MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 30258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006142	TAT	2	6	37524	37529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473243
1002	NC_006142	ATC	2	6	37548	37553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473243
1003	NC_006142	TC	3	6	37580	37585	0 %	50 %	0 %	50 %	51473243
1004	NC_006142	TCC	2	6	37620	37625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473243
1005	NC_006142	T	6	6	37682	37687	0 %	100 %	0 %	0 %	51473243
1006	NC_006142	TATAT	2	10	37707	37716	40 %	60 %	0 %	0 %	51473243
1007	NC_006142	TA	3	6	37724	37729	50 %	50 %	0 %	0 %	51473243
1008	NC_006142	GGT	2	6	37759	37764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473243
1009	NC_006142	TAT	2	6	37832	37837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473243
1010	NC_006142	AT	3	6	37845	37850	50 %	50 %	0 %	0 %	51473243
1011	NC_006142	CTG	2	6	37883	37888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473243
1012	NC_006142	T	7	7	37906	37912	0 %	100 %	0 %	0 %	51473243
1013	NC_006142	TA	3	6	37959	37964	50 %	50 %	0 %	0 %	51473243
1014	NC_006142	ATCTTT	2	12	37965	37976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51473243
1015	NC_006142	CAA	2	6	37991	37996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473243
1016	NC_006142	ATT	2	6	38031	38036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473243
1017	NC_006142	TAA	2	6	38064	38069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473243
1018	NC_006142	CAT	2	6	38108	38113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473243
1019	NC_006142	TGAT	2	8	38143	38150	25 %	50 %	25 %	0 %	51473243
1020	NC_006142	AAACT	2	10	38171	38180	60 %	20 %	0 %	20 %	51473243
1021	NC_006142	ACA	2	6	38184	38189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473243
1022	NC_006142	AGC	2	6	38205	38210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473243
1023	NC_006142	TCT	2	6	38233	38238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473243
1024	NC_006142	TTC	2	6	38268	38273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473243
1025	NC_006142	AAT	2	6	38294	38299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473243
1026	NC_006142	AATA	2	8	38336	38343	75 %	25 %	0 %	0 %	51473243
1027	NC_006142	AAG	2	6	38369	38374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473243
1028	NC_006142	TCA	2	6	38422	38427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473243
1029	NC_006142	CATT	2	8	38509	38516	25 %	50 %	0 %	25 %	51473243
1030	NC_006142	T	6	6	38518	38523	0 %	100 %	0 %	0 %	51473243
1031	NC_006142	ATT	2	6	38530	38535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473243
1032	NC_006142	TGGAAT	2	12	38571	38582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473243
1033	NC_006142	ATT	2	6	38643	38648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473243
1034	NC_006142	T	6	6	38647	38652	0 %	100 %	0 %	0 %	51473243
1035	NC_006142	GACC	2	8	38681	38688	25 %	0 %	25 %	50 %	51473243
1036	NC_006142	T	7	7	38710	38716	0 %	100 %	0 %	0 %	51473243
1037	NC_006142	CTA	2	6	38717	38722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473243
1038	NC_006142	TAG	2	6	38774	38779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473243
1039	NC_006142	ATTAGC	2	12	38814	38825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51473243
1040	NC_006142	TGC	2	6	38931	38936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473243
1041	NC_006142	CTA	2	6	38960	38965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473243
1042	NC_006142	TAA	2	6	38988	38993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473243
1043	NC_006142	CCA	2	6	39022	39027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473244
1044	NC_006142	CTC	2	6	39053	39058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473244
1045	NC_006142	TTG	2	6	39084	39089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473244
1046	NC_006142	TAC	2	6	39107	39112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473244
1047	NC_006142	GAA	2	6	39160	39165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473244
1048	NC_006142	TGC	2	6	39180	39185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473244
1049	NC_006142	T	7	7	39189	39195	0 %	100 %	0 %	0 %	51473244
1050	NC_006142	CAA	2	6	39203	39208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473244
1051	NC_006142	CAG	2	6	39260	39265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473244
1052	NC_006142	TAA	2	6	39292	39297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473244
1053	NC_006142	A	6	6	39296	39301	100 %	0 %	0 %	0 %	51473244
1054	NC_006142	AC	3	6	39319	39324	50 %	0 %	0 %	50 %	51473244
1055	NC_006142	ACA	2	6	39346	39351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473244
1056	NC_006142	TTC	2	6	39393	39398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473244
1057	NC_006142	ATA	2	6	39414	39419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473244
1058	NC_006142	CATA	2	8	39560	39567	50 %	25 %	0 %	25 %	51473244
1059	NC_006142	TTA	2	6	39569	39574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473244
1060	NC_006142	CTA	2	6	39593	39598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473244
1061	NC_006142	ATAC	2	8	39622	39629	50 %	25 %	0 %	25 %	51473244
1062	NC_006142	ACCC	2	8	39634	39641	25 %	0 %	0 %	75 %	51473244
1063	NC_006142	TAAA	2	8	39665	39672	75 %	25 %	0 %	0 %	51473244
1064	NC_006142	GAAT	2	8	39680	39687	50 %	25 %	25 %	0 %	51473244
1065	NC_006142	AT	3	6	39697	39702	50 %	50 %	0 %	0 %	51473244
1066	NC_006142	AAT	2	6	39734	39739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473244
1067	NC_006142	TAA	2	6	39743	39748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473244
1068	NC_006142	TAA	2	6	39803	39808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473244
1069	NC_006142	A	6	6	39843	39848	100 %	0 %	0 %	0 %	51473244
1070	NC_006142	T	6	6	39888	39893	0 %	100 %	0 %	0 %	51473244
1071	NC_006142	TAT	2	6	39923	39928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473244
1072	NC_006142	ATA	2	6	40005	40010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473244
1073	NC_006142	CAAT	2	8	40021	40028	50 %	25 %	0 %	25 %	51473244
1074	NC_006142	TGC	2	6	40137	40142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473244
1075	NC_006142	ACC	2	6	40197	40202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473244
1076	NC_006142	ACA	2	6	40240	40245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473244
1077	NC_006142	TAT	2	6	40257	40262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473244
1078	NC_006142	T	6	6	40274	40279	0 %	100 %	0 %	0 %	51473244
1079	NC_006142	AGT	2	6	40281	40286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473244
1080	NC_006142	TTA	2	6	40297	40302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473244
1081	NC_006142	A	6	6	40320	40325	100 %	0 %	0 %	0 %	51473244
1082	NC_006142	A	6	6	40446	40451	100 %	0 %	0 %	0 %	51473244
1083	NC_006142	TTA	2	6	40456	40461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473244
1084	NC_006142	ATTA	2	8	40500	40507	50 %	50 %	0 %	0 %	51473244
1085	NC_006142	T	6	6	40665	40670	0 %	100 %	0 %	0 %	51473244
1086	NC_006142	ATT	2	6	40719	40724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473244
1087	NC_006142	TA	3	6	40772	40777	50 %	50 %	0 %	0 %	51473244
1088	NC_006142	AAAAC	2	10	40812	40821	80 %	0 %	0 %	20 %	51473244
1089	NC_006142	TAC	2	6	40874	40879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473244
1090	NC_006142	TA	3	6	40884	40889	50 %	50 %	0 %	0 %	51473244
1091	NC_006142	AT	3	6	40988	40993	50 %	50 %	0 %	0 %	51473244
1092	NC_006142	TAA	2	6	41000	41005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473244
1093	NC_006142	TAT	2	6	41040	41045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473245
1094	NC_006142	T	8	8	41047	41054	0 %	100 %	0 %	0 %	51473245
1095	NC_006142	TAC	2	6	41059	41064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473245
1096	NC_006142	ATC	2	6	41080	41085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473245
1097	NC_006142	CGT	2	6	41108	41113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473245
1098	NC_006142	TCC	2	6	41125	41130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473245
1099	NC_006142	TAT	2	6	41304	41309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473245
1100	NC_006142	GTATTA	2	12	41330	41341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	51473245
1101	NC_006142	TATTTT	2	12	41364	41375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51473245
1102	NC_006142	TAT	2	6	41421	41426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473245
1103	NC_006142	TAT	2	6	41433	41438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473245
1104	NC_006142	TAC	2	6	41458	41463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473245
1105	NC_006142	CAA	2	6	41472	41477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473245
1106	NC_006142	ATTC	2	8	41478	41485	25 %	50 %	0 %	25 %	51473245
1107	NC_006142	TTTCT	2	10	41488	41497	0 %	80 %	0 %	20 %	51473245
1108	NC_006142	TTC	2	6	41521	41526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473245
1109	NC_006142	TTG	2	6	41530	41535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473245
1110	NC_006142	CCA	2	6	41552	41557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473245
1111	NC_006142	T	6	6	41712	41717	0 %	100 %	0 %	0 %	51473245
1112	NC_006142	GTA	2	6	41729	41734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473245
1113	NC_006142	TAA	2	6	41769	41774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473245
1114	NC_006142	TAG	2	6	41823	41828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473245
1115	NC_006142	TGT	2	6	41857	41862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473245
1116	NC_006142	GAG	2	6	41871	41876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473245
1117	NC_006142	CAT	2	6	41895	41900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473245
1118	NC_006142	GTT	3	9	41948	41956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473245
1119	NC_006142	TAT	2	6	42024	42029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473245
1120	NC_006142	TAT	2	6	42057	42062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473245
1121	NC_006142	CACCTC	2	12	42099	42110	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	51473245
1122	NC_006142	ATT	2	6	42211	42216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473245
1123	NC_006142	GCA	2	6	42242	42247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473245
1124	NC_006142	ACT	2	6	42262	42267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473245
1125	NC_006142	TAAT	2	8	42303	42310	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
1126	NC_006142	A	6	6	42358	42363	100 %	0 %	0 %	0 %	51473245
1127	NC_006142	AAC	2	6	42379	42384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473245
1128	NC_006142	AGAA	2	8	42406	42413	75 %	0 %	25 %	0 %	51473245
1129	NC_006142	TCA	2	6	42416	42421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473245
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1242	NC_006142	TTA	2	6	47109	47114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1251	NC_006142	TTAA	2	8	47537	47544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_006142	TAA	2	6	47670	47675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_006142	TAC	2	6	47696	47701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_006142	ATT	2	6	47715	47720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_006142	ATA	2	6	47751	47756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_006142	T	7	7	47807	47813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_006142	TAAC	2	8	47837	47844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1261	NC_006142	TTG	2	6	47885	47890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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