MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007761	GCC	2	6	192352	192357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355836
4502	NC_007761	TC	3	6	192365	192370	0 %	50 %	0 %	50 %	86355836
4503	NC_007761	GGT	2	6	192371	192376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355836
4504	NC_007761	TCT	2	6	192415	192420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355836
4505	NC_007761	GATC	2	8	192470	192477	25 %	25 %	25 %	25 %	86355836
4506	NC_007761	CGC	3	9	192514	192522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355837
4507	NC_007761	CCG	2	6	192551	192556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355837
4508	NC_007761	GCT	2	6	192565	192570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355837
4509	NC_007761	GAA	2	6	192595	192600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355837
4510	NC_007761	CTG	3	9	192644	192652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355837
4511	NC_007761	ATC	2	6	192698	192703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355837
4512	NC_007761	CCT	2	6	192705	192710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355837
4513	NC_007761	GAG	2	6	192752	192757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355837
4514	NC_007761	CGG	2	6	192763	192768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355837
4515	NC_007761	CTC	2	6	192793	192798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355837
4516	NC_007761	GAT	2	6	192832	192837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355837
4517	NC_007761	GCC	2	6	192841	192846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355837
4518	NC_007761	ATT	2	6	192852	192857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86355837
4519	NC_007761	C	6	6	192902	192907	0 %	0 %	0 %	100 %	86355837
4520	NC_007761	TGA	2	6	192915	192920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355837
4521	NC_007761	AGG	2	6	192924	192929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355837
4522	NC_007761	GC	3	6	193028	193033	0 %	0 %	50 %	50 %	86355837
4523	NC_007761	ATC	2	6	193094	193099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355837
4524	NC_007761	CGG	2	6	193132	193137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355837
4525	NC_007761	TGC	2	6	193152	193157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355837
4526	NC_007761	GTC	2	6	193177	193182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355837
4527	NC_007761	CGC	2	6	193213	193218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355837
4528	NC_007761	GCC	2	6	193225	193230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355837
4529	NC_007761	CTT	2	6	193234	193239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355837
4530	NC_007761	TGC	2	6	193242	193247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355837
4531	NC_007761	TGC	2	6	193257	193262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355837
4532	NC_007761	TCT	2	6	193263	193268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355837
4533	NC_007761	CGT	2	6	193288	193293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355837
4534	NC_007761	GC	3	6	193294	193299	0 %	0 %	50 %	50 %	86355837
4535	NC_007761	GC	3	6	193309	193314	0 %	0 %	50 %	50 %	86355837
4536	NC_007761	CGC	2	6	193336	193341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355837
4537	NC_007761	CAA	2	6	193357	193362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355837
4538	NC_007761	CAT	2	6	193369	193374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355837
4539	NC_007761	CTG	2	6	193385	193390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355837
4540	NC_007761	TGG	2	6	193401	193406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355837
4541	NC_007761	TC	3	6	193432	193437	0 %	50 %	0 %	50 %	86355837
4542	NC_007761	ACG	2	6	193448	193453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355837
4543	NC_007761	CTCG	2	8	193459	193466	0 %	25 %	25 %	50 %	86355837
4544	NC_007761	GCC	2	6	193486	193491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355837
4545	NC_007761	CTT	2	6	193567	193572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355837
4546	NC_007761	TGACA	2	10	193659	193668	40 %	20 %	20 %	20 %	86355838
4547	NC_007761	TCCG	2	8	193681	193688	0 %	25 %	25 %	50 %	86355838
4548	NC_007761	TC	3	6	193692	193697	0 %	50 %	0 %	50 %	86355838
4549	NC_007761	TCA	2	6	193707	193712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355838
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4551	NC_007761	TCG	2	6	193781	193786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355838
4552	NC_007761	TCCGGC	2	12	193792	193803	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86355838
4553	NC_007761	CGG	2	6	194136	194141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355838
4554	NC_007761	CAGCGC	2	12	194143	194154	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86355838
4555	NC_007761	CCGG	2	8	194181	194188	0 %	0 %	50 %	50 %	86355838
4556	NC_007761	CTG	2	6	194191	194196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355838
4557	NC_007761	CGA	2	6	194202	194207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355838
4558	NC_007761	ACA	2	6	194212	194217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355838
4559	NC_007761	GCT	2	6	194289	194294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355838
4560	NC_007761	TCA	2	6	194297	194302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355838
4561	NC_007761	TCG	2	6	194366	194371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355838
4562	NC_007761	GAG	2	6	194386	194391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355838
4563	NC_007761	TCT	2	6	194427	194432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355838
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4565	NC_007761	GCC	2	6	194454	194459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355838
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4569	NC_007761	GTC	2	6	194611	194616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355838
4570	NC_007761	TCG	2	6	194671	194676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355838
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4572	NC_007761	GC	3	6	194841	194846	0 %	0 %	50 %	50 %	86355838
4573	NC_007761	GAG	2	6	194857	194862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355838
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4578	NC_007761	CGA	2	6	195009	195014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355838
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4581	NC_007761	TCA	2	6	195104	195109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355838
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4585	NC_007761	CGCC	2	8	195272	195279	0 %	0 %	25 %	75 %	86355838
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4589	NC_007761	TCG	2	6	195322	195327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355839
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4593	NC_007761	CAT	2	6	195533	195538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355839
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4595	NC_007761	TCG	2	6	195577	195582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355839
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4605	NC_007761	GCCG	2	8	195993	196000	0 %	0 %	50 %	50 %	86355839
4606	NC_007761	AGGG	2	8	196041	196048	25 %	0 %	75 %	0 %	86355839
4607	NC_007761	CGG	2	6	196055	196060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355839
4608	NC_007761	TC	3	6	196065	196070	0 %	50 %	0 %	50 %	86355839
4609	NC_007761	TCA	2	6	196132	196137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355839
4610	NC_007761	GAG	2	6	196161	196166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355839
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4612	NC_007761	GATC	2	8	196235	196242	25 %	25 %	25 %	25 %	86355839
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4614	NC_007761	TTA	2	6	196253	196258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86355839
4615	NC_007761	GCG	2	6	196280	196285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_007761	CGC	2	6	196375	196380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_007761	GAT	2	6	196400	196405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355840
4618	NC_007761	CCG	2	6	196470	196475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355840
4619	NC_007761	TGC	2	6	196519	196524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355840
4620	NC_007761	GCC	2	6	196576	196581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355840
4621	NC_007761	GCA	2	6	196604	196609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355840
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4623	NC_007761	GCA	2	6	196644	196649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355840
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4876	NC_007761	CTG	2	6	207371	207376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355852
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4952	NC_007761	GGCG	2	8	210520	210527	0 %	0 %	75 %	25 %	86355856
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4958	NC_007761	CTTC	2	8	210703	210710	0 %	50 %	0 %	50 %	86355856
4959	NC_007761	GCGAA	2	10	210727	210736	40 %	0 %	40 %	20 %	86355856
4960	NC_007761	GC	3	6	210834	210839	0 %	0 %	50 %	50 %	86355856
4961	NC_007761	TGCG	2	8	210853	210860	0 %	25 %	50 %	25 %	86355856
4962	NC_007761	ATGG	2	8	210917	210924	25 %	25 %	50 %	0 %	86355856
4963	NC_007761	TTGGCC	2	12	211125	211136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355856
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4971	NC_007761	CGG	2	6	211665	211670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355857
4972	NC_007761	CTT	2	6	211699	211704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355857
4973	NC_007761	GC	3	6	211720	211725	0 %	0 %	50 %	50 %	86355857
4974	NC_007761	CGA	2	6	211794	211799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355857
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4976	NC_007761	TGA	2	6	211884	211889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355857
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4978	NC_007761	GCCG	2	8	211947	211954	0 %	0 %	50 %	50 %	86355857
4979	NC_007761	GGA	2	6	211959	211964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355857
4980	NC_007761	GCA	2	6	211992	211997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355857
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4983	NC_007761	AGC	2	6	212123	212128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355857
4984	NC_007761	GCG	2	6	212156	212161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355857
4985	NC_007761	GAG	2	6	212180	212185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355857
4986	NC_007761	CTC	2	6	212218	212223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355857
4987	NC_007761	GAT	2	6	212236	212241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355857
4988	NC_007761	CGG	2	6	212317	212322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355857
4989	NC_007761	GCCG	2	8	212470	212477	0 %	0 %	50 %	50 %	86355857
4990	NC_007761	CG	5	10	212494	212503	0 %	0 %	50 %	50 %	86355857
4991	NC_007761	TCG	2	6	212624	212629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355857
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4993	NC_007761	GC	4	8	212690	212697	0 %	0 %	50 %	50 %	86355857
4994	NC_007761	CAG	2	6	212805	212810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355858
4995	NC_007761	CGC	2	6	212812	212817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355858
4996	NC_007761	CATCC	2	10	212879	212888	20 %	20 %	0 %	60 %	86355858
4997	NC_007761	CGGC	2	8	212974	212981	0 %	0 %	50 %	50 %	86355858
4998	NC_007761	CGT	2	6	213014	213019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355858
4999	NC_007761	TCGA	2	8	213066	213073	25 %	25 %	25 %	25 %	86355858
5000	NC_007761	TCAGCG	2	12	213088	213099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86355858

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