MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007761	TCT	2	6	44325	44330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355710
1003	NC_007761	GCC	2	6	44368	44373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355710
1004	NC_007761	CGC	2	6	44406	44411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355710
1005	NC_007761	TGCG	2	8	44420	44427	0 %	25 %	50 %	25 %	86355710
1006	NC_007761	TCGA	2	8	44441	44448	25 %	25 %	25 %	25 %	86355710
1007	NC_007761	GAC	2	6	44449	44454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355710
1008	NC_007761	GCC	2	6	44480	44485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355710
1009	NC_007761	CGA	2	6	44490	44495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355710
1010	NC_007761	CAG	2	6	44548	44553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355710
1011	NC_007761	CGC	3	9	44583	44591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355710
1012	NC_007761	GC	3	6	44626	44631	0 %	0 %	50 %	50 %	86355710
1013	NC_007761	TCG	2	6	44693	44698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355710
1014	NC_007761	GCCG	2	8	44701	44708	0 %	0 %	50 %	50 %	86355710
1015	NC_007761	CGC	2	6	44722	44727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355710
1016	NC_007761	CGA	2	6	44748	44753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355710
1017	NC_007761	GAC	2	6	44776	44781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355710
1018	NC_007761	CAGCGC	2	12	44866	44877	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	162329648
1019	NC_007761	CGT	2	6	44898	44903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162329648
1020	NC_007761	GCA	2	6	44952	44957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162329648
1021	NC_007761	GCGAG	2	10	44976	44985	20 %	0 %	60 %	20 %	162329648
1022	NC_007761	GCC	2	6	44986	44991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162329648
1023	NC_007761	GAT	2	6	45088	45093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162329648
1024	NC_007761	GAT	2	6	45133	45138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162329648
1025	NC_007761	GCC	2	6	45181	45186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162329648
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1027	NC_007761	CG	3	6	45294	45299	0 %	0 %	50 %	50 %	162329648
1028	NC_007761	GCC	3	9	45334	45342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162329648
1029	NC_007761	GGC	2	6	45478	45483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162329648
1030	NC_007761	CTG	2	6	45508	45513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162329648
1031	NC_007761	GCC	2	6	45544	45549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162329648
1032	NC_007761	GATC	2	8	45555	45562	25 %	25 %	25 %	25 %	162329648
1033	NC_007761	GGC	2	6	45664	45669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355712
1034	NC_007761	AGC	2	6	45680	45685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355712
1035	NC_007761	GCAC	2	8	45713	45720	25 %	0 %	25 %	50 %	86355712
1036	NC_007761	CTT	2	6	45742	45747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355712
1037	NC_007761	CGC	2	6	45773	45778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355712
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1039	NC_007761	GA	3	6	45899	45904	50 %	0 %	50 %	0 %	86355712
1040	NC_007761	CGG	2	6	45918	45923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355712
1041	NC_007761	CGGC	2	8	45947	45954	0 %	0 %	50 %	50 %	86355712
1042	NC_007761	GAC	2	6	45973	45978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355712
1043	NC_007761	GC	3	6	46097	46102	0 %	0 %	50 %	50 %	86355712
1044	NC_007761	ATC	2	6	46139	46144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355712
1045	NC_007761	CTTT	2	8	46153	46160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_007761	TCG	2	6	46204	46209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_007761	GAAG	2	8	46251	46258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_007761	GCA	2	6	46280	46285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_007761	TGT	2	6	46458	46463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355713
1050	NC_007761	CGA	2	6	46470	46475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355713
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1053	NC_007761	TCT	2	6	46722	46727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355713
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1055	NC_007761	GTCCA	2	10	46834	46843	20 %	20 %	20 %	40 %	86355713
1056	NC_007761	GCA	2	6	46875	46880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355713
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1059	NC_007761	CG	4	8	46950	46957	0 %	0 %	50 %	50 %	86355713
1060	NC_007761	CGAA	2	8	46981	46988	50 %	0 %	25 %	25 %	86355713
1061	NC_007761	TCC	2	6	47034	47039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355714
1062	NC_007761	CCGGT	2	10	47106	47115	0 %	20 %	40 %	40 %	86355714
1063	NC_007761	GTC	2	6	47124	47129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355714
1064	NC_007761	GGC	2	6	47223	47228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355714
1065	NC_007761	TGCGGA	2	12	47234	47245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86355714
1066	NC_007761	GACC	2	8	47261	47268	25 %	0 %	25 %	50 %	86355714
1067	NC_007761	CGC	2	6	47292	47297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355714
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1072	NC_007761	CGC	2	6	47474	47479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355714
1073	NC_007761	CGC	2	6	47517	47522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1081	NC_007761	TCGTC	2	10	47822	47831	0 %	40 %	20 %	40 %	86355715
1082	NC_007761	GATC	2	8	47840	47847	25 %	25 %	25 %	25 %	86355715
1083	NC_007761	CGG	2	6	47869	47874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355715
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1090	NC_007761	CAA	2	6	48259	48264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_007761	ACA	2	6	48322	48327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355716
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1095	NC_007761	GCG	2	6	48423	48428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355716
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1100	NC_007761	ACG	2	6	48676	48681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355716
1101	NC_007761	GGC	2	6	48694	48699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355716
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1103	NC_007761	GC	3	6	48765	48770	0 %	0 %	50 %	50 %	86355716
1104	NC_007761	CGC	2	6	48780	48785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355716
1105	NC_007761	ACCA	2	8	48802	48809	50 %	0 %	0 %	50 %	86355716
1106	NC_007761	GTG	2	6	48817	48822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355716
1107	NC_007761	GCT	2	6	48862	48867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_007761	ATG	2	6	48896	48901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_007761	GAC	2	6	48954	48959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355717
1110	NC_007761	C	6	6	48965	48970	0 %	0 %	0 %	100 %	86355717
1111	NC_007761	ATC	2	6	49000	49005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355717
1112	NC_007761	ATG	2	6	49013	49018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355717
1113	NC_007761	TGCGC	2	10	49038	49047	0 %	20 %	40 %	40 %	86355717
1114	NC_007761	CAG	2	6	49063	49068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355717
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1118	NC_007761	GC	3	6	49175	49180	0 %	0 %	50 %	50 %	86355717
1119	NC_007761	CCA	2	6	49199	49204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355717
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1123	NC_007761	CGCC	2	8	49373	49380	0 %	0 %	25 %	75 %	86355717
1124	NC_007761	AAG	2	6	49399	49404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355717
1125	NC_007761	CGA	2	6	49422	49427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355717
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1127	NC_007761	AAG	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355717
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1252	NC_007761	GGA	2	6	54822	54827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355720
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