MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 10605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006569	TG	3	6	21100	21105	0 %	50 %	50 %	0 %	56708814
502	NC_006569	CTG	2	6	21116	21121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708814
503	NC_006569	CGT	2	6	21133	21138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708814
504	NC_006569	ACA	2	6	21166	21171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708814
505	NC_006569	GGC	2	6	21181	21186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708814
506	NC_006569	GGCG	2	8	21208	21215	0 %	0 %	75 %	25 %	56708814
507	NC_006569	TCC	2	6	21251	21256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708815
508	NC_006569	ACCTCG	2	12	21287	21298	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56708815
509	NC_006569	CGG	2	6	21325	21330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708815
510	NC_006569	GAT	2	6	21370	21375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708815
511	NC_006569	GTG	2	6	21392	21397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708815
512	NC_006569	GTG	2	6	21485	21490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708815
513	NC_006569	CCGCG	2	10	21493	21502	0 %	0 %	40 %	60 %	56708815
514	NC_006569	CTTGC	2	10	21568	21577	0 %	40 %	20 %	40 %	56708815
515	NC_006569	C	6	6	21683	21688	0 %	0 %	0 %	100 %	56708815
516	NC_006569	CAC	2	6	21697	21702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708815
517	NC_006569	CGGG	2	8	21738	21745	0 %	0 %	75 %	25 %	56708815
518	NC_006569	GAT	2	6	21871	21876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708815
519	NC_006569	CGG	2	6	21895	21900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708815
520	NC_006569	CGC	2	6	21940	21945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708815
521	NC_006569	CCGC	2	8	21965	21972	0 %	0 %	25 %	75 %	56708815
522	NC_006569	CG	3	6	21982	21987	0 %	0 %	50 %	50 %	56708815
523	NC_006569	GAT	2	6	22042	22047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708815
524	NC_006569	CGG	2	6	22068	22073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708815
525	NC_006569	TGG	2	6	22077	22082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708815
526	NC_006569	CAC	2	6	22176	22181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708816
527	NC_006569	CGC	2	6	22253	22258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708816
528	NC_006569	CGC	2	6	22307	22312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708816
529	NC_006569	GTT	2	6	22380	22385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708816
530	NC_006569	GGC	2	6	22386	22391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708816
531	NC_006569	TTG	2	6	22399	22404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708816
532	NC_006569	TTGCTG	2	12	22450	22461	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56708816
533	NC_006569	CGCGG	2	10	22470	22479	0 %	0 %	60 %	40 %	56708816
534	NC_006569	TCGCC	2	10	22481	22490	0 %	20 %	20 %	60 %	56708816
535	NC_006569	GCG	2	6	22531	22536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708816
536	NC_006569	ACC	2	6	22543	22548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708816
537	NC_006569	TTCCAG	2	12	22599	22610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56708816
538	NC_006569	CG	4	8	22643	22650	0 %	0 %	50 %	50 %	56708816
539	NC_006569	TCATAG	2	12	22693	22704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56708816
540	NC_006569	CAC	2	6	22815	22820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708816
541	NC_006569	GC	3	6	22835	22840	0 %	0 %	50 %	50 %	56708816
542	NC_006569	GCG	2	6	22845	22850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708816
543	NC_006569	GCC	2	6	22876	22881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708816
544	NC_006569	CCT	2	6	22904	22909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708816
545	NC_006569	GGC	2	6	22947	22952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708816
546	NC_006569	TTTC	2	8	22970	22977	0 %	75 %	0 %	25 %	56708816
547	NC_006569	CG	3	6	22995	23000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_006569	GGTG	2	8	23007	23014	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
549	NC_006569	CGC	2	6	23100	23105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
550	NC_006569	ATC	2	6	23183	23188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708817
551	NC_006569	GC	4	8	23217	23224	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
552	NC_006569	CTT	2	6	23292	23297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708817
553	NC_006569	CG	4	8	23343	23350	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
554	NC_006569	GTT	2	6	23362	23367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708817
555	NC_006569	CAC	2	6	23413	23418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708817
556	NC_006569	CCGC	2	8	23423	23430	0 %	0 %	25 %	75 %	56708817
557	NC_006569	GC	3	6	23452	23457	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
558	NC_006569	CTC	2	6	23491	23496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708817
559	NC_006569	TGT	2	6	23550	23555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708817
560	NC_006569	CAAG	2	8	23607	23614	50 %	0 %	25 %	25 %	56708817
561	NC_006569	GAG	2	6	23618	23623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708817
562	NC_006569	TTGA	2	8	23642	23649	25 %	50 %	25 %	0 %	56708817
563	NC_006569	GC	4	8	23676	23683	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
564	NC_006569	TCG	2	6	23696	23701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708817
565	NC_006569	GCC	2	6	23722	23727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
566	NC_006569	G	6	6	23887	23892	0 %	0 %	100 %	0 %	56708817
567	NC_006569	CG	3	6	23927	23932	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
568	NC_006569	CGG	2	6	23949	23954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708817
569	NC_006569	CAC	2	6	23962	23967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708817
570	NC_006569	CGG	2	6	23976	23981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708817
571	NC_006569	GTG	2	6	24068	24073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708817
572	NC_006569	TCA	2	6	24078	24083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708817
573	NC_006569	TGC	2	6	24101	24106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708817
574	NC_006569	CG	3	6	24111	24116	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
575	NC_006569	CAC	2	6	24121	24126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708817
576	NC_006569	GCC	2	6	24167	24172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
577	NC_006569	CA	3	6	24213	24218	50 %	0 %	0 %	50 %	56708817
578	NC_006569	GC	3	6	24272	24277	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
579	NC_006569	GCC	2	6	24332	24337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
580	NC_006569	CGC	2	6	24357	24362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
581	NC_006569	GC	3	6	24361	24366	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
582	NC_006569	GA	3	6	24396	24401	50 %	0 %	50 %	0 %	56708817
583	NC_006569	CGC	2	6	24420	24425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708817
584	NC_006569	TCA	2	6	24453	24458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708817
585	NC_006569	TTA	2	6	24545	24550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_006569	TAAA	2	8	24563	24570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_006569	ATG	2	6	24571	24576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_006569	CTGCG	2	10	24610	24619	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
589	NC_006569	CCGC	2	8	24626	24633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
590	NC_006569	GCA	2	6	24640	24645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_006569	GT	3	6	24720	24725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_006569	CGC	2	6	24733	24738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_006569	C	6	6	24738	24743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
594	NC_006569	GC	3	6	24756	24761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_006569	TAGG	2	8	24849	24856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_006569	CCCGG	2	10	24967	24976	0 %	0 %	40 %	60 %	56708818
597	NC_006569	CGA	2	6	25047	25052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708818
598	NC_006569	CGC	2	6	25067	25072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
599	NC_006569	GAT	2	6	25101	25106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708818
600	NC_006569	CGC	2	6	25131	25136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
601	NC_006569	GC	4	8	25148	25155	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
602	NC_006569	GTG	2	6	25171	25176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708818
603	NC_006569	GCC	2	6	25192	25197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
604	NC_006569	CCA	2	6	25217	25222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708818
605	NC_006569	GCC	2	6	25267	25272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
606	NC_006569	TGCCGG	2	12	25313	25324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56708818
607	NC_006569	GCC	2	6	25375	25380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
608	NC_006569	GCC	2	6	25384	25389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
609	NC_006569	CAT	2	6	25392	25397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708818
610	NC_006569	GGC	2	6	25431	25436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708818
611	NC_006569	GCT	2	6	25443	25448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708818
612	NC_006569	GCGAT	2	10	25484	25493	20 %	20 %	40 %	20 %	56708818
613	NC_006569	GCG	2	6	25499	25504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708818
614	NC_006569	GGCG	2	8	25509	25516	0 %	0 %	75 %	25 %	56708818
615	NC_006569	GTCG	2	8	25518	25525	0 %	25 %	50 %	25 %	56708818
616	NC_006569	CGG	2	6	25547	25552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708818
617	NC_006569	CTGG	2	8	25555	25562	0 %	25 %	50 %	25 %	56708818
618	NC_006569	GCT	2	6	25647	25652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708818
619	NC_006569	CGC	2	6	25701	25706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
620	NC_006569	GC	3	6	25705	25710	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
621	NC_006569	CAT	2	6	25731	25736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708818
622	NC_006569	ACC	2	6	25759	25764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708818
623	NC_006569	GATC	2	8	25805	25812	25 %	25 %	25 %	25 %	56708818
624	NC_006569	GCGG	2	8	25817	25824	0 %	0 %	75 %	25 %	56708818
625	NC_006569	AGC	2	6	25895	25900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708818
626	NC_006569	GCC	2	6	26009	26014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708818
627	NC_006569	GC	4	8	26082	26089	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
628	NC_006569	GC	3	6	26126	26131	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
629	NC_006569	AATACG	2	12	26183	26194	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56708818
630	NC_006569	AGG	2	6	26231	26236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708818
631	NC_006569	CTT	2	6	26260	26265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56708819
632	NC_006569	GGC	2	6	26294	26299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708819
633	NC_006569	GAC	2	6	26365	26370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708819
634	NC_006569	GGC	2	6	26371	26376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708819
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641	NC_006569	GGC	2	6	26807	26812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708819
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646	NC_006569	GCCT	2	8	27047	27054	0 %	25 %	25 %	50 %	56708819
647	NC_006569	TGA	2	6	27075	27080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708819
648	NC_006569	GCA	2	6	27111	27116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708819
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652	NC_006569	GCCA	2	8	27260	27267	25 %	0 %	25 %	50 %	56708819
653	NC_006569	GC	3	6	27294	27299	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
654	NC_006569	TGG	2	6	27312	27317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708819
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661	NC_006569	GTCT	2	8	27537	27544	0 %	50 %	25 %	25 %	56708820
662	NC_006569	GAT	2	6	27554	27559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708820
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664	NC_006569	CAA	2	6	27602	27607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708820
665	NC_006569	GCC	3	9	27765	27773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708820
666	NC_006569	CG	3	6	27792	27797	0 %	0 %	50 %	50 %	56708820
667	NC_006569	GAC	2	6	27804	27809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708820
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672	NC_006569	CGC	2	6	28109	28114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708820
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674	NC_006569	GA	3	6	28240	28245	50 %	0 %	50 %	0 %	56708820
675	NC_006569	AAGA	2	8	28262	28269	75 %	0 %	25 %	0 %	56708821
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682	NC_006569	ATC	2	6	28565	28570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708821
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700	NC_006569	CGA	2	6	29330	29335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708822
701	NC_006569	GGCG	2	8	29385	29392	0 %	0 %	75 %	25 %	56708822
702	NC_006569	GATGGC	2	12	29469	29480	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56708822
703	NC_006569	CGT	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708823
704	NC_006569	TGATCG	2	12	29561	29572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56708823
705	NC_006569	CCG	2	6	29666	29671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708823
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709	NC_006569	G	6	6	29772	29777	0 %	0 %	100 %	0 %	56708823
710	NC_006569	CCGA	2	8	29791	29798	25 %	0 %	25 %	50 %	56708823
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712	NC_006569	CCTGT	2	10	29841	29850	0 %	40 %	20 %	40 %	56708823
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715	NC_006569	GAAC	2	8	30129	30136	50 %	0 %	25 %	25 %	56708823
716	NC_006569	GAG	2	6	30172	30177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56708823
717	NC_006569	CAT	3	9	30183	30191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708823
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719	NC_006569	GCA	2	6	30224	30229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708823
720	NC_006569	CCGG	2	8	30238	30245	0 %	0 %	50 %	50 %	56708823
721	NC_006569	GTC	2	6	30252	30257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708823
722	NC_006569	CGG	2	6	30354	30359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708823
723	NC_006569	GC	4	8	30446	30453	0 %	0 %	50 %	50 %	56708823
724	NC_006569	GAA	2	6	30456	30461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56708823
725	NC_006569	GCTG	2	8	30492	30499	0 %	25 %	50 %	25 %	56708823
726	NC_006569	TG	3	6	30647	30652	0 %	50 %	50 %	0 %	56708823
727	NC_006569	CCG	2	6	30655	30660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708823
728	NC_006569	TGC	2	6	30686	30691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708823
729	NC_006569	CAT	2	6	30717	30722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708823
730	NC_006569	CGA	2	6	30726	30731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708823
731	NC_006569	ATT	2	6	30797	30802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
732	NC_006569	AAT	2	6	30808	30813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
733	NC_006569	CGA	2	6	30864	30869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708824
734	NC_006569	CAC	2	6	30922	30927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708824
735	NC_006569	CAC	2	6	31012	31017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708824
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737	NC_006569	GC	3	6	31035	31040	0 %	0 %	50 %	50 %	56708824
738	NC_006569	CG	4	8	31051	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	56708824
739	NC_006569	TCA	2	6	31059	31064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708824
740	NC_006569	CTG	2	6	31075	31080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708824
741	NC_006569	GCG	2	6	31111	31116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708824
742	NC_006569	CAG	2	6	31144	31149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708824
743	NC_006569	CGA	2	6	31206	31211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708824
744	NC_006569	GCC	2	6	31261	31266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708824
745	NC_006569	GTC	2	6	31328	31333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708824
746	NC_006569	TGCT	2	8	31397	31404	0 %	50 %	25 %	25 %	56708825
747	NC_006569	GCCC	2	8	31483	31490	0 %	0 %	25 %	75 %	56708825
748	NC_006569	GCG	2	6	31524	31529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708825
749	NC_006569	GTC	3	9	31545	31553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708825
750	NC_006569	CGCGC	2	10	31595	31604	0 %	0 %	40 %	60 %	56708825
751	NC_006569	CGG	2	6	31630	31635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708825
752	NC_006569	CCG	2	6	31692	31697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708826
753	NC_006569	CGC	2	6	31698	31703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708826
754	NC_006569	GCA	2	6	31715	31720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708826
755	NC_006569	GGT	2	6	31811	31816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708826
756	NC_006569	CT	3	6	31821	31826	0 %	50 %	0 %	50 %	56708826
757	NC_006569	ATCAC	2	10	31849	31858	40 %	20 %	0 %	40 %	56708826
758	NC_006569	GCC	2	6	31917	31922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708826
759	NC_006569	GCC	2	6	32034	32039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708826
760	NC_006569	G	6	6	32060	32065	0 %	0 %	100 %	0 %	56708826
761	NC_006569	GATCC	2	10	32130	32139	20 %	20 %	20 %	40 %	56708826
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