	6	22921	22926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360071
503	NC_007764	AGGC	2	8	22984	22991	25 %	0 %	50 %	25 %	86360071
504	NC_007764	CGT	2	6	23003	23008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360071
505	NC_007764	CAT	2	6	23012	23017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360071
506	NC_007764	CCT	2	6	23032	23037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360071
507	NC_007764	GGC	2	6	23042	23047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360071
508	NC_007764	CGG	2	6	23087	23092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360071
509	NC_007764	CGT	2	6	23111	23116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360071
510	NC_007764	CGG	2	6	23159	23164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360071
511	NC_007764	GCC	2	6	23208	23213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360071
512	NC_007764	CGC	2	6	23237	23242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360071
513	NC_007764	TCG	2	6	23278	23283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360071
514	NC_007764	TCG	2	6	23305	23310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360071
515	NC_007764	GCT	2	6	23312	23317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360071
516	NC_007764	GGC	2	6	23327	23332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360071
517	NC_007764	GC	3	6	23347	23352	0 %	0 %	50 %	50 %	86360071
518	NC_007764	CCA	2	6	23386	23391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360071
519	NC_007764	CAG	2	6	23397	23402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360071
520	NC_007764	GA	3	6	23424	23429	50 %	0 %	50 %	0 %	86360071
521	NC_007764	TCGA	2	8	23430	23437	25 %	25 %	25 %	25 %	86360071
522	NC_007764	GCG	2	6	23440	23445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360071
523	NC_007764	TAT	2	6	23487	23492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360071
524	NC_007764	CGA	2	6	23500	23505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360071
525	NC_007764	CGA	2	6	23516	23521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360071
526	NC_007764	TTC	2	6	23550	23555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360071
527	NC_007764	CGT	2	6	23570	23575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360071
528	NC_007764	CCGAGG	2	12	23587	23598	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360071
529	NC_007764	TGA	2	6	23677	23682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360071
530	NC_007764	CGG	2	6	23747	23752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360071
531	NC_007764	GGC	2	6	23781	23786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360071
532	NC_007764	CGA	2	6	23840	23845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360071
533	NC_007764	TGA	2	6	23866	23871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360071
534	NC_007764	GAA	2	6	23910	23915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360072
535	NC_007764	GTC	2	6	23941	23946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360072
536	NC_007764	GAA	2	6	23950	23955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360072
537	NC_007764	AGA	2	6	23969	23974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360072
538	NC_007764	CTT	2	6	24000	24005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360072
539	NC_007764	ATC	2	6	24031	24036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360072
540	NC_007764	GAC	2	6	24061	24066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360072
541	NC_007764	CGCGA	2	10	24067	24076	20 %	0 %	40 %	40 %	86360072
542	NC_007764	TC	3	6	24179	24184	0 %	50 %	0 %	50 %	86360072
543	NC_007764	GC	3	6	24196	24201	0 %	0 %	50 %	50 %	86360072
544	NC_007764	CGG	2	6	24276	24281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
545	NC_007764	TCT	2	6	24330	24335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360073
546	NC_007764	GGC	2	6	24370	24375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
547	NC_007764	CGT	2	6	24412	24417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360073
548	NC_007764	CGAC	2	8	24429	24436	25 %	0 %	25 %	50 %	86360073
549	NC_007764	GTC	2	6	24485	24490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360073
550	NC_007764	GCC	2	6	24509	24514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360073
551	NC_007764	ATT	2	6	24597	24602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360073
552	NC_007764	TAT	2	6	24617	24622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360073
553	NC_007764	ATGCCG	2	12	24642	24653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360073
554	NC_007764	GCG	2	6	24752	24757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
555	NC_007764	TGCC	2	8	24774	24781	0 %	25 %	25 %	50 %	86360073
556	NC_007764	AAG	2	6	24818	24823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360073
557	NC_007764	TGG	2	6	24851	24856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360073
558	NC_007764	GCG	2	6	24861	24866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
559	NC_007764	GCA	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360073
560	NC_007764	CCG	2	6	24891	24896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360073
561	NC_007764	GCG	2	6	24941	24946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360073
562	NC_007764	CCT	2	6	24966	24971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360073
563	NC_007764	CCG	3	9	24987	24995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360073
564	NC_007764	TCG	2	6	25002	25007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360073
565	NC_007764	GC	3	6	25017	25022	0 %	0 %	50 %	50 %	86360073
566	NC_007764	CAG	2	6	25169	25174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360073
567	NC_007764	ATT	2	6	25203	25208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360073
568	NC_007764	TCT	2	6	25482	25487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360074
569	NC_007764	CTG	3	9	25508	25516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
570	NC_007764	CTG	3	9	25712	25720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
571	NC_007764	CTG	2	6	25736	25741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
572	NC_007764	TGC	3	9	25764	25772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
573	NC_007764	CGGAC	2	10	25775	25784	20 %	0 %	40 %	40 %	86360074
574	NC_007764	TCA	2	6	25785	25790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360074
575	NC_007764	GATC	2	8	25816	25823	25 %	25 %	25 %	25 %	86360074
576	NC_007764	CAA	2	6	25840	25845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360074
577	NC_007764	CAT	2	6	25876	25881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360074
578	NC_007764	TCA	2	6	25890	25895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360074
579	NC_007764	AAG	2	6	25919	25924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360074
580	NC_007764	GGC	2	6	25945	25950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
581	NC_007764	GCG	2	6	25959	25964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
582	NC_007764	CTG	2	6	25994	25999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360074
583	NC_007764	GGC	2	6	26020	26025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
584	NC_007764	CTT	2	6	26078	26083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360074
585	NC_007764	GGC	2	6	26084	26089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
586	NC_007764	ATG	2	6	26099	26104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360074
587	NC_007764	GCG	2	6	26157	26162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
588	NC_007764	CGG	2	6	26163	26168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360074
589	NC_007764	TGG	2	6	26181	26186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360074
590	NC_007764	TTC	2	6	26219	26224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360074
591	NC_007764	TGG	2	6	26280	26285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360075
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593	NC_007764	CTG	3	9	26328	26336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360075
594	NC_007764	CTC	2	6	26369	26374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360075
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596	NC_007764	CTGG	2	8	26398	26405	0 %	25 %	50 %	25 %	86360075
597	NC_007764	TGC	2	6	26503	26508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360075
598	NC_007764	GTTC	2	8	26542	26549	0 %	50 %	25 %	25 %	86360075
599	NC_007764	GTT	2	6	26573	26578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360075
600	NC_007764	GAT	2	6	26588	26593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360075
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603	NC_007764	TCGA	2	8	26748	26755	25 %	25 %	25 %	25 %	86360075
604	NC_007764	GCG	2	6	26773	26778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360075
605	NC_007764	CCT	2	6	26863	26868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360075
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608	NC_007764	ATC	2	6	27003	27008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360075
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611	NC_007764	ACG	2	6	27185	27190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360076
612	NC_007764	GCT	2	6	27253	27258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360076
613	NC_007764	GGTG	2	8	27328	27335	0 %	25 %	75 %	0 %	86360076
614	NC_007764	TGC	2	6	27405	27410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360076
615	NC_007764	CAG	3	9	27467	27475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360076
616	NC_007764	CCG	2	6	27509	27514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360076
617	NC_007764	AAG	2	6	27551	27556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360076
618	NC_007764	CCG	2	6	27583	27588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360076
619	NC_007764	CCA	2	6	27592	27597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360076
620	NC_007764	CACG	2	8	27625	27632	25 %	0 %	25 %	50 %	86360076
621	NC_007764	TTCAT	2	10	27770	27779	20 %	60 %	0 %	20 %	86360076
622	NC_007764	GTC	2	6	27790	27795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360076
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625	NC_007764	GCG	2	6	27884	27889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360076
626	NC_007764	CG	4	8	27921	27928	0 %	0 %	50 %	50 %	86360076
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752	NC_007764	GA	3	6	32854	32859	50 %	0 %	50 %	0 %	86360082
753	NC_007764	GGATCA	2	12	32873	32884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86360082
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755	NC_007764	AAC	2	6	32937	32942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360082
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