MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007643	GAC	2	6	40931	40936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591376
1002	NC_007643	CCG	2	6	40952	40957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591376
1003	NC_007643	A	6	6	40967	40972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_007643	CCGG	2	8	40985	40992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_007643	CGC	2	6	41008	41013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_007643	GGC	2	6	41037	41042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_007643	CGGG	2	8	41064	41071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_007643	CAAG	2	8	41153	41160	50 %	0 %	25 %	25 %	83591377
1009	NC_007643	C	6	6	41215	41220	0 %	0 %	0 %	100 %	83591377
1010	NC_007643	GGC	2	6	41251	41256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_007643	GCC	2	6	41260	41265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591378
1012	NC_007643	CAG	2	6	41272	41277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591378
1013	NC_007643	GGC	3	9	41296	41304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591378
1014	NC_007643	CAC	2	6	41419	41424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591378
1015	NC_007643	CCA	2	6	41449	41454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591378
1016	NC_007643	TGA	2	6	41469	41474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591378
1017	NC_007643	GCC	3	9	41510	41518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591378
1018	NC_007643	CG	3	6	41526	41531	0 %	0 %	50 %	50 %	83591378
1019	NC_007643	TCG	2	6	41537	41542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591378
1020	NC_007643	AGAA	2	8	41576	41583	75 %	0 %	25 %	0 %	83591378
1021	NC_007643	CCA	2	6	41620	41625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591378
1022	NC_007643	CAGA	2	8	41665	41672	50 %	0 %	25 %	25 %	83591378
1023	NC_007643	CGGCG	2	10	41695	41704	0 %	0 %	60 %	40 %	83591378
1024	NC_007643	GCGG	2	8	41707	41714	0 %	0 %	75 %	25 %	83591378
1025	NC_007643	CCG	2	6	41751	41756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591378
1026	NC_007643	GGC	3	9	41758	41766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591378
1027	NC_007643	ACAT	2	8	41813	41820	50 %	25 %	0 %	25 %	83591378
1028	NC_007643	CTG	2	6	41839	41844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591378
1029	NC_007643	CGGG	2	8	41850	41857	0 %	0 %	75 %	25 %	83591378
1030	NC_007643	ACC	2	6	41885	41890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591378
1031	NC_007643	CCG	2	6	41898	41903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591378
1032	NC_007643	CAC	2	6	41915	41920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591378
1033	NC_007643	GGT	2	6	42025	42030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_007643	CGC	2	6	42211	42216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591379
1035	NC_007643	GGC	2	6	42232	42237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591379
1036	NC_007643	CCG	2	6	42255	42260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591379
1037	NC_007643	CGC	2	6	42333	42338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591379
1038	NC_007643	GGC	2	6	42358	42363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591379
1039	NC_007643	AGGCTG	2	12	42380	42391	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83591379
1040	NC_007643	CGC	2	6	42409	42414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591379
1041	NC_007643	CGC	2	6	42435	42440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591379
1042	NC_007643	GCA	2	6	42447	42452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591379
1043	NC_007643	GCG	2	6	42509	42514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591379
1044	NC_007643	GAC	2	6	42526	42531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591379
1045	NC_007643	GAG	2	6	42548	42553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591379
1046	NC_007643	CAG	2	6	42559	42564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591379
1047	NC_007643	CTG	2	6	42589	42594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591379
1048	NC_007643	CCG	2	6	42672	42677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591379
1049	NC_007643	CAC	2	6	42706	42711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591379
1050	NC_007643	GAC	2	6	42715	42720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591379
1051	NC_007643	CCA	3	9	42729	42737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591379
1052	NC_007643	CGC	2	6	42747	42752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591379
1053	NC_007643	TCC	2	6	42817	42822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591380
1054	NC_007643	CGG	2	6	42833	42838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591380
1055	NC_007643	CG	3	6	42839	42844	0 %	0 %	50 %	50 %	83591380
1056	NC_007643	TGG	2	6	42904	42909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591380
1057	NC_007643	C	6	6	42928	42933	0 %	0 %	0 %	100 %	83591380
1058	NC_007643	GCC	2	6	42934	42939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591380
1059	NC_007643	GGCG	2	8	42944	42951	0 %	0 %	75 %	25 %	83591380
1060	NC_007643	CGT	2	6	42993	42998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591380
1061	NC_007643	AGC	2	6	43009	43014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591380
1062	NC_007643	GCG	2	6	43019	43024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591380
1063	NC_007643	CGGCG	2	10	43026	43035	0 %	0 %	60 %	40 %	83591380
1064	NC_007643	ACA	2	6	43076	43081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591380
1065	NC_007643	TGG	2	6	43094	43099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591380
1066	NC_007643	CCG	2	6	43243	43248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591380
1067	NC_007643	CGG	2	6	43262	43267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591380
1068	NC_007643	C	7	7	43279	43285	0 %	0 %	0 %	100 %	83591380
1069	NC_007643	GCCG	2	8	43292	43299	0 %	0 %	50 %	50 %	83591380
1070	NC_007643	GCA	3	9	43310	43318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591380
1071	NC_007643	CGA	2	6	43338	43343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591380
1072	NC_007643	AGC	2	6	43366	43371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591380
1073	NC_007643	GCC	2	6	43380	43385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591380
1074	NC_007643	GGCGA	2	10	43389	43398	20 %	0 %	60 %	20 %	83591380
1075	NC_007643	CGC	2	6	43427	43432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591380
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1077	NC_007643	G	7	7	43494	43500	0 %	0 %	100 %	0 %	83591380
1078	NC_007643	G	6	6	43509	43514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_007643	CCG	2	6	43536	43541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_007643	GGA	2	6	43593	43598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_007643	GGCG	2	8	43606	43613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_007643	A	6	6	43614	43619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_007643	GGC	2	6	43620	43625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_007643	GCC	2	6	43663	43668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_007643	GAA	2	6	43694	43699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_007643	GCC	2	6	43700	43705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_007643	AAG	2	6	43748	43753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_007643	T	6	6	43799	43804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_007643	TTA	2	6	43835	43840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83591381
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1091	NC_007643	CCG	2	6	43927	43932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591381
1092	NC_007643	TCC	2	6	43944	43949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591381
1093	NC_007643	GGCG	2	8	44011	44018	0 %	0 %	75 %	25 %	83591381
1094	NC_007643	GGGC	3	12	44024	44035	0 %	0 %	75 %	25 %	83591381
1095	NC_007643	GGC	2	6	44069	44074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591381
1096	NC_007643	GCGG	2	8	44096	44103	0 %	0 %	75 %	25 %	83591381
1097	NC_007643	CGA	2	6	44116	44121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591381
1098	NC_007643	ATC	2	6	44136	44141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591381
1099	NC_007643	GGC	2	6	44237	44242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591381
1100	NC_007643	GCGAA	2	10	44271	44280	40 %	0 %	40 %	20 %	83591381
1101	NC_007643	GATC	2	8	44295	44302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_007643	AC	3	6	44337	44342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_007643	GGC	2	6	44343	44348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_007643	TTC	2	6	44350	44355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_007643	CAC	2	6	44386	44391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_007643	G	8	8	44392	44399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_007643	G	6	6	44477	44482	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_007643	GCG	2	6	44554	44559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_007643	CGC	2	6	44565	44570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_007643	CCG	2	6	44571	44576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_007643	CGG	2	6	44605	44610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_007643	CGG	2	6	44701	44706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591382
1113	NC_007643	CCG	2	6	44710	44715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591382
1114	NC_007643	GCG	2	6	44716	44721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591382
1115	NC_007643	CGG	2	6	44843	44848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591382
1116	NC_007643	CGG	2	6	44869	44874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591382
1117	NC_007643	GAT	2	6	44892	44897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591382
1118	NC_007643	CTG	2	6	44898	44903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591382
1119	NC_007643	CTT	2	6	44931	44936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591382
1120	NC_007643	GGT	2	6	45021	45026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591382
1121	NC_007643	CGC	2	6	45029	45034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591382
1122	NC_007643	CGA	2	6	45089	45094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591382
1123	NC_007643	CGCC	2	8	45095	45102	0 %	0 %	25 %	75 %	83591382
1124	NC_007643	CGG	2	6	45117	45122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591382
1125	NC_007643	G	7	7	45182	45188	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_007643	CGTC	2	8	45208	45215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_007643	TTGCC	2	10	45222	45231	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1128	NC_007643	CGC	2	6	45251	45256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_007643	TTCC	2	8	45293	45300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_007643	CG	3	6	45314	45319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_007643	GA	3	6	45331	45336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_007643	GGC	2	6	45450	45455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591383
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