MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 38199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007109	AAT	2	6	198899	198904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458570
5002	NC_007109	TAT	2	6	198955	198960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_007109	ATA	2	6	199025	199030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_007109	TAA	2	6	199053	199058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_007109	CCA	2	6	199108	199113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_007109	GCG	2	6	199225	199230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_007109	AT	3	6	199249	199254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_007109	ATA	2	6	199258	199263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_007109	GAG	2	6	199317	199322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_007109	ACG	2	6	199365	199370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_007109	TAA	2	6	199429	199434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_007109	GAT	2	6	199454	199459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_007109	CCG	2	6	199461	199466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_007109	ATA	2	6	199507	199512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_007109	AGC	2	6	199535	199540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_007109	TATTTT	2	12	199602	199613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	67458571
5017	NC_007109	T	7	7	199610	199616	0 %	100 %	0 %	0 %	67458571
5018	NC_007109	A	6	6	199635	199640	100 %	0 %	0 %	0 %	67458571
5019	NC_007109	TGAA	2	8	199645	199652	50 %	25 %	25 %	0 %	67458571
5020	NC_007109	A	7	7	199671	199677	100 %	0 %	0 %	0 %	67458571
5021	NC_007109	CTAA	2	8	199680	199687	50 %	25 %	0 %	25 %	67458571
5022	NC_007109	AAT	2	6	199886	199891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458571
5023	NC_007109	TTA	2	6	199912	199917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458571
5024	NC_007109	TTG	2	6	199921	199926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458571
5025	NC_007109	AAT	3	9	199932	199940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458571
5026	NC_007109	AGT	2	6	200004	200009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458571
5027	NC_007109	TCCAAA	2	12	200036	200047	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	67458571
5028	NC_007109	CTAAAC	2	12	200080	200091	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	67458571
5029	NC_007109	AT	3	6	200105	200110	50 %	50 %	0 %	0 %	67458572
5030	NC_007109	AGT	2	6	200120	200125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458572
5031	NC_007109	TA	4	8	200126	200133	50 %	50 %	0 %	0 %	67458572
5032	NC_007109	TCCTGG	2	12	200156	200167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458572
5033	NC_007109	TAA	2	6	200237	200242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458572
5034	NC_007109	GCA	2	6	200259	200264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458572
5035	NC_007109	A	7	7	200285	200291	100 %	0 %	0 %	0 %	67458572
5036	NC_007109	A	6	6	200366	200371	100 %	0 %	0 %	0 %	67458572
5037	NC_007109	CAA	2	6	200387	200392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67458572
5038	NC_007109	TAT	2	6	200453	200458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458572
5039	NC_007109	ATA	2	6	200485	200490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458572
5040	NC_007109	TGC	2	6	200501	200506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458572
5041	NC_007109	GATA	2	8	200563	200570	50 %	25 %	25 %	0 %	67458572
5042	NC_007109	T	6	6	200573	200578	0 %	100 %	0 %	0 %	67458573
5043	NC_007109	T	7	7	200584	200590	0 %	100 %	0 %	0 %	67458573
5044	NC_007109	A	6	6	200594	200599	100 %	0 %	0 %	0 %	67458573
5045	NC_007109	ATT	2	6	200649	200654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458573
5046	NC_007109	AGG	2	6	200666	200671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458573
5047	NC_007109	TTAT	2	8	200676	200683	25 %	75 %	0 %	0 %	67458573
5048	NC_007109	CCG	2	6	200711	200716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	67458573
5049	NC_007109	CAT	2	6	200735	200740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458573
5050	NC_007109	AAT	2	6	200789	200794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458573
5051	NC_007109	GCC	2	6	200809	200814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	67458573
5052	NC_007109	TAG	2	6	200836	200841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458573
5053	NC_007109	TAAT	3	12	200852	200863	50 %	50 %	0 %	0 %	67458573
5054	NC_007109	A	7	7	200871	200877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_007109	ATT	2	6	200892	200897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458574
5056	NC_007109	GTA	2	6	200916	200921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458574
5057	NC_007109	ATT	2	6	200925	200930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458574
5058	NC_007109	TAGC	2	8	200974	200981	25 %	25 %	25 %	25 %	67458574
5059	NC_007109	ATG	3	9	201133	201141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458574
5060	NC_007109	AGT	2	6	201170	201175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458574
5061	NC_007109	AT	3	6	201200	201205	50 %	50 %	0 %	0 %	67458574
5062	NC_007109	ATG	3	9	201223	201231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458574
5063	NC_007109	AGATA	2	10	201253	201262	60 %	20 %	20 %	0 %	67458574
5064	NC_007109	ATTA	2	8	201290	201297	50 %	50 %	0 %	0 %	67458574
5065	NC_007109	TTC	2	6	201308	201313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458574
5066	NC_007109	GTA	2	6	201319	201324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458574
5067	NC_007109	A	6	6	201344	201349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_007109	T	7	7	201385	201391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_007109	TAA	2	6	201474	201479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_007109	TCAAAT	2	12	201500	201511	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67458575
5071	NC_007109	AGA	2	6	201520	201525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458575
5072	NC_007109	A	6	6	201539	201544	100 %	0 %	0 %	0 %	67458575
5073	NC_007109	ATC	2	6	201625	201630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458575
5074	NC_007109	ACC	2	6	201708	201713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67458575
5075	NC_007109	GCTA	2	8	201754	201761	25 %	25 %	25 %	25 %	67458575
5076	NC_007109	AT	3	6	201799	201804	50 %	50 %	0 %	0 %	67458576
5077	NC_007109	ATT	2	6	201807	201812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458576
5078	NC_007109	AAG	2	6	201830	201835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458576
5079	NC_007109	T	7	7	201864	201870	0 %	100 %	0 %	0 %	67458576
5080	NC_007109	TAA	2	6	201890	201895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458576
5081	NC_007109	ATT	2	6	201905	201910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458576
5082	NC_007109	ATTTT	2	10	201933	201942	20 %	80 %	0 %	0 %	67458576
5083	NC_007109	AAT	2	6	201957	201962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458576
5084	NC_007109	TAT	2	6	201966	201971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458576
5085	NC_007109	TCT	2	6	201973	201978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458576
5086	NC_007109	AG	3	6	202057	202062	50 %	0 %	50 %	0 %	67458576
5087	NC_007109	TAG	2	6	202064	202069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458576
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5089	NC_007109	A	6	6	202203	202208	100 %	0 %	0 %	0 %	67458576
5090	NC_007109	AGT	2	6	202232	202237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458576
5091	NC_007109	ATTT	2	8	202239	202246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_007109	CTTAA	2	10	202289	202298	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5093	NC_007109	CAAA	2	8	202363	202370	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_007109	CAA	2	6	202476	202481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_007109	TTC	2	6	202561	202566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_007109	T	6	6	202575	202580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_007109	TCG	2	6	202631	202636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458577
5098	NC_007109	TA	3	6	202648	202653	50 %	50 %	0 %	0 %	67458577
5099	NC_007109	AT	3	6	202666	202671	50 %	50 %	0 %	0 %	67458577
5100	NC_007109	ATTTT	2	10	202697	202706	20 %	80 %	0 %	0 %	67458577
5101	NC_007109	ATC	2	6	202804	202809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458577
5102	NC_007109	AAT	2	6	202835	202840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458577
5103	NC_007109	TGA	2	6	202853	202858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458577
5104	NC_007109	TTC	2	6	202867	202872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458577
5105	NC_007109	TTA	3	9	202946	202954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458577
5106	NC_007109	TA	3	6	202962	202967	50 %	50 %	0 %	0 %	67458577
5107	NC_007109	T	7	7	202971	202977	0 %	100 %	0 %	0 %	67458577
5108	NC_007109	TTA	2	6	203009	203014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458577
5109	NC_007109	TAA	2	6	203030	203035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458577
5110	NC_007109	AT	3	6	203126	203131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_007109	ATAGT	2	10	203151	203160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_007109	TA	3	6	203195	203200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_007109	T	7	7	203208	203214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_007109	TTTA	2	8	203226	203233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_007109	TATT	2	8	203239	203246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_007109	TAA	2	6	203251	203256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_007109	T	7	7	203268	203274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_007109	T	7	7	203291	203297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_007109	A	6	6	203320	203325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_007109	TTAT	2	8	203369	203376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_007109	TA	3	6	203406	203411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_007109	AATTT	2	10	203433	203442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_007109	T	6	6	203440	203445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_007109	AAG	2	6	203503	203508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458578
5125	NC_007109	TGT	2	6	203557	203562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458578
5126	NC_007109	CTTCT	2	10	203623	203632	0 %	60 %	0 %	40 %	67458578
5127	NC_007109	CT	3	6	203631	203636	0 %	50 %	0 %	50 %	67458578
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5129	NC_007109	TGC	2	6	203807	203812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458578
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