MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 10605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006569	GCG	2	6	66151	66156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708856
1502	NC_006569	GAT	2	6	66206	66211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708856
1503	NC_006569	GCG	2	6	66246	66251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708856
1504	NC_006569	TCC	2	6	66255	66260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708856
1505	NC_006569	GC	3	6	66329	66334	0 %	0 %	50 %	50 %	56708856
1506	NC_006569	GCC	2	6	66345	66350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708856
1507	NC_006569	CCA	2	6	66448	66453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708856
1508	NC_006569	TCG	2	6	66459	66464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708856
1509	NC_006569	CG	3	6	66584	66589	0 %	0 %	50 %	50 %	56708856
1510	NC_006569	GGT	2	6	66620	66625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708856
1511	NC_006569	GC	3	6	66633	66638	0 %	0 %	50 %	50 %	56708856
1512	NC_006569	CATC	2	8	66655	66662	25 %	25 %	0 %	50 %	56708856
1513	NC_006569	CGG	2	6	66667	66672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708856
1514	NC_006569	GC	3	6	66688	66693	0 %	0 %	50 %	50 %	56708856
1515	NC_006569	ATC	2	6	66729	66734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708856
1516	NC_006569	GC	3	6	66741	66746	0 %	0 %	50 %	50 %	56708856
1517	NC_006569	GCC	2	6	66767	66772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708856
1518	NC_006569	TCAG	2	8	66777	66784	25 %	25 %	25 %	25 %	56708856
1519	NC_006569	GCG	2	6	66785	66790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708856
1520	NC_006569	GGT	2	6	66800	66805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708856
1521	NC_006569	CCGA	2	8	66854	66861	25 %	0 %	25 %	50 %	56708857
1522	NC_006569	GC	3	6	66909	66914	0 %	0 %	50 %	50 %	56708857
1523	NC_006569	GC	4	8	66963	66970	0 %	0 %	50 %	50 %	56708857
1524	NC_006569	CGCC	2	8	66993	67000	0 %	0 %	25 %	75 %	56708857
1525	NC_006569	TCC	2	6	67001	67006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708857
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1527	NC_006569	CGG	2	6	67144	67149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708857
1528	NC_006569	GCC	2	6	67187	67192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708857
1529	NC_006569	GGC	2	6	67258	67263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708857
1530	NC_006569	CCT	2	6	67323	67328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708857
1531	NC_006569	TGC	2	6	67335	67340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708857
1532	NC_006569	GCC	2	6	67349	67354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708857
1533	NC_006569	CGG	2	6	67416	67421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708857
1534	NC_006569	GCG	2	6	67438	67443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708857
1535	NC_006569	CGG	2	6	67468	67473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_006569	G	6	6	67566	67571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_006569	GCC	2	6	67613	67618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708858
1538	NC_006569	CTG	2	6	67637	67642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708858
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1540	NC_006569	GGC	2	6	67733	67738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708858
1541	NC_006569	TCGGGC	2	12	67739	67750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56708858
1542	NC_006569	TGC	2	6	67761	67766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708858
1543	NC_006569	GC	3	6	67834	67839	0 %	0 %	50 %	50 %	56708858
1544	NC_006569	CTG	2	6	67934	67939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708858
1545	NC_006569	CG	4	8	67980	67987	0 %	0 %	50 %	50 %	56708858
1546	NC_006569	GC	4	8	68003	68010	0 %	0 %	50 %	50 %	56708858
1547	NC_006569	CTG	2	6	68012	68017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708858
1548	NC_006569	GAAG	2	8	68038	68045	50 %	0 %	50 %	0 %	56708858
1549	NC_006569	GTT	2	6	68056	68061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708858
1550	NC_006569	GGT	2	6	68069	68074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708858
1551	NC_006569	CAG	3	9	68075	68083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708858
1552	NC_006569	CG	3	6	68084	68089	0 %	0 %	50 %	50 %	56708858
1553	NC_006569	CG	5	10	68095	68104	0 %	0 %	50 %	50 %	56708858
1554	NC_006569	CGG	2	6	68118	68123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708858
1555	NC_006569	GCC	2	6	68201	68206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708858
1556	NC_006569	TGG	2	6	68223	68228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708858
1557	NC_006569	ATCT	2	8	68273	68280	25 %	50 %	0 %	25 %	56708858
1558	NC_006569	GCC	2	6	68308	68313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708858
1559	NC_006569	CAA	2	6	68404	68409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_006569	GCT	2	6	68427	68432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708859
1561	NC_006569	GCC	2	6	68473	68478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708859
1562	NC_006569	GGC	2	6	68589	68594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708859
1563	NC_006569	CAT	2	6	68634	68639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708859
1564	NC_006569	CAT	2	6	68670	68675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708859
1565	NC_006569	ACA	2	6	68735	68740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708859
1566	NC_006569	CGCC	2	8	68786	68793	0 %	0 %	25 %	75 %	56708859
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1574	NC_006569	CG	3	6	69144	69149	0 %	0 %	50 %	50 %	56708859
1575	NC_006569	CGC	2	6	69156	69161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708859
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1580	NC_006569	CTTCGG	2	12	69315	69326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708860
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1582	NC_006569	ACC	2	6	69403	69408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708860
1583	NC_006569	TCG	2	6	69455	69460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708860
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1585	NC_006569	GCG	2	6	69518	69523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708860
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1591	NC_006569	GCC	2	6	69642	69647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708860
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1608	NC_006569	GGTC	2	8	70258	70265	0 %	25 %	50 %	25 %	56708861
1609	NC_006569	GCT	2	6	70334	70339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708861
1610	NC_006569	GGC	2	6	70421	70426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708861
1611	NC_006569	GC	3	6	70425	70430	0 %	0 %	50 %	50 %	56708861
1612	NC_006569	CCG	2	6	70460	70465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708861
1613	NC_006569	CAA	2	6	70487	70492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708861
1614	NC_006569	TGC	2	6	70495	70500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708861
1615	NC_006569	G	6	6	70508	70513	0 %	0 %	100 %	0 %	56708861
1616	NC_006569	CGC	2	6	70540	70545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708861
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1621	NC_006569	CGG	2	6	70710	70715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708861
1622	NC_006569	GGC	2	6	70719	70724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708861
1623	NC_006569	TC	3	6	70816	70821	0 %	50 %	0 %	50 %	56708862
1624	NC_006569	GGA	2	6	70904	70909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708862
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1626	NC_006569	GAC	2	6	70935	70940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708862
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1628	NC_006569	GGT	2	6	71069	71074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708862
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