MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 30258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006142	TTTA	2	8	166803	166810	25 %	75 %	0 %	0 %	51473340
4502	NC_006142	GCT	2	6	166851	166856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
4503	NC_006142	TGG	2	6	166864	166869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
4504	NC_006142	AG	3	6	166914	166919	50 %	0 %	50 %	0 %	51473340
4505	NC_006142	TTGT	2	8	167020	167027	0 %	75 %	25 %	0 %	51473340
4506	NC_006142	ATG	2	6	167115	167120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4507	NC_006142	ACAA	2	8	167124	167131	75 %	0 %	0 %	25 %	51473340
4508	NC_006142	TAT	2	6	167159	167164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4509	NC_006142	TAT	2	6	167196	167201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4510	NC_006142	GAT	2	6	167237	167242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4511	NC_006142	TA	3	6	167275	167280	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
4512	NC_006142	TAC	2	6	167366	167371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
4513	NC_006142	TGGT	2	8	167386	167393	0 %	50 %	50 %	0 %	51473340
4514	NC_006142	TTA	2	6	167397	167402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4515	NC_006142	TAA	2	6	167435	167440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473340
4516	NC_006142	CTAA	2	8	167445	167452	50 %	25 %	0 %	25 %	51473340
4517	NC_006142	A	6	6	167451	167456	100 %	0 %	0 %	0 %	51473340
4518	NC_006142	AT	3	6	167458	167463	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
4519	NC_006142	TTC	2	6	167558	167563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473340
4520	NC_006142	AAC	2	6	167653	167658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473340
4521	NC_006142	AGT	2	6	167702	167707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4522	NC_006142	ATG	2	6	167748	167753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4523	NC_006142	CCA	2	6	167769	167774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473340
4524	NC_006142	ATC	2	6	167791	167796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
4525	NC_006142	TA	4	8	167810	167817	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
4526	NC_006142	CAG	2	6	167850	167855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473340
4527	NC_006142	AGC	2	6	167860	167865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473340
4528	NC_006142	GGT	2	6	167868	167873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
4529	NC_006142	TAT	2	6	167921	167926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4530	NC_006142	AAGG	2	8	167937	167944	50 %	0 %	50 %	0 %	51473340
4531	NC_006142	TAT	2	6	168068	168073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4532	NC_006142	GA	3	6	168133	168138	50 %	0 %	50 %	0 %	51473340
4533	NC_006142	CTG	2	6	168175	168180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
4534	NC_006142	AT	3	6	168187	168192	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
4535	NC_006142	TTA	2	6	168235	168240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4536	NC_006142	AGT	2	6	168315	168320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4537	NC_006142	AGG	2	6	168458	168463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473340
4538	NC_006142	TGC	2	6	168464	168469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
4539	NC_006142	TCT	2	6	168489	168494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473340
4540	NC_006142	GTT	2	6	168540	168545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473340
4541	NC_006142	GAA	2	6	168555	168560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473340
4542	NC_006142	ATT	3	9	168590	168598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4543	NC_006142	TGA	2	6	168602	168607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4544	NC_006142	TTG	2	6	168658	168663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473340
4545	NC_006142	ATG	2	6	168664	168669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4546	NC_006142	TATAC	2	10	168714	168723	40 %	40 %	0 %	20 %	51473340
4547	NC_006142	ATT	2	6	168726	168731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4548	NC_006142	TGA	2	6	168797	168802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4549	NC_006142	TTA	2	6	168826	168831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4550	NC_006142	GTG	2	6	168853	168858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
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4552	NC_006142	AGA	2	6	168968	168973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473340
4553	NC_006142	ACT	3	9	169026	169034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
4554	NC_006142	TGG	2	6	169046	169051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
4555	NC_006142	GTAGA	2	10	169123	169132	40 %	20 %	40 %	0 %	51473340
4556	NC_006142	TAT	3	9	169163	169171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4557	NC_006142	AT	3	6	169202	169207	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
4558	NC_006142	TGT	2	6	169226	169231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473340
4559	NC_006142	A	6	6	169254	169259	100 %	0 %	0 %	0 %	51473340
4560	NC_006142	ATTG	2	8	169268	169275	25 %	50 %	25 %	0 %	51473340
4561	NC_006142	TAC	2	6	169288	169293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
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4563	NC_006142	TGA	2	6	169385	169390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4564	NC_006142	TTA	2	6	169405	169410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
4565	NC_006142	GGT	2	6	169449	169454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
4566	NC_006142	TAG	2	6	169465	169470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
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4568	NC_006142	TGA	2	6	169496	169501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4569	NC_006142	CTG	2	6	169537	169542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
4570	NC_006142	CAT	2	6	169609	169614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
4571	NC_006142	ACT	2	6	169623	169628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
4572	NC_006142	CTG	2	6	169714	169719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
4573	NC_006142	AGC	2	6	169751	169756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473340
4574	NC_006142	TGA	2	6	169766	169771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
4575	NC_006142	ATTGTC	2	12	169853	169864	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4576	NC_006142	T	6	6	169947	169952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_006142	T	6	6	169959	169964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_006142	GTA	2	6	169973	169978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_006142	ATT	2	6	170072	170077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_006142	AAT	2	6	170106	170111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_006142	TTA	2	6	170134	170139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_006142	ATA	2	6	170144	170149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_006142	TAAAG	2	10	170150	170159	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_006142	TAA	2	6	170177	170182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_006142	TAA	2	6	170185	170190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_006142	TC	3	6	170193	170198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_006142	AGT	3	9	170209	170217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_006142	AGAA	2	8	170258	170265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_006142	TAT	2	6	170299	170304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_006142	AGT	2	6	170331	170336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_006142	TA	3	6	170369	170374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_006142	ATGT	2	8	170376	170383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_006142	ATA	2	6	170389	170394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_006142	TCTA	2	8	170406	170413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_006142	TCT	2	6	170463	170468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_006142	ATC	2	6	170523	170528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_006142	AT	3	6	170540	170545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_006142	ATA	2	6	170547	170552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_006142	TTA	2	6	170578	170583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_006142	AT	3	6	170608	170613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_006142	TACTT	2	10	170643	170652	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4602	NC_006142	ATT	2	6	170705	170710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_006142	ATAA	2	8	170772	170779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_006142	TGAA	2	8	170836	170843	50 %	25 %	25 %	0 %	51473341
4605	NC_006142	ATC	2	6	170846	170851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473341
4606	NC_006142	CAA	2	6	170922	170927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473341
4607	NC_006142	TTA	2	6	171010	171015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473341
4608	NC_006142	TAA	2	6	171037	171042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473341
4609	NC_006142	TAG	2	6	171043	171048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473341
4610	NC_006142	GGT	2	6	171096	171101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473341
4611	NC_006142	ACA	2	6	171110	171115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473341
4612	NC_006142	CTA	2	6	171136	171141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473341
4613	NC_006142	AATA	2	8	171164	171171	75 %	25 %	0 %	0 %	51473341
4614	NC_006142	GTG	2	6	171208	171213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473341
4615	NC_006142	CTT	2	6	171223	171228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473341
4616	NC_006142	ACC	2	6	171249	171254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473341
4617	NC_006142	AAG	2	6	171259	171264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473341
4618	NC_006142	AAT	2	6	171306	171311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473341
4619	NC_006142	ATT	2	6	171326	171331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473341
4620	NC_006142	A	6	6	171339	171344	100 %	0 %	0 %	0 %	51473341
4621	NC_006142	T	6	6	171363	171368	0 %	100 %	0 %	0 %	51473341
4622	NC_006142	AGG	2	6	171569	171574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473341
4623	NC_006142	TAG	2	6	171575	171580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473341
4624	NC_006142	GAT	2	6	171582	171587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473341
4625	NC_006142	TGGT	2	8	171601	171608	0 %	50 %	50 %	0 %	51473341
4626	NC_006142	GGT	2	6	171630	171635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473341
4627	NC_006142	GATAT	2	10	171673	171682	40 %	40 %	20 %	0 %	51473341
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4630	NC_006142	TGT	2	6	171809	171814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473341
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4721	NC_006142	GCATT	2	10	175675	175684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4722	NC_006142	ATTG	2	8	175703	175710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4723	NC_006142	AT	3	6	175736	175741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4725	NC_006142	TTA	2	6	175768	175773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4726	NC_006142	AT	3	6	175796	175801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4727	NC_006142	GTTTC	2	10	175805	175814	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4734	NC_006142	T	8	8	176078	176085	0 %	100 %	0 %	0 %	51473345
4735	NC_006142	AT	3	6	176145	176150	50 %	50 %	0 %	0 %	51473345
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4746	NC_006142	AACC	2	8	176665	176672	50 %	0 %	0 %	50 %	51473345
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4750	NC_006142	TAC	2	6	176765	176770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473345
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