MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007643	GGC	2	6	237136	237141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_007643	AT	3	6	237156	237161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_007643	ATT	2	6	237179	237184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_007643	AGT	2	6	237218	237223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_007643	CACC	2	8	237240	237247	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6006	NC_007643	CCGG	2	8	237323	237330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_007643	GCC	2	6	237368	237373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591534
6008	NC_007643	CGC	2	6	237384	237389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591534
6009	NC_007643	CCA	2	6	237394	237399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591534
6010	NC_007643	CGCC	2	8	237431	237438	0 %	0 %	25 %	75 %	83591534
6011	NC_007643	GAG	2	6	237440	237445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591534
6012	NC_007643	A	6	6	237522	237527	100 %	0 %	0 %	0 %	83591534
6013	NC_007643	AAG	2	6	237620	237625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591534
6014	NC_007643	TCAGA	2	10	237681	237690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6015	NC_007643	GC	3	6	237760	237765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_007643	TC	3	6	237772	237777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_007643	CCG	2	6	237830	237835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_007643	ATG	2	6	237867	237872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591535
6019	NC_007643	GCC	3	9	237894	237902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6020	NC_007643	CGC	2	6	237934	237939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6021	NC_007643	CCCTAT	2	12	237954	237965	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	83591535
6022	NC_007643	CCG	2	6	237972	237977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6023	NC_007643	GGC	2	6	237980	237985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6024	NC_007643	C	6	6	238012	238017	0 %	0 %	0 %	100 %	83591535
6025	NC_007643	CCA	2	6	238045	238050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591535
6026	NC_007643	GCT	2	6	238076	238081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6027	NC_007643	GTC	2	6	238128	238133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6028	NC_007643	GAC	2	6	238241	238246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6029	NC_007643	GCG	2	6	238247	238252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6030	NC_007643	CGAT	2	8	238357	238364	25 %	25 %	25 %	25 %	83591535
6031	NC_007643	GCC	2	6	238365	238370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6032	NC_007643	GCC	2	6	238395	238400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6033	NC_007643	CGC	2	6	238415	238420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6034	NC_007643	CGC	2	6	238430	238435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6035	NC_007643	GCTCG	2	10	238445	238454	0 %	20 %	40 %	40 %	83591535
6036	NC_007643	GTC	2	6	238458	238463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6037	NC_007643	GGC	2	6	238535	238540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6038	NC_007643	GC	3	6	238591	238596	0 %	0 %	50 %	50 %	83591535
6039	NC_007643	CGG	2	6	238597	238602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6040	NC_007643	ACC	2	6	238620	238625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591535
6041	NC_007643	GC	3	6	238666	238671	0 %	0 %	50 %	50 %	83591535
6042	NC_007643	CGC	2	6	238703	238708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6043	NC_007643	GTCG	2	8	238805	238812	0 %	25 %	50 %	25 %	83591535
6044	NC_007643	GCC	2	6	238842	238847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6045	NC_007643	CTT	2	6	238970	238975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591535
6046	NC_007643	CCT	2	6	238990	238995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591535
6047	NC_007643	TC	3	6	239050	239055	0 %	50 %	0 %	50 %	83591535
6048	NC_007643	TCCT	2	8	239061	239068	0 %	50 %	0 %	50 %	83591535
6049	NC_007643	CGG	2	6	239146	239151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6050	NC_007643	TGC	2	6	239167	239172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6051	NC_007643	GTG	2	6	239184	239189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6052	NC_007643	TCGA	2	8	239220	239227	25 %	25 %	25 %	25 %	83591535
6053	NC_007643	GGC	2	6	239252	239257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6054	NC_007643	CTT	2	6	239259	239264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591535
6055	NC_007643	GTG	2	6	239274	239279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6056	NC_007643	CGC	2	6	239309	239314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6057	NC_007643	ACG	2	6	239316	239321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6058	NC_007643	GGC	2	6	239345	239350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6059	NC_007643	ACC	2	6	239373	239378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591535
6060	NC_007643	GC	3	6	239399	239404	0 %	0 %	50 %	50 %	83591535
6061	NC_007643	GC	3	6	239422	239427	0 %	0 %	50 %	50 %	83591535
6062	NC_007643	GCTCAA	2	12	239456	239467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	83591535
6063	NC_007643	GCA	2	6	239470	239475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6064	NC_007643	CGG	2	6	239491	239496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6065	NC_007643	CGA	2	6	239522	239527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6066	NC_007643	CAT	2	6	239579	239584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591535
6067	NC_007643	ATC	2	6	239760	239765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591535
6068	NC_007643	CGG	2	6	239852	239857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6069	NC_007643	CAG	3	9	239943	239951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6070	NC_007643	GTG	2	6	240006	240011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6071	NC_007643	C	6	6	240030	240035	0 %	0 %	0 %	100 %	83591535
6072	NC_007643	GAC	2	6	240057	240062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6073	NC_007643	GC	3	6	240075	240080	0 %	0 %	50 %	50 %	83591535
6074	NC_007643	CGC	2	6	240089	240094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6075	NC_007643	GGT	2	6	240107	240112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6076	NC_007643	GCC	2	6	240144	240149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
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6078	NC_007643	TCG	2	6	240226	240231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6079	NC_007643	CGC	3	9	240308	240316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6080	NC_007643	GCG	2	6	240384	240389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6081	NC_007643	GCC	2	6	240412	240417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6082	NC_007643	CGC	2	6	240443	240448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6083	NC_007643	CGGT	2	8	240498	240505	0 %	25 %	50 %	25 %	83591535
6084	NC_007643	TCAA	2	8	240526	240533	50 %	25 %	0 %	25 %	83591535
6085	NC_007643	CAG	2	6	240561	240566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
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6092	NC_007643	CGG	2	6	240914	240919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6093	NC_007643	GATC	2	8	240938	240945	25 %	25 %	25 %	25 %	83591535
6094	NC_007643	CGC	2	6	240947	240952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6095	NC_007643	GTG	2	6	240993	240998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
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6097	NC_007643	GGT	2	6	241176	241181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6098	NC_007643	GCCG	2	8	241247	241254	0 %	0 %	50 %	50 %	83591535
6099	NC_007643	CAA	2	6	241265	241270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591535
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6109	NC_007643	GCG	2	6	241500	241505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591535
6110	NC_007643	CAC	2	6	241508	241513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591535
6111	NC_007643	TGG	2	6	241516	241521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6112	NC_007643	CTT	2	6	241535	241540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591535
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6116	NC_007643	CAT	2	6	241724	241729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591535
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6119	NC_007643	TGG	2	6	241882	241887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6120	NC_007643	TCG	2	6	241951	241956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591535
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6122	NC_007643	CCG	2	6	242002	242007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6123	NC_007643	GCAC	2	8	242044	242051	25 %	0 %	25 %	50 %	83591535
6124	NC_007643	CGCC	2	8	242059	242066	0 %	0 %	25 %	75 %	83591535
6125	NC_007643	GTG	2	6	242151	242156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6126	NC_007643	CGC	2	6	242158	242163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6127	NC_007643	GCA	2	6	242176	242181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6128	NC_007643	TGC	2	6	242200	242205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6129	NC_007643	CAG	2	6	242235	242240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6130	NC_007643	CCG	2	6	242253	242258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
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6132	NC_007643	CGT	2	6	242336	242341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591535
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6149	NC_007643	CTG	2	6	243303	243308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591535
6150	NC_007643	GCC	3	9	243345	243353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6151	NC_007643	GAC	2	6	243401	243406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591535
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6153	NC_007643	GTG	2	6	243570	243575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6154	NC_007643	GGT	2	6	243605	243610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591535
6155	NC_007643	GCC	2	6	243617	243622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591535
6156	NC_007643	GGAC	2	8	243649	243656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6157	NC_007643	CAT	2	6	243753	243758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591536
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6162	NC_007643	CG	3	6	243958	243963	0 %	0 %	50 %	50 %	83591536
6163	NC_007643	CGG	2	6	243989	243994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591536
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6186	NC_007643	GAT	2	6	245067	245072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591537
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6190	NC_007643	GATCA	2	10	245314	245323	40 %	20 %	20 %	20 %	83591537
6191	NC_007643	CGC	2	6	245334	245339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591537
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6197	NC_007643	CCG	2	6	245531	245536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591537
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6199	NC_007643	TGA	2	6	245576	245581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591537
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6202	NC_007643	CTG	2	6	245718	245723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591537
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6242	NC_007643	CGT	2	6	247302	247307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591538
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6245	NC_007643	C	6	6	247475	247480	0 %	0 %	0 %	100 %	83591538
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6372	NC_007643	GGC	2	6	252111	252116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591542
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6375	NC_007643	CGGC	2	8	252300	252307	0 %	0 %	50 %	50 %	83591542
6376	NC_007643	CGGC	2	8	252327	252334	0 %	0 %	50 %	50 %	83591542
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6402	NC_007643	CGG	2	6	253180	253185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6403	NC_007643	GGCG	2	8	253190	253197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6404	NC_007643	G	7	7	253207	253213	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6498	NC_007643	GAA	2	6	257238	257243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591547
6499	NC_007643	GCTT	2	8	257245	257252	0 %	50 %	25 %	25 %	83591547
6500	NC_007643	GGT	2	6	257339	257344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591547

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