MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007643	GC	3	6	154156	154161	0 %	0 %	50 %	50 %	83591471
4002	NC_007643	GCCA	2	8	154219	154226	25 %	0 %	25 %	50 %	83591472
4003	NC_007643	CCA	2	6	154232	154237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591472
4004	NC_007643	CAGC	2	8	154266	154273	25 %	0 %	25 %	50 %	83591472
4005	NC_007643	GCG	3	9	154279	154287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4006	NC_007643	CGCC	2	8	154290	154297	0 %	0 %	25 %	75 %	83591472
4007	NC_007643	CGT	2	6	154298	154303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591472
4008	NC_007643	TCG	2	6	154318	154323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591472
4009	NC_007643	GCG	2	6	154329	154334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4010	NC_007643	GAA	2	6	154353	154358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591472
4011	NC_007643	CCCG	2	8	154409	154416	0 %	0 %	25 %	75 %	83591472
4012	NC_007643	GGC	2	6	154451	154456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4013	NC_007643	GCA	2	6	154511	154516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591472
4014	NC_007643	GCC	2	6	154675	154680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591472
4015	NC_007643	CCGG	2	8	154713	154720	0 %	0 %	50 %	50 %	83591472
4016	NC_007643	CCG	2	6	154725	154730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591472
4017	NC_007643	ATC	2	6	154747	154752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591472
4018	NC_007643	TTG	2	6	154765	154770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591472
4019	NC_007643	GCC	2	6	154783	154788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591472
4020	NC_007643	GCG	2	6	154805	154810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4021	NC_007643	GC	3	6	154837	154842	0 %	0 %	50 %	50 %	83591472
4022	NC_007643	GGCGG	2	10	154843	154852	0 %	0 %	80 %	20 %	83591472
4023	NC_007643	GCG	2	6	154865	154870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4024	NC_007643	G	7	7	155006	155012	0 %	0 %	100 %	0 %	83591472
4025	NC_007643	CGG	2	6	155033	155038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4026	NC_007643	G	6	6	155046	155051	0 %	0 %	100 %	0 %	83591472
4027	NC_007643	CGG	2	6	155139	155144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4028	NC_007643	GCC	2	6	155172	155177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591472
4029	NC_007643	CGG	2	6	155252	155257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4030	NC_007643	GCTG	2	8	155258	155265	0 %	25 %	50 %	25 %	83591472
4031	NC_007643	TCA	2	6	155299	155304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591472
4032	NC_007643	CG	3	6	155325	155330	0 %	0 %	50 %	50 %	83591472
4033	NC_007643	CCG	2	6	155336	155341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591472
4034	NC_007643	CCG	2	6	155370	155375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591472
4035	NC_007643	CCA	2	6	155402	155407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591472
4036	NC_007643	ACG	2	6	155437	155442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591472
4037	NC_007643	AGG	2	6	155477	155482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591472
4038	NC_007643	GCG	2	6	155500	155505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4039	NC_007643	GTC	2	6	155509	155514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591472
4040	NC_007643	CAGC	2	8	155568	155575	25 %	0 %	25 %	50 %	83591472
4041	NC_007643	G	6	6	155615	155620	0 %	0 %	100 %	0 %	83591472
4042	NC_007643	CGG	2	6	155645	155650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591472
4043	NC_007643	TCG	2	6	155651	155656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591472
4044	NC_007643	GCCGG	2	10	155665	155674	0 %	0 %	60 %	40 %	83591472
4045	NC_007643	CCG	4	12	155675	155686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591472
4046	NC_007643	TGG	2	6	155693	155698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591472
4047	NC_007643	CG	3	6	155702	155707	0 %	0 %	50 %	50 %	83591472
4048	NC_007643	CGGC	2	8	155711	155718	0 %	0 %	50 %	50 %	83591472
4049	NC_007643	CGC	3	9	155727	155735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591472
4050	NC_007643	CAG	2	6	155736	155741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591472
4051	NC_007643	TCG	2	6	155808	155813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_007643	GCCG	2	8	155839	155846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_007643	GC	3	6	155860	155865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_007643	G	6	6	155896	155901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_007643	GGC	2	6	155903	155908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_007643	GAT	2	6	155917	155922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_007643	CG	4	8	155936	155943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_007643	TGGC	2	8	155945	155952	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_007643	GTG	2	6	156075	156080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591473
4060	NC_007643	GGT	2	6	156083	156088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591473
4061	NC_007643	GTT	2	6	156149	156154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591473
4062	NC_007643	CTG	2	6	156198	156203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591473
4063	NC_007643	CCGGC	2	10	156204	156213	0 %	0 %	40 %	60 %	83591473
4064	NC_007643	GAT	2	6	156224	156229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591473
4065	NC_007643	GGC	2	6	156284	156289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591473
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4067	NC_007643	CAC	2	6	156323	156328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591473
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4074	NC_007643	CGGG	2	8	156581	156588	0 %	0 %	75 %	25 %	83591473
4075	NC_007643	CCTT	2	8	156613	156620	0 %	50 %	0 %	50 %	83591473
4076	NC_007643	GCA	2	6	156637	156642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591473
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4081	NC_007643	GACCG	2	10	156848	156857	20 %	0 %	40 %	40 %	83591473
4082	NC_007643	CG	3	6	156856	156861	0 %	0 %	50 %	50 %	83591473
4083	NC_007643	GCC	2	6	156873	156878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591473
4084	NC_007643	CGA	2	6	156893	156898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591473
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4089	NC_007643	GC	3	6	157047	157052	0 %	0 %	50 %	50 %	83591473
4090	NC_007643	TGG	2	6	157133	157138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4093	NC_007643	CGA	2	6	157277	157282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591474
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4098	NC_007643	GGCG	2	8	157402	157409	0 %	0 %	75 %	25 %	83591474
4099	NC_007643	CGC	2	6	157427	157432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591474
4100	NC_007643	TGA	2	6	157489	157494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591474
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4106	NC_007643	GCCG	2	8	157751	157758	0 %	0 %	50 %	50 %	83591474
4107	NC_007643	CGC	2	6	157765	157770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591474
4108	NC_007643	TGG	2	6	157786	157791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591474
4109	NC_007643	GGCC	2	8	157805	157812	0 %	0 %	50 %	50 %	83591474
4110	NC_007643	ACC	2	6	157839	157844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591474
4111	NC_007643	GCG	2	6	157864	157869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591474
4112	NC_007643	GAA	2	6	157961	157966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591474
4113	NC_007643	GGC	2	6	157983	157988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591474
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4115	NC_007643	GGC	2	6	158027	158032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591474
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4117	NC_007643	CAA	2	6	158210	158215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591474
4118	NC_007643	GGTT	2	8	158239	158246	0 %	50 %	50 %	0 %	83591474
4119	NC_007643	CGG	2	6	158272	158277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591474
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4121	NC_007643	GGC	2	6	158304	158309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591474
4122	NC_007643	CGA	2	6	158323	158328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591474
4123	NC_007643	CCG	2	6	158344	158349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591474
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4245	NC_007643	TA	3	6	163252	163257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_007643	AAT	3	9	163263	163271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_007643	TGT	2	6	163288	163293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591479
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4369	NC_007643	GGT	2	6	168505	168510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591484
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4372	NC_007643	CGG	2	6	168616	168621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4373	NC_007643	G	7	7	168639	168645	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_007643	AG	3	6	168652	168657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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