MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005296	CGG	2	6	132265	132270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_005296	GGT	2	6	132292	132297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_005296	CGG	2	6	132299	132304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_005296	ACC	2	6	132314	132319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_005296	TGG	2	6	132333	132338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_005296	TGA	2	6	132429	132434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_005296	TTG	2	6	132479	132484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_005296	TGA	2	6	132495	132500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_005296	GTG	2	6	132520	132525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_005296	CGAAC	2	10	132625	132634	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3511	NC_005296	TCG	2	6	132638	132643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_005296	GCC	2	6	132710	132715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_005296	GCA	2	6	132717	132722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_005296	CGA	2	6	132735	132740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_005296	CAC	2	6	132811	132816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_005296	CTC	2	6	132829	132834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_005296	CAG	2	6	132838	132843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_005296	CGA	2	6	132861	132866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_005296	TCG	2	6	132896	132901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_005296	GCT	3	9	132946	132954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_005296	GCC	2	6	132956	132961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_005296	GCG	2	6	132966	132971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_005296	CGA	2	6	133051	133056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_005296	GCG	2	6	133070	133075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_005296	TCG	2	6	133104	133109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_005296	CCGA	2	8	133110	133117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_005296	ACG	2	6	133125	133130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_005296	CGAT	2	8	133140	133147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3529	NC_005296	GC	3	6	133181	133186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_005296	CGA	2	6	133195	133200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_005296	GTG	2	6	133243	133248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_005296	ACG	2	6	133303	133308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_005296	CAA	2	6	133316	133321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_005296	TCGT	2	8	133404	133411	0 %	50 %	25 %	25 %	39933195
3535	NC_005296	ACA	2	6	133420	133425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933195
3536	NC_005296	TCG	2	6	133435	133440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933195
3537	NC_005296	CGG	2	6	133486	133491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933195
3538	NC_005296	GC	3	6	133525	133530	0 %	0 %	50 %	50 %	39933195
3539	NC_005296	CCG	2	6	133642	133647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933195
3540	NC_005296	GGT	2	6	133715	133720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933195
3541	NC_005296	ACT	2	6	133738	133743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933195
3542	NC_005296	CGC	3	9	133747	133755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933195
3543	NC_005296	GCC	2	6	133850	133855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933195
3544	NC_005296	TCG	2	6	133898	133903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3545	NC_005296	GTC	2	6	133910	133915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3546	NC_005296	GC	3	6	133944	133949	0 %	0 %	50 %	50 %	39933196
3547	NC_005296	CTG	2	6	133975	133980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3548	NC_005296	CCGG	2	8	133983	133990	0 %	0 %	50 %	50 %	39933196
3549	NC_005296	GTC	2	6	134053	134058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3550	NC_005296	TGC	2	6	134061	134066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3551	NC_005296	CG	3	6	134149	134154	0 %	0 %	50 %	50 %	39933196
3552	NC_005296	CGAC	2	8	134189	134196	25 %	0 %	25 %	50 %	39933196
3553	NC_005296	CCG	2	6	134213	134218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933196
3554	NC_005296	AGC	2	6	134219	134224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3555	NC_005296	GCGG	2	8	134289	134296	0 %	0 %	75 %	25 %	39933196
3556	NC_005296	CCT	2	6	134333	134338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933196
3557	NC_005296	CTGGCC	2	12	134380	134391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39933196
3558	NC_005296	GGT	2	6	134412	134417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933196
3559	NC_005296	GC	3	6	134444	134449	0 %	0 %	50 %	50 %	39933196
3560	NC_005296	CGT	2	6	134475	134480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3561	NC_005296	CTG	2	6	134488	134493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3562	NC_005296	CGC	2	6	134583	134588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933196
3563	NC_005296	AGC	2	6	134595	134600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3564	NC_005296	CGG	2	6	134601	134606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933196
3565	NC_005296	ACC	2	6	134635	134640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933196
3566	NC_005296	CGA	2	6	134666	134671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3567	NC_005296	CGC	3	9	134697	134705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933196
3568	NC_005296	GGC	2	6	134729	134734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933196
3569	NC_005296	GCT	2	6	134760	134765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933196
3570	NC_005296	ATC	2	6	134789	134794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933197
3571	NC_005296	TAT	2	6	134800	134805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39933197
3572	NC_005296	TAT	2	6	134894	134899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39933197
3573	NC_005296	TGA	2	6	134913	134918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933197
3574	NC_005296	CGCC	2	8	134952	134959	0 %	0 %	25 %	75 %	39933197
3575	NC_005296	GGCC	2	8	135082	135089	0 %	0 %	50 %	50 %	39933197
3576	NC_005296	CTG	2	6	135146	135151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933197
3577	NC_005296	GCA	2	6	135163	135168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933197
3578	NC_005296	CG	3	6	135250	135255	0 %	0 %	50 %	50 %	39933197
3579	NC_005296	TCGA	2	8	135257	135264	25 %	25 %	25 %	25 %	39933197
3580	NC_005296	GTC	2	6	135329	135334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933197
3581	NC_005296	CTG	2	6	135535	135540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933197
3582	NC_005296	GAG	2	6	135545	135550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933197
3583	NC_005296	GGAT	2	8	135566	135573	25 %	25 %	50 %	0 %	39933197
3584	NC_005296	CGG	2	6	135625	135630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933197
3585	NC_005296	GGC	2	6	135646	135651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933197
3586	NC_005296	GCG	2	6	135662	135667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_005296	CGG	2	6	135692	135697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_005296	GCT	2	6	135704	135709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_005296	GC	3	6	135721	135726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_005296	ACAGA	2	10	135735	135744	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3591	NC_005296	GAA	2	6	135759	135764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_005296	CG	3	6	135828	135833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_005296	CGG	2	6	135850	135855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_005296	GCA	2	6	135861	135866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_005296	CGC	2	6	135888	135893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_005296	GAT	2	6	135903	135908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_005296	CCGG	2	8	135911	135918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_005296	CG	3	6	135919	135924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_005296	GAC	2	6	136033	136038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_005296	CGC	2	6	136041	136046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_005296	GC	4	8	136089	136096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_005296	AGA	2	6	136112	136117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933198
3603	NC_005296	CAT	2	6	136161	136166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933198
3604	NC_005296	CCGG	2	8	136167	136174	0 %	0 %	50 %	50 %	39933198
3605	NC_005296	GC	3	6	136175	136180	0 %	0 %	50 %	50 %	39933198
3606	NC_005296	CGC	2	6	136241	136246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933198
3607	NC_005296	GCC	2	6	136287	136292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933198
3608	NC_005296	GAGC	2	8	136293	136300	25 %	0 %	50 %	25 %	39933198
3609	NC_005296	ATG	2	6	136327	136332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933198
3610	NC_005296	CGG	3	9	136397	136405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933198
3611	NC_005296	GCA	2	6	136448	136453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933198
3612	NC_005296	GCTG	2	8	136525	136532	0 %	25 %	50 %	25 %	39933198
3613	NC_005296	GTG	2	6	136584	136589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933198
3614	NC_005296	CTG	2	6	136596	136601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933198
3615	NC_005296	CGC	2	6	136603	136608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933198
3616	NC_005296	GCC	2	6	136631	136636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933198
3617	NC_005296	CGAG	2	8	136720	136727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_005296	GATG	2	8	136733	136740	25 %	25 %	50 %	0 %	39933199
3619	NC_005296	GCG	2	6	136750	136755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933199
3620	NC_005296	TGC	2	6	136873	136878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933199
3621	NC_005296	GCG	2	6	136896	136901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933199
3622	NC_005296	GCC	2	6	136913	136918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933199
3623	NC_005296	CGC	2	6	136943	136948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933199
3624	NC_005296	GGGC	2	8	136957	136964	0 %	0 %	75 %	25 %	39933199
3625	NC_005296	GCTCG	2	10	136976	136985	0 %	20 %	40 %	40 %	39933199
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3627	NC_005296	GCG	2	6	137080	137085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933199
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3993	NC_005296	CGG	2	6	151894	151899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933211
3994	NC_005296	GGCT	2	8	151915	151922	0 %	25 %	50 %	25 %	39933211
3995	NC_005296	GAC	2	6	151972	151977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933212
3996	NC_005296	GGC	2	6	152023	152028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933212
3997	NC_005296	CGA	2	6	152130	152135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933212
3998	NC_005296	GAA	2	6	152191	152196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933212
3999	NC_005296	TCG	2	6	152222	152227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933212
4000	NC_005296	GC	3	6	152233	152238	0 %	0 %	50 %	50 %	39933212

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