MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007643	GCTG	2	8	118083	118090	0 %	25 %	50 %	25 %	83591444
3002	NC_007643	CG	3	6	118131	118136	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3003	NC_007643	GCC	3	9	118142	118150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3004	NC_007643	GCC	2	6	118169	118174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3005	NC_007643	CCG	2	6	118209	118214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3006	NC_007643	GCC	2	6	118226	118231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3007	NC_007643	GTT	2	6	118255	118260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591444
3008	NC_007643	CCG	2	6	118261	118266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3009	NC_007643	GCCA	2	8	118274	118281	25 %	0 %	25 %	50 %	83591444
3010	NC_007643	CG	3	6	118290	118295	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3011	NC_007643	CGC	2	6	118309	118314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3012	NC_007643	CGG	2	6	118318	118323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3013	NC_007643	CGG	2	6	118340	118345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3014	NC_007643	CCG	2	6	118395	118400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3015	NC_007643	CGC	2	6	118405	118410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3016	NC_007643	CCG	2	6	118443	118448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3017	NC_007643	C	6	6	118605	118610	0 %	0 %	0 %	100 %	83591444
3018	NC_007643	GC	3	6	118646	118651	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3019	NC_007643	CTG	2	6	118706	118711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3020	NC_007643	CTG	2	6	118739	118744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3021	NC_007643	GCG	2	6	118776	118781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3022	NC_007643	CGC	2	6	118843	118848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3023	NC_007643	GACGGC	2	12	118861	118872	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83591444
3024	NC_007643	CCA	2	6	118884	118889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591444
3025	NC_007643	CCCCG	2	10	118901	118910	0 %	0 %	20 %	80 %	83591444
3026	NC_007643	CTG	2	6	118919	118924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3027	NC_007643	GCC	2	6	118925	118930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3028	NC_007643	TGG	2	6	118958	118963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591444
3029	NC_007643	GCT	2	6	118981	118986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3030	NC_007643	CGCT	2	8	119045	119052	0 %	25 %	25 %	50 %	83591444
3031	NC_007643	CG	3	6	119095	119100	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3032	NC_007643	CAA	2	6	119101	119106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591444
3033	NC_007643	GCCC	2	8	119158	119165	0 %	0 %	25 %	75 %	83591444
3034	NC_007643	CGGC	2	8	119217	119224	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3035	NC_007643	CGG	2	6	119281	119286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3036	NC_007643	CCGG	2	8	119341	119348	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3037	NC_007643	GTT	2	6	119371	119376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591444
3038	NC_007643	GC	3	6	119390	119395	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3039	NC_007643	GCCT	2	8	119406	119413	0 %	25 %	25 %	50 %	83591444
3040	NC_007643	GC	3	6	119519	119524	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3041	NC_007643	CGC	2	6	119560	119565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3042	NC_007643	GCC	2	6	119566	119571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3043	NC_007643	TCGT	2	8	119585	119592	0 %	50 %	25 %	25 %	83591444
3044	NC_007643	ACC	2	6	119636	119641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591444
3045	NC_007643	GAC	2	6	119659	119664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3046	NC_007643	ATT	2	6	119709	119714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83591444
3047	NC_007643	GTG	2	6	119756	119761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591444
3048	NC_007643	CGC	2	6	119785	119790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3049	NC_007643	AGG	3	9	119820	119828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591444
3050	NC_007643	GC	3	6	119907	119912	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3051	NC_007643	GC	3	6	119932	119937	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3052	NC_007643	G	6	6	119973	119978	0 %	0 %	100 %	0 %	83591444
3053	NC_007643	GC	3	6	119981	119986	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3054	NC_007643	TGC	2	6	119994	119999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3055	NC_007643	GCC	2	6	120089	120094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3056	NC_007643	CGGC	2	8	120102	120109	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3057	NC_007643	CGG	2	6	120181	120186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3058	NC_007643	CCG	2	6	120199	120204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3059	NC_007643	CGA	2	6	120214	120219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3060	NC_007643	GC	3	6	120223	120228	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3061	NC_007643	TGA	2	6	120240	120245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591444
3062	NC_007643	CCG	2	6	120246	120251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3063	NC_007643	GGC	2	6	120317	120322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3064	NC_007643	TCGC	2	8	120326	120333	0 %	25 %	25 %	50 %	83591444
3065	NC_007643	TGG	2	6	120362	120367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591444
3066	NC_007643	CGAGGC	2	12	120418	120429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83591444
3067	NC_007643	GGT	2	6	120496	120501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591444
3068	NC_007643	G	6	6	120582	120587	0 %	0 %	100 %	0 %	83591444
3069	NC_007643	TGG	2	6	120600	120605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591444
3070	NC_007643	CGGG	2	8	120649	120656	0 %	0 %	75 %	25 %	83591444
3071	NC_007643	GGCG	2	8	120769	120776	0 %	0 %	75 %	25 %	83591444
3072	NC_007643	GCC	2	6	120803	120808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3073	NC_007643	TTA	3	9	120862	120870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83591444
3074	NC_007643	CGCC	2	8	120934	120941	0 %	0 %	25 %	75 %	83591444
3075	NC_007643	GGC	2	6	120959	120964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3076	NC_007643	TCG	2	6	121035	121040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3077	NC_007643	GGGC	2	8	121055	121062	0 %	0 %	75 %	25 %	83591444
3078	NC_007643	CCGG	2	8	121092	121099	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3079	NC_007643	CCGGCG	2	12	121125	121136	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3080	NC_007643	GCG	2	6	121151	121156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3081	NC_007643	TGG	2	6	121176	121181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591444
3082	NC_007643	TCCT	2	8	121223	121230	0 %	50 %	0 %	50 %	83591444
3083	NC_007643	CGGC	2	8	121260	121267	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3084	NC_007643	GCC	2	6	121280	121285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
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3087	NC_007643	CCCGGG	2	12	121384	121395	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3088	NC_007643	GC	3	6	121470	121475	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3089	NC_007643	CGG	2	6	121507	121512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3090	NC_007643	CGG	2	6	121534	121539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3091	NC_007643	GTC	2	6	121588	121593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3092	NC_007643	CGATC	2	10	121606	121615	20 %	20 %	20 %	40 %	83591444
3093	NC_007643	GGC	2	6	121793	121798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3094	NC_007643	TCG	2	6	121814	121819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3095	NC_007643	G	7	7	121819	121825	0 %	0 %	100 %	0 %	83591444
3096	NC_007643	CTG	2	6	121862	121867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3097	NC_007643	GCC	2	6	121886	121891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3098	NC_007643	TCG	2	6	121902	121907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3099	NC_007643	CGG	3	9	121974	121982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3100	NC_007643	CCG	3	9	122094	122102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3101	NC_007643	GCT	2	6	122110	122115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3102	NC_007643	CG	3	6	122127	122132	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3103	NC_007643	CGC	2	6	122137	122142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3104	NC_007643	CGA	2	6	122188	122193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3105	NC_007643	CGC	2	6	122224	122229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3106	NC_007643	GAT	2	6	122267	122272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591444
3107	NC_007643	C	6	6	122316	122321	0 %	0 %	0 %	100 %	83591444
3108	NC_007643	GGCT	2	8	122342	122349	0 %	25 %	50 %	25 %	83591444
3109	NC_007643	CGC	2	6	122356	122361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3110	NC_007643	CAG	2	6	122378	122383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3111	NC_007643	CGC	2	6	122392	122397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3112	NC_007643	CAC	2	6	122431	122436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591444
3113	NC_007643	GGC	2	6	122492	122497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3114	NC_007643	CGT	2	6	122512	122517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3115	NC_007643	GCC	3	9	122545	122553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3116	NC_007643	GGC	2	6	122554	122559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591444
3117	NC_007643	CTG	2	6	122642	122647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
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3119	NC_007643	CTG	2	6	122726	122731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3120	NC_007643	CCG	2	6	122733	122738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
3121	NC_007643	ACC	2	6	122819	122824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591444
3122	NC_007643	CGA	2	6	122839	122844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591444
3123	NC_007643	GC	3	6	122908	122913	0 %	0 %	50 %	50 %	83591444
3124	NC_007643	GTT	2	6	122933	122938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591444
3125	NC_007643	GCC	2	6	122945	122950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591444
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3243	NC_007643	CTTT	2	8	127056	127063	0 %	75 %	0 %	25 %	83591448
3244	NC_007643	CCGGG	2	10	127067	127076	0 %	0 %	60 %	40 %	83591448
3245	NC_007643	CCG	2	6	127135	127140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591448
3246	NC_007643	TGC	2	6	127183	127188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591448
3247	NC_007643	ATCGAT	2	12	127203	127214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	83591448
3248	NC_007643	TTC	2	6	127240	127245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591448
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3250	NC_007643	C	6	6	127300	127305	0 %	0 %	0 %	100 %	83591448
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3375	NC_007643	GCG	2	6	131014	131019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3376	NC_007643	CGC	2	6	131022	131027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591452
3377	NC_007643	CGG	3	9	131093	131101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3378	NC_007643	ACC	2	6	131113	131118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591452
3379	NC_007643	GCCC	2	8	131121	131128	0 %	0 %	25 %	75 %	83591452
3380	NC_007643	ATC	2	6	131152	131157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591452
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3382	NC_007643	GCG	2	6	131233	131238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591452
3383	NC_007643	TGA	2	6	131309	131314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591452
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3479	NC_007643	CGG	2	6	134908	134913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591455
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3496	NC_007643	TGC	2	6	135431	135436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591455
3497	NC_007643	GCCG	2	8	135501	135508	0 %	0 %	50 %	50 %	83591455
3498	NC_007643	GAG	2	6	135532	135537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591455
3499	NC_007643	GCG	2	6	135561	135566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591455
3500	NC_007643	TGC	3	9	135599	135607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591455

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