MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 4375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007763	TTG	2	6	128478	128483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359994
3002	NC_007763	CCT	2	6	128526	128531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359994
3003	NC_007763	CTG	2	6	128543	128548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359994
3004	NC_007763	TCT	2	6	128554	128559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359994
3005	NC_007763	CTC	2	6	128600	128605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359994
3006	NC_007763	CTT	2	6	128612	128617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359994
3007	NC_007763	CTC	2	6	128645	128650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359994
3008	NC_007763	ACC	2	6	128653	128658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359994
3009	NC_007763	TCT	2	6	128671	128676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359994
3010	NC_007763	CGAT	2	8	128689	128696	25 %	25 %	25 %	25 %	86359994
3011	NC_007763	TCA	2	6	128698	128703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359994
3012	NC_007763	TCC	2	6	128754	128759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_007763	A	6	6	128761	128766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_007763	AGTC	2	8	128793	128800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_007763	GCCCC	2	10	128806	128815	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3016	NC_007763	CGG	2	6	128828	128833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_007763	CAA	2	6	128863	128868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359995
3018	NC_007763	TCG	2	6	128934	128939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359995
3019	NC_007763	TCGA	2	8	128970	128977	25 %	25 %	25 %	25 %	86359995
3020	NC_007763	ATG	2	6	129009	129014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359995
3021	NC_007763	TGA	2	6	129091	129096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359995
3022	NC_007763	CATGGA	2	12	129124	129135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86359995
3023	NC_007763	TCA	2	6	129225	129230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359995
3024	NC_007763	CGG	2	6	129346	129351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359995
3025	NC_007763	ATG	2	6	129458	129463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359995
3026	NC_007763	TCG	2	6	129622	129627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359995
3027	NC_007763	AAG	2	6	129636	129641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359995
3028	NC_007763	GGC	2	6	129689	129694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359995
3029	NC_007763	TTG	2	6	129702	129707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359995
3030	NC_007763	CGC	2	6	129883	129888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359996
3031	NC_007763	TTC	2	6	129925	129930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359996
3032	NC_007763	GCC	2	6	130001	130006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359996
3033	NC_007763	CGA	2	6	130050	130055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359996
3034	NC_007763	GCC	2	6	130056	130061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359996
3035	NC_007763	TCG	2	6	130127	130132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359996
3036	NC_007763	GAA	2	6	130272	130277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359996
3037	NC_007763	TTC	2	6	130291	130296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359996
3038	NC_007763	GCC	2	6	130303	130308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359996
3039	NC_007763	GCG	2	6	130314	130319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359996
3040	NC_007763	GAA	2	6	130324	130329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359996
3041	NC_007763	ATGG	2	8	130336	130343	25 %	25 %	50 %	0 %	86359996
3042	NC_007763	CGA	2	6	130371	130376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359996
3043	NC_007763	GCG	2	6	130408	130413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359996
3044	NC_007763	GATC	2	8	130455	130462	25 %	25 %	25 %	25 %	86359996
3045	NC_007763	GCG	2	6	130466	130471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359996
3046	NC_007763	GGC	2	6	130486	130491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359996
3047	NC_007763	CGACA	2	10	130537	130546	40 %	0 %	20 %	40 %	86359996
3048	NC_007763	CGGA	2	8	130557	130564	25 %	0 %	50 %	25 %	86359996
3049	NC_007763	TCG	2	6	130593	130598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359996
3050	NC_007763	CGA	2	6	130689	130694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359996
3051	NC_007763	CGA	2	6	130698	130703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359996
3052	NC_007763	CGA	2	6	130716	130721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359996
3053	NC_007763	GC	3	6	130742	130747	0 %	0 %	50 %	50 %	86359996
3054	NC_007763	AACC	2	8	130748	130755	50 %	0 %	0 %	50 %	86359996
3055	NC_007763	CCGCAC	2	12	130769	130780	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_007763	TCC	2	6	130805	130810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_007763	TC	3	6	130987	130992	0 %	50 %	0 %	50 %	86359997
3058	NC_007763	CGT	2	6	131031	131036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359997
3059	NC_007763	GGC	3	9	131045	131053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359997
3060	NC_007763	GA	3	6	131104	131109	50 %	0 %	50 %	0 %	86359997
3061	NC_007763	TGA	2	6	131125	131130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359997
3062	NC_007763	CTT	2	6	131168	131173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359997
3063	NC_007763	TGC	2	6	131233	131238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359997
3064	NC_007763	CGA	2	6	131249	131254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359997
3065	NC_007763	CG	3	6	131285	131290	0 %	0 %	50 %	50 %	86359997
3066	NC_007763	TCG	2	6	131296	131301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359997
3067	NC_007763	GAT	2	6	131306	131311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359997
3068	NC_007763	ATCG	2	8	131331	131338	25 %	25 %	25 %	25 %	86359997
3069	NC_007763	TTG	2	6	131374	131379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359997
3070	NC_007763	GATC	2	8	131417	131424	25 %	25 %	25 %	25 %	86359997
3071	NC_007763	TGG	2	6	131464	131469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359997
3072	NC_007763	CCG	2	6	131546	131551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359997
3073	NC_007763	CGGCA	2	10	131562	131571	20 %	0 %	40 %	40 %	86359997
3074	NC_007763	GGC	2	6	131630	131635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359997
3075	NC_007763	CTG	2	6	131649	131654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359997
3076	NC_007763	ATC	2	6	131673	131678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359997
3077	NC_007763	CCG	2	6	131711	131716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359997
3078	NC_007763	CG	3	6	131779	131784	0 %	0 %	50 %	50 %	86359997
3079	NC_007763	CTT	2	6	131859	131864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359997
3080	NC_007763	GCCG	2	8	131901	131908	0 %	0 %	50 %	50 %	86359997
3081	NC_007763	CAT	2	6	131912	131917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359997
3082	NC_007763	ATG	2	6	132005	132010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359997
3083	NC_007763	AGCC	2	8	132018	132025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_007763	CGGC	2	8	132038	132045	0 %	0 %	50 %	50 %	86359998
3085	NC_007763	GAC	2	6	132190	132195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359998
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3087	NC_007763	TCG	2	6	132239	132244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359998
3088	NC_007763	CGA	2	6	132264	132269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359998
3089	NC_007763	GCC	2	6	132286	132291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359998
3090	NC_007763	CGG	2	6	132330	132335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359998
3091	NC_007763	TCGG	2	8	132389	132396	0 %	25 %	50 %	25 %	86359998
3092	NC_007763	GCG	2	6	132399	132404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359998
3093	NC_007763	CAT	2	6	132426	132431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359998
3094	NC_007763	AGCGA	2	10	132449	132458	40 %	0 %	40 %	20 %	86359998
3095	NC_007763	CG	3	6	132493	132498	0 %	0 %	50 %	50 %	86359998
3096	NC_007763	GC	4	8	132503	132510	0 %	0 %	50 %	50 %	86359998
3097	NC_007763	CTC	2	6	132511	132516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359998
3098	NC_007763	CGA	2	6	132528	132533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359998
3099	NC_007763	GGC	2	6	132541	132546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359998
3100	NC_007763	CAGC	2	8	132672	132679	25 %	0 %	25 %	50 %	86359998
3101	NC_007763	GGC	2	6	132681	132686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359998
3102	NC_007763	GGCC	2	8	132699	132706	0 %	0 %	50 %	50 %	86359998
3103	NC_007763	GCG	2	6	132729	132734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359998
3104	NC_007763	GGCG	3	12	132731	132742	0 %	0 %	75 %	25 %	86359998
3105	NC_007763	GAA	2	6	132811	132816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359998
3106	NC_007763	CGT	2	6	132846	132851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359998
3107	NC_007763	TCG	2	6	132932	132937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359998
3108	NC_007763	CGC	2	6	132952	132957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359998
3109	NC_007763	CGT	2	6	132970	132975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359998
3110	NC_007763	GCC	2	6	132997	133002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359998
3111	NC_007763	ACG	2	6	133027	133032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359998
3112	NC_007763	TCG	2	6	133049	133054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359998
3113	NC_007763	GTG	2	6	133058	133063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359998
3114	NC_007763	CGA	2	6	133074	133079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359998
3115	NC_007763	AGG	2	6	133134	133139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359998
3116	NC_007763	GAA	2	6	133204	133209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359998
3117	NC_007763	GGC	2	6	133391	133396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_007763	CGG	3	9	133483	133491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_007763	CCG	3	9	133527	133535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_007763	GC	3	6	133559	133564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_007763	TTTC	2	8	133642	133649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_007763	ATC	2	6	133659	133664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3124	NC_007763	CGA	2	6	133741	133746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359999
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3248	NC_007763	CTC	2	6	138564	138569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360002
3249	NC_007763	CG	3	6	138644	138649	0 %	0 %	50 %	50 %	86360002
3250	NC_007763	CGG	2	6	138660	138665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360002
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3371	NC_007763	ATC	2	6	143843	143848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360006
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3373	NC_007763	TGC	2	6	143987	143992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360006
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3375	NC_007763	GCT	2	6	144012	144017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360006
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3383	NC_007763	GCTCG	2	10	144281	144290	0 %	20 %	40 %	40 %	86360007
3384	NC_007763	CG	3	6	144289	144294	0 %	0 %	50 %	50 %	86360007
3385	NC_007763	TAT	2	6	144353	144358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360007
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3403	NC_007763	GGC	2	6	144890	144895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360007
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3451	NC_007763	AGG	2	6	146662	146667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3477	NC_007763	CCAT	2	8	147710	147717	25 %	25 %	0 %	50 %	86360010
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3482	NC_007763	CGG	2	6	148013	148018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360011
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3484	NC_007763	TGC	2	6	148027	148032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360011
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3491	NC_007763	CGC	2	6	148271	148276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360011
3492	NC_007763	ATC	2	6	148284	148289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360011
3493	NC_007763	GCG	2	6	148291	148296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360011
3494	NC_007763	TCG	2	6	148312	148317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360011
3495	NC_007763	CTG	2	6	148341	148346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360011
3496	NC_007763	CGACC	2	10	148355	148364	20 %	0 %	20 %	60 %	86360011
3497	NC_007763	GGCG	2	8	148384	148391	0 %	0 %	75 %	25 %	86360011
3498	NC_007763	GC	3	6	148421	148426	0 %	0 %	50 %	50 %	86360011
3499	NC_007763	CCGA	2	8	148440	148447	25 %	0 %	25 %	50 %	86360011
3500	NC_007763	GCC	2	6	148488	148493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360011

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