MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 30258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006142	CTA	2	6	109896	109901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473295
3002	NC_006142	AAT	2	6	109906	109911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473295
3003	NC_006142	TTAT	2	8	109921	109928	25 %	75 %	0 %	0 %	51473295
3004	NC_006142	T	6	6	109951	109956	0 %	100 %	0 %	0 %	51473295
3005	NC_006142	ATA	2	6	109970	109975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473295
3006	NC_006142	TGT	2	6	109981	109986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473295
3007	NC_006142	ATT	2	6	109996	110001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473295
3008	NC_006142	TTA	2	6	110022	110027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473295
3009	NC_006142	T	7	7	110125	110131	0 %	100 %	0 %	0 %	51473295
3010	NC_006142	ATT	2	6	110143	110148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473295
3011	NC_006142	AT	3	6	110213	110218	50 %	50 %	0 %	0 %	51473295
3012	NC_006142	AAT	2	6	110242	110247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473295
3013	NC_006142	AG	3	6	110261	110266	50 %	0 %	50 %	0 %	51473295
3014	NC_006142	TTTTA	2	10	110284	110293	20 %	80 %	0 %	0 %	51473295
3015	NC_006142	AATT	2	8	110381	110388	50 %	50 %	0 %	0 %	51473296
3016	NC_006142	TAT	2	6	110455	110460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473296
3017	NC_006142	ATT	2	6	110533	110538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473296
3018	NC_006142	AG	3	6	110554	110559	50 %	0 %	50 %	0 %	51473296
3019	NC_006142	TTAGT	2	10	110588	110597	20 %	60 %	20 %	0 %	51473296
3020	NC_006142	TAC	2	6	110636	110641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473296
3021	NC_006142	CT	3	6	110673	110678	0 %	50 %	0 %	50 %	51473296
3022	NC_006142	TAA	2	6	110700	110705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473296
3023	NC_006142	TCA	2	6	110718	110723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473296
3024	NC_006142	AGA	2	6	110775	110780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473296
3025	NC_006142	CTA	2	6	110795	110800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473296
3026	NC_006142	TAA	3	9	110801	110809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473296
3027	NC_006142	T	6	6	110818	110823	0 %	100 %	0 %	0 %	51473296
3028	NC_006142	AT	3	6	110844	110849	50 %	50 %	0 %	0 %	51473296
3029	NC_006142	TAA	2	6	110931	110936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473296
3030	NC_006142	GCA	2	6	110971	110976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473296
3031	NC_006142	GAA	2	6	110995	111000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473296
3032	NC_006142	A	7	7	111045	111051	100 %	0 %	0 %	0 %	51473296
3033	NC_006142	TAA	2	6	111068	111073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473296
3034	NC_006142	GATAT	2	10	111083	111092	40 %	40 %	20 %	0 %	51473296
3035	NC_006142	T	6	6	111279	111284	0 %	100 %	0 %	0 %	51473296
3036	NC_006142	TTA	2	6	111301	111306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473296
3037	NC_006142	GCAA	2	8	111308	111315	50 %	0 %	25 %	25 %	51473296
3038	NC_006142	GAAA	2	8	111321	111328	75 %	0 %	25 %	0 %	51473296
3039	NC_006142	ATG	2	6	111335	111340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473296
3040	NC_006142	TAA	2	6	111350	111355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473296
3041	NC_006142	T	6	6	111457	111462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_006142	ATTA	2	8	111519	111526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_006142	TA	3	6	111533	111538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_006142	TGA	2	6	111560	111565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_006142	TTC	2	6	111590	111595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_006142	T	7	7	111617	111623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_006142	T	7	7	111636	111642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_006142	ATT	2	6	111663	111668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_006142	AT	3	6	111671	111676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_006142	T	6	6	111753	111758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_006142	AAT	2	6	111823	111828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_006142	ATT	2	6	111851	111856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_006142	TCT	2	6	112010	112015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473297
3054	NC_006142	TAT	2	6	112038	112043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473297
3055	NC_006142	CCA	2	6	112114	112119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473297
3056	NC_006142	AAC	2	6	112140	112145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473297
3057	NC_006142	ATA	2	6	112152	112157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473297
3058	NC_006142	TAC	2	6	112306	112311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473297
3059	NC_006142	AT	3	6	112330	112335	50 %	50 %	0 %	0 %	51473297
3060	NC_006142	AT	3	6	112350	112355	50 %	50 %	0 %	0 %	51473297
3061	NC_006142	ATCT	2	8	112519	112526	25 %	50 %	0 %	25 %	51473297
3062	NC_006142	TAG	2	6	112539	112544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473297
3063	NC_006142	TTA	2	6	112550	112555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473297
3064	NC_006142	TGT	2	6	112607	112612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473297
3065	NC_006142	T	7	7	112630	112636	0 %	100 %	0 %	0 %	51473297
3066	NC_006142	ACT	2	6	112637	112642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473297
3067	NC_006142	CT	3	6	112679	112684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_006142	ATTT	2	8	112689	112696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_006142	TATT	2	8	112721	112728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_006142	ATAG	2	8	112746	112753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_006142	ATT	2	6	112777	112782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_006142	ATT	2	6	112791	112796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_006142	T	6	6	112803	112808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_006142	ATT	2	6	112825	112830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_006142	ATT	2	6	112847	112852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_006142	GTT	2	6	112941	112946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473298
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3078	NC_006142	CAT	2	6	112993	112998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3079	NC_006142	ATTT	2	8	113008	113015	25 %	75 %	0 %	0 %	51473298
3080	NC_006142	TAA	2	6	113164	113169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473298
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3082	NC_006142	TGT	2	6	113226	113231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473298
3083	NC_006142	CATA	2	8	113236	113243	50 %	25 %	0 %	25 %	51473298
3084	NC_006142	TCA	2	6	113244	113249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3085	NC_006142	AAT	2	6	113378	113383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473298
3086	NC_006142	GAT	2	6	113421	113426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473298
3087	NC_006142	TCA	2	6	113454	113459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3088	NC_006142	CTA	2	6	113551	113556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3089	NC_006142	TCC	2	6	113564	113569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473298
3090	NC_006142	ACG	2	6	113618	113623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473298
3091	NC_006142	CTT	2	6	113653	113658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473298
3092	NC_006142	CATG	2	8	113665	113672	25 %	25 %	25 %	25 %	51473298
3093	NC_006142	CTT	2	6	113677	113682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473298
3094	NC_006142	T	6	6	113681	113686	0 %	100 %	0 %	0 %	51473298
3095	NC_006142	GCA	2	6	113697	113702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473298
3096	NC_006142	AGC	2	6	113708	113713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473298
3097	NC_006142	TTCA	2	8	113714	113721	25 %	50 %	0 %	25 %	51473298
3098	NC_006142	AAT	2	6	113768	113773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473298
3099	NC_006142	TAT	2	6	113791	113796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473298
3100	NC_006142	T	8	8	113803	113810	0 %	100 %	0 %	0 %	51473298
3101	NC_006142	GTA	2	6	113890	113895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473298
3102	NC_006142	ACA	2	6	113940	113945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473298
3103	NC_006142	CCAT	2	8	113964	113971	25 %	25 %	0 %	50 %	51473298
3104	NC_006142	TCA	2	6	114006	114011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3105	NC_006142	ACC	2	6	114014	114019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473298
3106	NC_006142	TCA	2	6	114060	114065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3107	NC_006142	ATA	2	6	114072	114077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473298
3108	NC_006142	CAA	2	6	114148	114153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473298
3109	NC_006142	A	7	7	114173	114179	100 %	0 %	0 %	0 %	51473298
3110	NC_006142	AAG	2	6	114212	114217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473298
3111	NC_006142	AGG	2	6	114233	114238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473298
3112	NC_006142	TAAG	2	8	114244	114251	50 %	25 %	25 %	0 %	51473298
3113	NC_006142	A	6	6	114303	114308	100 %	0 %	0 %	0 %	51473298
3114	NC_006142	CTA	2	6	114310	114315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3115	NC_006142	TTC	2	6	114326	114331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473298
3116	NC_006142	TAA	2	6	114473	114478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473298
3117	NC_006142	ATTC	2	8	114518	114525	25 %	50 %	0 %	25 %	51473298
3118	NC_006142	TAC	2	6	114539	114544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3119	NC_006142	CAT	2	6	114556	114561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3120	NC_006142	CAT	2	6	114622	114627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473298
3121	NC_006142	AATT	2	8	114667	114674	50 %	50 %	0 %	0 %	51473298
3122	NC_006142	A	6	6	114696	114701	100 %	0 %	0 %	0 %	51473298
3123	NC_006142	ATT	2	6	114716	114721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473298
3124	NC_006142	TGC	2	6	114785	114790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473298
3125	NC_006142	ATT	2	6	114815	114820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473298
3126	NC_006142	TAA	2	6	114836	114841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_006142	ATA	2	6	114946	114951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473299
3128	NC_006142	AT	3	6	114954	114959	50 %	50 %	0 %	0 %	51473299
3129	NC_006142	AGGTA	2	10	114997	115006	40 %	20 %	40 %	0 %	51473299
3130	NC_006142	T	6	6	115040	115045	0 %	100 %	0 %	0 %	51473299
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3240	NC_006142	GGAT	2	8	118795	118802	25 %	25 %	50 %	0 %	51473303
3241	NC_006142	TAG	2	6	118805	118810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473303
3242	NC_006142	AAT	2	6	118864	118869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473303
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3247	NC_006142	TGG	2	6	118953	118958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473303
3248	NC_006142	TTAT	2	8	118987	118994	25 %	75 %	0 %	0 %	51473303
3249	NC_006142	CAA	2	6	119017	119022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473303
3250	NC_006142	GTA	2	6	119060	119065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473303
3251	NC_006142	A	6	6	119065	119070	100 %	0 %	0 %	0 %	51473303
3252	NC_006142	TAC	2	6	119071	119076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473303
3253	NC_006142	CTG	2	6	119084	119089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473303
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3255	NC_006142	ATT	2	6	119109	119114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473303
3256	NC_006142	CAT	2	6	119143	119148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473303
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3271	NC_006142	A	7	7	119728	119734	100 %	0 %	0 %	0 %	51473304
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3303	NC_006142	T	7	7	120893	120899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3313	NC_006142	ATT	2	6	121272	121277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3314	NC_006142	TAT	2	6	121318	121323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3315	NC_006142	ATTT	2	8	121363	121370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3316	NC_006142	CTG	2	6	121382	121387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3318	NC_006142	TAA	2	6	121469	121474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3319	NC_006142	A	6	6	121473	121478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3320	NC_006142	AAT	2	6	121481	121486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3321	NC_006142	TAT	2	6	121497	121502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3322	NC_006142	AAT	2	6	121505	121510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3323	NC_006142	ACT	2	6	121596	121601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473305
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