MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007761	GCC	2	6	108789	108794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355758
2502	NC_007761	CGA	2	6	108800	108805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355758
2503	NC_007761	GAC	2	6	108831	108836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355758
2504	NC_007761	CAA	2	6	108842	108847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355758
2505	NC_007761	CTT	2	6	108854	108859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355758
2506	NC_007761	GCT	2	6	108884	108889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355758
2507	NC_007761	TTC	2	6	108900	108905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355758
2508	NC_007761	ACG	2	6	108925	108930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355758
2509	NC_007761	GCG	2	6	108989	108994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355758
2510	NC_007761	CGGA	2	8	109008	109015	25 %	0 %	50 %	25 %	86355758
2511	NC_007761	GCC	2	6	109071	109076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355758
2512	NC_007761	TTC	2	6	109149	109154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355758
2513	NC_007761	GCG	2	6	109155	109160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355758
2514	NC_007761	CG	3	6	109169	109174	0 %	0 %	50 %	50 %	86355758
2515	NC_007761	GACTTC	2	12	109218	109229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86355758
2516	NC_007761	GGT	2	6	109492	109497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_007761	CT	3	6	109529	109534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_007761	GAT	2	6	109646	109651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355759
2519	NC_007761	CAAG	2	8	109699	109706	50 %	0 %	25 %	25 %	86355759
2520	NC_007761	CAT	2	6	109711	109716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355759
2521	NC_007761	TCG	2	6	109758	109763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355759
2522	NC_007761	CGC	2	6	109764	109769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355759
2523	NC_007761	CCG	2	6	109798	109803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355759
2524	NC_007761	TCG	2	6	109824	109829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355759
2525	NC_007761	CGTC	2	8	109914	109921	0 %	25 %	25 %	50 %	86355759
2526	NC_007761	GCGCT	2	10	109955	109964	0 %	20 %	40 %	40 %	86355759
2527	NC_007761	CTA	2	6	109966	109971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355759
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2529	NC_007761	TCG	3	9	110097	110105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355759
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2531	NC_007761	CG	3	6	110141	110146	0 %	0 %	50 %	50 %	86355759
2532	NC_007761	GCC	2	6	110223	110228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355759
2533	NC_007761	CGATGG	2	12	110236	110247	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86355759
2534	NC_007761	TTG	2	6	110257	110262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355759
2535	NC_007761	ATG	2	6	110282	110287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355759
2536	NC_007761	GGC	2	6	110343	110348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355759
2537	NC_007761	GCG	2	6	110354	110359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355759
2538	NC_007761	TTC	2	6	110401	110406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_007761	GCT	2	6	110426	110431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_007761	T	6	6	110443	110448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_007761	GAT	2	6	110520	110525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_007761	AAG	2	6	110698	110703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355760
2543	NC_007761	CTT	2	6	110766	110771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355760
2544	NC_007761	GAT	2	6	110872	110877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355760
2545	NC_007761	GCG	2	6	110885	110890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355760
2546	NC_007761	CGA	3	9	110910	110918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355760
2547	NC_007761	CGA	3	9	110934	110942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355760
2548	NC_007761	GAC	2	6	110944	110949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355760
2549	NC_007761	CGA	2	6	110964	110969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355760
2550	NC_007761	GAC	3	9	110971	110979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355760
2551	NC_007761	GAC	2	6	110983	110988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355760
2552	NC_007761	CAT	2	6	110997	111002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355760
2553	NC_007761	CGA	2	6	111015	111020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355760
2554	NC_007761	A	7	7	111059	111065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_007761	T	6	6	111078	111083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_007761	AAG	2	6	111112	111117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_007761	GAG	2	6	111142	111147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_007761	GCATG	2	10	111212	111221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2559	NC_007761	CCA	2	6	111253	111258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2560	NC_007761	CGA	2	6	111339	111344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_007761	AGC	2	6	111433	111438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_007761	GCG	2	6	111444	111449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_007761	CCAC	2	8	111466	111473	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2564	NC_007761	ACCT	2	8	111549	111556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2565	NC_007761	GTGC	2	8	111660	111667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2566	NC_007761	GCC	2	6	111751	111756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2567	NC_007761	GCC	2	6	111796	111801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355761
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2570	NC_007761	AGC	2	6	111829	111834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355761
2571	NC_007761	GGC	2	6	111891	111896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355761
2572	NC_007761	GAC	2	6	111936	111941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355761
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2574	NC_007761	GAC	2	6	111975	111980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355761
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2576	NC_007761	AGCGC	2	10	112049	112058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2577	NC_007761	CGG	2	6	112063	112068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_007761	TTGA	2	8	112077	112084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_007761	TCT	2	6	112210	112215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_007761	CGC	3	9	112267	112275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355762
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2582	NC_007761	TCG	2	6	112313	112318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355762
2583	NC_007761	GCT	3	9	112359	112367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355762
2584	NC_007761	ACG	2	6	112402	112407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355762
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2587	NC_007761	TCG	2	6	112535	112540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355762
2588	NC_007761	GAC	2	6	112581	112586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355762
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2591	NC_007761	ATC	2	6	112738	112743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355762
2592	NC_007761	CGT	2	6	112750	112755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355762
2593	NC_007761	GGC	2	6	112786	112791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355762
2594	NC_007761	GCC	2	6	112888	112893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355762
2595	NC_007761	GCG	2	6	112917	112922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355762
2596	NC_007761	GTCC	2	8	113020	113027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2597	NC_007761	TCT	2	6	113106	113111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355763
2598	NC_007761	GC	3	6	113172	113177	0 %	0 %	50 %	50 %	86355763
2599	NC_007761	CGGC	2	8	113205	113212	0 %	0 %	50 %	50 %	86355763
2600	NC_007761	AGC	2	6	113235	113240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355763
2601	NC_007761	GCC	2	6	113255	113260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355763
2602	NC_007761	CGG	2	6	113293	113298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355763
2603	NC_007761	GC	3	6	113324	113329	0 %	0 %	50 %	50 %	86355763
2604	NC_007761	CGG	2	6	113347	113352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355763
2605	NC_007761	GCG	2	6	113421	113426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355763
2606	NC_007761	GCG	2	6	113459	113464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355763
2607	NC_007761	CTT	2	6	113476	113481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355763
2608	NC_007761	TCGGCA	2	12	113490	113501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86355763
2609	NC_007761	CTG	2	6	113597	113602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355763
2610	NC_007761	CCGA	2	8	113675	113682	25 %	0 %	25 %	50 %	86355763
2611	NC_007761	CTA	2	6	113788	113793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355763
2612	NC_007761	GCCG	2	8	113798	113805	0 %	0 %	50 %	50 %	86355763
2613	NC_007761	TTC	2	6	113837	113842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355764
2614	NC_007761	CG	3	6	113873	113878	0 %	0 %	50 %	50 %	86355764
2615	NC_007761	CGT	3	9	114048	114056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355764
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2620	NC_007761	CTT	2	6	114196	114201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355764
2621	NC_007761	GCC	3	9	114245	114253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355764
2622	NC_007761	GCCGC	2	10	114351	114360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2624	NC_007761	GCC	2	6	114375	114380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2993	NC_007761	GCG	2	6	129845	129850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355778
2994	NC_007761	CGG	2	6	129868	129873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355778
2995	NC_007761	AAT	2	6	129951	129956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86355778
2996	NC_007761	GC	3	6	130057	130062	0 %	0 %	50 %	50 %	86355778
2997	NC_007761	CG	3	6	130122	130127	0 %	0 %	50 %	50 %	86355778
2998	NC_007761	ACTG	2	8	130168	130175	25 %	25 %	25 %	25 %	86355778
2999	NC_007761	GTC	2	6	130249	130254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355779
3000	NC_007761	GC	3	6	130298	130303	0 %	0 %	50 %	50 %	86355779

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