MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 3707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007643	GGCCC	2	10	1562	1571	0 %	0 %	40 %	60 %	83591341
2	NC_007643	ACCAC	2	10	1651	1660	40 %	0 %	0 %	60 %	83591341
3	NC_007643	TGGCG	2	10	3766	3775	0 %	20 %	60 %	20 %	83591343
4	NC_007643	GGCCC	2	10	3896	3905	0 %	0 %	40 %	60 %	83591343
5	NC_007643	ACCGC	2	10	3973	3982	20 %	0 %	20 %	60 %	83591343
6	NC_007643	GCGCC	3	15	4154	4168	0 %	0 %	40 %	60 %	83591343
7	NC_007643	GTGCT	2	10	5166	5175	0 %	40 %	40 %	20 %	83591344
8	NC_007643	GCTAC	2	10	7194	7203	20 %	20 %	20 %	40 %	83591345
9	NC_007643	GGTTG	2	10	7849	7858	0 %	40 %	60 %	0 %	83591346
10	NC_007643	AAGGC	2	10	9619	9628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007643	AGCGC	2	10	11192	11201	20 %	0 %	40 %	40 %	83591350
12	NC_007643	GATCG	2	10	12260	12269	20 %	20 %	40 %	20 %	83591351
13	NC_007643	GGCCA	2	10	14476	14485	20 %	0 %	40 %	40 %	83591353
14	NC_007643	GGCCG	2	10	15017	15026	0 %	0 %	60 %	40 %	83591354
15	NC_007643	GGCCG	2	10	15542	15551	0 %	0 %	60 %	40 %	83591354
16	NC_007643	TTGCG	2	10	17238	17247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007643	GAAGG	2	10	17340	17349	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007643	CGGCG	2	10	17908	17917	0 %	0 %	60 %	40 %	83591356
19	NC_007643	CTCCG	2	10	18417	18426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007643	AGCCA	2	10	18602	18611	40 %	0 %	20 %	40 %	83591357
21	NC_007643	AGGCG	2	10	19068	19077	20 %	0 %	60 %	20 %	83591357
22	NC_007643	GCCGG	2	10	22161	22170	0 %	0 %	60 %	40 %	83591359
23	NC_007643	TGCGC	2	10	23232	23241	0 %	20 %	40 %	40 %	83591359
24	NC_007643	CGGCG	2	10	23602	23611	0 %	0 %	60 %	40 %	83591359
25	NC_007643	GCGGT	2	10	28465	28474	0 %	20 %	60 %	20 %	83591364
26	NC_007643	TTTGG	2	10	29687	29696	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007643	CCGAT	2	10	30583	30592	20 %	20 %	20 %	40 %	83591366
28	NC_007643	GGATC	2	10	32849	32858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007643	GGGGA	2	10	35347	35356	20 %	0 %	80 %	0 %	83591371
30	NC_007643	GGGCG	2	10	36312	36321	0 %	0 %	80 %	20 %	83591372
31	NC_007643	GCGCG	2	10	36680	36689	0 %	0 %	60 %	40 %	83591372
32	NC_007643	AAGCC	2	10	37739	37748	40 %	0 %	20 %	40 %	83591373
33	NC_007643	GACCA	2	10	40776	40785	40 %	0 %	20 %	40 %	83591376
34	NC_007643	CGGCG	2	10	41695	41704	0 %	0 %	60 %	40 %	83591378
35	NC_007643	CGGCG	2	10	43026	43035	0 %	0 %	60 %	40 %	83591380
36	NC_007643	GGCGA	2	10	43389	43398	20 %	0 %	60 %	20 %	83591380
37	NC_007643	GCGAA	2	10	44271	44280	40 %	0 %	40 %	20 %	83591381
38	NC_007643	TTGCC	2	10	45222	45231	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_007643	TGATT	2	10	45473	45482	20 %	60 %	20 %	0 %	83591383
40	NC_007643	CGGCG	2	10	48692	48701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_007643	GCTCT	2	10	48780	48789	0 %	40 %	20 %	40 %	83591387
42	NC_007643	TCATC	2	10	51143	51152	20 %	40 %	0 %	40 %	83591388
43	NC_007643	TGACC	2	10	51290	51299	20 %	20 %	20 %	40 %	83591389
44	NC_007643	GGCGA	2	10	52188	52197	20 %	0 %	60 %	20 %	83591391
45	NC_007643	GCCGC	2	10	53076	53085	0 %	0 %	40 %	60 %	83591391
46	NC_007643	GACCG	2	10	53720	53729	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007643	GCGAG	2	10	54618	54627	20 %	0 %	60 %	20 %	83591392
48	NC_007643	GGAAG	2	10	57646	57655	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007643	TGCGG	2	10	57760	57769	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007643	TCGGC	2	10	58517	58526	0 %	20 %	40 %	40 %	83591394
51	NC_007643	GCCAT	2	10	60512	60521	20 %	20 %	20 %	40 %	83591395
52	NC_007643	GAGGT	2	10	60644	60653	20 %	20 %	60 %	0 %	83591395
53	NC_007643	TCGTC	2	10	61848	61857	0 %	40 %	20 %	40 %	83591396
54	NC_007643	GATCT	2	10	61874	61883	20 %	40 %	20 %	20 %	83591396
55	NC_007643	CCGGC	2	10	64193	64202	0 %	0 %	40 %	60 %	83591397
56	NC_007643	CGGAA	2	10	64924	64933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007643	GAAAG	2	10	65991	66000	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007643	GCCGG	2	10	69376	69385	0 %	0 %	60 %	40 %	83591401
59	NC_007643	GCGAT	2	10	70617	70626	20 %	20 %	40 %	20 %	83591402
60	NC_007643	TCAAG	2	10	71628	71637	40 %	20 %	20 %	20 %	83591403
61	NC_007643	GCAGC	2	10	71650	71659	20 %	0 %	40 %	40 %	83591403
62	NC_007643	AGCCA	2	10	72270	72279	40 %	0 %	20 %	40 %	83591403
63	NC_007643	GCGCC	2	10	73873	73882	0 %	0 %	40 %	60 %	83591404
64	NC_007643	CGCAG	2	10	74451	74460	20 %	0 %	40 %	40 %	83591404
65	NC_007643	GCCCC	2	10	78493	78502	0 %	0 %	20 %	80 %	83591407
66	NC_007643	TGGGG	2	10	78846	78855	0 %	20 %	80 %	0 %	83591408
67	NC_007643	GGGGC	2	10	80151	80160	0 %	0 %	80 %	20 %	83591409
68	NC_007643	CAGAT	2	10	81470	81479	40 %	20 %	20 %	20 %	83591410
69	NC_007643	CGTCC	2	10	85134	85143	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_007643	GCGCC	2	10	86758	86767	0 %	0 %	40 %	60 %	83591414
71	NC_007643	GGCGC	2	10	87678	87687	0 %	0 %	60 %	40 %	83591414
72	NC_007643	GCCGA	2	10	88338	88347	20 %	0 %	40 %	40 %	83591414
73	NC_007643	CGGAC	2	10	89535	89544	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_007643	CGGCC	2	10	91908	91917	0 %	0 %	40 %	60 %	83591420
75	NC_007643	CGCCT	2	10	93389	93398	0 %	20 %	20 %	60 %	83591421
76	NC_007643	TCGGA	2	10	94317	94326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007643	AGCGA	2	10	95417	95426	40 %	0 %	40 %	20 %	83591422
78	NC_007643	GGCCG	2	10	95641	95650	0 %	0 %	60 %	40 %	83591422
79	NC_007643	CCTGG	2	10	96966	96975	0 %	20 %	40 %	40 %	83591423
80	NC_007643	ATGCC	2	10	100201	100210	20 %	20 %	20 %	40 %	83591427
81	NC_007643	GGGCG	2	10	100592	100601	0 %	0 %	80 %	20 %	83591427
82	NC_007643	CGGCG	2	10	100782	100791	0 %	0 %	60 %	40 %	83591427
83	NC_007643	ATGGC	2	10	105249	105258	20 %	20 %	40 %	20 %	83591431
84	NC_007643	TGGGG	2	10	105534	105543	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007643	TTCAA	2	10	107082	107091	40 %	40 %	0 %	20 %	83591432
86	NC_007643	CTGGG	2	10	107604	107613	0 %	20 %	60 %	20 %	83591433
87	NC_007643	CGGGC	2	10	107900	107909	0 %	0 %	60 %	40 %	83591433
88	NC_007643	GGGCC	2	10	109438	109447	0 %	0 %	60 %	40 %	83591435
89	NC_007643	GCCCG	2	10	109817	109826	0 %	0 %	40 %	60 %	83591435
90	NC_007643	CAAGG	2	10	110164	110173	40 %	0 %	40 %	20 %	83591436
91	NC_007643	ATCGG	2	10	110239	110248	20 %	20 %	40 %	20 %	83591436
92	NC_007643	GTCTT	2	10	114155	114164	0 %	60 %	20 %	20 %	83591439
93	NC_007643	GCCCG	2	10	114609	114618	0 %	0 %	40 %	60 %	83591439
94	NC_007643	CGCGG	2	10	115648	115657	0 %	0 %	60 %	40 %	83591441
95	NC_007643	CGCTT	2	10	117463	117472	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007643	GCCCT	2	10	117836	117845	0 %	20 %	20 %	60 %	83591444
97	NC_007643	CCCCG	2	10	118901	118910	0 %	0 %	20 %	80 %	83591444
98	NC_007643	CGATC	2	10	121606	121615	20 %	20 %	20 %	40 %	83591444
99	NC_007643	GGGGC	2	10	122990	122999	0 %	0 %	80 %	20 %	83591444
100	NC_007643	GGGCG	2	10	126297	126306	0 %	0 %	80 %	20 %	83591447
101	NC_007643	CCGGG	2	10	127067	127076	0 %	0 %	60 %	40 %	83591448
102	NC_007643	GGGCC	2	10	128355	128364	0 %	0 %	60 %	40 %	83591449
103	NC_007643	CGCTG	2	10	129698	129707	0 %	20 %	40 %	40 %	83591450
104	NC_007643	CGGCG	2	10	129836	129845	0 %	0 %	60 %	40 %	83591450
105	NC_007643	GGCGA	2	10	130328	130337	20 %	0 %	60 %	20 %	83591451
106	NC_007643	GCGCC	2	10	133425	133434	0 %	0 %	40 %	60 %	83591453
107	NC_007643	CCTTG	2	10	134355	134364	0 %	40 %	20 %	40 %	83591454
108	NC_007643	GCGCC	2	10	135177	135186	0 %	0 %	40 %	60 %	83591455
109	NC_007643	CGGGG	2	10	136791	136800	0 %	0 %	80 %	20 %	83591456
110	NC_007643	CCCCG	2	10	136952	136961	0 %	0 %	20 %	80 %	83591456
111	NC_007643	CGGCC	2	10	138808	138817	0 %	0 %	40 %	60 %	83591458
112	NC_007643	TAAAG	2	10	139831	139840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007643	GCGCA	2	10	140802	140811	20 %	0 %	40 %	40 %	83591460
114	NC_007643	GGGCA	2	10	141896	141905	20 %	0 %	60 %	20 %	83591461
115	NC_007643	GATGG	2	10	144244	144253	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007643	CGGCG	2	10	145332	145341	0 %	0 %	60 %	40 %	83591464
117	NC_007643	GCGGG	2	10	146149	146158	0 %	0 %	80 %	20 %	83591465
118	NC_007643	GGCTG	2	10	147346	147355	0 %	20 %	60 %	20 %	83591466
119	NC_007643	CAGTC	2	10	147964	147973	20 %	20 %	20 %	40 %	83591467
120	NC_007643	GGGGC	2	10	149854	149863	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007643	GTCGC	2	10	150028	150037	0 %	20 %	40 %	40 %	83591469
122	NC_007643	CGGCG	2	10	150378	150387	0 %	0 %	60 %	40 %	83591469
123	NC_007643	GCGAG	2	10	150549	150558	20 %	0 %	60 %	20 %	83591469
124	NC_007643	GGGCA	2	10	150975	150984	20 %	0 %	60 %	20 %	83591469
125	NC_007643	TCCCC	2	10	151321	151330	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
126	NC_007643	TTAGC	2	10	151454	151463	20 %	40 %	20 %	20 %	83591470
127	NC_007643	GGCGG	2	10	154843	154852	0 %	0 %	80 %	20 %	83591472
128	NC_007643	GCCGG	2	10	155665	155674	0 %	0 %	60 %	40 %	83591472
129	NC_007643	CCGGC	2	10	156204	156213	0 %	0 %	40 %	60 %	83591473
130	NC_007643	TCGGG	2	10	156652	156661	0 %	20 %	60 %	20 %	83591473
131	NC_007643	GACCG	2	10	156848	156857	20 %	0 %	40 %	40 %	83591473
132	NC_007643	GGCCG	2	10	159773	159782	0 %	0 %	60 %	40 %	83591476
133	NC_007643	CGGCG	2	10	159902	159911	0 %	0 %	60 %	40 %	83591476
134	NC_007643	TGGCT	2	10	160105	160114	0 %	40 %	40 %	20 %	83591476
135	NC_007643	GGTGC	2	10	163077	163086	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007643	GCGGG	2	10	165860	165869	0 %	0 %	80 %	20 %	83591482
137	NC_007643	AGGGC	2	10	168201	168210	20 %	0 %	60 %	20 %	83591484
138	NC_007643	GGCTG	2	10	168403	168412	0 %	20 %	60 %	20 %	83591484
139	NC_007643	CCCAG	2	10	169561	169570	20 %	0 %	20 %	60 %	83591486
140	NC_007643	CCCGA	2	10	172978	172987	20 %	0 %	20 %	60 %	83591488
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263	NC_007643	CGGCG	2	10	302704	302713	0 %	0 %	60 %	40 %	83591583
264	NC_007643	TGGCG	2	10	304762	304771	0 %	20 %	60 %	20 %	83591585
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266	NC_007643	CGGCC	2	10	306073	306082	0 %	0 %	40 %	60 %	83591586
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268	NC_007643	CGCGG	2	10	307199	307208	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
269	NC_007643	GACCA	2	10	310066	310075	40 %	0 %	20 %	40 %	83591589
270	NC_007643	CGCGC	2	10	312734	312743	0 %	0 %	40 %	60 %	83591591
271	NC_007643	GGTCC	2	10	313673	313682	0 %	20 %	40 %	40 %	83591592
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