MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007761	GCG	2	6	22920	22925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
502	NC_007761	ACAA	2	8	22931	22938	75 %	0 %	0 %	25 %	86355694
503	NC_007761	TCG	2	6	22952	22957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
504	NC_007761	GGGGC	2	10	22987	22996	0 %	0 %	80 %	20 %	86355694
505	NC_007761	GCG	2	6	23007	23012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
506	NC_007761	CCT	2	6	23043	23048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355694
507	NC_007761	CGAT	2	8	23069	23076	25 %	25 %	25 %	25 %	86355694
508	NC_007761	GCC	2	6	23153	23158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
509	NC_007761	ATC	2	6	23195	23200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355694
510	NC_007761	GAC	2	6	23245	23250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
511	NC_007761	CGA	2	6	23291	23296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
512	NC_007761	CTC	2	6	23299	23304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355694
513	NC_007761	GCG	2	6	23385	23390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
514	NC_007761	TCG	2	6	23393	23398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
515	NC_007761	ATGCGT	2	12	23431	23442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86355694
516	NC_007761	GCC	2	6	23455	23460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
517	NC_007761	CGA	2	6	23463	23468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
518	NC_007761	GCC	3	9	23691	23699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
519	NC_007761	CG	3	6	23718	23723	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
520	NC_007761	GAA	2	6	23760	23765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355694
521	NC_007761	GCA	2	6	23786	23791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
522	NC_007761	GTC	2	6	23851	23856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
523	NC_007761	AGCG	2	8	23923	23930	25 %	0 %	50 %	25 %	86355694
524	NC_007761	TCC	2	6	23939	23944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355694
525	NC_007761	CAG	2	6	23971	23976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
526	NC_007761	GTCG	2	8	24009	24016	0 %	25 %	50 %	25 %	86355694
527	NC_007761	CGA	2	6	24141	24146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
528	NC_007761	CGA	2	6	24159	24164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
529	NC_007761	CCG	2	6	24187	24192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
530	NC_007761	CG	3	6	24191	24196	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
531	NC_007761	GC	3	6	24210	24215	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
532	NC_007761	TCC	3	9	24248	24256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355694
533	NC_007761	CAC	2	6	24259	24264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355694
534	NC_007761	TCG	2	6	24389	24394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
535	NC_007761	CGG	2	6	24411	24416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
536	NC_007761	GGA	2	6	24445	24450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355694
537	NC_007761	CGC	3	9	24476	24484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
538	NC_007761	CT	3	6	24494	24499	0 %	50 %	0 %	50 %	86355694
539	NC_007761	TCG	2	6	24551	24556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
540	NC_007761	CCGG	2	8	24582	24589	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
541	NC_007761	GCGA	2	8	24617	24624	25 %	0 %	50 %	25 %	86355694
542	NC_007761	TCG	2	6	24665	24670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
543	NC_007761	CAG	2	6	24736	24741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
544	NC_007761	CGG	2	6	24744	24749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
545	NC_007761	GCTGC	2	10	24781	24790	0 %	20 %	40 %	40 %	86355694
546	NC_007761	TTC	2	6	24791	24796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355694
547	NC_007761	CTC	2	6	24799	24804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355694
548	NC_007761	GCC	2	6	24839	24844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
549	NC_007761	CAT	2	6	24865	24870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355694
550	NC_007761	GC	3	6	24900	24905	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
551	NC_007761	GCG	2	6	24933	24938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
552	NC_007761	GC	3	6	25025	25030	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
553	NC_007761	TCG	2	6	25037	25042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
554	NC_007761	CGGC	2	8	25049	25056	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
555	NC_007761	CCT	2	6	25077	25082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355694
556	NC_007761	GCC	2	6	25093	25098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
557	NC_007761	CGG	2	6	25194	25199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
558	NC_007761	CGC	3	9	25233	25241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
559	NC_007761	CGT	2	6	25255	25260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
560	NC_007761	GCG	2	6	25264	25269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
561	NC_007761	CGA	2	6	25287	25292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
562	NC_007761	TCG	2	6	25322	25327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
563	NC_007761	CAG	2	6	25393	25398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
564	NC_007761	GC	3	6	25405	25410	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
565	NC_007761	GCC	3	9	25424	25432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
566	NC_007761	TCG	2	6	25439	25444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
567	NC_007761	GCA	2	6	25491	25496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
568	NC_007761	CCCG	2	8	25534	25541	0 %	0 %	25 %	75 %	86355694
569	NC_007761	GC	3	6	25570	25575	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
570	NC_007761	CCG	2	6	25624	25629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
571	NC_007761	TCG	3	9	25640	25648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
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573	NC_007761	CG	3	6	25742	25747	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
574	NC_007761	AGC	2	6	25754	25759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
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576	NC_007761	TCG	2	6	25889	25894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355694
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585	NC_007761	GAT	2	6	26327	26332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355695
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590	NC_007761	GCC	2	6	26580	26585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355695
591	NC_007761	GCCA	2	8	26594	26601	25 %	0 %	25 %	50 %	86355695
592	NC_007761	GAT	2	6	26627	26632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355695
593	NC_007761	GCG	2	6	26788	26793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355695
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597	NC_007761	CAGC	2	8	26927	26934	25 %	0 %	25 %	50 %	86355695
598	NC_007761	CGGT	2	8	26944	26951	0 %	25 %	50 %	25 %	86355695
599	NC_007761	CGG	2	6	27044	27049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355695
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606	NC_007761	CGAG	2	8	27391	27398	25 %	0 %	50 %	25 %	86355695
607	NC_007761	TCCGC	2	10	27406	27415	0 %	20 %	20 %	60 %	86355695
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612	NC_007761	CGG	2	6	27544	27549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355695
613	NC_007761	GCG	2	6	27568	27573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355695
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615	NC_007761	TGG	2	6	27603	27608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355695
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619	NC_007761	CAG	3	9	27785	27793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355695
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621	NC_007761	GCCG	2	8	27833	27840	0 %	0 %	50 %	50 %	86355695
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623	NC_007761	CCGTC	2	10	27933	27942	0 %	20 %	20 %	60 %	86355695
624	NC_007761	GGC	2	6	28004	28009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355695
625	NC_007761	GC	3	6	28060	28065	0 %	0 %	50 %	50 %	86355695
626	NC_007761	GC	4	8	28108	28115	0 %	0 %	50 %	50 %	86355695
627	NC_007761	GC	3	6	28128	28133	0 %	0 %	50 %	50 %	86355695
628	NC_007761	CAG	2	6	28199	28204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355695
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630	NC_007761	GA	3	6	28305	28310	50 %	0 %	50 %	0 %	86355695
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744	NC_007761	GC	3	6	33501	33506	0 %	0 %	50 %	50 %	86355698
745	NC_007761	CCG	2	6	33528	33533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355698
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753	NC_007761	GGC	2	6	33774	33779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355698
754	NC_007761	CACG	2	8	33795	33802	25 %	0 %	25 %	50 %	86355698
755	NC_007761	GC	3	6	33813	33818	0 %	0 %	50 %	50 %	86355698
756	NC_007761	GCGG	2	8	33887	33894	0 %	0 %	75 %	25 %	86355698
757	NC_007761	CGG	2	6	34073	34078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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