MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 14572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	TTCG	2	8	246	253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005296	CGTC	2	8	994	1001	0 %	25 %	25 %	50 %	39933081
3	NC_005296	CTCG	2	8	1332	1339	0 %	25 %	25 %	50 %	39933081
4	NC_005296	GCCG	2	8	1453	1460	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
5	NC_005296	CACC	2	8	1617	1624	25 %	0 %	0 %	75 %	39933081
6	NC_005296	CGAC	2	8	2468	2475	25 %	0 %	25 %	50 %	39933082
7	NC_005296	GCCG	2	8	2502	2509	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
8	NC_005296	GCCG	2	8	2635	2642	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
9	NC_005296	GATC	2	8	2748	2755	25 %	25 %	25 %	25 %	39933082
10	NC_005296	CGAC	2	8	2858	2865	25 %	0 %	25 %	50 %	39933082
11	NC_005296	ATCC	2	8	3522	3529	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005296	TCCG	2	8	4362	4369	0 %	25 %	25 %	50 %	39933083
13	NC_005296	TGGA	2	8	4390	4397	25 %	25 %	50 %	0 %	39933083
14	NC_005296	GCCG	2	8	4852	4859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005296	TCTA	2	8	4925	4932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_005296	GCCG	2	8	5097	5104	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
17	NC_005296	GGCC	2	8	5250	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
18	NC_005296	CTGG	2	8	6171	6178	0 %	25 %	50 %	25 %	39933084
19	NC_005296	TCCG	2	8	6186	6193	0 %	25 %	25 %	50 %	39933084
20	NC_005296	GGAA	2	8	7205	7212	50 %	0 %	50 %	0 %	39933084
21	NC_005296	GCCG	2	8	7264	7271	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
22	NC_005296	CCAT	2	8	7567	7574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_005296	TCGA	2	8	7722	7729	25 %	25 %	25 %	25 %	39933085
24	NC_005296	GCCG	2	8	8450	8457	0 %	0 %	50 %	50 %	39933085
25	NC_005296	CGAG	2	8	8467	8474	25 %	0 %	50 %	25 %	39933085
26	NC_005296	GCCG	2	8	8865	8872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005296	CGGC	2	8	8970	8977	0 %	0 %	50 %	50 %	39933086
28	NC_005296	ACCA	2	8	8980	8987	50 %	0 %	0 %	50 %	39933086
29	NC_005296	CCGA	2	8	8996	9003	25 %	0 %	25 %	50 %	39933086
30	NC_005296	CGGA	2	8	9183	9190	25 %	0 %	50 %	25 %	39933086
31	NC_005296	CCGG	2	8	9880	9887	0 %	0 %	50 %	50 %	39933087
32	NC_005296	GGTG	2	8	10302	10309	0 %	25 %	75 %	0 %	39933087
33	NC_005296	CGGC	2	8	10313	10320	0 %	0 %	50 %	50 %	39933087
34	NC_005296	GAGC	2	8	10615	10622	25 %	0 %	50 %	25 %	39933087
35	NC_005296	CATC	2	8	10704	10711	25 %	25 %	0 %	50 %	39933087
36	NC_005296	GATC	2	8	11045	11052	25 %	25 %	25 %	25 %	39933088
37	NC_005296	CGCT	2	8	11245	11252	0 %	25 %	25 %	50 %	39933089
38	NC_005296	CAGC	2	8	11901	11908	25 %	0 %	25 %	50 %	39933089
39	NC_005296	ACCG	2	8	11922	11929	25 %	0 %	25 %	50 %	39933089
40	NC_005296	CCTG	2	8	12338	12345	0 %	25 %	25 %	50 %	39933089
41	NC_005296	TCGG	2	8	12574	12581	0 %	25 %	50 %	25 %	39933089
42	NC_005296	CGAG	2	8	12644	12651	25 %	0 %	50 %	25 %	39933089
43	NC_005296	ATCA	2	8	13078	13085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_005296	TCGA	2	8	13528	13535	25 %	25 %	25 %	25 %	39933090
45	NC_005296	GAAA	2	8	13827	13834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005296	TCGG	2	8	14390	14397	0 %	25 %	50 %	25 %	39933091
47	NC_005296	GCGA	2	8	15002	15009	25 %	0 %	50 %	25 %	39933093
48	NC_005296	CGGC	2	8	15090	15097	0 %	0 %	50 %	50 %	39933093
49	NC_005296	TACA	2	8	16003	16010	50 %	25 %	0 %	25 %	39933093
50	NC_005296	TGAT	2	8	16307	16314	25 %	50 %	25 %	0 %	39933093
51	NC_005296	GCCG	2	8	17101	17108	0 %	0 %	50 %	50 %	39933094
52	NC_005296	GGCT	2	8	17263	17270	0 %	25 %	50 %	25 %	39933094
53	NC_005296	GATG	2	8	17915	17922	25 %	25 %	50 %	0 %	39933095
54	NC_005296	GCCG	2	8	19259	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	39933096
55	NC_005296	CGAA	3	12	19304	19315	50 %	0 %	25 %	25 %	39933096
56	NC_005296	CGAG	2	8	19600	19607	25 %	0 %	50 %	25 %	39933096
57	NC_005296	TCGG	2	8	20167	20174	0 %	25 %	50 %	25 %	39933098
58	NC_005296	CGGA	2	8	20583	20590	25 %	0 %	50 %	25 %	39933098
59	NC_005296	CGAC	2	8	20981	20988	25 %	0 %	25 %	50 %	39933099
60	NC_005296	CGAG	2	8	21014	21021	25 %	0 %	50 %	25 %	39933099
61	NC_005296	CGAC	2	8	21320	21327	25 %	0 %	25 %	50 %	39933099
62	NC_005296	CGGA	2	8	22095	22102	25 %	0 %	50 %	25 %	39933099
63	NC_005296	GCCG	2	8	22103	22110	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
64	NC_005296	GGCC	2	8	22169	22176	0 %	0 %	50 %	50 %	39933099
65	NC_005296	GGAC	2	8	22682	22689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_005296	ACCG	2	8	23092	23099	25 %	0 %	25 %	50 %	39933100
67	NC_005296	GAGC	2	8	23283	23290	25 %	0 %	50 %	25 %	39933100
68	NC_005296	GCCG	2	8	23652	23659	0 %	0 %	50 %	50 %	39933100
69	NC_005296	GCCC	2	8	24169	24176	0 %	0 %	25 %	75 %	39933101
70	NC_005296	CGAG	3	12	24333	24344	25 %	0 %	50 %	25 %	39933101
71	NC_005296	CGGC	2	8	24410	24417	0 %	0 %	50 %	50 %	39933101
72	NC_005296	GCGA	2	8	24544	24551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_005296	CCAC	2	8	24870	24877	25 %	0 %	0 %	75 %	39933102
74	NC_005296	GACA	2	8	25430	25437	50 %	0 %	25 %	25 %	39933103
75	NC_005296	CGGC	2	8	25688	25695	0 %	0 %	50 %	50 %	39933103
76	NC_005296	CGCC	2	8	26060	26067	0 %	0 %	25 %	75 %	39933103
77	NC_005296	GTCG	2	8	26781	26788	0 %	25 %	50 %	25 %	39933104
78	NC_005296	CATC	2	8	27309	27316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_005296	ATCG	2	8	28900	28907	25 %	25 %	25 %	25 %	39933105
80	NC_005296	CAGC	2	8	28947	28954	25 %	0 %	25 %	50 %	39933105
81	NC_005296	CCGG	2	8	29203	29210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005296	GGAA	2	8	29212	29219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005296	GGGC	2	8	31478	31485	0 %	0 %	75 %	25 %	39933107
84	NC_005296	GCCA	2	8	31632	31639	25 %	0 %	25 %	50 %	39933107
85	NC_005296	GCGG	2	8	32223	32230	0 %	0 %	75 %	25 %	39933108
86	NC_005296	GCGG	2	8	32235	32242	0 %	0 %	75 %	25 %	39933108
87	NC_005296	TCGG	2	8	32368	32375	0 %	25 %	50 %	25 %	39933108
88	NC_005296	CCAT	2	8	33382	33389	25 %	25 %	0 %	50 %	39933108
89	NC_005296	GGCC	2	8	33434	33441	0 %	0 %	50 %	50 %	39933108
90	NC_005296	GGAA	2	8	33600	33607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005296	GGCG	2	8	33790	33797	0 %	0 %	75 %	25 %	39933109
92	NC_005296	TCGA	2	8	33867	33874	25 %	25 %	25 %	25 %	39933109
93	NC_005296	GCCA	2	8	33920	33927	25 %	0 %	25 %	50 %	39933109
94	NC_005296	GGCG	2	8	34499	34506	0 %	0 %	75 %	25 %	39933109
95	NC_005296	CAGC	2	8	35222	35229	25 %	0 %	25 %	50 %	39933109
96	NC_005296	CGGC	2	8	35328	35335	0 %	0 %	50 %	50 %	39933109
97	NC_005296	ACGG	2	8	35570	35577	25 %	0 %	50 %	25 %	39933109
98	NC_005296	GATC	2	8	35960	35967	25 %	25 %	25 %	25 %	39933110
99	NC_005296	AGCG	2	8	36117	36124	25 %	0 %	50 %	25 %	39933110
100	NC_005296	TCCA	2	8	36853	36860	25 %	25 %	0 %	50 %	39933110
101	NC_005296	TCGG	2	8	36910	36917	0 %	25 %	50 %	25 %	39933110
102	NC_005296	GAAC	2	8	37645	37652	50 %	0 %	25 %	25 %	39933112
103	NC_005296	CGGC	2	8	37720	37727	0 %	0 %	50 %	50 %	39933112
104	NC_005296	CTTC	2	8	39035	39042	0 %	50 %	0 %	50 %	39933113
105	NC_005296	GCCG	2	8	39222	39229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_005296	GCCG	2	8	39375	39382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_005296	GGGC	3	12	39514	39525	0 %	0 %	75 %	25 %	39933114
108	NC_005296	GCCG	2	8	40175	40182	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
109	NC_005296	GCCC	2	8	40854	40861	0 %	0 %	25 %	75 %	39933114
110	NC_005296	CAGC	2	8	41437	41444	25 %	0 %	25 %	50 %	39933115
111	NC_005296	GCCG	2	8	41503	41510	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
112	NC_005296	GCGA	2	8	42372	42379	25 %	0 %	50 %	25 %	39933115
113	NC_005296	GCGA	2	8	42529	42536	25 %	0 %	50 %	25 %	39933115
114	NC_005296	ACCG	2	8	42878	42885	25 %	0 %	25 %	50 %	39933115
115	NC_005296	CGGC	2	8	42892	42899	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
116	NC_005296	TCAA	2	8	44051	44058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_005296	CCGC	2	8	44213	44220	0 %	0 %	25 %	75 %	39933117
118	NC_005296	CGAT	2	8	44327	44334	25 %	25 %	25 %	25 %	39933117
119	NC_005296	CCAG	2	8	44427	44434	25 %	0 %	25 %	50 %	39933117
120	NC_005296	CTTC	2	8	44784	44791	0 %	50 %	0 %	50 %	39933117
121	NC_005296	CATC	2	8	45328	45335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_005296	GGCC	2	8	45656	45663	0 %	0 %	50 %	50 %	39933118
123	NC_005296	TGGC	2	8	46357	46364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_005296	GTTC	2	8	46372	46379	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_005296	GGCC	2	8	47150	47157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_005296	AACC	2	8	47234	47241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_005296	GCTG	2	8	47519	47526	0 %	25 %	50 %	25 %	39933121
128	NC_005296	GCTG	2	8	47928	47935	0 %	25 %	50 %	25 %	39933121
129	NC_005296	CCGA	2	8	47944	47951	25 %	0 %	25 %	50 %	39933121
130	NC_005296	GGCG	2	8	48105	48112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_005296	GATT	2	8	48185	48192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005296	CCGC	2	8	48237	48244	0 %	0 %	25 %	75 %	39933122
133	NC_005296	AGGC	2	8	48755	48762	25 %	0 %	50 %	25 %	39933122
134	NC_005296	CGGA	2	8	49431	49438	25 %	0 %	50 %	25 %	39933123
135	NC_005296	CAGC	2	8	49596	49603	25 %	0 %	25 %	50 %	39933123
136	NC_005296	CATC	2	8	49652	49659	25 %	25 %	0 %	50 %	39933123
137	NC_005296	CGCC	2	8	50496	50503	0 %	0 %	25 %	75 %	39933124
138	NC_005296	GTGG	2	8	50595	50602	0 %	25 %	75 %	0 %	39933124
139	NC_005296	GCCG	2	8	52021	52028	0 %	0 %	50 %	50 %	39933125
140	NC_005296	TTGG	2	8	52186	52193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005296	ACCG	2	8	52825	52832	25 %	0 %	25 %	50 %	39933126
142	NC_005296	CCGT	2	8	53048	53055	0 %	25 %	25 %	50 %	39933126
143	NC_005296	CCAG	2	8	53646	53653	25 %	0 %	25 %	50 %	39933127
144	NC_005296	CTCG	2	8	53977	53984	0 %	25 %	25 %	50 %	39933127
145	NC_005296	AGCC	2	8	56439	56446	25 %	0 %	25 %	50 %	39933130
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