MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 30258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_006142	TAC	2	6	186336	186341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473354
5003	NC_006142	T	8	8	186345	186352	0 %	100 %	0 %	0 %	51473354
5004	NC_006142	TCA	2	6	186398	186403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473354
5005	NC_006142	GA	3	6	186415	186420	50 %	0 %	50 %	0 %	51473354
5006	NC_006142	TTA	2	6	186473	186478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473354
5007	NC_006142	TA	3	6	186495	186500	50 %	50 %	0 %	0 %	51473354
5008	NC_006142	TGC	2	6	186531	186536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473354
5009	NC_006142	CCA	2	6	186562	186567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473354
5010	NC_006142	CTT	2	6	186602	186607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473354
5011	NC_006142	T	6	6	186625	186630	0 %	100 %	0 %	0 %	51473354
5012	NC_006142	TTGT	2	8	186654	186661	0 %	75 %	25 %	0 %	51473354
5013	NC_006142	T	6	6	186699	186704	0 %	100 %	0 %	0 %	51473354
5014	NC_006142	T	7	7	186758	186764	0 %	100 %	0 %	0 %	51473355
5015	NC_006142	TGA	2	6	186795	186800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473355
5016	NC_006142	ATT	3	9	186828	186836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473355
5017	NC_006142	TAC	2	6	186888	186893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473355
5018	NC_006142	ATCT	2	8	186939	186946	25 %	50 %	0 %	25 %	51473355
5019	NC_006142	ATT	2	6	186964	186969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473355
5020	NC_006142	TAA	3	9	187002	187010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473355
5021	NC_006142	ATATA	2	10	187020	187029	60 %	40 %	0 %	0 %	51473355
5022	NC_006142	AATTT	2	10	187030	187039	40 %	60 %	0 %	0 %	51473355
5023	NC_006142	AACATT	2	12	187045	187056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51473355
5024	NC_006142	TAG	2	6	187090	187095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473356
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5027	NC_006142	AT	3	6	187131	187136	50 %	50 %	0 %	0 %	51473356
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5031	NC_006142	TAA	2	6	187225	187230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473356
5032	NC_006142	AT	3	6	187278	187283	50 %	50 %	0 %	0 %	51473356
5033	NC_006142	ATT	2	6	187337	187342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473356
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5039	NC_006142	GCA	2	6	187499	187504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473356
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5041	NC_006142	GTG	2	6	187620	187625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473356
5042	NC_006142	CAT	2	6	187654	187659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473356
5043	NC_006142	AT	3	6	187716	187721	50 %	50 %	0 %	0 %	51473356
5044	NC_006142	ATGA	2	8	187751	187758	50 %	25 %	25 %	0 %	51473356
5045	NC_006142	AAAGT	2	10	187772	187781	60 %	20 %	20 %	0 %	51473356
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5053	NC_006142	T	6	6	187988	187993	0 %	100 %	0 %	0 %	51473356
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5057	NC_006142	ATT	2	6	188287	188292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473356
5058	NC_006142	ATA	2	6	188304	188309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473356
5059	NC_006142	TCA	2	6	188313	188318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473356
5060	NC_006142	AATAA	2	10	188338	188347	80 %	20 %	0 %	0 %	51473356
5061	NC_006142	AAT	2	6	188392	188397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473356
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5063	NC_006142	CAA	2	6	188490	188495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473356
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5067	NC_006142	TAA	2	6	188632	188637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_006142	AAAT	2	8	188645	188652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_006142	A	6	6	188662	188667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_006142	TTG	2	6	188668	188673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_006142	TATTTA	2	12	188737	188748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_006142	ATA	2	6	188753	188758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_006142	TA	3	6	188761	188766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_006142	TTG	2	6	189066	189071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_006142	A	6	6	189110	189115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_006142	TCT	2	6	189133	189138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5090	NC_006142	CTT	2	6	189299	189304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_006142	TA	3	6	189322	189327	50 %	50 %	0 %	0 %	51473358
5092	NC_006142	ATT	2	6	189348	189353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473358
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5095	NC_006142	TAT	2	6	189488	189493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_006142	ATA	2	6	189494	189499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_006142	GTT	2	6	189552	189557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_006142	AATTT	2	10	189603	189612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_006142	T	6	6	189641	189646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_006142	TAA	2	6	189677	189682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_006142	ATTAT	2	10	189683	189692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_006142	TTA	2	6	189738	189743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_006142	T	7	7	189756	189762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_006142	TAAT	2	8	189794	189801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_006142	TA	3	6	189842	189847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5107	NC_006142	TA	3	6	189978	189983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_006142	GTT	2	6	190027	190032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_006142	TGA	2	6	190074	190079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5113	NC_006142	T	7	7	190413	190419	0 %	100 %	0 %	0 %	51473359
5114	NC_006142	ACC	2	6	190433	190438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473359
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5121	NC_006142	TGATGG	2	12	190763	190774	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	51473359
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5125	NC_006142	AG	3	6	190845	190850	50 %	0 %	50 %	0 %	51473359
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5250	NC_006142	TTC	2	6	195097	195102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_006142	TTA	2	6	195203	195208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_006142	TAA	2	6	195290	195295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_006142	GTT	2	6	204441	204446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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