MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF

Total Repeats: 982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007110	GGT	2	6	16	21	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007110	TAA	2	6	37	42	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007110	TAC	2	6	98	103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007110	CCT	2	6	145	150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007110	GAG	3	9	333	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007110	CTC	2	6	381	386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007110	CTA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007110	CAG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007110	ATC	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459794
10	NC_007110	TAA	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007110	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007110	ATT	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459795
13	NC_007110	AGT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459795
14	NC_007110	TAA	2	6	1425	1430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459795
15	NC_007110	ATA	2	6	1493	1498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459795
16	NC_007110	TTA	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459795
17	NC_007110	ATT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459795
18	NC_007110	TAT	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007110	ATT	2	6	1782	1787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007110	AAT	2	6	1796	1801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007110	ATT	2	6	1864	1869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
22	NC_007110	AAT	2	6	1872	1877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
23	NC_007110	GGT	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67459796
24	NC_007110	CTA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459796
25	NC_007110	TAA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
26	NC_007110	TAA	2	6	2067	2072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
27	NC_007110	AAT	2	6	2110	2115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
28	NC_007110	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
29	NC_007110	TAG	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459796
30	NC_007110	CCA	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459796
31	NC_007110	AAT	2	6	2301	2306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
32	NC_007110	TTA	2	6	2353	2358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
33	NC_007110	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
34	NC_007110	TAT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
35	NC_007110	TAA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
36	NC_007110	TTA	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
37	NC_007110	TAG	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459797
38	NC_007110	AAT	2	6	2677	2682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459797
39	NC_007110	TTA	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459797
40	NC_007110	AAT	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459797
41	NC_007110	AAC	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459797
42	NC_007110	ATT	2	6	2798	2803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459797
43	NC_007110	TTA	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459797
44	NC_007110	TTC	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459797
45	NC_007110	TAT	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007110	TGT	2	6	3053	3058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007110	GTT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007110	ATT	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
49	NC_007110	AGA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459798
50	NC_007110	AAT	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
51	NC_007110	TAC	3	9	3807	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459798
52	NC_007110	ACA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
53	NC_007110	TTA	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
54	NC_007110	TAT	2	6	4070	4075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
55	NC_007110	GTA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459798
56	NC_007110	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
57	NC_007110	CAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459798
58	NC_007110	CAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
59	NC_007110	TTA	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
60	NC_007110	TTA	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
61	NC_007110	ATT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
62	NC_007110	CAG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459798
63	NC_007110	ATG	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459798
64	NC_007110	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459798
65	NC_007110	TTA	2	6	4462	4467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
66	NC_007110	ACA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
67	NC_007110	CCT	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459798
68	NC_007110	ATA	3	9	4622	4630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
69	NC_007110	TAA	2	6	4632	4637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
70	NC_007110	GAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459798
71	NC_007110	TAC	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459798
72	NC_007110	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
73	NC_007110	TTA	2	6	4909	4914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
74	NC_007110	ACA	2	6	5029	5034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
75	NC_007110	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459798
76	NC_007110	AGG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459798
77	NC_007110	ATA	2	6	5222	5227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
78	NC_007110	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
79	NC_007110	CAA	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
80	NC_007110	AAT	2	6	5680	5685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
81	NC_007110	ATT	2	6	5759	5764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
82	NC_007110	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459799
83	NC_007110	GTA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
84	NC_007110	ATA	2	6	5929	5934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459799
85	NC_007110	TGA	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
86	NC_007110	GAA	2	6	6111	6116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459799
87	NC_007110	ATT	2	6	6126	6131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459799
88	NC_007110	CAA	2	6	6132	6137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459799
89	NC_007110	TGA	2	6	6182	6187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
90	NC_007110	CAA	2	6	6236	6241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459799
91	NC_007110	TCT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459799
92	NC_007110	TAG	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
93	NC_007110	GAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
94	NC_007110	ATT	2	6	6439	6444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459799
95	NC_007110	ATT	2	6	6455	6460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459799
96	NC_007110	TGG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007110	GAT	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459800
98	NC_007110	GGA	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459800
99	NC_007110	TTA	2	6	6746	6751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459800
100	NC_007110	TTA	2	6	6956	6961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459800
101	NC_007110	GTA	2	6	7006	7011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459800
102	NC_007110	ATA	2	6	7124	7129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459800
103	NC_007110	ATT	2	6	7272	7277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459800
104	NC_007110	AGC	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459800
105	NC_007110	CTA	2	6	7384	7389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459800
106	NC_007110	ATC	2	6	7396	7401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459800
107	NC_007110	CTT	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459800
108	NC_007110	TTA	2	6	7479	7484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459800
109	NC_007110	ACA	2	6	7550	7555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459801
110	NC_007110	AGT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459801
111	NC_007110	CCT	2	6	7614	7619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459801
112	NC_007110	TAT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459801
113	NC_007110	TAA	2	6	7764	7769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007110	TCT	2	6	7791	7796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007110	TAA	2	6	7812	7817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007110	AAT	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459802
117	NC_007110	AAT	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459802
118	NC_007110	TAA	2	6	8077	8082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459802
119	NC_007110	TCC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459802
120	NC_007110	GAT	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459802
121	NC_007110	TTC	2	6	8191	8196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459802
122	NC_007110	ATC	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459802
123	NC_007110	TGA	3	9	8254	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459802
124	NC_007110	ATT	2	6	8415	8420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459803
125	NC_007110	TTG	2	6	8453	8458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459803
126	NC_007110	ATA	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459803
127	NC_007110	TAC	2	6	8504	8509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459803
128	NC_007110	ATG	2	6	8516	8521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459803
129	NC_007110	CCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459803
130	NC_007110	CAT	2	6	8600	8605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459803
131	NC_007110	ATT	2	6	8659	8664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459803
132	NC_007110	CTA	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459803
133	NC_007110	TGA	2	6	8817	8822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459803
134	NC_007110	CTT	2	6	8885	8890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459803
135	NC_007110	ATA	3	9	8902	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459803
136	NC_007110	TAC	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007110	TAA	2	6	9106	9111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007110	GTT	2	6	9137	9142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007110	TTG	2	6	9150	9155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007110	TTC	2	6	9190	9195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007110	AAC	2	6	9280	9285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007110	TTG	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007110	CAT	2	6	9386	9391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007110	CAT	2	6	9399	9404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007110	ATT	2	6	9414	9419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007110	TTC	2	6	9521	9526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459804
147	NC_007110	TCA	2	6	9553	9558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
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149	NC_007110	ATG	2	6	9779	9784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459804
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151	NC_007110	CAT	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
152	NC_007110	TTA	2	6	9871	9876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459804
153	NC_007110	TCA	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
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159	NC_007110	ACT	2	6	10140	10145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
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395	NC_007110	AGC	2	6	23571	23576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459818
396	NC_007110	TCA	2	6	23637	23642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459818
397	NC_007110	CAA	2	6	23676	23681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_007110	GAA	2	6	23852	23857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459819
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499	NC_007110	GGA	2	6	30211	30216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_007110	TGC	2	6	30324	30329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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