MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 314

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	GCCG	2	8	163	170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007489	CGTC	2	8	333	340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007489	CCGG	2	8	524	531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007489	CGCT	2	8	1398	1405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007489	TTCT	2	8	1801	1808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007489	CAGA	2	8	2542	2549	50 %	0 %	25 %	25 %	77404694
7	NC_007489	AAGG	2	8	2659	2666	50 %	0 %	50 %	0 %	77404694
8	NC_007489	TCCG	2	8	3198	3205	0 %	25 %	25 %	50 %	77404695
9	NC_007489	CGCA	2	8	3217	3224	25 %	0 %	25 %	50 %	77404695
10	NC_007489	GCCG	2	8	3406	3413	0 %	0 %	50 %	50 %	77404695
11	NC_007489	GTCG	2	8	3760	3767	0 %	25 %	50 %	25 %	77404695
12	NC_007489	GACT	2	8	3930	3937	25 %	25 %	25 %	25 %	77404695
13	NC_007489	GGGC	2	8	4302	4309	0 %	0 %	75 %	25 %	77404695
14	NC_007489	ATCG	2	8	4643	4650	25 %	25 %	25 %	25 %	77404696
15	NC_007489	TGGA	2	8	4727	4734	25 %	25 %	50 %	0 %	77404696
16	NC_007489	CGCA	2	8	4970	4977	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
17	NC_007489	CGAC	2	8	5104	5111	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
18	NC_007489	TCGA	2	8	5142	5149	25 %	25 %	25 %	25 %	77404696
19	NC_007489	AAAG	2	8	5314	5321	75 %	0 %	25 %	0 %	77404696
20	NC_007489	CCAG	2	8	5419	5426	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
21	NC_007489	GCCG	2	8	5582	5589	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
22	NC_007489	CCGA	2	8	5732	5739	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
23	NC_007489	CTGC	2	8	5931	5938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007489	CCCG	2	8	5988	5995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_007489	TGCT	2	8	6688	6695	0 %	50 %	25 %	25 %	77404697
26	NC_007489	CGAC	2	8	6735	6742	25 %	0 %	25 %	50 %	77404697
27	NC_007489	GCAG	2	8	6886	6893	25 %	0 %	50 %	25 %	77404697
28	NC_007489	TTCG	2	8	6960	6967	0 %	50 %	25 %	25 %	77404697
29	NC_007489	GCGG	2	8	7676	7683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007489	GCAA	2	8	8274	8281	50 %	0 %	25 %	25 %	77404698
31	NC_007489	CCTG	2	8	8573	8580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007489	CGGC	2	8	8706	8713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007489	CCGA	2	8	8851	8858	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007489	AGGC	2	8	8874	8881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007489	AGGA	2	8	9165	9172	50 %	0 %	50 %	0 %	77404699
36	NC_007489	CGAC	2	8	9600	9607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007489	AGGC	2	8	9637	9644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007489	GGCG	2	8	9735	9742	0 %	0 %	75 %	25 %	77404700
39	NC_007489	TCTT	2	8	10584	10591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007489	GCCT	2	8	10829	10836	0 %	25 %	25 %	50 %	77404701
41	NC_007489	CGGC	2	8	11052	11059	0 %	0 %	50 %	50 %	77404701
42	NC_007489	CAGG	2	8	11468	11475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007489	CGTG	2	8	11608	11615	0 %	25 %	50 %	25 %	77404702
44	NC_007489	ATGT	2	8	11789	11796	25 %	50 %	25 %	0 %	77404702
45	NC_007489	TGGA	2	8	12178	12185	25 %	25 %	50 %	0 %	77404703
46	NC_007489	TCGT	2	8	12238	12245	0 %	50 %	25 %	25 %	77404703
47	NC_007489	GCCT	2	8	12631	12638	0 %	25 %	25 %	50 %	77404703
48	NC_007489	GCAC	2	8	12821	12828	25 %	0 %	25 %	50 %	77404703
49	NC_007489	CGGA	2	8	13128	13135	25 %	0 %	50 %	25 %	77404703
50	NC_007489	CTGC	2	8	13608	13615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007489	GCGG	2	8	14045	14052	0 %	0 %	75 %	25 %	77404704
52	NC_007489	CTTC	2	8	14424	14431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007489	GAAA	2	8	14864	14871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007489	GCTG	2	8	15189	15196	0 %	25 %	50 %	25 %	77404705
55	NC_007489	GTCC	2	8	16061	16068	0 %	25 %	25 %	50 %	77404706
56	NC_007489	CCGT	2	8	16266	16273	0 %	25 %	25 %	50 %	77404706
57	NC_007489	GGGC	2	8	16529	16536	0 %	0 %	75 %	25 %	77404706
58	NC_007489	CCTC	2	8	16579	16586	0 %	25 %	0 %	75 %	77404706
59	NC_007489	CGCC	2	8	16712	16719	0 %	0 %	25 %	75 %	77404706
60	NC_007489	GCCC	2	8	17447	17454	0 %	0 %	25 %	75 %	77404706
61	NC_007489	CGGA	2	8	18433	18440	25 %	0 %	50 %	25 %	77404708
62	NC_007489	GTCG	2	8	18849	18856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007489	CAGG	2	8	18899	18906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007489	GGCC	2	8	19150	19157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007489	CCCG	2	8	19605	19612	0 %	0 %	25 %	75 %	77404709
66	NC_007489	GCTG	2	8	19729	19736	0 %	25 %	50 %	25 %	77404709
67	NC_007489	ACAG	2	8	19902	19909	50 %	0 %	25 %	25 %	77404709
68	NC_007489	CCGA	2	8	19912	19919	25 %	0 %	25 %	50 %	77404709
69	NC_007489	GCCG	2	8	20766	20773	0 %	0 %	50 %	50 %	77404710
70	NC_007489	CTGC	2	8	21193	21200	0 %	25 %	25 %	50 %	77404711
71	NC_007489	ATCG	2	8	21822	21829	25 %	25 %	25 %	25 %	77404711
72	NC_007489	CGAG	2	8	21985	21992	25 %	0 %	50 %	25 %	77404712
73	NC_007489	CCGG	2	8	22664	22671	0 %	0 %	50 %	50 %	77404712
74	NC_007489	TGGA	2	8	22674	22681	25 %	25 %	50 %	0 %	77404712
75	NC_007489	GGCA	2	8	23167	23174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007489	CCGG	2	8	23178	23185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007489	ATGG	2	8	23637	23644	25 %	25 %	50 %	0 %	77404714
78	NC_007489	CGCC	2	8	23875	23882	0 %	0 %	25 %	75 %	77404714
79	NC_007489	TCGA	2	8	25978	25985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007489	GCTG	2	8	26125	26132	0 %	25 %	50 %	25 %	77404716
81	NC_007489	CCCG	2	8	26863	26870	0 %	0 %	25 %	75 %	77404717
82	NC_007489	ACTG	2	8	26984	26991	25 %	25 %	25 %	25 %	77404717
83	NC_007489	GATC	2	8	27227	27234	25 %	25 %	25 %	25 %	77404717
84	NC_007489	AGCC	2	8	27238	27245	25 %	0 %	25 %	50 %	77404717
85	NC_007489	CCCG	2	8	27557	27564	0 %	0 %	25 %	75 %	77404717
86	NC_007489	GCTG	2	8	27619	27626	0 %	25 %	50 %	25 %	77404718
87	NC_007489	GATG	2	8	27892	27899	25 %	25 %	50 %	0 %	77404718
88	NC_007489	CCGG	2	8	28203	28210	0 %	0 %	50 %	50 %	77404718
89	NC_007489	GGTC	2	8	28303	28310	0 %	25 %	50 %	25 %	77404718
90	NC_007489	ACGC	2	8	28716	28723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007489	GCCC	2	8	29376	29383	0 %	0 %	25 %	75 %	77404719
92	NC_007489	CGCC	2	8	29607	29614	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_007489	CATC	2	8	29848	29855	25 %	25 %	0 %	50 %	77404720
94	NC_007489	CGGC	2	8	30024	30031	0 %	0 %	50 %	50 %	77404720
95	NC_007489	GGAT	2	8	30084	30091	25 %	25 %	50 %	0 %	77404720
96	NC_007489	CTCC	2	8	30466	30473	0 %	25 %	0 %	75 %	77404721
97	NC_007489	GGCC	2	8	31047	31054	0 %	0 %	50 %	50 %	77404721
98	NC_007489	GCCC	2	8	31137	31144	0 %	0 %	25 %	75 %	77404721
99	NC_007489	GCAG	2	8	32121	32128	25 %	0 %	50 %	25 %	77404723
100	NC_007489	GCCT	2	8	32790	32797	0 %	25 %	25 %	50 %	77404724
101	NC_007489	ACGG	2	8	33121	33128	25 %	0 %	50 %	25 %	77404724
102	NC_007489	TCGA	2	8	33135	33142	25 %	25 %	25 %	25 %	77404724
103	NC_007489	GTCC	2	8	33263	33270	0 %	25 %	25 %	50 %	77404724
104	NC_007489	TCCT	2	8	34251	34258	0 %	50 %	0 %	50 %	77404724
105	NC_007489	GTCG	2	8	34550	34557	0 %	25 %	50 %	25 %	77404724
106	NC_007489	CCGA	2	8	34896	34903	25 %	0 %	25 %	50 %	77404724
107	NC_007489	GCCC	3	12	34917	34928	0 %	0 %	25 %	75 %	77404724
108	NC_007489	GCCG	2	8	35454	35461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007489	AGGG	2	8	35649	35656	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007489	CATC	2	8	36197	36204	25 %	25 %	0 %	50 %	77404725
111	NC_007489	GCAG	2	8	36431	36438	25 %	0 %	50 %	25 %	77404725
112	NC_007489	CCGC	2	8	36731	36738	0 %	0 %	25 %	75 %	77404725
113	NC_007489	CTGC	2	8	37514	37521	0 %	25 %	25 %	50 %	77404725
114	NC_007489	GCCT	2	8	37618	37625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007489	GAAG	2	8	38062	38069	50 %	0 %	50 %	0 %	77404726
116	NC_007489	CGGC	2	8	38070	38077	0 %	0 %	50 %	50 %	77404726
117	NC_007489	CGTC	2	8	38982	38989	0 %	25 %	25 %	50 %	77404727
118	NC_007489	TCAT	2	8	39848	39855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007489	CAGC	2	8	40407	40414	25 %	0 %	25 %	50 %	77404728
120	NC_007489	GAAG	2	8	40473	40480	50 %	0 %	50 %	0 %	77404728
121	NC_007489	GCTC	2	8	40710	40717	0 %	25 %	25 %	50 %	77404728
122	NC_007489	CGGT	2	8	41731	41738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007489	AGGC	2	8	41851	41858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007489	CTGC	2	8	41941	41948	0 %	25 %	25 %	50 %	77404729
125	NC_007489	CCGA	2	8	42572	42579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007489	GCGG	2	8	42806	42813	0 %	0 %	75 %	25 %	77404730
127	NC_007489	GACG	2	8	42974	42981	25 %	0 %	50 %	25 %	77404730
128	NC_007489	AGCC	2	8	43161	43168	25 %	0 %	25 %	50 %	77404730
129	NC_007489	CGCC	2	8	43211	43218	0 %	0 %	25 %	75 %	77404730
130	NC_007489	GGCC	2	8	43313	43320	0 %	0 %	50 %	50 %	77404730
131	NC_007489	GCCC	2	8	43615	43622	0 %	0 %	25 %	75 %	77404730
132	NC_007489	TTGC	2	8	44277	44284	0 %	50 %	25 %	25 %	77404730
133	NC_007489	GCCA	2	8	44848	44855	25 %	0 %	25 %	50 %	77404730
134	NC_007489	GTCC	2	8	45135	45142	0 %	25 %	25 %	50 %	77404731
135	NC_007489	CGAG	2	8	45256	45263	25 %	0 %	50 %	25 %	77404731
136	NC_007489	CGAG	2	8	45733	45740	25 %	0 %	50 %	25 %	77404732
137	NC_007489	CGGC	2	8	46345	46352	0 %	0 %	50 %	50 %	77404732
138	NC_007489	CCCG	2	8	46626	46633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_007489	CCGC	2	8	47231	47238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_007489	GGAC	2	8	47537	47544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007489	GCCC	2	8	47610	47617	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_007489	TCGT	2	8	48320	48327	0 %	50 %	25 %	25 %	77404733
143	NC_007489	GCAC	2	8	49234	49241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007489	ATGC	2	8	49630	49637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007489	TCCA	2	8	50199	50206	25 %	25 %	0 %	50 %	77404734
146	NC_007489	GCGA	2	8	50949	50956	25 %	0 %	50 %	25 %	77404734
147	NC_007489	GTGA	2	8	51064	51071	25 %	25 %	50 %	0 %	77404734
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291	NC_007489	CGAT	2	8	96394	96401	25 %	25 %	25 %	25 %	77404768
292	NC_007489	GCCG	2	8	96610	96617	0 %	0 %	50 %	50 %	77404768
293	NC_007489	CCAG	2	8	96769	96776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
294	NC_007489	CCAG	2	8	97919	97926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
295	NC_007489	TCCC	2	8	97941	97948	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
296	NC_007489	GCTC	2	8	98535	98542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
297	NC_007489	GGCG	2	8	99376	99383	0 %	0 %	75 %	25 %	77404769
298	NC_007489	CCGG	2	8	100091	100098	0 %	0 %	50 %	50 %	77404770
299	NC_007489	GGCG	2	8	101597	101604	0 %	0 %	75 %	25 %	77404771
300	NC_007489	GGGA	2	8	101647	101654	25 %	0 %	75 %	0 %	77404771
301	NC_007489	AGGC	2	8	101863	101870	25 %	0 %	50 %	25 %	77404771
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307	NC_007489	CCGG	2	8	104230	104237	0 %	0 %	50 %	50 %	77404774
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309	NC_007489	AGCA	2	8	104348	104355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
310	NC_007489	CAAG	2	8	104542	104549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
311	NC_007489	ACGA	2	8	104641	104648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
312	NC_007489	GAGC	2	8	104847	104854	25 %	0 %	50 %	25 %	77404775
313	NC_007489	CTGG	2	8	105090	105097	0 %	25 %	50 %	25 %	77404775
314	NC_007489	CCCG	2	8	105166	105173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.