MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 chromosome 1

Total Repeats: 3114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007493	TCGTG	2	10	1012	1021	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007493	GATCA	2	10	2124	2133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007493	CTCAT	2	10	4635	4644	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_007493	ATCCC	2	10	5143	5152	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_007493	AAGGG	2	10	6170	6179	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007493	AAAGC	2	10	6723	6732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007493	GGCGG	2	10	8924	8933	0 %	0 %	80 %	20 %	77461968
8	NC_007493	CTGGG	2	10	10024	10033	0 %	20 %	60 %	20 %	77461969
9	NC_007493	CGAAG	2	10	10956	10965	40 %	0 %	40 %	20 %	77461969
10	NC_007493	CGAGC	2	10	12972	12981	20 %	0 %	40 %	40 %	77461972
11	NC_007493	AGCGC	2	10	14063	14072	20 %	0 %	40 %	40 %	77461973
12	NC_007493	TCGGC	2	10	14665	14674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007493	TTGCG	2	10	16367	16376	0 %	40 %	40 %	20 %	77461974
14	NC_007493	CGGCT	2	10	16957	16966	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007493	AGGCG	2	10	17516	17525	20 %	0 %	60 %	20 %	77461975
16	NC_007493	GGGCG	2	10	17911	17920	0 %	0 %	80 %	20 %	77461976
17	NC_007493	GCGCG	2	10	17931	17940	0 %	0 %	60 %	40 %	77461976
18	NC_007493	GCCAG	2	10	18199	18208	20 %	0 %	40 %	40 %	77461976
19	NC_007493	GCCGC	2	10	18438	18447	0 %	0 %	40 %	60 %	77461976
20	NC_007493	GCGCC	2	10	18523	18532	0 %	0 %	40 %	60 %	77461976
21	NC_007493	GCGCC	2	10	19752	19761	0 %	0 %	40 %	60 %	77461977
22	NC_007493	AGCGC	2	10	19776	19785	20 %	0 %	40 %	40 %	77461977
23	NC_007493	GGCGC	2	10	20897	20906	0 %	0 %	60 %	40 %	77461978
24	NC_007493	AGCGC	2	10	22439	22448	20 %	0 %	40 %	40 %	77461978
25	NC_007493	TCTGC	2	10	22481	22490	0 %	40 %	20 %	40 %	77461978
26	NC_007493	GATCG	2	10	23194	23203	20 %	20 %	40 %	20 %	77461979
27	NC_007493	CCGCC	2	10	24780	24789	0 %	0 %	20 %	80 %	77461980
28	NC_007493	CTGGG	2	10	26046	26055	0 %	20 %	60 %	20 %	552535528
29	NC_007493	GCCTC	2	10	26434	26443	0 %	20 %	20 %	60 %	552535528
30	NC_007493	GGGCG	2	10	28172	28181	0 %	0 %	80 %	20 %	77461983
31	NC_007493	CGGGT	2	10	28303	28312	0 %	20 %	60 %	20 %	77461983
32	NC_007493	CGGGA	2	10	28580	28589	20 %	0 %	60 %	20 %	77461984
33	NC_007493	CTCGG	2	10	29108	29117	0 %	20 %	40 %	40 %	77461984
34	NC_007493	CGGGG	2	10	29796	29805	0 %	0 %	80 %	20 %	77461985
35	NC_007493	GCCGC	2	10	30312	30321	0 %	0 %	40 %	60 %	77461985
36	NC_007493	CCCGG	2	10	30562	30571	0 %	0 %	40 %	60 %	77461986
37	NC_007493	GGTCG	2	10	31134	31143	0 %	20 %	60 %	20 %	77461986
38	NC_007493	CGGCG	2	10	33684	33693	0 %	0 %	60 %	40 %	77461989
39	NC_007493	TGCCA	2	10	34540	34549	20 %	20 %	20 %	40 %	77461989
40	NC_007493	TCCAC	2	10	34952	34961	20 %	20 %	0 %	60 %	77461989
41	NC_007493	TCCGG	2	10	35391	35400	0 %	20 %	40 %	40 %	77461990
42	NC_007493	CGATC	2	10	35466	35475	20 %	20 %	20 %	40 %	77461990
43	NC_007493	GGGCG	2	10	35562	35571	0 %	0 %	80 %	20 %	77461990
44	NC_007493	GCGCC	2	10	39569	39578	0 %	0 %	40 %	60 %	77461993
45	NC_007493	GCCGT	2	10	40148	40157	0 %	20 %	40 %	40 %	77461993
46	NC_007493	TCCGG	2	10	42433	42442	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007493	GCCGT	2	10	42554	42563	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_007493	GCCCT	2	10	42932	42941	0 %	20 %	20 %	60 %	552535529
49	NC_007493	CTGGC	2	10	42968	42977	0 %	20 %	40 %	40 %	552535529
50	NC_007493	CCGGC	2	10	43246	43255	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_007493	GCGCC	2	10	44024	44033	0 %	0 %	40 %	60 %	77461996
52	NC_007493	GATCG	2	10	44107	44116	20 %	20 %	40 %	20 %	77461996
53	NC_007493	GAGTC	2	10	45011	45020	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007493	GCCGG	2	10	45245	45254	0 %	0 %	60 %	40 %	77461997
55	NC_007493	CTCGG	2	10	46097	46106	0 %	20 %	40 %	40 %	77461998
56	NC_007493	CGGCC	2	10	46931	46940	0 %	0 %	40 %	60 %	77462000
57	NC_007493	CGCTC	2	10	48059	48068	0 %	20 %	20 %	60 %	77462001
58	NC_007493	CGGGG	2	10	49274	49283	0 %	0 %	80 %	20 %	77462002
59	NC_007493	GCGCC	2	10	51607	51616	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_007493	GCTGG	2	10	52472	52481	0 %	20 %	60 %	20 %	77462005
61	NC_007493	GCCCG	2	10	53737	53746	0 %	0 %	40 %	60 %	77462006
62	NC_007493	CGCGG	2	10	56342	56351	0 %	0 %	60 %	40 %	77462009
63	NC_007493	CAGGG	2	10	56548	56557	20 %	0 %	60 %	20 %	77462009
64	NC_007493	AGGGG	2	10	56585	56594	20 %	0 %	80 %	0 %	77462009
65	NC_007493	GAAAG	2	10	57296	57305	60 %	0 %	40 %	0 %	552535530
66	NC_007493	TGCGC	2	10	57485	57494	0 %	20 %	40 %	40 %	77462011
67	NC_007493	GCCGT	2	10	58079	58088	0 %	20 %	40 %	40 %	77462012
68	NC_007493	CGCGG	2	10	58129	58138	0 %	0 %	60 %	40 %	77462012
69	NC_007493	TGGCC	2	10	58849	58858	0 %	20 %	40 %	40 %	77462013
70	NC_007493	GATCG	2	10	60999	61008	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007493	CGGCG	2	10	61646	61655	0 %	0 %	60 %	40 %	552535531
72	NC_007493	GCGCC	2	10	63817	63826	0 %	0 %	40 %	60 %	77462017
73	NC_007493	AGCGC	2	10	66477	66486	20 %	0 %	40 %	40 %	77462019
74	NC_007493	CGGGC	2	10	70209	70218	0 %	0 %	60 %	40 %	552535532
75	NC_007493	CGCGG	2	10	70555	70564	0 %	0 %	60 %	40 %	552535532
76	NC_007493	GCGCG	2	10	70721	70730	0 %	0 %	60 %	40 %	552535532
77	NC_007493	CGGCC	2	10	70933	70942	0 %	0 %	40 %	60 %	552535532
78	NC_007493	CCGGG	2	10	74291	74300	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007493	GCGCG	2	10	75232	75241	0 %	0 %	60 %	40 %	77462027
80	NC_007493	CCGAT	2	10	75280	75289	20 %	20 %	20 %	40 %	77462027
81	NC_007493	CGTCG	2	10	76446	76455	0 %	20 %	40 %	40 %	77462030
82	NC_007493	CGGCT	2	10	77103	77112	0 %	20 %	40 %	40 %	77462030
83	NC_007493	TGCGA	2	10	77272	77281	20 %	20 %	40 %	20 %	77462030
84	NC_007493	CGCGG	2	10	77546	77555	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007493	GGGGC	2	10	77603	77612	0 %	0 %	80 %	20 %	552535533
86	NC_007493	CCGGG	2	10	78395	78404	0 %	0 %	60 %	40 %	552535533
87	NC_007493	GCTCG	2	10	80567	80576	0 %	20 %	40 %	40 %	77462033
88	NC_007493	GCCGC	2	10	80908	80917	0 %	0 %	40 %	60 %	77462033
89	NC_007493	GCCGG	2	10	82259	82268	0 %	0 %	60 %	40 %	77462033
90	NC_007493	CGGCC	2	10	83843	83852	0 %	0 %	40 %	60 %	77462034
91	NC_007493	AACTG	2	10	85491	85500	40 %	20 %	20 %	20 %	552535534
92	NC_007493	GCCGC	2	10	85502	85511	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_007493	CGAGG	2	10	85989	85998	20 %	0 %	60 %	20 %	77462037
94	NC_007493	GAGCG	2	10	86461	86470	20 %	0 %	60 %	20 %	77462037
95	NC_007493	GGGCA	2	10	87457	87466	20 %	0 %	60 %	20 %	77462038
96	NC_007493	GGCCG	2	10	87467	87476	0 %	0 %	60 %	40 %	77462038
97	NC_007493	GCCCC	2	10	87485	87494	0 %	0 %	20 %	80 %	77462038
98	NC_007493	TTCCG	2	10	88151	88160	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_007493	CGTGA	2	10	90416	90425	20 %	20 %	40 %	20 %	77462044
100	NC_007493	CCGCA	2	10	90605	90614	20 %	0 %	20 %	60 %	77462044
101	NC_007493	CGCGC	2	10	90913	90922	0 %	0 %	40 %	60 %	77462045
102	NC_007493	GCGCC	2	10	90976	90985	0 %	0 %	40 %	60 %	77462045
103	NC_007493	GTCGG	2	10	91174	91183	0 %	20 %	60 %	20 %	77462045
104	NC_007493	CGGTC	2	10	92802	92811	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_007493	GCCTT	2	10	92841	92850	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007493	CTTCC	2	10	94407	94416	0 %	40 %	0 %	60 %	77462047
107	NC_007493	AGCGG	2	10	95551	95560	20 %	0 %	60 %	20 %	77462047
108	NC_007493	CGTGC	2	10	96239	96248	0 %	20 %	40 %	40 %	77462048
109	NC_007493	GCCCG	2	10	98307	98316	0 %	0 %	40 %	60 %	77462050
110	NC_007493	GATCG	2	10	101510	101519	20 %	20 %	40 %	20 %	77462054
111	NC_007493	TCGCG	2	10	101803	101812	0 %	20 %	40 %	40 %	77462054
112	NC_007493	GCGTC	2	10	102484	102493	0 %	20 %	40 %	40 %	552535536
113	NC_007493	GCGCC	2	10	102909	102918	0 %	0 %	40 %	60 %	552535536
114	NC_007493	CGGAT	2	10	103825	103834	20 %	20 %	40 %	20 %	77462056
115	NC_007493	GCCTT	2	10	104977	104986	0 %	40 %	20 %	40 %	77462058
116	NC_007493	GGGCC	2	10	106708	106717	0 %	0 %	60 %	40 %	77462060
117	NC_007493	GCGCC	2	10	107044	107053	0 %	0 %	40 %	60 %	77462060
118	NC_007493	ACGCC	2	10	107595	107604	20 %	0 %	20 %	60 %	77462061
119	NC_007493	CGGGG	2	10	109209	109218	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007493	TCCCG	2	10	109286	109295	0 %	20 %	20 %	60 %	552535537
121	NC_007493	CGCCC	2	10	109634	109643	0 %	0 %	20 %	80 %	552535537
122	NC_007493	CGCCC	2	10	109902	109911	0 %	0 %	20 %	80 %	77462063
123	NC_007493	TCTGG	2	10	111293	111302	0 %	40 %	40 %	20 %	77462064
124	NC_007493	CGCGC	2	10	111732	111741	0 %	0 %	40 %	60 %	77462065
125	NC_007493	GGCCC	2	10	113061	113070	0 %	0 %	40 %	60 %	77462065
126	NC_007493	CCCGG	2	10	113505	113514	0 %	0 %	40 %	60 %	77462065
127	NC_007493	CGCGC	2	10	114221	114230	0 %	0 %	40 %	60 %	77462065
128	NC_007493	GCGCG	2	10	115672	115681	0 %	0 %	60 %	40 %	77462066
129	NC_007493	GGCGC	2	10	116893	116902	0 %	0 %	60 %	40 %	77462066
130	NC_007493	GCCGC	2	10	117101	117110	0 %	0 %	40 %	60 %	77462066
131	NC_007493	GCGAT	2	10	117240	117249	20 %	20 %	40 %	20 %	77462066
132	NC_007493	GGCGG	2	10	117475	117484	0 %	0 %	80 %	20 %	77462066
133	NC_007493	GCGCC	2	10	118319	118328	0 %	0 %	40 %	60 %	77462068
134	NC_007493	GGCAC	2	10	119333	119342	20 %	0 %	40 %	40 %	77462069
135	NC_007493	TGACG	2	10	119697	119706	20 %	20 %	40 %	20 %	77462069
136	NC_007493	CGGCG	2	10	122523	122532	0 %	0 %	60 %	40 %	77462071
137	NC_007493	TCGAA	2	10	126096	126105	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007493	CGGCA	2	10	126920	126929	20 %	0 %	40 %	40 %	77462076
139	NC_007493	CGCGC	2	10	127078	127087	0 %	0 %	40 %	60 %	77462076
140	NC_007493	CGGAT	2	10	131470	131479	20 %	20 %	40 %	20 %	77462080
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142	NC_007493	CCGTG	2	10	132402	132411	0 %	20 %	40 %	40 %	77462080
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251	NC_007493	GCTCA	2	10	239576	239585	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
252	NC_007493	GCGAG	2	10	240954	240963	20 %	0 %	60 %	20 %	77462189
253	NC_007493	GATCG	2	10	241509	241518	20 %	20 %	40 %	20 %	77462190
254	NC_007493	TGGGC	2	10	244999	245008	0 %	20 %	60 %	20 %	77462192
255	NC_007493	AAGCG	2	10	246792	246801	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
256	NC_007493	GCCGC	2	10	248066	248075	0 %	0 %	40 %	60 %	77462196
257	NC_007493	GTCCT	4	20	248248	248267	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
258	NC_007493	CGCGC	2	10	251469	251478	0 %	0 %	40 %	60 %	77462203
259	NC_007493	CGGCG	2	10	251852	251861	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
260	NC_007493	GAACG	2	10	255111	255120	40 %	0 %	40 %	20 %	552535554
261	NC_007493	AGGAT	2	10	256888	256897	40 %	20 %	40 %	0 %	77462209
262	NC_007493	CCGCG	2	10	257154	257163	0 %	0 %	40 %	60 %	77462210
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267	NC_007493	GGCGG	2	10	260114	260123	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
268	NC_007493	CACGA	2	10	260768	260777	40 %	0 %	20 %	40 %	77462215
269	NC_007493	CGGCG	2	10	263831	263840	0 %	0 %	60 %	40 %	77462217
270	NC_007493	GGCGA	2	10	264057	264066	20 %	0 %	60 %	20 %	77462217
271	NC_007493	CGCGC	2	10	265657	265666	0 %	0 %	40 %	60 %	77462220
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