MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005296	CG	3	6	112554	112559	0 %	0 %	50 %	50 %	39933179
3002	NC_005296	GCCGC	2	10	112575	112584	0 %	0 %	40 %	60 %	39933179
3003	NC_005296	CGGC	2	8	112616	112623	0 %	0 %	50 %	50 %	39933179
3004	NC_005296	TCG	2	6	112640	112645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933179
3005	NC_005296	TCG	2	6	112772	112777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933179
3006	NC_005296	CAG	2	6	112783	112788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933179
3007	NC_005296	CGGC	2	8	112792	112799	0 %	0 %	50 %	50 %	39933179
3008	NC_005296	ATC	2	6	112817	112822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933179
3009	NC_005296	GCC	2	6	112837	112842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933179
3010	NC_005296	GC	3	6	112868	112873	0 %	0 %	50 %	50 %	39933179
3011	NC_005296	GCC	2	6	112880	112885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933179
3012	NC_005296	CGG	2	6	112923	112928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933179
3013	NC_005296	GCC	2	6	112944	112949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933179
3014	NC_005296	ATA	2	6	112954	112959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39933179
3015	NC_005296	CGC	2	6	113043	113048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933179
3016	NC_005296	CGGG	2	8	113068	113075	0 %	0 %	75 %	25 %	39933179
3017	NC_005296	C	6	6	113110	113115	0 %	0 %	0 %	100 %	39933179
3018	NC_005296	GCA	2	6	113136	113141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933179
3019	NC_005296	CAT	2	6	113311	113316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933179
3020	NC_005296	CCG	2	6	113322	113327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933180
3021	NC_005296	CCA	2	6	113421	113426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933180
3022	NC_005296	ATC	2	6	113458	113463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933180
3023	NC_005296	GCCGAG	2	12	113490	113501	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39933180
3024	NC_005296	GCC	2	6	113511	113516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933180
3025	NC_005296	CGG	2	6	113565	113570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933180
3026	NC_005296	GCA	2	6	113582	113587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933180
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3028	NC_005296	CG	3	6	113627	113632	0 %	0 %	50 %	50 %	39933180
3029	NC_005296	TGA	2	6	113639	113644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933180
3030	NC_005296	GC	3	6	113674	113679	0 %	0 %	50 %	50 %	39933180
3031	NC_005296	CG	3	6	113686	113691	0 %	0 %	50 %	50 %	39933180
3032	NC_005296	CAG	2	6	113775	113780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933180
3033	NC_005296	CGG	2	6	113781	113786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933180
3034	NC_005296	GCC	2	6	113835	113840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933180
3035	NC_005296	GAA	2	6	113841	113846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933180
3036	NC_005296	GCC	2	6	113893	113898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933180
3037	NC_005296	GCC	2	6	113925	113930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933180
3038	NC_005296	GCC	2	6	113989	113994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933180
3039	NC_005296	CGA	2	6	114014	114019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933180
3040	NC_005296	AGC	3	9	114070	114078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933180
3041	NC_005296	CGGA	2	8	114104	114111	25 %	0 %	50 %	25 %	39933180
3042	NC_005296	GCGCA	2	10	114126	114135	20 %	0 %	40 %	40 %	39933180
3043	NC_005296	GATC	2	8	114247	114254	25 %	25 %	25 %	25 %	39933181
3044	NC_005296	AGA	2	6	114307	114312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933181
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3046	NC_005296	CCA	2	6	114400	114405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933181
3047	NC_005296	CAC	2	6	114494	114499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933181
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3049	NC_005296	CCG	2	6	114541	114546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933181
3050	NC_005296	CGA	2	6	114592	114597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933181
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3053	NC_005296	AGC	2	6	114738	114743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933181
3054	NC_005296	AGA	2	6	114754	114759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933181
3055	NC_005296	CCA	2	6	114865	114870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933181
3056	NC_005296	CGC	2	6	114878	114883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933181
3057	NC_005296	AGT	2	6	114943	114948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933181
3058	NC_005296	CCCA	2	8	115064	115071	25 %	0 %	0 %	75 %	39933181
3059	NC_005296	TCA	2	6	115129	115134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933181
3060	NC_005296	CAG	3	9	115145	115153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933181
3061	NC_005296	GAG	2	6	115190	115195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933181
3062	NC_005296	TCG	2	6	115209	115214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_005296	TTC	2	6	115234	115239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933182
3064	NC_005296	TCG	2	6	115261	115266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3065	NC_005296	GCG	2	6	115268	115273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933182
3066	NC_005296	AGA	2	6	115352	115357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933182
3067	NC_005296	CGA	3	9	115370	115378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3068	NC_005296	TCT	2	6	115379	115384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933182
3069	NC_005296	CGA	2	6	115416	115421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3070	NC_005296	CT	3	6	115423	115428	0 %	50 %	0 %	50 %	39933182
3071	NC_005296	GGC	2	6	115431	115436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933182
3072	NC_005296	TCG	2	6	115450	115455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3073	NC_005296	CTG	2	6	115473	115478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3074	NC_005296	GAT	2	6	115491	115496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933182
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3078	NC_005296	GTG	2	6	115738	115743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933182
3079	NC_005296	TCG	2	6	115777	115782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3080	NC_005296	AGC	2	6	115783	115788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3081	NC_005296	TTG	2	6	115789	115794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933182
3082	NC_005296	TTC	2	6	115828	115833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933182
3083	NC_005296	GCG	2	6	115841	115846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933182
3084	NC_005296	CGGTC	2	10	115860	115869	0 %	20 %	40 %	40 %	39933182
3085	NC_005296	AAGGC	2	10	115871	115880	40 %	0 %	40 %	20 %	39933182
3086	NC_005296	GCC	2	6	115884	115889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933182
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3089	NC_005296	GACG	2	8	115940	115947	25 %	0 %	50 %	25 %	39933182
3090	NC_005296	CGT	2	6	115952	115957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3091	NC_005296	CTT	3	9	115965	115973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933182
3092	NC_005296	GAC	3	9	116028	116036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3093	NC_005296	CGC	2	6	116102	116107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933182
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3095	NC_005296	GCC	2	6	116174	116179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933182
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3097	NC_005296	GTA	2	6	116214	116219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933182
3098	NC_005296	CCG	2	6	116393	116398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933182
3099	NC_005296	GAT	2	6	116453	116458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933182
3100	NC_005296	CGT	2	6	116513	116518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933182
3101	NC_005296	GTC	2	6	116613	116618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933182
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3103	NC_005296	GCC	2	6	116787	116792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933182
3104	NC_005296	CAT	2	6	116826	116831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933182
3105	NC_005296	GGGC	2	8	116912	116919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_005296	CCGG	2	8	116934	116941	0 %	0 %	50 %	50 %	39933183
3107	NC_005296	CGGC	2	8	116974	116981	0 %	0 %	50 %	50 %	39933183
3108	NC_005296	GGC	3	9	116979	116987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933183
3109	NC_005296	CGG	2	6	116992	116997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933183
3110	NC_005296	CGGC	2	8	117043	117050	0 %	0 %	50 %	50 %	39933183
3111	NC_005296	CGT	2	6	117091	117096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933183
3112	NC_005296	GGCGA	2	10	117104	117113	20 %	0 %	60 %	20 %	39933183
3113	NC_005296	GCG	2	6	117139	117144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933183
3114	NC_005296	ACCG	2	8	117184	117191	25 %	0 %	25 %	50 %	39933183
3115	NC_005296	GCG	2	6	117194	117199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933183
3116	NC_005296	GATC	2	8	117229	117236	25 %	25 %	25 %	25 %	39933183
3117	NC_005296	CGA	2	6	117272	117277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933183
3118	NC_005296	CGA	2	6	117328	117333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933183
3119	NC_005296	GC	3	6	117368	117373	0 %	0 %	50 %	50 %	39933183
3120	NC_005296	AGC	2	6	117374	117379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933183
3121	NC_005296	TGC	2	6	117664	117669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933183
3122	NC_005296	GTG	2	6	117699	117704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933183
3123	NC_005296	CGT	2	6	117706	117711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933183
3124	NC_005296	GCGTC	2	10	117724	117733	0 %	20 %	40 %	40 %	39933183
3125	NC_005296	CCG	2	6	117766	117771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933183
3126	NC_005296	GCC	2	6	117779	117784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933183
3127	NC_005296	GGT	2	6	117809	117814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933183
3128	NC_005296	GCC	2	6	117833	117838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933183
3129	NC_005296	TGC	2	6	117866	117871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933183
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3131	NC_005296	GCC	2	6	117901	117906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933184
3132	NC_005296	CGG	2	6	117946	117951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933184
3133	NC_005296	ACG	2	6	117977	117982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933184
3134	NC_005296	TGC	2	6	118008	118013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933184
3135	NC_005296	GAT	2	6	118020	118025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933184
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3140	NC_005296	AGT	2	6	118290	118295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933184
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3145	NC_005296	TGC	2	6	118376	118381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933184
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3149	NC_005296	TTC	2	6	118525	118530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933184
3150	NC_005296	GGC	2	6	118555	118560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933184
3151	NC_005296	GCCAG	2	10	118573	118582	20 %	0 %	40 %	40 %	39933184
3152	NC_005296	CG	3	6	118589	118594	0 %	0 %	50 %	50 %	39933184
3153	NC_005296	CGA	2	6	118617	118622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933184
3154	NC_005296	GGTCG	2	10	118783	118792	0 %	20 %	60 %	20 %	39933184
3155	NC_005296	GTG	2	6	118820	118825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933184
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3159	NC_005296	CGC	2	6	118947	118952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933184
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3168	NC_005296	ACT	2	6	119240	119245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933184
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3175	NC_005296	GCGG	2	8	119485	119492	0 %	0 %	75 %	25 %	39933184
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3178	NC_005296	CGG	2	6	119562	119567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3179	NC_005296	GCC	3	9	119615	119623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3180	NC_005296	C	6	6	119622	119627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3181	NC_005296	CTT	2	6	119636	119641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3182	NC_005296	CGT	2	6	119688	119693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3183	NC_005296	GTCA	2	8	119697	119704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3184	NC_005296	GCAC	2	8	119759	119766	25 %	0 %	25 %	50 %	39933185
3185	NC_005296	GCC	2	6	119798	119803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933185
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3188	NC_005296	CGG	2	6	119857	119862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933185
3189	NC_005296	ATC	2	6	119891	119896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933185
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3195	NC_005296	TCG	2	6	120057	120062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933185
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3200	NC_005296	CGA	2	6	120331	120336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933185
3201	NC_005296	TGC	2	6	120369	120374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933185
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3203	NC_005296	CGA	2	6	120400	120405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933185
3204	NC_005296	ATG	2	6	120410	120415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933185
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3220	NC_005296	CGC	2	6	120934	120939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933185
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3222	NC_005296	TGC	2	6	120993	120998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933185
3223	NC_005296	GCT	2	6	121012	121017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933185
3224	NC_005296	TGC	2	6	121026	121031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933185
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3226	NC_005296	TCGA	2	8	121103	121110	25 %	25 %	25 %	25 %	39933185
3227	NC_005296	CGT	2	6	121147	121152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933185
3228	NC_005296	TCG	2	6	121220	121225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933185
3229	NC_005296	GTCG	2	8	121394	121401	0 %	25 %	50 %	25 %	39933186
3230	NC_005296	GCA	2	6	121426	121431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933186
3231	NC_005296	ATG	2	6	121473	121478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933186
3232	NC_005296	CG	3	6	121483	121488	0 %	0 %	50 %	50 %	39933186
3233	NC_005296	CGC	2	6	121498	121503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933186
3234	NC_005296	ATC	2	6	121562	121567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933186
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3236	NC_005296	CGA	2	6	121667	121672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933186
3237	NC_005296	GAC	2	6	121725	121730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933186
3238	NC_005296	GCC	2	6	121733	121738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933186
3239	NC_005296	GGT	2	6	121808	121813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933186
3240	NC_005296	CGGCG	2	10	121832	121841	0 %	0 %	60 %	40 %	39933186
3241	NC_005296	ATCG	2	8	121865	121872	25 %	25 %	25 %	25 %	39933186
3242	NC_005296	TCGGA	2	10	121873	121882	20 %	20 %	40 %	20 %	39933186
3243	NC_005296	TCG	2	6	121968	121973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933186
3244	NC_005296	CGC	2	6	122036	122041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933186
3245	NC_005296	GC	4	8	122048	122055	0 %	0 %	50 %	50 %	39933186
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3370	NC_005296	GC	3	6	126732	126737	0 %	0 %	50 %	50 %	39933190
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3451	NC_005296	CAA	2	6	129959	129964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3452	NC_005296	GCA	2	6	129970	129975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3456	NC_005296	CGATGT	2	12	130189	130200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	39933193
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3479	NC_005296	GAT	2	6	131281	131286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933193
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3484	NC_005296	T	6	6	131492	131497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3485	NC_005296	CGA	2	6	131514	131519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3486	NC_005296	CTT	2	6	131555	131560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933194
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3488	NC_005296	GCT	2	6	131608	131613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933194
3489	NC_005296	GC	3	6	131616	131621	0 %	0 %	50 %	50 %	39933194
3490	NC_005296	CAC	2	6	131648	131653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933194
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3492	NC_005296	GAA	2	6	131759	131764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933194
3493	NC_005296	CCAG	2	8	131803	131810	25 %	0 %	25 %	50 %	39933194
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3497	NC_005296	CCGG	2	8	132009	132016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3498	NC_005296	CTG	2	6	132167	132172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3499	NC_005296	ACG	2	6	132223	132228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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