MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007643	CGGC	2	8	215671	215678	0 %	0 %	50 %	50 %	83591521
5502	NC_007643	CGC	3	9	215729	215737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591521
5503	NC_007643	TGA	2	6	215742	215747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591521
5504	NC_007643	G	8	8	215764	215771	0 %	0 %	100 %	0 %	83591521
5505	NC_007643	G	6	6	215773	215778	0 %	0 %	100 %	0 %	83591521
5506	NC_007643	CCA	2	6	215794	215799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591521
5507	NC_007643	ATC	2	6	215834	215839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591521
5508	NC_007643	GC	3	6	215855	215860	0 %	0 %	50 %	50 %	83591521
5509	NC_007643	C	6	6	215860	215865	0 %	0 %	0 %	100 %	83591521
5510	NC_007643	TTTCA	2	10	215930	215939	20 %	60 %	0 %	20 %	83591521
5511	NC_007643	C	6	6	215949	215954	0 %	0 %	0 %	100 %	83591521
5512	NC_007643	GAA	2	6	215957	215962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591521
5513	NC_007643	GAG	2	6	215974	215979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591521
5514	NC_007643	CGC	2	6	216034	216039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591522
5515	NC_007643	GAC	2	6	216040	216045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591522
5516	NC_007643	GCA	2	6	216090	216095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591522
5517	NC_007643	ACA	2	6	216096	216101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591522
5518	NC_007643	CGC	2	6	216175	216180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591522
5519	NC_007643	CCA	2	6	216231	216236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591522
5520	NC_007643	CATT	2	8	216240	216247	25 %	50 %	0 %	25 %	83591522
5521	NC_007643	CAGGGA	2	12	216265	216276	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83591522
5522	NC_007643	TCG	2	6	216285	216290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591522
5523	NC_007643	CGT	2	6	216304	216309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591522
5524	NC_007643	GCC	2	6	216311	216316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591522
5525	NC_007643	CGG	2	6	216318	216323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591522
5526	NC_007643	GTC	2	6	216523	216528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591522
5527	NC_007643	AAT	2	6	216609	216614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83591522
5528	NC_007643	T	7	7	216752	216758	0 %	100 %	0 %	0 %	83591522
5529	NC_007643	GAA	2	6	216925	216930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591522
5530	NC_007643	CCT	2	6	216945	216950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591522
5531	NC_007643	GGCG	2	8	216957	216964	0 %	0 %	75 %	25 %	83591522
5532	NC_007643	CGC	2	6	216988	216993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591522
5533	NC_007643	CAG	2	6	217004	217009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591522
5534	NC_007643	TGA	2	6	217031	217036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591522
5535	NC_007643	TCT	2	6	217040	217045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591522
5536	NC_007643	CT	3	6	217066	217071	0 %	50 %	0 %	50 %	83591522
5537	NC_007643	GGA	2	6	217121	217126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591522
5538	NC_007643	CCG	2	6	217284	217289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591522
5539	NC_007643	CGG	2	6	217310	217315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591522
5540	NC_007643	GGC	2	6	217393	217398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591522
5541	NC_007643	GTTT	2	8	217410	217417	0 %	75 %	25 %	0 %	83591522
5542	NC_007643	T	7	7	217415	217421	0 %	100 %	0 %	0 %	83591522
5543	NC_007643	TCA	2	6	217436	217441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591522
5544	NC_007643	GCGGA	2	10	217447	217456	20 %	0 %	60 %	20 %	83591522
5545	NC_007643	GTCG	2	8	217528	217535	0 %	25 %	50 %	25 %	83591522
5546	NC_007643	CCA	2	6	217593	217598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591522
5547	NC_007643	CCGT	2	8	217619	217626	0 %	25 %	25 %	50 %	83591522
5548	NC_007643	TGGC	2	8	217737	217744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_007643	GAC	2	6	217836	217841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591523
5550	NC_007643	TTC	3	9	217852	217860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591523
5551	NC_007643	ATG	2	6	217930	217935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591523
5552	NC_007643	CGG	2	6	217991	217996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591523
5553	NC_007643	CGG	2	6	218009	218014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591523
5554	NC_007643	GGC	2	6	218029	218034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591523
5555	NC_007643	GGTC	2	8	218035	218042	0 %	25 %	50 %	25 %	83591523
5556	NC_007643	CGT	2	6	218076	218081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591523
5557	NC_007643	TCG	2	6	218102	218107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591523
5558	NC_007643	G	7	7	218128	218134	0 %	0 %	100 %	0 %	83591523
5559	NC_007643	GGA	2	6	218156	218161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591523
5560	NC_007643	CG	3	6	218180	218185	0 %	0 %	50 %	50 %	83591523
5561	NC_007643	CGA	2	6	218195	218200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591523
5562	NC_007643	TCC	2	6	218218	218223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591523
5563	NC_007643	GCT	2	6	218248	218253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591523
5564	NC_007643	GTC	2	6	218259	218264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591523
5565	NC_007643	CAG	2	6	218319	218324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591523
5566	NC_007643	CGT	2	6	218339	218344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591523
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5569	NC_007643	GC	3	6	218425	218430	0 %	0 %	50 %	50 %	83591523
5570	NC_007643	TGG	2	6	218432	218437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591523
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5578	NC_007643	CT	3	6	219109	219114	0 %	50 %	0 %	50 %	83591523
5579	NC_007643	CGC	2	6	219147	219152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591523
5580	NC_007643	CGGGG	2	10	219234	219243	0 %	0 %	80 %	20 %	83591523
5581	NC_007643	CGG	2	6	219253	219258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591523
5582	NC_007643	C	6	6	219284	219289	0 %	0 %	0 %	100 %	83591523
5583	NC_007643	GCC	2	6	219306	219311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591523
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5585	NC_007643	TCG	2	6	219331	219336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591523
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5588	NC_007643	GCT	2	6	219506	219511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591523
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5590	NC_007643	TCA	2	6	219725	219730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591523
5591	NC_007643	CGG	2	6	219780	219785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591523
5592	NC_007643	GGC	2	6	219886	219891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591523
5593	NC_007643	GCTTTA	2	12	219917	219928	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	83591523
5594	NC_007643	TCG	2	6	219929	219934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591523
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5598	NC_007643	G	7	7	220128	220134	0 %	0 %	100 %	0 %	83591523
5599	NC_007643	CAG	2	6	220152	220157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591523
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5602	NC_007643	GGT	2	6	220233	220238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591523
5603	NC_007643	CAGA	2	8	220259	220266	50 %	0 %	25 %	25 %	83591523
5604	NC_007643	CGT	2	6	220271	220276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591523
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5606	NC_007643	CGC	2	6	220469	220474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591524
5607	NC_007643	CCTC	2	8	220480	220487	0 %	25 %	0 %	75 %	83591524
5608	NC_007643	GCG	2	6	220489	220494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591524
5609	NC_007643	TGGA	2	8	220512	220519	25 %	25 %	50 %	0 %	83591524
5610	NC_007643	CCG	2	6	220551	220556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591524
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5612	NC_007643	GCC	2	6	220631	220636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591524
5613	NC_007643	GCAAGA	2	12	220690	220701	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	83591524
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5617	NC_007643	CGAT	2	8	220824	220831	25 %	25 %	25 %	25 %	83591524
5618	NC_007643	CCA	2	6	220834	220839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591524
5619	NC_007643	CG	3	6	220901	220906	0 %	0 %	50 %	50 %	83591524
5620	NC_007643	CAAA	2	8	220921	220928	75 %	0 %	0 %	25 %	83591524
5621	NC_007643	TGG	2	6	220933	220938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591524
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5624	NC_007643	CCG	3	9	220963	220971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591524
5625	NC_007643	CGG	2	6	220984	220989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591524
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6000	NC_007643	CGA	2	6	237099	237104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591533

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