MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 plasmid unnamed

Total Repeats: 1205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007641	CAC	2	6	44014	44019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582773
1002	NC_007641	ACC	2	6	44129	44134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582773
1003	NC_007641	GTC	2	6	44156	44161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582773
1004	NC_007641	CGG	2	6	44170	44175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582773
1005	NC_007641	ACGG	2	8	44267	44274	25 %	0 %	50 %	25 %	83582773
1006	NC_007641	ATCGGC	2	12	44318	44329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83582773
1007	NC_007641	GGC	2	6	44341	44346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582773
1008	NC_007641	CGA	2	6	44370	44375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_007641	CGC	2	6	44435	44440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1010	NC_007641	CCCCG	2	10	44443	44452	0 %	0 %	20 %	80 %	83582774
1011	NC_007641	ATC	2	6	44458	44463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582774
1012	NC_007641	GGA	2	6	44484	44489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582774
1013	NC_007641	CGC	2	6	44529	44534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1014	NC_007641	CG	3	6	44599	44604	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
1015	NC_007641	CGG	2	6	44614	44619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582774
1016	NC_007641	TCG	2	6	44654	44659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582774
1017	NC_007641	CTG	2	6	44704	44709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582774
1018	NC_007641	GC	3	6	44754	44759	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
1019	NC_007641	GGC	2	6	44760	44765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582774
1020	NC_007641	CGG	2	6	44776	44781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582774
1021	NC_007641	CGA	2	6	44813	44818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582774
1022	NC_007641	C	6	6	44857	44862	0 %	0 %	0 %	100 %	83582774
1023	NC_007641	CGC	3	9	44895	44903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1024	NC_007641	CCG	2	6	44958	44963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1025	NC_007641	TGA	2	6	44973	44978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582774
1026	NC_007641	GCC	2	6	45038	45043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1027	NC_007641	CGC	2	6	45075	45080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1028	NC_007641	GGT	2	6	45186	45191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582774
1029	NC_007641	GC	3	6	45234	45239	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
1030	NC_007641	TGC	2	6	45275	45280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582774
1031	NC_007641	GGC	3	9	45301	45309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582774
1032	NC_007641	GGGC	2	8	45349	45356	0 %	0 %	75 %	25 %	83582774
1033	NC_007641	CCG	2	6	45392	45397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1034	NC_007641	GCG	2	6	45422	45427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582774
1035	NC_007641	GCCCT	2	10	45430	45439	0 %	20 %	20 %	60 %	83582774
1036	NC_007641	GCT	2	6	45465	45470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582774
1037	NC_007641	GCTG	2	8	45598	45605	0 %	25 %	50 %	25 %	83582774
1038	NC_007641	GC	3	6	45726	45731	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
1039	NC_007641	GTT	2	6	45765	45770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83582774
1040	NC_007641	TGC	2	6	45809	45814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582774
1041	NC_007641	CCA	2	6	45863	45868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582774
1042	NC_007641	CGC	2	6	45872	45877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1043	NC_007641	GAC	2	6	45900	45905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582774
1044	NC_007641	GGC	2	6	45984	45989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582774
1045	NC_007641	ACCG	2	8	46034	46041	25 %	0 %	25 %	50 %	83582774
1046	NC_007641	CG	4	8	46048	46055	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
1047	NC_007641	ACC	2	6	46082	46087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582774
1048	NC_007641	GAG	2	6	46090	46095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582774
1049	NC_007641	TGGCT	2	10	46130	46139	0 %	40 %	40 %	20 %	83582774
1050	NC_007641	GCCG	2	8	46140	46147	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
1051	NC_007641	GCC	2	6	46189	46194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1052	NC_007641	GGT	3	9	46203	46211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582774
1053	NC_007641	CCA	2	6	46228	46233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582774
1054	NC_007641	GCC	2	6	46247	46252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1055	NC_007641	GCG	3	9	46294	46302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582774
1056	NC_007641	TTC	2	6	46303	46308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582774
1057	NC_007641	GC	3	6	46317	46322	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
1058	NC_007641	CGC	2	6	46361	46366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582774
1059	NC_007641	CG	4	8	46432	46439	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
1060	NC_007641	GC	3	6	46495	46500	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
1061	NC_007641	TTTC	2	8	46616	46623	0 %	75 %	0 %	25 %	83582774
1062	NC_007641	GAC	2	6	46705	46710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_007641	CCAT	2	8	46729	46736	25 %	25 %	0 %	50 %	83582775
1064	NC_007641	ATC	2	6	46762	46767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582775
1065	NC_007641	GAA	2	6	46831	46836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582775
1066	NC_007641	GAA	2	6	46894	46899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582775
1067	NC_007641	GTG	2	6	46903	46908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582775
1068	NC_007641	CCG	2	6	46931	46936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582775
1069	NC_007641	A	6	6	46982	46987	100 %	0 %	0 %	0 %	83582775
1070	NC_007641	CGG	2	6	46997	47002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582775
1071	NC_007641	GAT	2	6	47055	47060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582775
1072	NC_007641	GGC	2	6	47065	47070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582775
1073	NC_007641	TTC	2	6	47077	47082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582775
1074	NC_007641	ATT	2	6	47174	47179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83582775
1075	NC_007641	CTG	2	6	47188	47193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582775
1076	NC_007641	GGC	2	6	47194	47199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582775
1077	NC_007641	CCG	2	6	47204	47209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582775
1078	NC_007641	GCC	2	6	47314	47319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582775
1079	NC_007641	CAT	2	6	47341	47346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582775
1080	NC_007641	GCC	2	6	47407	47412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582775
1081	NC_007641	CGACGG	2	12	47427	47438	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83582775
1082	NC_007641	CTG	2	6	47500	47505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582775
1083	NC_007641	GCC	2	6	47521	47526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582775
1084	NC_007641	ATC	2	6	47542	47547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582775
1085	NC_007641	AGCC	2	8	47559	47566	25 %	0 %	25 %	50 %	83582775
1086	NC_007641	GCT	2	6	47568	47573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582775
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1088	NC_007641	TCT	2	6	47693	47698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582775
1089	NC_007641	CGA	2	6	47721	47726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582775
1090	NC_007641	CTG	2	6	47749	47754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582775
1091	NC_007641	TCG	2	6	47759	47764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582775
1092	NC_007641	GC	3	6	47880	47885	0 %	0 %	50 %	50 %	83582775
1093	NC_007641	GAA	2	6	47892	47897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582775
1094	NC_007641	TGG	2	6	47953	47958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582775
1095	NC_007641	GC	3	6	47964	47969	0 %	0 %	50 %	50 %	83582775
1096	NC_007641	TGG	2	6	47990	47995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582775
1097	NC_007641	GACC	2	8	48018	48025	25 %	0 %	25 %	50 %	83582775
1098	NC_007641	ACC	2	6	48078	48083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582775
1099	NC_007641	TGA	2	6	48089	48094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582775
1100	NC_007641	GAT	2	6	48118	48123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_007641	GAT	2	6	48131	48136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_007641	GC	3	6	48174	48179	0 %	0 %	50 %	50 %	83582776
1103	NC_007641	G	6	6	48202	48207	0 %	0 %	100 %	0 %	83582776
1104	NC_007641	GAT	2	6	48283	48288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582776
1105	NC_007641	GTGGCG	2	12	48449	48460	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	83582776
1106	NC_007641	CAT	2	6	48493	48498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582776
1107	NC_007641	CGC	2	6	48547	48552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582776
1108	NC_007641	GCG	2	6	48563	48568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582776
1109	NC_007641	CGG	2	6	48570	48575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582776
1110	NC_007641	CG	3	6	48576	48581	0 %	0 %	50 %	50 %	83582776
1111	NC_007641	GGCTAT	2	12	48629	48640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	83582776
1112	NC_007641	CGG	2	6	48649	48654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582776
1113	NC_007641	TCG	2	6	48696	48701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582776
1114	NC_007641	CGG	2	6	48720	48725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582776
1115	NC_007641	GCG	2	6	48890	48895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582776
1116	NC_007641	CGC	2	6	48901	48906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582776
1117	NC_007641	A	6	6	48942	48947	100 %	0 %	0 %	0 %	83582776
1118	NC_007641	GCC	2	6	48956	48961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582776
1119	NC_007641	CGTGGC	2	12	49111	49122	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83582776
1120	NC_007641	GTG	2	6	49139	49144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582776
1121	NC_007641	GACG	2	8	49150	49157	25 %	0 %	50 %	25 %	83582776
1122	NC_007641	TGAT	2	8	49170	49177	25 %	50 %	25 %	0 %	83582776
1123	NC_007641	TCG	2	6	49206	49211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582776
1124	NC_007641	A	6	6	49220	49225	100 %	0 %	0 %	0 %	83582776
1125	NC_007641	ATCG	2	8	49289	49296	25 %	25 %	25 %	25 %	83582776
1126	NC_007641	TCG	2	6	49323	49328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582776
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1128	NC_007641	GCC	2	6	49603	49608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582776
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1199	NC_007641	AG	3	6	53457	53462	50 %	0 %	50 %	0 %	83582780
1200	NC_007641	GAC	2	6	53498	53503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582780
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1203	NC_007641	GTCT	2	8	53624	53631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1204	NC_007641	CCG	2	6	53673	53678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1205	NC_007641	CT	3	6	53691	53696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.