MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 plasmid unnamed

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007641	AT	3	6	175	180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007641	CG	3	6	1115	1120	0 %	0 %	50 %	50 %	83582732
3	NC_007641	AT	3	6	2114	2119	50 %	50 %	0 %	0 %	83582733
4	NC_007641	GA	3	6	2282	2287	50 %	0 %	50 %	0 %	83582733
5	NC_007641	AG	3	6	3409	3414	50 %	0 %	50 %	0 %	83582735
6	NC_007641	CG	3	6	3470	3475	0 %	0 %	50 %	50 %	83582735
7	NC_007641	CG	3	6	3578	3583	0 %	0 %	50 %	50 %	83582735
8	NC_007641	GC	3	6	3773	3778	0 %	0 %	50 %	50 %	83582735
9	NC_007641	AG	3	6	4645	4650	50 %	0 %	50 %	0 %	83582735
10	NC_007641	AT	3	6	4709	4714	50 %	50 %	0 %	0 %	83582735
11	NC_007641	AT	3	6	4721	4726	50 %	50 %	0 %	0 %	83582735
12	NC_007641	GA	3	6	5102	5107	50 %	0 %	50 %	0 %	83582735
13	NC_007641	CT	3	6	6139	6144	0 %	50 %	0 %	50 %	83582736
14	NC_007641	GA	3	6	6688	6693	50 %	0 %	50 %	0 %	83582737
15	NC_007641	AT	3	6	7100	7105	50 %	50 %	0 %	0 %	83582737
16	NC_007641	TC	3	6	7382	7387	0 %	50 %	0 %	50 %	83582737
17	NC_007641	CA	3	6	7774	7779	50 %	0 %	0 %	50 %	83582737
18	NC_007641	CG	3	6	8788	8793	0 %	0 %	50 %	50 %	83582737
19	NC_007641	CA	3	6	9657	9662	50 %	0 %	0 %	50 %	83582737
20	NC_007641	AC	3	6	9739	9744	50 %	0 %	0 %	50 %	83582737
21	NC_007641	CG	3	6	9921	9926	0 %	0 %	50 %	50 %	83582737
22	NC_007641	CG	4	8	10360	10367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007641	TG	4	8	11992	11999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007641	TG	3	6	12315	12320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007641	GC	3	6	13355	13360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007641	AT	3	6	16091	16096	50 %	50 %	0 %	0 %	83582746
27	NC_007641	CA	3	6	16176	16181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007641	CG	3	6	16989	16994	0 %	0 %	50 %	50 %	83582747
29	NC_007641	GC	3	6	17921	17926	0 %	0 %	50 %	50 %	83582748
30	NC_007641	CG	3	6	20498	20503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007641	TG	3	6	20701	20706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007641	TG	3	6	20814	20819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007641	CA	3	6	20997	21002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007641	TG	3	6	22648	22653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007641	GT	4	8	22668	22675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007641	TG	3	6	22711	22716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007641	AC	3	6	22804	22809	50 %	0 %	0 %	50 %	83582754
38	NC_007641	GC	3	6	23015	23020	0 %	0 %	50 %	50 %	83582754
39	NC_007641	GA	3	6	23788	23793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007641	CT	3	6	24226	24231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007641	AG	3	6	24377	24382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007641	CA	3	6	24928	24933	50 %	0 %	0 %	50 %	83582756
43	NC_007641	AC	3	6	25657	25662	50 %	0 %	0 %	50 %	83582757
44	NC_007641	AG	3	6	25715	25720	50 %	0 %	50 %	0 %	83582757
45	NC_007641	GC	3	6	28383	28388	0 %	0 %	50 %	50 %	83582759
46	NC_007641	CA	3	6	28738	28743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007641	TG	3	6	28780	28785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007641	AG	3	6	29658	29663	50 %	0 %	50 %	0 %	83582760
49	NC_007641	GC	3	6	30516	30521	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
50	NC_007641	CG	4	8	31013	31020	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
51	NC_007641	GC	3	6	31044	31049	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
52	NC_007641	GC	3	6	31464	31469	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
53	NC_007641	GC	3	6	31497	31502	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
54	NC_007641	CG	3	6	31598	31603	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
55	NC_007641	CG	3	6	31669	31674	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
56	NC_007641	CG	3	6	32519	32524	0 %	0 %	50 %	50 %	83582763
57	NC_007641	GC	3	6	32806	32811	0 %	0 %	50 %	50 %	83582763
58	NC_007641	TA	3	6	33271	33276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007641	GA	3	6	33296	33301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007641	GC	3	6	33516	33521	0 %	0 %	50 %	50 %	83582764
61	NC_007641	GC	3	6	33723	33728	0 %	0 %	50 %	50 %	83582765
62	NC_007641	GC	3	6	34493	34498	0 %	0 %	50 %	50 %	83582766
63	NC_007641	GC	3	6	34675	34680	0 %	0 %	50 %	50 %	83582766
64	NC_007641	GC	3	6	34838	34843	0 %	0 %	50 %	50 %	83582766
65	NC_007641	GC	4	8	34845	34852	0 %	0 %	50 %	50 %	83582766
66	NC_007641	AG	3	6	36157	36162	50 %	0 %	50 %	0 %	83582767
67	NC_007641	TG	3	6	36361	36366	0 %	50 %	50 %	0 %	83582767
68	NC_007641	AC	3	6	36710	36715	50 %	0 %	0 %	50 %	83582767
69	NC_007641	GC	3	6	37609	37614	0 %	0 %	50 %	50 %	83582767
70	NC_007641	GA	3	6	37857	37862	50 %	0 %	50 %	0 %	83582767
71	NC_007641	AC	3	6	38045	38050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007641	CA	3	6	38061	38066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007641	CA	3	6	38954	38959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007641	GC	3	6	39930	39935	0 %	0 %	50 %	50 %	83582769
75	NC_007641	CG	3	6	40675	40680	0 %	0 %	50 %	50 %	83582769
76	NC_007641	GC	3	6	40926	40931	0 %	0 %	50 %	50 %	83582770
77	NC_007641	GC	3	6	42140	42145	0 %	0 %	50 %	50 %	83582770
78	NC_007641	TC	3	6	42496	42501	0 %	50 %	0 %	50 %	83582771
79	NC_007641	CG	3	6	44599	44604	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
80	NC_007641	GC	3	6	44754	44759	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
81	NC_007641	GC	3	6	45234	45239	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
82	NC_007641	GC	3	6	45726	45731	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
83	NC_007641	CG	4	8	46048	46055	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
84	NC_007641	GC	3	6	46317	46322	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
85	NC_007641	CG	4	8	46432	46439	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
86	NC_007641	GC	3	6	46495	46500	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
87	NC_007641	GC	3	6	47880	47885	0 %	0 %	50 %	50 %	83582775
88	NC_007641	GC	3	6	47964	47969	0 %	0 %	50 %	50 %	83582775
89	NC_007641	GC	3	6	48174	48179	0 %	0 %	50 %	50 %	83582776
90	NC_007641	CG	3	6	48576	48581	0 %	0 %	50 %	50 %	83582776
91	NC_007641	AT	3	6	49800	49805	50 %	50 %	0 %	0 %	83582777
92	NC_007641	GA	3	6	49813	49818	50 %	0 %	50 %	0 %	83582777
93	NC_007641	AG	4	8	50671	50678	50 %	0 %	50 %	0 %	83582777
94	NC_007641	CT	3	6	51603	51608	0 %	50 %	0 %	50 %	83582779
95	NC_007641	CG	3	6	52095	52100	0 %	0 %	50 %	50 %	83582779
96	NC_007641	AG	3	6	52209	52214	50 %	0 %	50 %	0 %	83582779
97	NC_007641	GC	4	8	52744	52751	0 %	0 %	50 %	50 %	83582780
98	NC_007641	AG	3	6	53457	53462	50 %	0 %	50 %	0 %	83582780
99	NC_007641	CT	3	6	53691	53696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.