MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007762	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	86359706
2	NC_007762	A	6	6	4649	4654	100 %	0 %	0 %	0 %	86359708
3	NC_007762	T	6	6	5752	5757	0 %	100 %	0 %	0 %	86359709
4	NC_007762	A	6	6	7368	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	86359711
5	NC_007762	G	6	6	8102	8107	0 %	0 %	100 %	0 %	86359712
6	NC_007762	C	6	6	9563	9568	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_007762	C	6	6	9985	9990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_007762	G	6	6	12463	12468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007762	A	6	6	15617	15622	100 %	0 %	0 %	0 %	86359717
10	NC_007762	T	6	6	16296	16301	0 %	100 %	0 %	0 %	86359719
11	NC_007762	T	6	6	17608	17613	0 %	100 %	0 %	0 %	86359719
12	NC_007762	T	7	7	19200	19206	0 %	100 %	0 %	0 %	86359722
13	NC_007762	A	7	7	30884	30890	100 %	0 %	0 %	0 %	86359732
14	NC_007762	C	6	6	34390	34395	0 %	0 %	0 %	100 %	86359735
15	NC_007762	A	6	6	35940	35945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007762	T	6	6	36666	36671	0 %	100 %	0 %	0 %	86359738
17	NC_007762	T	7	7	38367	38373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007762	G	6	6	39609	39614	0 %	0 %	100 %	0 %	86359740
19	NC_007762	C	6	6	43730	43735	0 %	0 %	0 %	100 %	86359744
20	NC_007762	A	6	6	45019	45024	100 %	0 %	0 %	0 %	86359746
21	NC_007762	A	6	6	47778	47783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007762	T	6	6	48741	48746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007762	A	9	9	54023	54031	100 %	0 %	0 %	0 %	86359754
24	NC_007762	A	6	6	56683	56688	100 %	0 %	0 %	0 %	86359757
25	NC_007762	T	6	6	59311	59316	0 %	100 %	0 %	0 %	86359760
26	NC_007762	G	6	6	59989	59994	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007762	T	6	6	63456	63461	0 %	100 %	0 %	0 %	86359763
28	NC_007762	A	6	6	66275	66280	100 %	0 %	0 %	0 %	86359766
29	NC_007762	A	6	6	66553	66558	100 %	0 %	0 %	0 %	86359766
30	NC_007762	A	6	6	67217	67222	100 %	0 %	0 %	0 %	86359766
31	NC_007762	C	6	6	67495	67500	0 %	0 %	0 %	100 %	86359766
32	NC_007762	T	6	6	67895	67900	0 %	100 %	0 %	0 %	86359766
33	NC_007762	A	6	6	71864	71869	100 %	0 %	0 %	0 %	86359769
34	NC_007762	C	6	6	72399	72404	0 %	0 %	0 %	100 %	86359770
35	NC_007762	C	8	8	73193	73200	0 %	0 %	0 %	100 %	86359770
36	NC_007762	G	6	6	74080	74085	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007762	G	6	6	74378	74383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007762	A	6	6	74565	74570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007762	A	6	6	75010	75015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007762	A	6	6	84061	84066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007762	C	6	6	85434	85439	0 %	0 %	0 %	100 %	86359776
42	NC_007762	A	6	6	86119	86124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007762	A	6	6	90574	90579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007762	A	6	6	95034	95039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007762	A	6	6	95173	95178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007762	G	6	6	95347	95352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007762	A	6	6	95756	95761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007762	T	9	9	96807	96815	0 %	100 %	0 %	0 %	86359787
49	NC_007762	A	6	6	99725	99730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007762	T	7	7	100115	100121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007762	A	6	6	101337	101342	100 %	0 %	0 %	0 %	86359790
52	NC_007762	A	6	6	112904	112909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007762	T	6	6	115194	115199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007762	T	6	6	115236	115241	0 %	100 %	0 %	0 %	86359805
55	NC_007762	A	6	6	120941	120946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007762	T	6	6	123886	123891	0 %	100 %	0 %	0 %	86359815
57	NC_007762	A	6	6	128303	128308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007762	A	6	6	129057	129062	100 %	0 %	0 %	0 %	86359819
59	NC_007762	A	6	6	129360	129365	100 %	0 %	0 %	0 %	86359819
60	NC_007762	T	7	7	136503	136509	0 %	100 %	0 %	0 %	86359825
61	NC_007762	G	6	6	139949	139954	0 %	0 %	100 %	0 %	86359829
62	NC_007762	C	6	6	141093	141098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_007762	A	6	6	144140	144145	100 %	0 %	0 %	0 %	86359834
64	NC_007762	A	6	6	145763	145768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007762	T	6	6	146095	146100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007762	T	7	7	148026	148032	0 %	100 %	0 %	0 %	86359836
67	NC_007762	C	6	6	151688	151693	0 %	0 %	0 %	100 %	86359838
68	NC_007762	C	7	7	152010	152016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_007762	T	7	7	157402	157408	0 %	100 %	0 %	0 %	86359840
70	NC_007762	C	6	6	165067	165072	0 %	0 %	0 %	100 %	86359850
71	NC_007762	A	6	6	165570	165575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007762	T	6	6	170509	170514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007762	C	6	6	174244	174249	0 %	0 %	0 %	100 %	86359858
74	NC_007762	T	6	6	175729	175734	0 %	100 %	0 %	0 %	86359859
75	NC_007762	T	6	6	181754	181759	0 %	100 %	0 %	0 %	86359869
76	NC_007762	T	6	6	182888	182893	0 %	100 %	0 %	0 %	86359870
77	NC_007762	C	6	6	183828	183833	0 %	0 %	0 %	100 %	86359871
78	NC_007762	T	6	6	187442	187447	0 %	100 %	0 %	0 %	86359873
79	NC_007762	A	7	7	190478	190484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.