MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 3111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007761	GCCGC	2	10	546	555	0 %	0 %	40 %	60 %	86355670
2	NC_007761	GCGCC	2	10	3266	3275	0 %	0 %	40 %	60 %	86355673
3	NC_007761	GGCGC	2	10	3741	3750	0 %	0 %	60 %	40 %	86355674
4	NC_007761	GCTCC	2	10	5436	5445	0 %	20 %	20 %	60 %	86355677
5	NC_007761	ATCGG	2	10	6397	6406	20 %	20 %	40 %	20 %	86355678
6	NC_007761	CCGAG	2	10	6760	6769	20 %	0 %	40 %	40 %	86355678
7	NC_007761	TGGCG	2	10	8741	8750	0 %	20 %	60 %	20 %	86355681
8	NC_007761	CATCT	2	10	11702	11711	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007761	GCCGC	2	10	14254	14263	0 %	0 %	40 %	60 %	86355685
10	NC_007761	CGCGC	2	10	15143	15152	0 %	0 %	40 %	60 %	86355685
11	NC_007761	CATCG	2	10	16328	16337	20 %	20 %	20 %	40 %	86355687
12	NC_007761	CGGCA	2	10	16742	16751	20 %	0 %	40 %	40 %	86355687
13	NC_007761	TCGTT	2	10	17601	17610	0 %	60 %	20 %	20 %	86355689
14	NC_007761	CCATT	2	10	18453	18462	20 %	40 %	0 %	40 %	86355689
15	NC_007761	TCCGA	2	10	18916	18925	20 %	20 %	20 %	40 %	86355690
16	NC_007761	GGCGA	2	10	20050	20059	20 %	0 %	60 %	20 %	86355691
17	NC_007761	ATGGT	2	10	20396	20405	20 %	40 %	40 %	0 %	86355691
18	NC_007761	GGCCG	2	10	21455	21464	0 %	0 %	60 %	40 %	86355692
19	NC_007761	GCCGC	2	10	22782	22791	0 %	0 %	40 %	60 %	86355694
20	NC_007761	GGGGC	2	10	22987	22996	0 %	0 %	80 %	20 %	86355694
21	NC_007761	GCTGC	2	10	24781	24790	0 %	20 %	40 %	40 %	86355694
22	NC_007761	TCCGC	2	10	27406	27415	0 %	20 %	20 %	60 %	86355695
23	NC_007761	CCGTC	2	10	27933	27942	0 %	20 %	20 %	60 %	86355695
24	NC_007761	GAACC	2	10	28381	28390	40 %	0 %	20 %	40 %	86355695
25	NC_007761	TTGCG	2	10	30032	30041	0 %	40 %	40 %	20 %	86355697
26	NC_007761	GCCGA	2	10	31108	31117	20 %	0 %	40 %	40 %	86355697
27	NC_007761	GGCTT	2	10	32347	32356	0 %	40 %	40 %	20 %	86355698
28	NC_007761	GCTGA	2	10	34226	34235	20 %	20 %	40 %	20 %	86355699
29	NC_007761	CTTCT	2	10	38215	38224	0 %	60 %	0 %	40 %	86355703
30	NC_007761	GCGTC	2	10	38632	38641	0 %	20 %	40 %	40 %	86355703
31	NC_007761	TGCCG	2	10	41343	41352	0 %	20 %	40 %	40 %	86355705
32	NC_007761	GAAGA	2	10	43619	43628	60 %	0 %	40 %	0 %	86355708
33	NC_007761	GCGAG	2	10	44976	44985	20 %	0 %	60 %	20 %	162329648
34	NC_007761	GTCCA	2	10	46834	46843	20 %	20 %	20 %	40 %	86355713
35	NC_007761	CCGGT	2	10	47106	47115	0 %	20 %	40 %	40 %	86355714
36	NC_007761	AAGCC	2	10	47394	47403	40 %	0 %	20 %	40 %	86355714
37	NC_007761	TCGTC	2	10	47822	47831	0 %	40 %	20 %	40 %	86355715
38	NC_007761	TGCGC	2	10	49038	49047	0 %	20 %	40 %	40 %	86355717
39	NC_007761	GTTTT	2	10	50356	50365	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007761	TGCGG	2	10	54678	54687	0 %	20 %	60 %	20 %	86355720
41	NC_007761	CGTGC	2	10	55309	55318	0 %	20 %	40 %	40 %	86355721
42	NC_007761	TTCTG	2	10	57115	57124	0 %	60 %	20 %	20 %	86355723
43	NC_007761	GATAT	2	10	61378	61387	40 %	40 %	20 %	0 %	86355726
44	NC_007761	GCCGT	2	10	61637	61646	0 %	20 %	40 %	40 %	86355726
45	NC_007761	CAGGG	2	10	61915	61924	20 %	0 %	60 %	20 %	86355726
46	NC_007761	GACGT	2	10	62560	62569	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007761	TCGTG	2	10	63599	63608	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007761	GGGCT	2	10	63744	63753	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007761	CGCAA	2	10	64184	64193	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_007761	GAAGA	2	10	64724	64733	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007761	AGCGG	2	10	66789	66798	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007761	AGAGG	2	10	67064	67073	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007761	GAGAT	2	10	69224	69233	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007761	AGCGC	2	10	70581	70590	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_007761	TTTTA	2	10	71203	71212	20 %	80 %	0 %	0 %	86355727
56	NC_007761	GGCTG	2	10	72183	72192	0 %	20 %	60 %	20 %	86355728
57	NC_007761	CGACC	2	10	73014	73023	20 %	0 %	20 %	60 %	86355729
58	NC_007761	GCCGG	2	10	73585	73594	0 %	0 %	60 %	40 %	86355729
59	NC_007761	GCGAT	2	10	73776	73785	20 %	20 %	40 %	20 %	86355730
60	NC_007761	CCGGT	2	10	74441	74450	0 %	20 %	40 %	40 %	86355730
61	NC_007761	GCCGC	2	10	75108	75117	0 %	0 %	40 %	60 %	86355731
62	NC_007761	GAAGG	2	10	76002	76011	40 %	0 %	60 %	0 %	86355731
63	NC_007761	CGGGA	2	10	76439	76448	20 %	0 %	60 %	20 %	86355731
64	NC_007761	GGATC	2	10	79901	79910	20 %	20 %	40 %	20 %	86355735
65	NC_007761	CATTC	2	10	81248	81257	20 %	40 %	0 %	40 %	86355736
66	NC_007761	TCAGG	2	10	81774	81783	20 %	20 %	40 %	20 %	86355736
67	NC_007761	TCGAT	2	10	81892	81901	20 %	40 %	20 %	20 %	86355736
68	NC_007761	CGGCC	2	10	82072	82081	0 %	0 %	40 %	60 %	86355736
69	NC_007761	GGCCC	2	10	88048	88057	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_007761	CGAGG	2	10	88149	88158	20 %	0 %	60 %	20 %	86355742
71	NC_007761	ATGCG	2	10	90379	90388	20 %	20 %	40 %	20 %	86355744
72	NC_007761	CGGCC	2	10	91352	91361	0 %	0 %	40 %	60 %	86355745
73	NC_007761	AGGAT	2	10	94525	94534	40 %	20 %	40 %	0 %	86355748
74	NC_007761	TGGCC	2	10	96610	96619	0 %	20 %	40 %	40 %	86355749
75	NC_007761	CTGCC	2	10	97915	97924	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_007761	GGCAG	2	10	98061	98070	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007761	TCACG	2	10	98612	98621	20 %	20 %	20 %	40 %	86355750
78	NC_007761	CAGGC	2	10	99917	99926	20 %	0 %	40 %	40 %	86355751
79	NC_007761	CGACA	2	10	102329	102338	40 %	0 %	20 %	40 %	86355753
80	NC_007761	CCACG	2	10	105833	105842	20 %	0 %	20 %	60 %	86355756
81	NC_007761	CATGC	2	10	106142	106151	20 %	20 %	20 %	40 %	86355757
82	NC_007761	GCGAA	2	10	107166	107175	40 %	0 %	40 %	20 %	86355757
83	NC_007761	AAGCG	2	10	107787	107796	40 %	0 %	40 %	20 %	86355758
84	NC_007761	CGAAC	2	10	107808	107817	40 %	0 %	20 %	40 %	86355758
85	NC_007761	GCCAT	2	10	108752	108761	20 %	20 %	20 %	40 %	86355758
86	NC_007761	GCGCT	2	10	109955	109964	0 %	20 %	40 %	40 %	86355759
87	NC_007761	GCATG	2	10	111212	111221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007761	AGCGC	2	10	112049	112058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_007761	GCCGC	2	10	114351	114360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_007761	CGCGC	2	10	115550	115559	0 %	0 %	40 %	60 %	86355766
91	NC_007761	GAAGT	2	10	116229	116238	40 %	20 %	40 %	0 %	86355767
92	NC_007761	AAGAC	2	10	116398	116407	60 %	0 %	20 %	20 %	86355767
93	NC_007761	GCGCT	2	10	118083	118092	0 %	20 %	40 %	40 %	86355769
94	NC_007761	TAGAA	2	10	119632	119641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007761	GCGCA	2	10	121876	121885	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007761	GGATC	2	10	123262	123271	20 %	20 %	40 %	20 %	86355773
97	NC_007761	ATCGC	2	10	123490	123499	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_007761	CGCGG	2	10	124817	124826	0 %	0 %	60 %	40 %	86355775
99	NC_007761	TGGTC	2	10	124874	124883	0 %	40 %	40 %	20 %	86355775
100	NC_007761	CCTTC	2	10	125242	125251	0 %	40 %	0 %	60 %	86355776
101	NC_007761	CCGCG	2	10	125971	125980	0 %	0 %	40 %	60 %	86355776
102	NC_007761	TGGCG	2	10	126469	126478	0 %	20 %	60 %	20 %	86355776
103	NC_007761	CGGCG	2	10	127333	127342	0 %	0 %	60 %	40 %	86355776
104	NC_007761	TTGGC	2	10	127488	127497	0 %	40 %	40 %	20 %	86355776
105	NC_007761	CCTGC	2	10	127987	127996	0 %	20 %	20 %	60 %	86355777
106	NC_007761	GCGAG	2	10	129180	129189	20 %	0 %	60 %	20 %	86355778
107	NC_007761	CTTCG	2	10	132292	132301	0 %	40 %	20 %	40 %	86355780
108	NC_007761	GAGGG	2	10	134378	134387	20 %	0 %	80 %	0 %	86355782
109	NC_007761	GCCTT	2	10	136216	136225	0 %	40 %	20 %	40 %	86355785
110	NC_007761	CCGCG	2	10	140567	140576	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_007761	GGCAG	2	10	142177	142186	20 %	0 %	60 %	20 %	86355791
112	NC_007761	AGCGC	2	10	142471	142480	20 %	0 %	40 %	40 %	86355792
113	NC_007761	TTGCC	2	10	142751	142760	0 %	40 %	20 %	40 %	86355792
114	NC_007761	GCCCG	2	10	143789	143798	0 %	0 %	40 %	60 %	86355794
115	NC_007761	AGGGG	2	10	144798	144807	20 %	0 %	80 %	0 %	86355794
116	NC_007761	CGCGC	2	10	147127	147136	0 %	0 %	40 %	60 %	86355798
117	NC_007761	CTTGC	2	10	148260	148269	0 %	40 %	20 %	40 %	86355799
118	NC_007761	CGAAG	2	10	148452	148461	40 %	0 %	40 %	20 %	86355799
119	NC_007761	TGGGT	2	10	148763	148772	0 %	40 %	60 %	0 %	86355800
120	NC_007761	GCGCG	2	10	149466	149475	0 %	0 %	60 %	40 %	86355801
121	NC_007761	ACGTA	2	10	150738	150747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007761	GCGGT	2	10	153329	153338	0 %	20 %	60 %	20 %	86355805
123	NC_007761	GTGGA	2	10	153383	153392	20 %	20 %	60 %	0 %	86355805
124	NC_007761	ACTTC	2	10	154362	154371	20 %	40 %	0 %	40 %	86355805
125	NC_007761	CCGAG	2	10	159146	159155	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007761	CGCGA	2	10	163884	163893	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007761	CCTGC	2	10	164377	164386	0 %	20 %	20 %	60 %	86355811
128	NC_007761	GATGC	2	10	165281	165290	20 %	20 %	40 %	20 %	86355811
129	NC_007761	CATGG	2	10	165611	165620	20 %	20 %	40 %	20 %	86355811
130	NC_007761	CCGAA	2	10	166260	166269	40 %	0 %	20 %	40 %	86355811
131	NC_007761	CCCGA	2	10	169048	169057	20 %	0 %	20 %	60 %	86355812
132	NC_007761	CGTCA	2	10	170189	170198	20 %	20 %	20 %	40 %	86355814
133	NC_007761	TGGTC	2	10	173351	173360	0 %	40 %	40 %	20 %	86355817
134	NC_007761	TCGGC	2	10	181793	181802	0 %	20 %	40 %	40 %	86355826
135	NC_007761	CGCTC	3	15	182224	182238	0 %	20 %	20 %	60 %	86355827
136	NC_007761	CGGCG	2	10	186282	186291	0 %	0 %	60 %	40 %	86355831
137	NC_007761	GATGT	2	10	186948	186957	20 %	40 %	40 %	0 %	86355832
138	NC_007761	TTCGG	2	10	187527	187536	0 %	40 %	40 %	20 %	86355832
139	NC_007761	GGGAA	2	10	187599	187608	40 %	0 %	60 %	0 %	86355832
140	NC_007761	GACCG	2	10	188151	188160	20 %	0 %	40 %	40 %	86355834
141	NC_007761	ATGGC	2	10	189433	189442	20 %	20 %	40 %	20 %	86355835
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149	NC_007761	CCCAT	2	10	200345	200354	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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174	NC_007761	TGCGG	2	10	232201	232210	0 %	20 %	60 %	20 %	86355879
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253	NC_007761	TGGCC	2	10	342365	342374	0 %	20 %	40 %	40 %	86355992
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261	NC_007761	CCGGC	2	10	355370	355379	0 %	0 %	40 %	60 %	86356001
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269	NC_007761	CCGTG	2	10	370369	370378	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
270	NC_007761	GCAGC	2	10	373406	373415	20 %	0 %	40 %	40 %	86356017
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397	NC_007761	TTCGG	2	10	560501	560510	0 %	40 %	40 %	20 %	86356197
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400	NC_007761	GGCAG	2	10	567920	567929	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
401	NC_007761	GATCG	2	10	568893	568902	20 %	20 %	40 %	20 %	86356205
402	NC_007761	AGGGG	2	10	571379	571388	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
403	NC_007761	GGGGC	2	10	575153	575162	0 %	0 %	80 %	20 %	86356208
404	NC_007761	AGATG	2	10	576422	576431	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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