MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 10605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006569	CCAT	2	8	43152	43159	25 %	25 %	0 %	50 %	56708839
1002	NC_006569	CGC	2	6	43165	43170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708839
1003	NC_006569	TGG	2	6	43206	43211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708839
1004	NC_006569	TGG	2	6	43257	43262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708839
1005	NC_006569	CGG	2	6	43312	43317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708839
1006	NC_006569	ATC	2	6	43337	43342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708839
1007	NC_006569	CAT	2	6	43360	43365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708839
1008	NC_006569	CGA	2	6	43372	43377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1009	NC_006569	GC	3	6	43387	43392	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
1010	NC_006569	CG	3	6	43409	43414	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
1011	NC_006569	GGC	2	6	43424	43429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708839
1012	NC_006569	CGCC	2	8	43434	43441	0 %	0 %	25 %	75 %	56708839
1013	NC_006569	CGG	2	6	43526	43531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708839
1014	NC_006569	CGA	2	6	43579	43584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1015	NC_006569	CGG	2	6	43595	43600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708839
1016	NC_006569	GC	3	6	43611	43616	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
1017	NC_006569	CTG	2	6	43679	43684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1018	NC_006569	GCG	2	6	43755	43760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708839
1019	NC_006569	GCG	2	6	43791	43796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708839
1020	NC_006569	GCGGT	2	10	43835	43844	0 %	20 %	60 %	20 %	56708839
1021	NC_006569	CGC	2	6	43862	43867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708839
1022	NC_006569	GCG	2	6	43880	43885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708839
1023	NC_006569	CCG	2	6	43929	43934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708839
1024	NC_006569	GCC	2	6	43952	43957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708839
1025	NC_006569	CTG	2	6	43973	43978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1026	NC_006569	GC	3	6	43984	43989	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
1027	NC_006569	CTG	2	6	44054	44059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1028	NC_006569	GCC	2	6	44066	44071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708839
1029	NC_006569	CGG	2	6	44073	44078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708839
1030	NC_006569	CGA	2	6	44095	44100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1031	NC_006569	GCC	3	9	44102	44110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708839
1032	NC_006569	TGC	2	6	44175	44180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1033	NC_006569	CTT	3	9	44197	44205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708839
1034	NC_006569	CG	4	8	44227	44234	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
1035	NC_006569	TCT	2	6	44235	44240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708839
1036	NC_006569	TTC	2	6	44276	44281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708839
1037	NC_006569	CGT	2	6	44311	44316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1038	NC_006569	GCC	2	6	44411	44416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708839
1039	NC_006569	TCT	2	6	44424	44429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708839
1040	NC_006569	GGGGC	2	10	44431	44440	0 %	0 %	80 %	20 %	56708839
1041	NC_006569	GGCT	2	8	44450	44457	0 %	25 %	50 %	25 %	56708839
1042	NC_006569	CAA	2	6	44488	44493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708839
1043	NC_006569	ATC	2	6	44657	44662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708839
1044	NC_006569	GTG	2	6	44690	44695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708839
1045	NC_006569	GCT	3	9	44701	44709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1046	NC_006569	CCCG	2	8	44783	44790	0 %	0 %	25 %	75 %	56708839
1047	NC_006569	CGAA	2	8	44901	44908	50 %	0 %	25 %	25 %	56708839
1048	NC_006569	CCTG	2	8	44916	44923	0 %	25 %	25 %	50 %	56708839
1049	NC_006569	CGT	2	6	44962	44967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708839
1050	NC_006569	GCG	2	6	44983	44988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708839
1051	NC_006569	GC	3	6	44990	44995	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
1052	NC_006569	AAG	2	6	45063	45068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708839
1053	NC_006569	AGG	2	6	45078	45083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_006569	AAC	2	6	45106	45111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708840
1055	NC_006569	CGC	2	6	45124	45129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708840
1056	NC_006569	CTG	2	6	45133	45138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708840
1057	NC_006569	TGA	2	6	45191	45196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708840
1058	NC_006569	CG	4	8	45198	45205	0 %	0 %	50 %	50 %	56708840
1059	NC_006569	CCG	3	9	45212	45220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708840
1060	NC_006569	GCT	2	6	45350	45355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708840
1061	NC_006569	CAC	2	6	45475	45480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708840
1062	NC_006569	TGA	2	6	45575	45580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708840
1063	NC_006569	ATC	2	6	45592	45597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708840
1064	NC_006569	GAT	2	6	45715	45720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708840
1065	NC_006569	ACA	2	6	45806	45811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708840
1066	NC_006569	CGG	2	6	45950	45955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708840
1067	NC_006569	GTC	2	6	45985	45990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708840
1068	NC_006569	CAA	2	6	46011	46016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708840
1069	NC_006569	CGC	2	6	46062	46067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708840
1070	NC_006569	CAT	2	6	46083	46088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708840
1071	NC_006569	ACA	2	6	46229	46234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708840
1072	NC_006569	ACC	2	6	46249	46254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708840
1073	NC_006569	GGT	2	6	46272	46277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708840
1074	NC_006569	CCG	2	6	46394	46399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708840
1075	NC_006569	AGC	2	6	46484	46489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708840
1076	NC_006569	GGT	2	6	46518	46523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708840
1077	NC_006569	CAT	2	6	46560	46565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708840
1078	NC_006569	CGCC	2	8	46629	46636	0 %	0 %	25 %	75 %	56708840
1079	NC_006569	GCC	3	9	46642	46650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708840
1080	NC_006569	GGA	2	6	46665	46670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708840
1081	NC_006569	CAA	2	6	46698	46703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708840
1082	NC_006569	CGA	2	6	46770	46775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708840
1083	NC_006569	CGA	2	6	46800	46805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708840
1084	NC_006569	GAT	2	6	46810	46815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708840
1085	NC_006569	CTG	2	6	47014	47019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1086	NC_006569	GCG	2	6	47050	47055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708841
1087	NC_006569	CGGG	2	8	47074	47081	0 %	0 %	75 %	25 %	56708841
1088	NC_006569	GGC	2	6	47106	47111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708841
1089	NC_006569	CCA	2	6	47201	47206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708841
1090	NC_006569	CGGCTC	2	12	47280	47291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56708841
1091	NC_006569	CCGC	2	8	47333	47340	0 %	0 %	25 %	75 %	56708841
1092	NC_006569	GGT	2	6	47346	47351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708841
1093	NC_006569	AAC	2	6	47356	47361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708841
1094	NC_006569	CCG	2	6	47448	47453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708841
1095	NC_006569	CG	4	8	47460	47467	0 %	0 %	50 %	50 %	56708841
1096	NC_006569	GTT	2	6	47503	47508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708841
1097	NC_006569	CTC	2	6	47553	47558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708841
1098	NC_006569	GGT	2	6	47703	47708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708841
1099	NC_006569	CAA	2	6	47829	47834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708841
1100	NC_006569	CAA	2	6	47847	47852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708841
1101	NC_006569	CGGCAT	2	12	47868	47879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1102	NC_006569	CCG	2	6	47888	47893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708841
1103	NC_006569	TCG	2	6	47912	47917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1104	NC_006569	CGG	2	6	48101	48106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708841
1105	NC_006569	TGC	2	6	48113	48118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1106	NC_006569	CCG	2	6	48128	48133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708841
1107	NC_006569	GCT	2	6	48138	48143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708841
1108	NC_006569	CGG	2	6	48180	48185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708841
1109	NC_006569	GACC	2	8	48294	48301	25 %	0 %	25 %	50 %	56708842
1110	NC_006569	GCT	2	6	48352	48357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1111	NC_006569	ATCC	2	8	48394	48401	25 %	25 %	0 %	50 %	56708842
1112	NC_006569	GCA	2	6	48426	48431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1113	NC_006569	AGC	2	6	48531	48536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1114	NC_006569	CGCC	2	8	48547	48554	0 %	0 %	25 %	75 %	56708842
1115	NC_006569	CCG	2	6	48619	48624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708842
1116	NC_006569	TGC	2	6	48675	48680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1117	NC_006569	GCT	2	6	48700	48705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1118	NC_006569	CGA	2	6	48714	48719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1119	NC_006569	CAT	2	6	48757	48762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708842
1120	NC_006569	CGA	2	6	48763	48768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1121	NC_006569	GCG	2	6	48785	48790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708842
1122	NC_006569	GCCA	2	8	48800	48807	25 %	0 %	25 %	50 %	56708842
1123	NC_006569	ACCG	2	8	48833	48840	25 %	0 %	25 %	50 %	56708842
1124	NC_006569	GAC	2	6	48875	48880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1125	NC_006569	AC	3	6	48879	48884	50 %	0 %	0 %	50 %	56708842
1126	NC_006569	GC	3	6	48935	48940	0 %	0 %	50 %	50 %	56708842
1127	NC_006569	GCC	2	6	48959	48964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708842
1128	NC_006569	GGC	2	6	48971	48976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708842
1129	NC_006569	GCT	2	6	49003	49008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1130	NC_006569	CCG	2	6	49017	49022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708842
1131	NC_006569	GCA	2	6	49041	49046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708842
1132	NC_006569	CGC	2	6	49048	49053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708842
1133	NC_006569	TGTCGA	2	12	49069	49080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56708842
1134	NC_006569	CCCCG	2	10	49086	49095	0 %	0 %	20 %	80 %	56708842
1135	NC_006569	GGA	2	6	49099	49104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708842
1136	NC_006569	GCTG	2	8	49193	49200	0 %	25 %	50 %	25 %	56708843
1137	NC_006569	GC	3	6	49256	49261	0 %	0 %	50 %	50 %	56708843
1138	NC_006569	TGA	2	6	49349	49354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708843
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1140	NC_006569	CTG	3	9	49402	49410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
1141	NC_006569	CGG	2	6	49418	49423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708843
1142	NC_006569	CTG	2	6	49438	49443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
1143	NC_006569	CGC	2	6	49452	49457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708843
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1146	NC_006569	GCC	2	6	49594	49599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708843
1147	NC_006569	CTG	2	6	49618	49623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
1148	NC_006569	CGG	3	9	49649	49657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708843
1149	NC_006569	CTGG	2	8	49674	49681	0 %	25 %	50 %	25 %	56708843
1150	NC_006569	GTC	2	6	49687	49692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
1151	NC_006569	GGC	2	6	49735	49740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708843
1152	NC_006569	TGG	2	6	49772	49777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708843
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1155	NC_006569	GCT	2	6	49893	49898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708843
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1168	NC_006569	GGCG	2	8	50309	50316	0 %	0 %	75 %	25 %	56708844
1169	NC_006569	GC	3	6	50323	50328	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
1170	NC_006569	GCC	2	6	50358	50363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708844
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1182	NC_006569	CGG	2	6	50910	50915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1193	NC_006569	TTG	2	6	51609	51614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1196	NC_006569	G	6	6	51693	51698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1198	NC_006569	GCCCC	2	10	51753	51762	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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1229	NC_006569	CGG	2	6	53521	53526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1230	NC_006569	CACC	2	8	53527	53534	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1231	NC_006569	CCG	2	6	53600	53605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708849
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1233	NC_006569	GCC	2	6	53693	53698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708849
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1239	NC_006569	CCG	2	6	54244	54249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708849
1240	NC_006569	CGCCAT	2	12	54275	54286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56708849
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1244	NC_006569	GCCGG	2	10	54446	54455	0 %	0 %	60 %	40 %	56708849
1245	NC_006569	ATC	2	6	54456	54461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708849
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1247	NC_006569	CAA	2	6	54485	54490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708849
1248	NC_006569	CCG	2	6	54530	54535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708849
1249	NC_006569	GCT	2	6	54572	54577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708849
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1251	NC_006569	GAG	2	6	54681	54686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708849
1252	NC_006569	GCC	2	6	54768	54773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708849
1253	NC_006569	GTG	2	6	54781	54786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708849
1254	NC_006569	AAG	2	6	54888	54893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708849
1255	NC_006569	CCCAT	2	10	54961	54970	20 %	20 %	0 %	60 %	56708849
1256	NC_006569	GCCGAG	2	12	54987	54998	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56708849
1257	NC_006569	GCG	2	6	55013	55018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708849
1258	NC_006569	GAT	2	6	55052	55057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708849
1259	NC_006569	CCA	2	6	55090	55095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708849
1260	NC_006569	GAT	2	6	55100	55105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708849
1261	NC_006569	GAT	2	6	55178	55183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708849
1262	NC_006569	CGA	2	6	55184	55189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708849
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1264	NC_006569	TGA	2	6	55276	55281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708849
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1292	NC_006569	CAT	2	6	56524	56529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1294	NC_006569	CGG	2	6	56553	56558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1295	NC_006569	GGC	2	6	56638	56643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708850
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1313	NC_006569	ACGAA	2	10	57434	57443	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1314	NC_006569	GGC	2	6	57449	57454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1323	NC_006569	TCTGC	2	10	57975	57984	0 %	40 %	20 %	40 %	56708851
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1333	NC_006569	GC	4	8	58417	58424	0 %	0 %	50 %	50 %	56708851
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1365	NC_006569	GCA	2	6	59720	59725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1366	NC_006569	AGAA	2	8	59728	59735	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1367	NC_006569	CGG	2	6	59909	59914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708852
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1371	NC_006569	CG	3	6	60017	60022	0 %	0 %	50 %	50 %	56708852
1372	NC_006569	GGC	2	6	60023	60028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708852
1373	NC_006569	CGCC	2	8	60136	60143	0 %	0 %	25 %	75 %	56708852
1374	NC_006569	CGG	2	6	60151	60156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708852
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1376	NC_006569	CCG	2	6	60250	60255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708852
1377	NC_006569	CGGTGC	2	12	60364	60375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56708852
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1380	NC_006569	CG	3	6	60455	60460	0 %	0 %	50 %	50 %	56708852
1381	NC_006569	CAG	2	6	60470	60475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708852
1382	NC_006569	GCA	2	6	60484	60489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708852
1383	NC_006569	TCG	2	6	60493	60498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708852
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1385	NC_006569	CCGG	2	8	60553	60560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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