MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 10605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006569	AAC	2	6	214287	214292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708985
4502	NC_006569	AC	3	6	214291	214296	50 %	0 %	0 %	50 %	56708985
4503	NC_006569	GCCG	2	8	214302	214309	0 %	0 %	50 %	50 %	56708985
4504	NC_006569	CAT	2	6	214340	214345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708985
4505	NC_006569	GCC	2	6	214424	214429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_006569	ATAA	2	8	214455	214462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_006569	TTA	2	6	214465	214470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_006569	AGC	2	6	214488	214493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_006569	GC	3	6	214492	214497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_006569	GCC	2	6	214504	214509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_006569	TCA	2	6	214537	214542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_006569	GCG	2	6	214597	214602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_006569	GGAGAA	2	12	214665	214676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_006569	GC	3	6	214771	214776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_006569	GGCG	2	8	214906	214913	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_006569	GCC	2	6	214969	214974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708986
4517	NC_006569	CCT	2	6	215003	215008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708986
4518	NC_006569	GGT	2	6	215045	215050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708986
4519	NC_006569	ATC	2	6	215058	215063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708986
4520	NC_006569	GC	3	6	215072	215077	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4521	NC_006569	GCG	2	6	215088	215093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4522	NC_006569	GCCC	2	8	215189	215196	0 %	0 %	25 %	75 %	56708986
4523	NC_006569	CGCGC	2	10	215202	215211	0 %	0 %	40 %	60 %	56708986
4524	NC_006569	GCC	2	6	215220	215225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708986
4525	NC_006569	GC	3	6	215226	215231	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4526	NC_006569	GC	3	6	215290	215295	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4527	NC_006569	GGCTG	2	10	215296	215305	0 %	20 %	60 %	20 %	56708986
4528	NC_006569	CGG	2	6	215314	215319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4529	NC_006569	CGG	3	9	215323	215331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4530	NC_006569	CCT	2	6	215356	215361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708986
4531	NC_006569	CTC	2	6	215366	215371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708986
4532	NC_006569	TGA	2	6	215377	215382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708986
4533	NC_006569	GGCG	2	8	215402	215409	0 %	0 %	75 %	25 %	56708986
4534	NC_006569	GTC	2	6	215413	215418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708986
4535	NC_006569	TGC	2	6	215464	215469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708986
4536	NC_006569	CGG	2	6	215510	215515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4537	NC_006569	TTG	2	6	215596	215601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708986
4538	NC_006569	CGA	2	6	215765	215770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708986
4539	NC_006569	GCC	2	6	215772	215777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708986
4540	NC_006569	GGCCG	2	10	215781	215790	0 %	0 %	60 %	40 %	56708986
4541	NC_006569	CGC	2	6	215829	215834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708986
4542	NC_006569	TCA	2	6	215872	215877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708986
4543	NC_006569	GCG	3	9	215898	215906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4544	NC_006569	GGC	2	6	215966	215971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4545	NC_006569	CGG	2	6	216038	216043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4546	NC_006569	TGC	2	6	216055	216060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708986
4547	NC_006569	CG	3	6	216065	216070	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4548	NC_006569	CAC	2	6	216119	216124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708986
4549	NC_006569	GC	3	6	216152	216157	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4550	NC_006569	CGG	3	9	216166	216174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708986
4551	NC_006569	GC	3	6	216183	216188	0 %	0 %	50 %	50 %	56708986
4552	NC_006569	CG	3	6	216320	216325	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4553	NC_006569	CGC	2	6	216367	216372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708987
4554	NC_006569	CAC	2	6	216494	216499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56708987
4555	NC_006569	CTC	2	6	216512	216517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708987
4556	NC_006569	GGGT	2	8	216533	216540	0 %	25 %	75 %	0 %	56708987
4557	NC_006569	GC	3	6	216676	216681	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4558	NC_006569	GCC	2	6	216703	216708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708987
4559	NC_006569	GGC	2	6	216722	216727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708987
4560	NC_006569	TCC	3	9	216747	216755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56708987
4561	NC_006569	GCCC	2	8	216765	216772	0 %	0 %	25 %	75 %	56708987
4562	NC_006569	CGC	2	6	216773	216778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708987
4563	NC_006569	CCCCG	2	10	216831	216840	0 %	0 %	20 %	80 %	56708987
4564	NC_006569	ATCGG	2	10	216963	216972	20 %	20 %	40 %	20 %	56708987
4565	NC_006569	GC	3	6	217008	217013	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4566	NC_006569	TGA	2	6	217014	217019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56708987
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4569	NC_006569	TTG	2	6	217161	217166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56708987
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4571	NC_006569	GC	3	6	217239	217244	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4572	NC_006569	CG	3	6	217252	217257	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4573	NC_006569	GGT	2	6	217364	217369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56708987
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4580	NC_006569	GGCG	2	8	217672	217679	0 %	0 %	75 %	25 %	56708987
4581	NC_006569	CGGG	2	8	217696	217703	0 %	0 %	75 %	25 %	56708987
4582	NC_006569	CG	4	8	217720	217727	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4583	NC_006569	CGG	3	9	217780	217788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708987
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4589	NC_006569	ATTC	2	8	217894	217901	25 %	50 %	0 %	25 %	56708987
4590	NC_006569	GCCCT	2	10	217926	217935	0 %	20 %	20 %	60 %	56708987
4591	NC_006569	GCA	2	6	218014	218019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56708987
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4593	NC_006569	GGCCCC	2	12	218114	218125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708987
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4595	NC_006569	GGC	2	6	218224	218229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708987
4596	NC_006569	GCG	2	6	218237	218242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56708987
4597	NC_006569	TCG	2	6	218250	218255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708987
4598	NC_006569	GC	3	6	218335	218340	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4599	NC_006569	GTC	2	6	218396	218401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56708987
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4605	NC_006569	GGTC	2	8	218662	218669	0 %	25 %	50 %	25 %	56708987
4606	NC_006569	ACA	2	6	218674	218679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708987
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4610	NC_006569	GC	3	6	218794	218799	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4611	NC_006569	CGC	2	6	218853	218858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708987
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4623	NC_006569	CG	3	6	219334	219339	0 %	0 %	50 %	50 %	56708987
4624	NC_006569	G	6	6	219367	219372	0 %	0 %	100 %	0 %	56708987
4625	NC_006569	CGC	2	6	219406	219411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56708987
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