MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC1

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007486	TCGA	2	8	331	338	25 %	25 %	25 %	25 %	77404486
2	NC_007486	GAAG	2	8	1014	1021	50 %	0 %	50 %	0 %	77404488
3	NC_007486	ACGA	2	8	1405	1412	50 %	0 %	25 %	25 %	77404489
4	NC_007486	GACT	2	8	1585	1592	25 %	25 %	25 %	25 %	77404490
5	NC_007486	CCTG	2	8	1699	1706	0 %	25 %	25 %	50 %	77404490
6	NC_007486	AACC	2	8	1859	1866	50 %	0 %	0 %	50 %	77404490
7	NC_007486	TCAT	2	8	2148	2155	25 %	50 %	0 %	25 %	77404490
8	NC_007486	TCCC	2	8	3148	3155	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_007486	AGGG	2	8	3288	3295	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007486	GCTC	2	8	3395	3402	0 %	25 %	25 %	50 %	77404493
11	NC_007486	CGGG	2	8	4377	4384	0 %	0 %	75 %	25 %	77404495
12	NC_007486	GGCG	2	8	4441	4448	0 %	0 %	75 %	25 %	77404495
13	NC_007486	CGAT	2	8	4873	4880	25 %	25 %	25 %	25 %	77404496
14	NC_007486	GCGA	2	8	4941	4948	25 %	0 %	50 %	25 %	77404496
15	NC_007486	CTGG	2	8	5228	5235	0 %	25 %	50 %	25 %	77404496
16	NC_007486	CAGG	2	8	5755	5762	25 %	0 %	50 %	25 %	77404497
17	NC_007486	GGCA	3	12	5787	5798	25 %	0 %	50 %	25 %	77404497
18	NC_007486	GACC	2	8	7178	7185	25 %	0 %	25 %	50 %	77404497
19	NC_007486	CCGG	2	8	8966	8973	0 %	0 %	50 %	50 %	77404497
20	NC_007486	TCAC	2	8	9163	9170	25 %	25 %	0 %	50 %	77404497
21	NC_007486	AAGG	2	8	9470	9477	50 %	0 %	50 %	0 %	77404497
22	NC_007486	ACGT	2	8	9845	9852	25 %	25 %	25 %	25 %	77404497
23	NC_007486	CCGT	2	8	10168	10175	0 %	25 %	25 %	50 %	77404497
24	NC_007486	CGTC	2	8	10717	10724	0 %	25 %	25 %	50 %	77404497
25	NC_007486	TCGT	2	8	11135	11142	0 %	50 %	25 %	25 %	77404497
26	NC_007486	GTGG	2	8	11344	11351	0 %	25 %	75 %	0 %	77404497
27	NC_007486	GACC	2	8	13474	13481	25 %	0 %	25 %	50 %	77404497
28	NC_007486	CAAC	2	8	13528	13535	50 %	0 %	0 %	50 %	77404497
29	NC_007486	GGCA	2	8	13725	13732	25 %	0 %	50 %	25 %	77404497
30	NC_007486	AACG	2	8	13916	13923	50 %	0 %	25 %	25 %	77404497
31	NC_007486	CCAC	2	8	14338	14345	25 %	0 %	0 %	75 %	77404497
32	NC_007486	ACCG	2	8	14473	14480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007486	GGCC	2	8	14725	14732	0 %	0 %	50 %	50 %	77404498
34	NC_007486	AGCC	2	8	14995	15002	25 %	0 %	25 %	50 %	77404498
35	NC_007486	CGGT	2	8	15172	15179	0 %	25 %	50 %	25 %	77404498
36	NC_007486	TGCG	2	8	15282	15289	0 %	25 %	50 %	25 %	77404498
37	NC_007486	GTCG	2	8	15973	15980	0 %	25 %	50 %	25 %	77404498
38	NC_007486	TGAC	2	8	16062	16069	25 %	25 %	25 %	25 %	77404498
39	NC_007486	TCTG	2	8	16150	16157	0 %	50 %	25 %	25 %	77404498
40	NC_007486	GTCT	2	8	16444	16451	0 %	50 %	25 %	25 %	77404499
41	NC_007486	CGCA	2	8	16634	16641	25 %	0 %	25 %	50 %	77404499
42	NC_007486	TCCG	2	8	16771	16778	0 %	25 %	25 %	50 %	77404499
43	NC_007486	CCCA	2	8	16793	16800	25 %	0 %	0 %	75 %	77404499
44	NC_007486	GAGC	2	8	17278	17285	25 %	0 %	50 %	25 %	77404500
45	NC_007486	CTTC	2	8	17554	17561	0 %	50 %	0 %	50 %	77404500
46	NC_007486	CCGT	2	8	17656	17663	0 %	25 %	25 %	50 %	77404500
47	NC_007486	CAAG	2	8	17702	17709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007486	CAAA	2	8	17841	17848	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007486	TCGC	2	8	18820	18827	0 %	25 %	25 %	50 %	77404501
50	NC_007486	CGGT	2	8	18865	18872	0 %	25 %	50 %	25 %	77404501
51	NC_007486	GGCA	2	8	18934	18941	25 %	0 %	50 %	25 %	77404501
52	NC_007486	GCGA	2	8	21089	21096	25 %	0 %	50 %	25 %	77404501
53	NC_007486	GCAA	2	8	21388	21395	50 %	0 %	25 %	25 %	77404501
54	NC_007486	CGAA	2	8	21415	21422	50 %	0 %	25 %	25 %	77404501
55	NC_007486	CGCC	2	8	21974	21981	0 %	0 %	25 %	75 %	77404501
56	NC_007486	CTGG	2	8	22894	22901	0 %	25 %	50 %	25 %	77404502
57	NC_007486	GCAA	2	8	22962	22969	50 %	0 %	25 %	25 %	77404502
58	NC_007486	CAAC	2	8	23058	23065	50 %	0 %	0 %	50 %	77404502
59	NC_007486	GAAC	2	8	23094	23101	50 %	0 %	25 %	25 %	77404502
60	NC_007486	GAAA	2	8	23761	23768	75 %	0 %	25 %	0 %	77404502
61	NC_007486	CGGT	2	8	24197	24204	0 %	25 %	50 %	25 %	77404502
62	NC_007486	CCGA	2	8	24400	24407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007486	GAAA	2	8	24747	24754	75 %	0 %	25 %	0 %	77404504
64	NC_007486	TGCG	3	12	24793	24804	0 %	25 %	50 %	25 %	77404504
65	NC_007486	CCGG	2	8	25334	25341	0 %	0 %	50 %	50 %	77404504
66	NC_007486	CGTA	2	8	25417	25424	25 %	25 %	25 %	25 %	77404504
67	NC_007486	GCCG	2	8	26104	26111	0 %	0 %	50 %	50 %	77404505
68	NC_007486	CGGG	2	8	26132	26139	0 %	0 %	75 %	25 %	77404505
69	NC_007486	TTGC	2	8	26479	26486	0 %	50 %	25 %	25 %	77404505
70	NC_007486	TCGC	2	8	26784	26791	0 %	25 %	25 %	50 %	77404505
71	NC_007486	CCCG	2	8	26922	26929	0 %	0 %	25 %	75 %	77404505
72	NC_007486	CGGA	2	8	27136	27143	25 %	0 %	50 %	25 %	77404505
73	NC_007486	GACA	2	8	27280	27287	50 %	0 %	25 %	25 %	77404505
74	NC_007486	GTAA	2	8	27709	27716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007486	AACG	2	8	27757	27764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007486	CGAC	2	8	27824	27831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007486	CCGA	2	8	28165	28172	25 %	0 %	25 %	50 %	77404506
78	NC_007486	TGAG	2	8	28211	28218	25 %	25 %	50 %	0 %	77404506
79	NC_007486	AGGC	2	8	28322	28329	25 %	0 %	50 %	25 %	77404506
80	NC_007486	AGCG	2	8	28892	28899	25 %	0 %	50 %	25 %	77404507
81	NC_007486	GCTT	2	8	28981	28988	0 %	50 %	25 %	25 %	77404507
82	NC_007486	CAGT	2	8	29330	29337	25 %	25 %	25 %	25 %	77404508
83	NC_007486	CAGG	2	8	29718	29725	25 %	0 %	50 %	25 %	77404508
84	NC_007486	TGCC	2	8	30444	30451	0 %	25 %	25 %	50 %	77404509
85	NC_007486	CGGC	2	8	30837	30844	0 %	0 %	50 %	50 %	77404509
86	NC_007486	GAGC	2	8	31389	31396	25 %	0 %	50 %	25 %	77404509
87	NC_007486	TCGA	2	8	31628	31635	25 %	25 %	25 %	25 %	77404509
88	NC_007486	TCGA	2	8	32108	32115	25 %	25 %	25 %	25 %	77404509
89	NC_007486	AGAC	2	8	32897	32904	50 %	0 %	25 %	25 %	77404510
90	NC_007486	CTTC	2	8	33350	33357	0 %	50 %	0 %	50 %	77404511
91	NC_007486	GCGG	2	8	33379	33386	0 %	0 %	75 %	25 %	77404511
92	NC_007486	CCGA	2	8	33934	33941	25 %	0 %	25 %	50 %	77404512
93	NC_007486	TCCT	2	8	35048	35055	0 %	50 %	0 %	50 %	77404514
94	NC_007486	TTCT	2	8	35171	35178	0 %	75 %	0 %	25 %	77404514
95	NC_007486	CACC	2	8	35827	35834	25 %	0 %	0 %	75 %	77404514
96	NC_007486	GCTT	2	8	36102	36109	0 %	50 %	25 %	25 %	77404514
97	NC_007486	GGTC	2	8	36745	36752	0 %	25 %	50 %	25 %	77404514
98	NC_007486	CCTT	2	8	37044	37051	0 %	50 %	0 %	50 %	77404514
99	NC_007486	TTCC	2	8	37316	37323	0 %	50 %	0 %	50 %	77404515
100	NC_007486	CTCG	2	8	38828	38835	0 %	25 %	25 %	50 %	77404518
101	NC_007486	TCGG	2	8	39596	39603	0 %	25 %	50 %	25 %	77404519
102	NC_007486	GCCG	2	8	39811	39818	0 %	0 %	50 %	50 %	77404519
103	NC_007486	AGGC	2	8	40425	40432	25 %	0 %	50 %	25 %	77404519
104	NC_007486	CGAC	2	8	41312	41319	25 %	0 %	25 %	50 %	77404520
105	NC_007486	GGAC	2	8	41544	41551	25 %	0 %	50 %	25 %	77404521
106	NC_007486	GATC	2	8	41698	41705	25 %	25 %	25 %	25 %	77404521
107	NC_007486	ACGA	2	8	43320	43327	50 %	0 %	25 %	25 %	77404522
108	NC_007486	GGGA	2	8	43346	43353	25 %	0 %	75 %	0 %	77404522
109	NC_007486	CGTC	2	8	44583	44590	0 %	25 %	25 %	50 %	77404522
110	NC_007486	CGCC	2	8	44728	44735	0 %	0 %	25 %	75 %	77404522
111	NC_007486	ACGA	2	8	45371	45378	50 %	0 %	25 %	25 %	77404523
112	NC_007486	TCCG	2	8	45879	45886	0 %	25 %	25 %	50 %	77404523
113	NC_007486	GTCC	2	8	46401	46408	0 %	25 %	25 %	50 %	77404524
114	NC_007486	GCCG	2	8	46962	46969	0 %	0 %	50 %	50 %	77404524
115	NC_007486	TTCC	2	8	47219	47226	0 %	50 %	0 %	50 %	77404525
116	NC_007486	GGAA	2	8	47241	47248	50 %	0 %	50 %	0 %	77404525
117	NC_007486	GATC	2	8	47444	47451	25 %	25 %	25 %	25 %	77404525
118	NC_007486	ATCC	2	8	48102	48109	25 %	25 %	0 %	50 %	77404526
119	NC_007486	CGGA	2	8	48598	48605	25 %	0 %	50 %	25 %	77404527
120	NC_007486	GTTC	2	8	48637	48644	0 %	50 %	25 %	25 %	77404527
121	NC_007486	GCCG	2	8	49030	49037	0 %	0 %	50 %	50 %	77404528
122	NC_007486	CGGG	2	8	49110	49117	0 %	0 %	75 %	25 %	77404528
123	NC_007486	CGCT	2	8	49200	49207	0 %	25 %	25 %	50 %	77404528
124	NC_007486	TCGA	2	8	49210	49217	25 %	25 %	25 %	25 %	77404528
125	NC_007486	AGGT	2	8	49819	49826	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007486	CGGG	2	8	50000	50007	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007486	GCGA	2	8	50226	50233	25 %	0 %	50 %	25 %	77404529
128	NC_007486	GACG	2	8	50904	50911	25 %	0 %	50 %	25 %	77404531
129	NC_007486	CGAC	2	8	51108	51115	25 %	0 %	25 %	50 %	77404531
130	NC_007486	GATC	2	8	51260	51267	25 %	25 %	25 %	25 %	77404532
131	NC_007486	CGAG	2	8	51277	51284	25 %	0 %	50 %	25 %	77404532
132	NC_007486	TCGA	2	8	51688	51695	25 %	25 %	25 %	25 %	77404532
133	NC_007486	GAGC	2	8	51970	51977	25 %	0 %	50 %	25 %	77404533
134	NC_007486	TCGA	2	8	52107	52114	25 %	25 %	25 %	25 %	77404533
135	NC_007486	GATC	2	8	52882	52889	25 %	25 %	25 %	25 %	77404533
136	NC_007486	ATCG	2	8	53965	53972	25 %	25 %	25 %	25 %	77404534
137	NC_007486	TTTC	2	8	54316	54323	0 %	75 %	0 %	25 %	77404535
138	NC_007486	GTCG	2	8	54581	54588	0 %	25 %	50 %	25 %	77404535
139	NC_007486	TCGA	2	8	55023	55030	25 %	25 %	25 %	25 %	77404535
140	NC_007486	GCGA	2	8	55172	55179	25 %	0 %	50 %	25 %	77404535
141	NC_007486	CAAG	2	8	55203	55210	50 %	0 %	25 %	25 %	77404535
142	NC_007486	GAGC	2	8	55247	55254	25 %	0 %	50 %	25 %	77404535
143	NC_007486	CGAG	2	8	55409	55416	25 %	0 %	50 %	25 %	77404535
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273	NC_007486	AACC	2	8	101326	101333	50 %	0 %	0 %	50 %	77404585
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.