MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 38199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007109	ATA	2	6	19714	19719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458413
502	NC_007109	ATT	2	6	19741	19746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458413
503	NC_007109	ATT	2	6	19827	19832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458413
504	NC_007109	ATAA	2	8	19833	19840	75 %	25 %	0 %	0 %	67458413
505	NC_007109	TAAA	2	8	19855	19862	75 %	25 %	0 %	0 %	67458413
506	NC_007109	TA	3	6	19929	19934	50 %	50 %	0 %	0 %	67458413
507	NC_007109	AGCA	2	8	19995	20002	50 %	0 %	25 %	25 %	67458413
508	NC_007109	CGT	2	6	20063	20068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458413
509	NC_007109	CGCTC	2	10	20104	20113	0 %	20 %	20 %	60 %	67458413
510	NC_007109	T	6	6	20234	20239	0 %	100 %	0 %	0 %	67458413
511	NC_007109	TGT	2	6	20249	20254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458413
512	NC_007109	TCC	2	6	20268	20273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67458413
513	NC_007109	TTA	2	6	20318	20323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458413
514	NC_007109	AAT	2	6	20397	20402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458413
515	NC_007109	AT	3	6	20426	20431	50 %	50 %	0 %	0 %	67458413
516	NC_007109	A	6	6	20468	20473	100 %	0 %	0 %	0 %	67458413
517	NC_007109	A	7	7	20476	20482	100 %	0 %	0 %	0 %	67458413
518	NC_007109	TTG	2	6	20483	20488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458413
519	NC_007109	AAT	2	6	20522	20527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007109	ATT	2	6	20564	20569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_007109	TAT	2	6	20631	20636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_007109	TAT	2	6	20647	20652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007109	AAT	2	6	20659	20664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007109	TA	3	6	20709	20714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_007109	TTAT	2	8	20730	20737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007109	TA	3	6	20758	20763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_007109	TTTAA	2	10	20768	20777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007109	A	7	7	20823	20829	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
529	NC_007109	TCT	2	6	20850	20855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458414
530	NC_007109	AAT	2	6	20877	20882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
531	NC_007109	AGC	2	6	20908	20913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458414
532	NC_007109	ATT	2	6	20925	20930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458414
533	NC_007109	GCA	2	6	21006	21011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458414
534	NC_007109	ACCGGA	2	12	21030	21041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458414
535	NC_007109	GTA	2	6	21155	21160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
536	NC_007109	ACC	2	6	21192	21197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67458414
537	NC_007109	CAAAAT	2	12	21238	21249	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	67458414
538	NC_007109	TAA	2	6	21299	21304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
539	NC_007109	TAC	2	6	21369	21374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
540	NC_007109	TAC	2	6	21396	21401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
541	NC_007109	TAG	2	6	21528	21533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
542	NC_007109	ACAG	2	8	21543	21550	50 %	0 %	25 %	25 %	67458414
543	NC_007109	TCC	2	6	21585	21590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67458414
544	NC_007109	TTG	2	6	21601	21606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458414
545	NC_007109	GAA	2	6	21627	21632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
546	NC_007109	GGT	2	6	21633	21638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67458414
547	NC_007109	AT	3	6	21644	21649	50 %	50 %	0 %	0 %	67458414
548	NC_007109	A	6	6	21727	21732	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
549	NC_007109	ACA	2	6	21738	21743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
550	NC_007109	A	7	7	21747	21753	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
551	NC_007109	A	6	6	21770	21775	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
552	NC_007109	AATAAA	2	12	21813	21824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	67458414
553	NC_007109	GAA	2	6	21835	21840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
554	NC_007109	A	6	6	21867	21872	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
555	NC_007109	ATA	2	6	21914	21919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
556	NC_007109	A	7	7	21919	21925	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
557	NC_007109	CAA	2	6	21937	21942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
558	NC_007109	AAC	2	6	21958	21963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
559	NC_007109	GAA	2	6	21982	21987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
560	NC_007109	A	6	6	22002	22007	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
561	NC_007109	TAA	2	6	22016	22021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
562	NC_007109	GCC	2	6	22053	22058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	67458414
563	NC_007109	CAG	2	6	22078	22083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458414
564	NC_007109	CAA	2	6	22084	22089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
565	NC_007109	CAG	2	6	22108	22113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458414
566	NC_007109	TGC	2	6	22122	22127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458414
567	NC_007109	AG	3	6	22151	22156	50 %	0 %	50 %	0 %	67458414
568	NC_007109	TAA	2	6	22202	22207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
569	NC_007109	AG	3	6	22213	22218	50 %	0 %	50 %	0 %	67458414
570	NC_007109	A	6	6	22259	22264	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
571	NC_007109	A	7	7	22266	22272	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
572	NC_007109	CAA	2	6	22276	22281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
573	NC_007109	GGA	2	6	22284	22289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458414
574	NC_007109	AAG	2	6	22304	22309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
575	NC_007109	AAG	2	6	22333	22338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
576	NC_007109	GCG	2	6	22357	22362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67458414
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580	NC_007109	A	7	7	22422	22428	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
581	NC_007109	GAA	2	6	22480	22485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
582	NC_007109	A	7	7	22491	22497	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
583	NC_007109	CAA	2	6	22523	22528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
584	NC_007109	CTT	2	6	22529	22534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458414
585	NC_007109	CTG	2	6	22535	22540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458414
586	NC_007109	CTA	2	6	22541	22546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
587	NC_007109	GGA	2	6	22614	22619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458414
588	NC_007109	CAA	2	6	22654	22659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
589	NC_007109	TGT	2	6	22673	22678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458414
590	NC_007109	AAG	2	6	22685	22690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
591	NC_007109	CAT	2	6	22789	22794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
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593	NC_007109	AAG	2	6	22869	22874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
594	NC_007109	AAC	2	6	22887	22892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
595	NC_007109	CAA	2	6	22903	22908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
596	NC_007109	AAG	2	6	22952	22957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
597	NC_007109	ACA	2	6	22980	22985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458414
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599	NC_007109	A	6	6	23036	23041	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
600	NC_007109	TAA	2	6	23079	23084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
601	NC_007109	CAGATG	2	12	23093	23104	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	67458414
602	NC_007109	ACT	2	6	23181	23186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
603	NC_007109	AAG	2	6	23201	23206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
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605	NC_007109	TTC	2	6	23352	23357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458414
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610	NC_007109	ATA	2	6	23492	23497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
611	NC_007109	AGAAAG	2	12	23501	23512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
612	NC_007109	TAG	2	6	23522	23527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
613	NC_007109	GTT	2	6	23551	23556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458414
614	NC_007109	ATA	3	9	23633	23641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
615	NC_007109	TGA	2	6	23667	23672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
616	NC_007109	AGAA	2	8	23677	23684	75 %	0 %	25 %	0 %	67458414
617	NC_007109	A	6	6	23701	23706	100 %	0 %	0 %	0 %	67458414
618	NC_007109	ATC	2	6	23814	23819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
619	NC_007109	AGCA	2	8	23828	23835	50 %	0 %	25 %	25 %	67458414
620	NC_007109	TCT	2	6	23863	23868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458414
621	NC_007109	ATC	2	6	24030	24035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458414
622	NC_007109	AGCA	2	8	24044	24051	50 %	0 %	25 %	25 %	67458414
623	NC_007109	TCT	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458414
624	NC_007109	ATA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458414
625	NC_007109	TAG	2	6	24288	24293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458414
626	NC_007109	AGA	2	6	24416	24421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
627	NC_007109	AGAAGT	2	12	24435	24446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	67458414
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631	NC_007109	GAA	2	6	24670	24675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
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762	NC_007109	A	6	6	30259	30264	100 %	0 %	0 %	0 %	67458418
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