MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 23286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007109	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458393
2	NC_007109	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458393
3	NC_007109	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458393
4	NC_007109	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458393
5	NC_007109	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458393
6	NC_007109	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458393
7	NC_007109	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458393
8	NC_007109	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458393
9	NC_007109	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458393
10	NC_007109	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458393
11	NC_007109	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458393
12	NC_007109	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007109	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007109	ACA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007109	TAC	2	6	1032	1037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458394
16	NC_007109	ATA	2	6	1172	1177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458394
17	NC_007109	TGA	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458394
18	NC_007109	GTA	2	6	1269	1274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458394
19	NC_007109	TAA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458394
20	NC_007109	AAG	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458395
21	NC_007109	TGC	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458395
22	NC_007109	ATA	3	9	1739	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458395
23	NC_007109	TAA	2	6	1806	1811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458395
24	NC_007109	TGA	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458395
25	NC_007109	ATA	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458395
26	NC_007109	TCA	2	6	2004	2009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458395
27	NC_007109	AGA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458395
28	NC_007109	TTA	2	6	2047	2052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458395
29	NC_007109	CTT	2	6	2113	2118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458395
30	NC_007109	AAG	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007109	CGG	2	6	2464	2469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67458396
32	NC_007109	AGC	2	6	2495	2500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458396
33	NC_007109	ATA	2	6	2540	2545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458396
34	NC_007109	ATA	2	6	2678	2683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458396
35	NC_007109	TAA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458396
36	NC_007109	ATG	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458396
37	NC_007109	TAT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458396
38	NC_007109	TTA	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458396
39	NC_007109	CTC	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67458397
40	NC_007109	ATT	2	6	3181	3186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
41	NC_007109	ATT	2	6	3194	3199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
42	NC_007109	AAG	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
43	NC_007109	ATT	2	6	3307	3312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
44	NC_007109	AGC	2	6	3510	3515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458397
45	NC_007109	AAG	2	6	3584	3589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
46	NC_007109	CTC	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67458397
47	NC_007109	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
48	NC_007109	GAG	2	6	3931	3936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458397
49	NC_007109	TAT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
50	NC_007109	GCA	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458397
51	NC_007109	AGA	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
52	NC_007109	CTT	2	6	4261	4266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458397
53	NC_007109	CTA	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458397
54	NC_007109	TAT	2	6	4369	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
55	NC_007109	TTA	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
56	NC_007109	GGA	2	6	4510	4515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458397
57	NC_007109	GGA	2	6	4777	4782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458397
58	NC_007109	GGC	2	6	4840	4845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67458397
59	NC_007109	GCA	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458397
60	NC_007109	GAA	2	6	4963	4968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
61	NC_007109	ATT	2	6	4986	4991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
62	NC_007109	AAG	2	6	4994	4999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
63	NC_007109	GAA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
64	NC_007109	TAA	2	6	5031	5036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458397
65	NC_007109	GGA	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458397
66	NC_007109	TAT	2	6	5056	5061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
67	NC_007109	TCG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458397
68	NC_007109	TGA	2	6	5361	5366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
69	NC_007109	TAG	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
70	NC_007109	AAG	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
71	NC_007109	TAA	2	6	5460	5465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458397
72	NC_007109	AAT	2	6	5476	5481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458397
73	NC_007109	ATT	2	6	5528	5533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
74	NC_007109	TAG	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
75	NC_007109	GAT	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
76	NC_007109	TGC	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458397
77	NC_007109	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
78	NC_007109	CTA	2	6	5759	5764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458397
79	NC_007109	CGC	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	67458397
80	NC_007109	TTG	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458397
81	NC_007109	TTA	2	6	5887	5892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
82	NC_007109	ATA	2	6	5909	5914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458397
83	NC_007109	TAA	2	6	5978	5983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458397
84	NC_007109	ATA	2	6	6001	6006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458397
85	NC_007109	GAA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
86	NC_007109	ATG	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
87	NC_007109	GTA	2	6	6155	6160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
88	NC_007109	GTT	2	6	6267	6272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007109	ACT	2	6	6413	6418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007109	CTA	3	9	6451	6459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458398
91	NC_007109	ATT	2	6	6498	6503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458398
92	NC_007109	TTC	2	6	6564	6569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458398
93	NC_007109	TAC	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458398
94	NC_007109	ATC	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458398
95	NC_007109	ATT	2	6	6769	6774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458398
96	NC_007109	ATT	2	6	6831	6836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458398
97	NC_007109	ATT	3	9	6882	6890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458398
98	NC_007109	CCG	2	6	6910	6915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	67458398
99	NC_007109	TAT	2	6	6956	6961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458398
100	NC_007109	ATT	2	6	6970	6975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458398
101	NC_007109	TTG	2	6	7325	7330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458399
102	NC_007109	TAG	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458399
103	NC_007109	CTT	2	6	7414	7419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458399
104	NC_007109	TAG	2	6	7426	7431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458399
105	NC_007109	AGC	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458399
106	NC_007109	CTA	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458399
107	NC_007109	CAT	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007109	CAA	2	6	7843	7848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007109	CTC	2	6	7858	7863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007109	ACT	2	6	7896	7901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458400
111	NC_007109	ATA	3	9	7940	7948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458400
112	NC_007109	CCG	2	6	7988	7993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	67458400
113	NC_007109	TCC	2	6	8089	8094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67458400
114	NC_007109	ATA	2	6	8150	8155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458400
115	NC_007109	TCT	2	6	8216	8221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458400
116	NC_007109	ATA	2	6	8222	8227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458400
117	NC_007109	ATT	2	6	8278	8283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458400
118	NC_007109	ATG	2	6	8317	8322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458400
119	NC_007109	TAC	2	6	8383	8388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458400
120	NC_007109	TCA	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458400
121	NC_007109	TGT	2	6	8423	8428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458400
122	NC_007109	TAT	2	6	8493	8498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458400
123	NC_007109	TAA	2	6	8505	8510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458400
124	NC_007109	CAA	2	6	8574	8579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458400
125	NC_007109	ATT	2	6	8591	8596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458400
126	NC_007109	AGC	3	9	8728	8736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458400
127	NC_007109	AAG	2	6	8777	8782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458400
128	NC_007109	AGG	2	6	8851	8856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458400
129	NC_007109	TAC	2	6	8925	8930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458400
130	NC_007109	TAT	2	6	8989	8994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007109	CAA	2	6	8996	9001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007109	AGG	2	6	9009	9014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007109	TAA	2	6	9145	9150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007109	TTA	2	6	9260	9265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007109	AAG	3	9	9331	9339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_007109	ATG	2	6	24497	24502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
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397	NC_007109	AAG	2	6	24677	24682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
398	NC_007109	GAA	2	6	24886	24891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
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402	NC_007109	TGA	2	6	25038	25043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
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