MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR01

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006969	CGA	2	6	3	8	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006969	CTG	2	6	10	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006969	GCT	2	6	16	21	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006969	GCC	2	6	90	95	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_006969	GCC	2	6	100	105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_006969	TGC	2	6	156	161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006969	CGG	2	6	270	275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006969	CCG	2	6	295	300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_006969	GAA	2	6	304	309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006969	CCG	2	6	310	315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_006969	CGG	2	6	334	339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006969	GGC	2	6	480	485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226315873
13	NC_006969	AAG	2	6	490	495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226315873
14	NC_006969	TCC	2	6	509	514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226315873
15	NC_006969	GGT	2	6	594	599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226315873
16	NC_006969	CGT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226315873
17	NC_006969	CGG	2	6	626	631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226315873
18	NC_006969	GGT	2	6	683	688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006969	GTG	2	6	702	707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006969	CAT	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006969	CTT	2	6	1032	1037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62739042
22	NC_006969	GCG	2	6	1038	1043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62739042
23	NC_006969	CGA	2	6	1082	1087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62739042
24	NC_006969	GCA	2	6	1168	1173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62739042
25	NC_006969	CTG	3	9	1192	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
26	NC_006969	CTT	2	6	1223	1228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62739043
27	NC_006969	TTC	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62739043
28	NC_006969	GCT	3	9	1280	1288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
29	NC_006969	CGG	3	9	1324	1332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62739043
30	NC_006969	CGT	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
31	NC_006969	GCC	2	6	1462	1467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62739043
32	NC_006969	CGT	2	6	1664	1669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
33	NC_006969	GCT	2	6	1699	1704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
34	NC_006969	ACC	2	6	1728	1733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62739043
35	NC_006969	AGC	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62739043
36	NC_006969	CAC	2	6	1824	1829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62739043
37	NC_006969	TCA	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62739043
38	NC_006969	GTC	3	9	1913	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
39	NC_006969	GCG	2	6	1973	1978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62739043
40	NC_006969	CAG	2	6	2080	2085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62739043
41	NC_006969	ATT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006969	ATT	2	6	2213	2218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006969	TGC	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006969	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006969	ACG	2	6	2423	2428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006969	CGG	2	6	2532	2537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006969	GAG	2	6	2692	2697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006969	GTT	2	6	2730	2735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006969	GTC	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006969	CGA	2	6	3009	3014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006969	AGT	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006969	GAC	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226315874
53	NC_006969	GTG	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226315874
54	NC_006969	GGA	2	6	3373	3378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226315874
55	NC_006969	CGC	2	6	3380	3385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226315874
56	NC_006969	TCG	2	6	3402	3407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226315874
57	NC_006969	GGT	2	6	3445	3450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226315874
58	NC_006969	ACG	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226315874
59	NC_006969	CGA	3	9	3493	3501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226315874
60	NC_006969	TGC	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226315874
61	NC_006969	CAC	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226315874
62	NC_006969	CGG	2	6	3769	3774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226315874
63	NC_006969	CGG	2	6	3824	3829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226315874
64	NC_006969	ATG	2	6	3936	3941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226315875
65	NC_006969	GCC	2	6	3991	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226315875
66	NC_006969	GCC	2	6	4017	4022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226315875
67	NC_006969	CGT	2	6	4043	4048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226315875
68	NC_006969	ACG	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226315875
69	NC_006969	CCG	2	6	4087	4092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226315875
70	NC_006969	GTG	2	6	4153	4158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006969	GCA	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006969	ACG	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006969	GGT	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006969	GGC	2	6	4265	4270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006969	CCG	2	6	4304	4309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_006969	GGA	2	6	4346	4351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.