MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 4375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007763	CGC	2	6	21775	21780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359901
502	NC_007763	CCG	2	6	21817	21822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359901
503	NC_007763	CTCG	2	8	21828	21835	0 %	25 %	25 %	50 %	86359901
504	NC_007763	CAT	2	6	21946	21951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359901
505	NC_007763	GC	3	6	21994	21999	0 %	0 %	50 %	50 %	86359901
506	NC_007763	ATCGAG	2	12	22105	22116	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86359901
507	NC_007763	TGC	2	6	22170	22175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359901
508	NC_007763	ATT	2	6	22283	22288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359902
509	NC_007763	ACG	2	6	22316	22321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359902
510	NC_007763	GCG	2	6	22322	22327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359902
511	NC_007763	GCT	2	6	22335	22340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359902
512	NC_007763	GCT	2	6	22368	22373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359902
513	NC_007763	CAT	2	6	22377	22382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359902
514	NC_007763	TGC	2	6	22391	22396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359902
515	NC_007763	GGCCGA	2	12	22551	22562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86359902
516	NC_007763	GATC	2	8	22596	22603	25 %	25 %	25 %	25 %	86359902
517	NC_007763	CCG	2	6	22640	22645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359902
518	NC_007763	CAGAAG	2	12	22648	22659	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	86359902
519	NC_007763	ACG	2	6	22688	22693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359902
520	NC_007763	CGA	2	6	22710	22715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359902
521	NC_007763	TGC	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359902
522	NC_007763	GTC	3	9	22849	22857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359902
523	NC_007763	GCCG	2	8	22890	22897	0 %	0 %	50 %	50 %	86359902
524	NC_007763	TCG	2	6	22925	22930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359902
525	NC_007763	CGGG	2	8	23088	23095	0 %	0 %	75 %	25 %	86359902
526	NC_007763	CAA	2	6	23115	23120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359902
527	NC_007763	CGGC	2	8	23133	23140	0 %	0 %	50 %	50 %	86359902
528	NC_007763	AGA	2	6	23141	23146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359902
529	NC_007763	GC	3	6	23151	23156	0 %	0 %	50 %	50 %	86359902
530	NC_007763	CGATCG	2	12	23174	23185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86359902
531	NC_007763	GAC	2	6	23200	23205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359902
532	NC_007763	TCCG	2	8	23235	23242	0 %	25 %	25 %	50 %	86359902
533	NC_007763	A	6	6	23297	23302	100 %	0 %	0 %	0 %	86359903
534	NC_007763	AAC	2	6	23308	23313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359903
535	NC_007763	TGC	2	6	23330	23335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
536	NC_007763	TGC	3	9	23339	23347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
537	NC_007763	CGG	2	6	23360	23365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359903
538	NC_007763	TGA	2	6	23375	23380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359903
539	NC_007763	CGT	2	6	23382	23387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
540	NC_007763	ACT	2	6	23390	23395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359903
541	NC_007763	TTC	2	6	23425	23430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359903
542	NC_007763	CTG	2	6	23500	23505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
543	NC_007763	TCA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359903
544	NC_007763	GCT	2	6	23616	23621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
545	NC_007763	CGT	2	6	23634	23639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
546	NC_007763	CGC	2	6	23697	23702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359903
547	NC_007763	TGC	2	6	23795	23800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
548	NC_007763	TAT	2	6	23836	23841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359903
549	NC_007763	TGC	2	6	23915	23920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
550	NC_007763	TCG	2	6	23975	23980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
551	NC_007763	CGG	3	9	23985	23993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359903
552	NC_007763	CGA	2	6	24005	24010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359903
553	NC_007763	CGG	3	9	24065	24073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359903
554	NC_007763	ATC	2	6	24082	24087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359903
555	NC_007763	TCA	2	6	24095	24100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359903
556	NC_007763	CTG	2	6	24103	24108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359903
557	NC_007763	TGA	2	6	24131	24136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359903
558	NC_007763	CAG	2	6	24138	24143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359903
559	NC_007763	GCAG	2	8	24192	24199	25 %	0 %	50 %	25 %	86359904
560	NC_007763	CTGG	2	8	24206	24213	0 %	25 %	50 %	25 %	86359904
561	NC_007763	CGA	2	6	24217	24222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359904
562	NC_007763	TCA	2	6	24259	24264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359904
563	NC_007763	ATC	2	6	24390	24395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359904
564	NC_007763	TGA	2	6	24403	24408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359904
565	NC_007763	CGG	2	6	24439	24444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359904
566	NC_007763	TTC	2	6	24489	24494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359904
567	NC_007763	GCT	2	6	24497	24502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359904
568	NC_007763	GCC	2	6	24518	24523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359904
569	NC_007763	CTT	2	6	24542	24547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359904
570	NC_007763	CGA	2	6	24674	24679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359904
571	NC_007763	TTCC	2	8	24701	24708	0 %	50 %	0 %	50 %	86359904
572	NC_007763	CTT	2	6	24713	24718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359904
573	NC_007763	GCG	2	6	24748	24753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359904
574	NC_007763	CTT	2	6	24767	24772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359904
575	NC_007763	CTG	2	6	24801	24806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359904
576	NC_007763	GAC	3	9	24818	24826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359904
577	NC_007763	GGC	2	6	24827	24832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359904
578	NC_007763	GCC	2	6	24870	24875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359904
579	NC_007763	CAT	2	6	24917	24922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359904
580	NC_007763	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	86359904
581	NC_007763	GAG	2	6	24991	24996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359904
582	NC_007763	TTC	2	6	25047	25052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359905
583	NC_007763	T	7	7	25095	25101	0 %	100 %	0 %	0 %	86359905
584	NC_007763	CGC	2	6	25114	25119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359905
585	NC_007763	TGC	2	6	25129	25134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359905
586	NC_007763	ACC	2	6	25143	25148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359905
587	NC_007763	GCT	2	6	25172	25177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359905
588	NC_007763	TTCA	2	8	25188	25195	25 %	50 %	0 %	25 %	86359905
589	NC_007763	TGG	2	6	25230	25235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359905
590	NC_007763	GCC	2	6	25321	25326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_007763	GGA	2	6	25356	25361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_007763	TAT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359906
593	NC_007763	GAC	3	9	25383	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
594	NC_007763	CTG	3	9	25399	25407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359906
595	NC_007763	AGGAAA	2	12	25502	25513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
596	NC_007763	TCG	2	6	25523	25528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359906
597	NC_007763	GGT	2	6	25563	25568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359906
598	NC_007763	CAC	2	6	25581	25586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359906
599	NC_007763	CAG	2	6	25771	25776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
600	NC_007763	TCGATG	2	12	25835	25846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86359906
601	NC_007763	CAG	2	6	25906	25911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
602	NC_007763	GAA	2	6	25956	25961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
603	NC_007763	TTC	2	6	26041	26046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359906
604	NC_007763	AAG	2	6	26068	26073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
605	NC_007763	AAG	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
606	NC_007763	CGA	2	6	26190	26195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
607	NC_007763	GC	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	86359906
608	NC_007763	GGC	2	6	26251	26256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359906
609	NC_007763	CGGCC	2	10	26265	26274	0 %	0 %	40 %	60 %	86359906
610	NC_007763	TCCA	2	8	26284	26291	25 %	25 %	0 %	50 %	86359906
611	NC_007763	CTGGA	2	10	26299	26308	20 %	20 %	40 %	20 %	86359906
612	NC_007763	CAG	2	6	26389	26394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359906
613	NC_007763	CCG	2	6	26417	26422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359906
614	NC_007763	AAGG	2	8	26431	26438	50 %	0 %	50 %	0 %	86359906
615	NC_007763	GTC	2	6	26446	26451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359906
616	NC_007763	TGA	2	6	26555	26560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359906
617	NC_007763	GGC	2	6	26586	26591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359906
618	NC_007763	GAA	2	6	26634	26639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
619	NC_007763	ACCG	2	8	26695	26702	25 %	0 %	25 %	50 %	86359906
620	NC_007763	CG	3	6	26701	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	86359906
621	NC_007763	CGG	2	6	26715	26720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359906
622	NC_007763	TGG	2	6	26809	26814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359906
623	NC_007763	TCC	2	6	26833	26838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359906
624	NC_007763	TGC	2	6	26894	26899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359906
625	NC_007763	GAA	2	6	26988	26993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
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627	NC_007763	AGA	2	6	27080	27085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359906
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