MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 10605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006569	CGC	2	6	189775	189780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_006569	ACCT	2	8	189787	189794	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_006569	GGAAA	2	10	189795	189804	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_006569	AC	3	6	189930	189935	50 %	0 %	0 %	50 %	56708958
4005	NC_006569	TGCG	2	8	189936	189943	0 %	25 %	50 %	25 %	56708958
4006	NC_006569	CAG	2	6	190069	190074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708959
4007	NC_006569	CTGAC	2	10	190091	190100	20 %	20 %	20 %	40 %	56708959
4008	NC_006569	CGC	2	6	190200	190205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708959
4009	NC_006569	GCC	2	6	190366	190371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708959
4010	NC_006569	CAT	2	6	190432	190437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708959
4011	NC_006569	CTG	2	6	190459	190464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708959
4012	NC_006569	GCC	2	6	190495	190500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708959
4013	NC_006569	CGG	2	6	190575	190580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_006569	TCAT	2	8	190597	190604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_006569	TCT	2	6	190610	190615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_006569	AGCTGG	2	12	190720	190731	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56708960
4017	NC_006569	GCC	2	6	190804	190809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708960
4018	NC_006569	ACC	2	6	190899	190904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708960
4019	NC_006569	CTGC	2	8	190955	190962	0 %	25 %	25 %	50 %	56708960
4020	NC_006569	CAT	2	6	191078	191083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708960
4021	NC_006569	GCT	2	6	191195	191200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708961
4022	NC_006569	GCC	2	6	191231	191236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708961
4023	NC_006569	CGG	2	6	191311	191316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708961
4024	NC_006569	AGAA	2	8	191344	191351	75 %	0 %	25 %	0 %	56708961
4025	NC_006569	CGG	2	6	191363	191368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708961
4026	NC_006569	GCGG	2	8	191469	191476	0 %	0 %	75 %	25 %	56708961
4027	NC_006569	GAT	2	6	191501	191506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708961
4028	NC_006569	GCC	2	6	191554	191559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708961
4029	NC_006569	GCC	2	6	191568	191573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708961
4030	NC_006569	GAT	2	6	191711	191716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708961
4031	NC_006569	TCT	2	6	191826	191831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708961
4032	NC_006569	CTTT	2	8	192155	192162	0 %	75 %	0 %	25 %	56708962
4033	NC_006569	TGC	2	6	192209	192214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708962
4034	NC_006569	CGG	2	6	192317	192322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708962
4035	NC_006569	GAT	2	6	192325	192330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708962
4036	NC_006569	TGGC	2	8	192353	192360	0 %	25 %	50 %	25 %	56708962
4037	NC_006569	GCG	2	6	192361	192366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708962
4038	NC_006569	CGG	2	6	192389	192394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708962
4039	NC_006569	TTC	2	6	192621	192626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708963
4040	NC_006569	CAG	2	6	192630	192635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708963
4041	NC_006569	CGG	2	6	192698	192703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708963
4042	NC_006569	CGT	2	6	192822	192827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708963
4043	NC_006569	TTGA	2	8	192871	192878	25 %	50 %	25 %	0 %	56708963
4044	NC_006569	GCA	2	6	192893	192898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708963
4045	NC_006569	ACC	2	6	193000	193005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708963
4046	NC_006569	CAC	2	6	193028	193033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708963
4047	NC_006569	CTG	2	6	193107	193112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708963
4048	NC_006569	CGC	2	6	193133	193138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708963
4049	NC_006569	GCG	3	9	193147	193155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708963
4050	NC_006569	CTT	2	6	193166	193171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708963
4051	NC_006569	AT	3	6	193186	193191	50 %	50 %	0 %	0 %	56708963
4052	NC_006569	TGC	2	6	193303	193308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_006569	ACC	2	6	193357	193362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_006569	GC	3	6	193370	193375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_006569	CGG	2	6	193403	193408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_006569	GCT	2	6	193415	193420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_006569	A	6	6	193441	193446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_006569	GCC	2	6	193503	193508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_006569	AAG	2	6	193578	193583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_006569	ACA	2	6	193708	193713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_006569	TCT	2	6	193720	193725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_006569	ACA	2	6	193804	193809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_006569	CTGC	2	8	193878	193885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_006569	TCA	2	6	193930	193935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_006569	CAG	2	6	193980	193985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_006569	CCA	2	6	194045	194050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_006569	CGAGGA	2	12	194099	194110	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4068	NC_006569	TGA	2	6	194143	194148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_006569	AGC	2	6	194155	194160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_006569	ACC	2	6	194181	194186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_006569	GC	3	6	194353	194358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_006569	GCCG	2	8	194361	194368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_006569	T	8	8	194397	194404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_006569	C	6	6	194457	194462	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4075	NC_006569	AGA	2	6	194513	194518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708964
4076	NC_006569	GCT	2	6	194526	194531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708964
4077	NC_006569	CTT	2	6	194532	194537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708964
4078	NC_006569	CTT	2	6	194578	194583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708964
4079	NC_006569	GGC	2	6	194587	194592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708964
4080	NC_006569	CTC	2	6	194728	194733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708964
4081	NC_006569	GGCA	2	8	194742	194749	25 %	0 %	50 %	25 %	56708964
4082	NC_006569	CTT	2	6	194767	194772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708964
4083	NC_006569	TCCT	2	8	194773	194780	0 %	50 %	0 %	50 %	56708964
4084	NC_006569	GC	3	6	194799	194804	0 %	0 %	50 %	50 %	56708964
4085	NC_006569	CTTT	2	8	194864	194871	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_006569	G	6	6	194874	194879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_006569	TCT	2	6	194941	194946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708965
4088	NC_006569	CAG	2	6	195145	195150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708965
4089	NC_006569	AGA	2	6	195172	195177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708965
4090	NC_006569	TCG	2	6	195198	195203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708965
4091	NC_006569	CG	6	12	195202	195213	0 %	0 %	50 %	50 %	56708965
4092	NC_006569	CA	3	6	195234	195239	50 %	0 %	0 %	50 %	56708965
4093	NC_006569	TCT	2	6	195292	195297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708965
4094	NC_006569	ACC	2	6	195347	195352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708965
4095	NC_006569	GCC	2	6	195353	195358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708965
4096	NC_006569	CGC	2	6	195371	195376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708965
4097	NC_006569	CAG	2	6	195377	195382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708965
4098	NC_006569	CCAGC	2	10	195402	195411	20 %	0 %	20 %	60 %	56708965
4099	NC_006569	CAT	2	6	195470	195475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708965
4100	NC_006569	ACC	2	6	195516	195521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708965
4101	NC_006569	CCGA	2	8	195588	195595	25 %	0 %	25 %	50 %	56708965
4102	NC_006569	CGG	2	6	195769	195774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708966
4103	NC_006569	GCA	3	9	195836	195844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708966
4104	NC_006569	CTG	2	6	195868	195873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708966
4105	NC_006569	GCA	2	6	195975	195980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708966
4106	NC_006569	GCCAGG	2	12	195990	196001	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56708966
4107	NC_006569	CAA	2	6	196024	196029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708966
4108	NC_006569	CGCC	2	8	196056	196063	0 %	0 %	25 %	75 %	56708966
4109	NC_006569	GCA	2	6	196092	196097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708966
4110	NC_006569	CAGAA	2	10	196100	196109	60 %	0 %	20 %	20 %	56708966
4111	NC_006569	CGC	2	6	196151	196156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708966
4112	NC_006569	AAAG	2	8	196267	196274	75 %	0 %	25 %	0 %	56708966
4113	NC_006569	TGC	2	6	196279	196284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708966
4114	NC_006569	AC	3	6	196289	196294	50 %	0 %	0 %	50 %	56708966
4115	NC_006569	ATG	2	6	196301	196306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708966
4116	NC_006569	CGG	2	6	196331	196336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708967
4117	NC_006569	CCG	2	6	196358	196363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708967
4118	NC_006569	CAG	2	6	196455	196460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708967
4119	NC_006569	GC	3	6	196485	196490	0 %	0 %	50 %	50 %	56708967
4120	NC_006569	GGC	2	6	196626	196631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708967
4121	NC_006569	CGC	2	6	196641	196646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708967
4122	NC_006569	ACC	2	6	196693	196698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708967
4123	NC_006569	GCG	2	6	196709	196714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708967
4124	NC_006569	TCAT	2	8	196732	196739	25 %	50 %	0 %	25 %	56708967
4125	NC_006569	GC	3	6	196794	196799	0 %	0 %	50 %	50 %	56708967
4126	NC_006569	GC	3	6	196820	196825	0 %	0 %	50 %	50 %	56708967
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4246	NC_006569	CAC	2	6	202424	202429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708974
4247	NC_006569	ATA	2	6	202442	202447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56708974
4248	NC_006569	GC	3	6	202481	202486	0 %	0 %	50 %	50 %	56708974
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4363	NC_006569	CGGA	2	8	207729	207736	25 %	0 %	50 %	25 %	56708981
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4434	NC_006569	CCCGC	2	10	210653	210662	0 %	0 %	20 %	80 %	56708983
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4497	NC_006569	GGTT	2	8	213889	213896	0 %	50 %	50 %	0 %	56708985
4498	NC_006569	GCG	2	6	214087	214092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708985
4499	NC_006569	ACA	2	6	214192	214197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708985
4500	NC_006569	CCGGG	2	10	214259	214268	0 %	0 %	60 %	40 %	56708985

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