MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007643	CCA	2	6	192756	192761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_007643	CGA	2	6	192765	192770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_007643	GCCA	2	8	192794	192801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_007643	GCA	2	6	192839	192844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_007643	GTGA	2	8	192892	192899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_007643	GAT	2	6	192938	192943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_007643	AGA	2	6	192956	192961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_007643	CAG	2	6	192982	192987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_007643	GTT	2	6	193013	193018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_007643	GTG	2	6	193131	193136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_007643	GGA	2	6	193173	193178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_007643	GGC	2	6	193193	193198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_007643	TGC	2	6	193511	193516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_007643	GTC	2	6	193523	193528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_007643	TCGTG	2	10	193532	193541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5016	NC_007643	GGA	2	6	193637	193642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_007643	GGGCT	2	10	193678	193687	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5018	NC_007643	AC	3	6	193688	193693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_007643	AC	3	6	193856	193861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_007643	AGG	2	6	193915	193920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_007643	CCT	2	6	193997	194002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_007643	AAG	2	6	194069	194074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_007643	CGG	2	6	194131	194136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_007643	GGT	2	6	194162	194167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_007643	GGT	2	6	194203	194208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_007643	CCA	2	6	194260	194265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_007643	GTC	2	6	194377	194382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_007643	CCA	2	6	194402	194407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_007643	CCT	2	6	194447	194452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_007643	CCA	2	6	194484	194489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_007643	CT	3	6	194545	194550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_007643	CTG	2	6	194575	194580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_007643	T	6	6	194601	194606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_007643	CGT	2	6	194607	194612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_007643	TTC	2	6	194703	194708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_007643	CAAG	2	8	194780	194787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_007643	TGG	2	6	194799	194804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_007643	ACCC	2	8	194903	194910	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5039	NC_007643	GGA	2	6	194983	194988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_007643	TAG	2	6	195012	195017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_007643	GCGA	2	8	195020	195027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_007643	G	6	6	195167	195172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_007643	ACC	2	6	195173	195178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_007643	GAC	2	6	195200	195205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_007643	TCG	2	6	195418	195423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_007643	GGA	2	6	195485	195490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_007643	GAT	2	6	195602	195607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_007643	ACC	2	6	195609	195614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_007643	CAGA	2	8	195698	195705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_007643	AAC	2	6	195738	195743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_007643	ACC	2	6	195748	195753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_007643	AAC	2	6	195805	195810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_007643	AGG	2	6	195812	195817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_007643	AGC	2	6	195828	195833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_007643	AAAG	2	8	195842	195849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_007643	TTCT	2	8	195927	195934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_007643	CCG	2	6	196054	196059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_007643	GTT	2	6	196190	196195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_007643	CCT	2	6	196196	196201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_007643	GCAG	2	8	196217	196224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_007643	GA	3	6	196305	196310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_007643	GTG	2	6	196368	196373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_007643	CAT	2	6	196380	196385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_007643	G	7	7	196386	196392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_007643	GAC	2	6	196450	196455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_007643	AGAGG	2	10	196493	196502	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_007643	CGG	2	6	196532	196537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_007643	TAC	2	6	196706	196711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_007643	GATG	2	8	196733	196740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_007643	TG	3	6	196781	196786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_007643	TCCGGG	2	12	196843	196854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_007643	GTG	2	6	196862	196867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_007643	GC	3	6	196910	196915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_007643	TGG	2	6	196918	196923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_007643	TGA	2	6	196947	196952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_007643	GGT	2	6	197026	197031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_007643	TCA	2	6	197141	197146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_007643	CGT	2	6	197221	197226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_007643	GAG	2	6	197270	197275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_007643	CCTC	2	8	197397	197404	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5081	NC_007643	ACC	2	6	197437	197442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_007643	TTGA	2	8	197511	197518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_007643	GAA	2	6	197576	197581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_007643	GAAC	2	8	197593	197600	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_007643	ACACA	2	10	197605	197614	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5086	NC_007643	TGG	2	6	197649	197654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_007643	ATCCC	2	10	197678	197687	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5088	NC_007643	CGC	2	6	197751	197756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_007643	CAA	2	6	197787	197792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_007643	CAG	2	6	197800	197805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_007643	AGC	2	6	197868	197873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_007643	CGT	2	6	198015	198020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_007643	CGG	2	6	198054	198059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_007643	GCC	2	6	198165	198170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_007643	GCC	2	6	198259	198264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591505
5096	NC_007643	GGC	2	6	198282	198287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591505
5097	NC_007643	CGG	2	6	198311	198316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591505
5098	NC_007643	CAC	2	6	198321	198326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591505
5099	NC_007643	GC	3	6	198422	198427	0 %	0 %	50 %	50 %	83591505
5100	NC_007643	TAA	2	6	198548	198553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_007643	AGT	2	6	198605	198610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_007643	AGA	2	6	198620	198625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_007643	CAT	2	6	198632	198637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_007643	GAG	2	6	198730	198735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_007643	CG	3	6	198796	198801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_007643	CGGCCT	2	12	199264	199275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_007643	TGA	2	6	199342	199347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_007643	CCG	2	6	199394	199399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_007643	CG	3	6	199458	199463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_007643	CGG	2	6	199637	199642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_007643	GCT	2	6	199708	199713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_007643	TCA	2	6	199867	199872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_007643	A	6	6	199910	199915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_007643	CGG	2	6	199959	199964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_007643	GCT	2	6	199965	199970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_007643	TCG	2	6	199986	199991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_007643	GCG	2	6	199999	200004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_007643	GGC	2	6	200019	200024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591508
5119	NC_007643	CGG	2	6	200079	200084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591508
5120	NC_007643	ATC	2	6	200160	200165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591508
5121	NC_007643	CGG	2	6	200199	200204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591508
5122	NC_007643	GCCA	2	8	200241	200248	25 %	0 %	25 %	50 %	83591508
5123	NC_007643	CGGGG	2	10	200271	200280	0 %	0 %	80 %	20 %	83591508
5124	NC_007643	CAT	2	6	200300	200305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591509
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5126	NC_007643	GC	3	6	200380	200385	0 %	0 %	50 %	50 %	83591509
5127	NC_007643	CGGG	2	8	200471	200478	0 %	0 %	75 %	25 %	83591509
5128	NC_007643	GTC	2	6	200481	200486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591509
5129	NC_007643	CGG	2	6	200495	200500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591509
5130	NC_007643	ACG	2	6	200533	200538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591509
5131	NC_007643	CGT	2	6	200564	200569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591509
5132	NC_007643	CGC	2	6	200625	200630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591509
5133	NC_007643	GCC	2	6	200671	200676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591509
5134	NC_007643	GACA	2	8	200677	200684	50 %	0 %	25 %	25 %	83591509
5135	NC_007643	T	6	6	200754	200759	0 %	100 %	0 %	0 %	83591509
5136	NC_007643	ACCG	2	8	200818	200825	25 %	0 %	25 %	50 %	83591509
5137	NC_007643	GCGG	3	12	200826	200837	0 %	0 %	75 %	25 %	83591509
5138	NC_007643	GTC	3	9	200838	200846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591509
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5140	NC_007643	TCA	2	6	200893	200898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591509
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5143	NC_007643	GCC	2	6	200940	200945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591509
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5145	NC_007643	CG	3	6	201010	201015	0 %	0 %	50 %	50 %	83591509
5146	NC_007643	GGC	2	6	201027	201032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591509
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5157	NC_007643	CTG	2	6	201455	201460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591510
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5172	NC_007643	CCCG	2	8	202087	202094	0 %	0 %	25 %	75 %	83591511
5173	NC_007643	GC	3	6	202114	202119	0 %	0 %	50 %	50 %	83591511
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5200	NC_007643	GTC	2	6	203195	203200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591512
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5241	NC_007643	CGC	2	6	205041	205046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591514
5242	NC_007643	GCC	2	6	205047	205052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591514
5243	NC_007643	GATG	2	8	205058	205065	25 %	25 %	50 %	0 %	83591514
5244	NC_007643	GTC	2	6	205086	205091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591514
5245	NC_007643	ATG	2	6	205165	205170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591514
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5247	NC_007643	CCG	2	6	205183	205188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591514
5248	NC_007643	GGT	2	6	205199	205204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591514
5249	NC_007643	CAAGCG	2	12	205227	205238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591514
5250	NC_007643	A	6	6	205251	205256	100 %	0 %	0 %	0 %	83591514
5251	NC_007643	TCG	2	6	205268	205273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591514
5252	NC_007643	CGA	2	6	205286	205291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591514
5253	NC_007643	CGC	2	6	205314	205319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591514
5254	NC_007643	GCCA	2	8	205321	205328	25 %	0 %	25 %	50 %	83591514
5255	NC_007643	GATCG	2	10	205374	205383	20 %	20 %	40 %	20 %	83591514
5256	NC_007643	GCCA	2	8	205452	205459	25 %	0 %	25 %	50 %	83591514
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