MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 2299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007490	GCA	2	6	23502	23507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404796
502	NC_007490	GC	3	6	23558	23563	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
503	NC_007490	GC	3	6	23600	23605	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
504	NC_007490	GCT	2	6	23623	23628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404796
505	NC_007490	TCG	2	6	23815	23820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404796
506	NC_007490	GAG	2	6	23844	23849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404796
507	NC_007490	AAG	2	6	23860	23865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404796
508	NC_007490	GGA	2	6	23895	23900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404796
509	NC_007490	CG	4	8	24029	24036	0 %	0 %	50 %	50 %	77404796
510	NC_007490	GAG	2	6	24124	24129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007490	ACC	2	6	24292	24297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_007490	TTCT	2	8	24520	24527	0 %	75 %	0 %	25 %	77404797
513	NC_007490	CGGA	2	8	24540	24547	25 %	0 %	50 %	25 %	77404797
514	NC_007490	GCCG	2	8	24581	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	77404797
515	NC_007490	GAG	2	6	24661	24666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404797
516	NC_007490	CGA	2	6	24707	24712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404797
517	NC_007490	GCG	2	6	24748	24753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404797
518	NC_007490	CG	3	6	24802	24807	0 %	0 %	50 %	50 %	77404797
519	NC_007490	ATC	2	6	24808	24813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404797
520	NC_007490	TCG	2	6	24814	24819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404797
521	NC_007490	GCC	2	6	24860	24865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
522	NC_007490	CAG	2	6	24877	24882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404797
523	NC_007490	TCT	2	6	24908	24913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404797
524	NC_007490	CAG	2	6	24924	24929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404797
525	NC_007490	GCC	2	6	24936	24941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
526	NC_007490	CAG	2	6	24954	24959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404797
527	NC_007490	CCG	2	6	24964	24969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
528	NC_007490	GCC	2	6	25002	25007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
529	NC_007490	GGA	2	6	25039	25044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404797
530	NC_007490	CGC	3	9	25046	25054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
531	NC_007490	ACC	2	6	25078	25083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404797
532	NC_007490	GGT	2	6	25134	25139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404797
533	NC_007490	TCG	2	6	25164	25169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404797
534	NC_007490	CAT	2	6	25179	25184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404797
535	NC_007490	CAG	2	6	25203	25208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404797
536	NC_007490	GCC	2	6	25213	25218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
537	NC_007490	CAC	2	6	25320	25325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404797
538	NC_007490	CG	3	6	25358	25363	0 %	0 %	50 %	50 %	77404797
539	NC_007490	TGT	2	6	25396	25401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404797
540	NC_007490	CGC	2	6	25514	25519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
541	NC_007490	TTG	2	6	25594	25599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404797
542	NC_007490	TCGC	2	8	25654	25661	0 %	25 %	25 %	50 %	77404797
543	NC_007490	GCCG	2	8	25674	25681	0 %	0 %	50 %	50 %	77404797
544	NC_007490	CGC	2	6	25756	25761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
545	NC_007490	AGC	2	6	25771	25776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404797
546	NC_007490	CCT	2	6	25796	25801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404797
547	NC_007490	GC	3	6	25833	25838	0 %	0 %	50 %	50 %	77404797
548	NC_007490	GCC	2	6	25856	25861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
549	NC_007490	TGCC	2	8	25938	25945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_007490	CGCGGC	2	12	25989	26000	0 %	0 %	50 %	50 %	77404798
551	NC_007490	CGC	2	6	26001	26006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404798
552	NC_007490	CGGC	2	8	26083	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	77404798
553	NC_007490	GCC	2	6	26108	26113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404798
554	NC_007490	CTT	2	6	26120	26125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404798
555	NC_007490	CCCG	2	8	26312	26319	0 %	0 %	25 %	75 %	77404798
556	NC_007490	CGC	2	6	26329	26334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404798
557	NC_007490	GCG	2	6	26369	26374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404799
558	NC_007490	GGCA	2	8	26383	26390	25 %	0 %	50 %	25 %	77404799
559	NC_007490	AGGC	2	8	26423	26430	25 %	0 %	50 %	25 %	77404799
560	NC_007490	ACC	2	6	26440	26445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404799
561	NC_007490	ACG	2	6	26468	26473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404799
562	NC_007490	TCC	2	6	26498	26503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404799
563	NC_007490	GCC	2	6	26528	26533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404799
564	NC_007490	CGC	2	6	26534	26539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404799
565	NC_007490	GCG	2	6	26553	26558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404799
566	NC_007490	GC	3	6	26575	26580	0 %	0 %	50 %	50 %	77404799
567	NC_007490	CCG	2	6	26650	26655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404799
568	NC_007490	GTT	2	6	26759	26764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_007490	ACC	2	6	26828	26833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_007490	AGG	2	6	26915	26920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_007490	CGGCT	2	10	26996	27005	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
572	NC_007490	CG	3	6	27072	27077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_007490	CGAG	2	8	27134	27141	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_007490	AAC	2	6	27184	27189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_007490	CCGT	2	8	27255	27262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
576	NC_007490	GCC	2	6	27391	27396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_007490	ACC	2	6	27414	27419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_007490	GCC	2	6	27424	27429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_007490	TCG	2	6	27520	27525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_007490	AGG	2	6	27528	27533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_007490	GCG	2	6	27537	27542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_007490	TGC	2	6	27550	27555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_007490	TCG	2	6	27565	27570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_007490	GCC	2	6	27583	27588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_007490	CGA	2	6	27593	27598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_007490	CGA	2	6	27662	27667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_007490	ACC	3	9	27673	27681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_007490	GCT	2	6	27823	27828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_007490	GCA	3	9	27849	27857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007490	CCG	2	6	27921	27926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_007490	CTCC	2	8	27989	27996	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
592	NC_007490	G	6	6	28050	28055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007490	AGC	2	6	28059	28064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_007490	TTC	2	6	28142	28147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404800
595	NC_007490	TTG	2	6	28152	28157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404800
596	NC_007490	GGC	2	6	28186	28191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404800
597	NC_007490	TCA	2	6	28341	28346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404800
598	NC_007490	GCC	2	6	28354	28359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404800
599	NC_007490	TTG	2	6	28484	28489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404800
600	NC_007490	GCG	2	6	28496	28501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404800
601	NC_007490	TGC	2	6	28509	28514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404800
602	NC_007490	GGA	2	6	28522	28527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404800
603	NC_007490	TCCC	2	8	28564	28571	0 %	25 %	0 %	75 %	77404800
604	NC_007490	CTCG	2	8	28609	28616	0 %	25 %	25 %	50 %	77404800
605	NC_007490	AAG	2	6	28640	28645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404800
606	NC_007490	CTG	2	6	28684	28689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404800
607	NC_007490	AAC	3	9	28724	28732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404800
608	NC_007490	GC	4	8	28747	28754	0 %	0 %	50 %	50 %	77404800
609	NC_007490	GTTG	2	8	28845	28852	0 %	50 %	50 %	0 %	77404800
610	NC_007490	TGT	2	6	28863	28868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404800
611	NC_007490	TGGC	2	8	28884	28891	0 %	25 %	50 %	25 %	77404800
612	NC_007490	ACC	2	6	29022	29027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404801
613	NC_007490	TCT	2	6	29110	29115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404801
614	NC_007490	CGGC	2	8	29134	29141	0 %	0 %	50 %	50 %	77404801
615	NC_007490	GCCA	2	8	29149	29156	25 %	0 %	25 %	50 %	77404801
616	NC_007490	AGG	2	6	29226	29231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404801
617	NC_007490	GCA	2	6	29283	29288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404801
618	NC_007490	TGC	2	6	29303	29308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404801
619	NC_007490	GC	3	6	29412	29417	0 %	0 %	50 %	50 %	552530965
620	NC_007490	ATC	2	6	29450	29455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530965
621	NC_007490	CG	3	6	29513	29518	0 %	0 %	50 %	50 %	552530965
622	NC_007490	TGCTTG	2	12	29672	29683	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	552530965
623	NC_007490	GCTG	2	8	29706	29713	0 %	25 %	50 %	25 %	552530965
624	NC_007490	CGTC	2	8	29748	29755	0 %	25 %	25 %	50 %	552530965
625	NC_007490	TTC	2	6	29794	29799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	552530965
626	NC_007490	CGG	2	6	29896	29901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_007490	GTCC	2	8	29916	29923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
628	NC_007490	CTG	2	6	29955	29960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_007490	T	6	6	29965	29970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_007490	ACGT	2	8	29971	29978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_007490	CG	3	6	30172	30177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_007490	GGA	2	6	30207	30212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_007490	CAG	2	6	30229	30234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530966
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