MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 499

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007762	TGCA	2	8	345	352	25 %	25 %	25 %	25 %	86359706
2	NC_007762	ACGG	2	8	671	678	25 %	0 %	50 %	25 %	86359706
3	NC_007762	AAAT	2	8	810	817	75 %	25 %	0 %	0 %	86359706
4	NC_007762	ACAA	2	8	846	853	75 %	0 %	0 %	25 %	86359706
5	NC_007762	GCCC	2	8	1355	1362	0 %	0 %	25 %	75 %	86359707
6	NC_007762	CGAT	2	8	1598	1605	25 %	25 %	25 %	25 %	86359707
7	NC_007762	CCGG	3	12	1668	1679	0 %	0 %	50 %	50 %	86359707
8	NC_007762	GGCC	2	8	1809	1816	0 %	0 %	50 %	50 %	86359707
9	NC_007762	ATCA	2	8	2585	2592	50 %	25 %	0 %	25 %	86359707
10	NC_007762	GGAA	2	8	2875	2882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007762	CTTT	2	8	2893	2900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007762	GCAT	2	8	3475	3482	25 %	25 %	25 %	25 %	86359708
13	NC_007762	GTTT	2	8	3955	3962	0 %	75 %	25 %	0 %	86359708
14	NC_007762	TCCA	2	8	4482	4489	25 %	25 %	0 %	50 %	86359708
15	NC_007762	GATC	2	8	4824	4831	25 %	25 %	25 %	25 %	86359709
16	NC_007762	GAAT	2	8	5525	5532	50 %	25 %	25 %	0 %	86359709
17	NC_007762	ATTG	2	8	5834	5841	25 %	50 %	25 %	0 %	86359710
18	NC_007762	AGGG	2	8	6468	6475	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007762	CCTG	2	8	6502	6509	0 %	25 %	25 %	50 %	86359711
20	NC_007762	TGGC	2	8	7000	7007	0 %	25 %	50 %	25 %	86359711
21	NC_007762	TCCT	2	8	7161	7168	0 %	50 %	0 %	50 %	86359711
22	NC_007762	GCTG	2	8	7498	7505	0 %	25 %	50 %	25 %	86359711
23	NC_007762	CGGG	2	8	7657	7664	0 %	0 %	75 %	25 %	86359712
24	NC_007762	ACAG	3	12	8593	8604	50 %	0 %	25 %	25 %	86359712
25	NC_007762	AGCG	2	8	8731	8738	25 %	0 %	50 %	25 %	86359712
26	NC_007762	ATTG	2	8	9217	9224	25 %	50 %	25 %	0 %	86359712
27	NC_007762	GCGG	2	8	9339	9346	0 %	0 %	75 %	25 %	86359712
28	NC_007762	GCTC	2	8	9349	9356	0 %	25 %	25 %	50 %	86359712
29	NC_007762	TGAC	2	8	9529	9536	25 %	25 %	25 %	25 %	86359712
30	NC_007762	CGAT	2	8	9649	9656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007762	CGCT	2	8	10543	10550	0 %	25 %	25 %	50 %	86359713
32	NC_007762	TGAT	2	8	10827	10834	25 %	50 %	25 %	0 %	86359714
33	NC_007762	CAGG	2	8	10994	11001	25 %	0 %	50 %	25 %	86359714
34	NC_007762	CGGC	2	8	11579	11586	0 %	0 %	50 %	50 %	86359714
35	NC_007762	TTCC	2	8	12345	12352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007762	TGGG	2	8	13454	13461	0 %	25 %	75 %	0 %	86359715
37	NC_007762	GCAT	2	8	14107	14114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007762	TTTC	2	8	14192	14199	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007762	CAGT	2	8	14262	14269	25 %	25 %	25 %	25 %	86359716
40	NC_007762	TGAG	2	8	15360	15367	25 %	25 %	50 %	0 %	86359717
41	NC_007762	CTTC	2	8	15447	15454	0 %	50 %	0 %	50 %	86359717
42	NC_007762	TGAC	2	8	15496	15503	25 %	25 %	25 %	25 %	86359717
43	NC_007762	AACG	2	8	15522	15529	50 %	0 %	25 %	25 %	86359717
44	NC_007762	CGAG	2	8	15625	15632	25 %	0 %	50 %	25 %	86359717
45	NC_007762	TCAA	2	8	15705	15712	50 %	25 %	0 %	25 %	86359717
46	NC_007762	TGCC	2	8	16472	16479	0 %	25 %	25 %	50 %	86359719
47	NC_007762	CAAG	2	8	17053	17060	50 %	0 %	25 %	25 %	86359719
48	NC_007762	GCGA	2	8	17547	17554	25 %	0 %	50 %	25 %	86359719
49	NC_007762	TTGA	2	8	17569	17576	25 %	50 %	25 %	0 %	86359719
50	NC_007762	GCTC	2	8	18175	18182	0 %	25 %	25 %	50 %	86359720
51	NC_007762	CCCA	2	8	18211	18218	25 %	0 %	0 %	75 %	86359720
52	NC_007762	AACG	2	8	18704	18711	50 %	0 %	25 %	25 %	86359721
53	NC_007762	ACAA	2	8	18795	18802	75 %	0 %	0 %	25 %	86359721
54	NC_007762	AACC	2	8	18837	18844	50 %	0 %	0 %	50 %	86359721
55	NC_007762	TCGC	2	8	19710	19717	0 %	25 %	25 %	50 %	86359723
56	NC_007762	GGAA	2	8	19741	19748	50 %	0 %	50 %	0 %	86359723
57	NC_007762	GCCT	2	8	19848	19855	0 %	25 %	25 %	50 %	86359723
58	NC_007762	AGCC	2	8	19964	19971	25 %	0 %	25 %	50 %	86359723
59	NC_007762	TTCC	2	8	20078	20085	0 %	50 %	0 %	50 %	86359723
60	NC_007762	TGGC	2	8	20767	20774	0 %	25 %	50 %	25 %	86359723
61	NC_007762	GTTC	2	8	20801	20808	0 %	50 %	25 %	25 %	86359723
62	NC_007762	GCGG	2	8	21132	21139	0 %	0 %	75 %	25 %	86359723
63	NC_007762	TGCC	2	8	21668	21675	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007762	CGCC	2	8	21772	21779	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_007762	GGCC	2	8	21814	21821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007762	TTGC	2	8	22316	22323	0 %	50 %	25 %	25 %	86359725
67	NC_007762	CTTT	2	8	23201	23208	0 %	75 %	0 %	25 %	86359725
68	NC_007762	TCGT	2	8	23754	23761	0 %	50 %	25 %	25 %	86359725
69	NC_007762	CGGC	2	8	24398	24405	0 %	0 %	50 %	50 %	86359726
70	NC_007762	TTGA	2	8	25159	25166	25 %	50 %	25 %	0 %	86359727
71	NC_007762	CTGC	2	8	26551	26558	0 %	25 %	25 %	50 %	86359728
72	NC_007762	CGGC	2	8	26591	26598	0 %	0 %	50 %	50 %	86359728
73	NC_007762	CCGG	3	12	26618	26629	0 %	0 %	50 %	50 %	86359728
74	NC_007762	TTTC	2	8	27114	27121	0 %	75 %	0 %	25 %	86359728
75	NC_007762	GAAG	2	8	27653	27660	50 %	0 %	50 %	0 %	86359729
76	NC_007762	ATGA	2	8	27666	27673	50 %	25 %	25 %	0 %	86359729
77	NC_007762	GAAG	2	8	28169	28176	50 %	0 %	50 %	0 %	86359729
78	NC_007762	GATG	2	8	28178	28185	25 %	25 %	50 %	0 %	86359729
79	NC_007762	CGGC	2	8	28377	28384	0 %	0 %	50 %	50 %	86359730
80	NC_007762	TGAT	2	8	29267	29274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007762	GTCG	2	8	29902	29909	0 %	25 %	50 %	25 %	86359731
82	NC_007762	CCGA	2	8	29924	29931	25 %	0 %	25 %	50 %	86359731
83	NC_007762	ATGG	2	8	30393	30400	25 %	25 %	50 %	0 %	86359732
84	NC_007762	GATC	2	8	30560	30567	25 %	25 %	25 %	25 %	86359732
85	NC_007762	ACCA	2	8	30663	30670	50 %	0 %	0 %	50 %	86359732
86	NC_007762	AGAT	2	8	30871	30878	50 %	25 %	25 %	0 %	86359732
87	NC_007762	CGAA	2	8	31049	31056	50 %	0 %	25 %	25 %	86359732
88	NC_007762	GTCG	2	8	31565	31572	0 %	25 %	50 %	25 %	86359732
89	NC_007762	CATC	2	8	32484	32491	25 %	25 %	0 %	50 %	86359733
90	NC_007762	GAGC	2	8	32841	32848	25 %	0 %	50 %	25 %	86359733
91	NC_007762	AGCA	2	8	33468	33475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007762	CTGC	2	8	33666	33673	0 %	25 %	25 %	50 %	86359734
93	NC_007762	GGCT	2	8	34147	34154	0 %	25 %	50 %	25 %	86359735
94	NC_007762	TCCA	2	8	34257	34264	25 %	25 %	0 %	50 %	86359735
95	NC_007762	ACAA	2	8	34366	34373	75 %	0 %	0 %	25 %	86359735
96	NC_007762	GGAA	2	8	34420	34427	50 %	0 %	50 %	0 %	86359735
97	NC_007762	GCTT	2	8	34887	34894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007762	TTGC	2	8	34966	34973	0 %	50 %	25 %	25 %	86359736
99	NC_007762	CGAC	2	8	36188	36195	25 %	0 %	25 %	50 %	86359738
100	NC_007762	CGGC	2	8	36203	36210	0 %	0 %	50 %	50 %	86359738
101	NC_007762	CGGG	2	8	36300	36307	0 %	0 %	75 %	25 %	86359738
102	NC_007762	TCGA	2	8	37325	37332	25 %	25 %	25 %	25 %	86359739
103	NC_007762	GGCT	2	8	38838	38845	0 %	25 %	50 %	25 %	86359740
104	NC_007762	GTTG	2	8	39054	39061	0 %	50 %	50 %	0 %	86359740
105	NC_007762	AAAG	2	8	39281	39288	75 %	0 %	25 %	0 %	86359740
106	NC_007762	TCAA	2	8	39414	39421	50 %	25 %	0 %	25 %	86359740
107	NC_007762	CCGG	2	8	39735	39742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007762	GATC	3	12	39890	39901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007762	CGGC	2	8	40570	40577	0 %	0 %	50 %	50 %	86359741
110	NC_007762	TGGC	2	8	40678	40685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007762	CTGG	2	8	41407	41414	0 %	25 %	50 %	25 %	86359743
112	NC_007762	ATCG	2	8	42727	42734	25 %	25 %	25 %	25 %	86359743
113	NC_007762	CGTG	2	8	43074	43081	0 %	25 %	50 %	25 %	86359743
114	NC_007762	TCCT	2	8	43236	43243	0 %	50 %	0 %	50 %	86359743
115	NC_007762	GCCT	2	8	43445	43452	0 %	25 %	25 %	50 %	86359744
116	NC_007762	GAAA	2	8	43886	43893	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007762	GCAC	2	8	44185	44192	25 %	0 %	25 %	50 %	86359745
118	NC_007762	CTGA	2	8	44216	44223	25 %	25 %	25 %	25 %	86359745
119	NC_007762	CGTC	2	8	44683	44690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007762	TGGC	2	8	44805	44812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007762	TGGC	2	8	44880	44887	0 %	25 %	50 %	25 %	86359746
122	NC_007762	ACTC	2	8	44922	44929	25 %	25 %	0 %	50 %	86359746
123	NC_007762	ATGA	2	8	45179	45186	50 %	25 %	25 %	0 %	86359746
124	NC_007762	GCGA	2	8	45334	45341	25 %	0 %	50 %	25 %	86359747
125	NC_007762	GACT	2	8	46024	46031	25 %	25 %	25 %	25 %	86359747
126	NC_007762	GTTT	2	8	46079	46086	0 %	75 %	25 %	0 %	86359747
127	NC_007762	ATGC	2	8	46170	46177	25 %	25 %	25 %	25 %	86359747
128	NC_007762	GCGA	2	8	46444	46451	25 %	0 %	50 %	25 %	86359747
129	NC_007762	ATCT	2	8	47246	47253	25 %	50 %	0 %	25 %	86359747
130	NC_007762	GGGC	2	8	47720	47727	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007762	GCCG	2	8	47746	47753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007762	TCGC	2	8	47986	47993	0 %	25 %	25 %	50 %	86359748
133	NC_007762	CTCG	2	8	48158	48165	0 %	25 %	25 %	50 %	86359748
134	NC_007762	CACG	2	8	48359	48366	25 %	0 %	25 %	50 %	86359748
135	NC_007762	CGGC	2	8	48756	48763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007762	GGAA	2	8	49003	49010	50 %	0 %	50 %	0 %	86359749
137	NC_007762	TCTA	2	8	49132	49139	25 %	50 %	0 %	25 %	86359750
138	NC_007762	ACCG	2	8	49734	49741	25 %	0 %	25 %	50 %	86359750
139	NC_007762	AAAG	2	8	49782	49789	75 %	0 %	25 %	0 %	86359750
140	NC_007762	GATC	2	8	49798	49805	25 %	25 %	25 %	25 %	86359750
141	NC_007762	TCGG	2	8	51185	51192	0 %	25 %	50 %	25 %	86359750
142	NC_007762	CCAT	2	8	52270	52277	25 %	25 %	0 %	50 %	86359752
143	NC_007762	TTCT	2	8	52992	52999	0 %	75 %	0 %	25 %	86359752
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145	NC_007762	CCGG	2	8	53531	53538	0 %	0 %	50 %	50 %	86359754
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