MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_005296	AGCCG	2	10	93915	93924	20 %	0 %	40 %	40 %	229220836
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2504	NC_005296	GGC	2	6	93982	93987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229220836
2505	NC_005296	CG	3	6	93988	93993	0 %	0 %	50 %	50 %	229220836
2506	NC_005296	CGT	2	6	94017	94022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220836
2507	NC_005296	AATGC	2	10	94092	94101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2512	NC_005296	GC	3	6	94343	94348	0 %	0 %	50 %	50 %	39933162
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2748	NC_005296	GCC	2	6	103256	103261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2749	NC_005296	CTGC	2	8	103278	103285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2750	NC_005296	TGG	2	6	103313	103318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933171
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2752	NC_005296	CGA	2	6	103467	103472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933171
2753	NC_005296	CGG	2	6	103497	103502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933171
2754	NC_005296	GGC	2	6	103515	103520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933171
2755	NC_005296	CGG	2	6	103523	103528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933171
2756	NC_005296	CAC	2	6	103566	103571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933171
2757	NC_005296	ATC	2	6	103609	103614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933171
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2759	NC_005296	TAC	2	6	103628	103633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933171
2760	NC_005296	GCA	2	6	103674	103679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2761	NC_005296	CTA	2	6	103744	103749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2762	NC_005296	CAC	2	6	103777	103782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2763	NC_005296	CG	3	6	103785	103790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2764	NC_005296	CGG	2	6	103809	103814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2765	NC_005296	CGAC	2	8	103839	103846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2766	NC_005296	TCA	2	6	103871	103876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2768	NC_005296	CGT	2	6	103932	103937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2769	NC_005296	GAT	2	6	104010	104015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2772	NC_005296	GC	3	6	104172	104177	0 %	0 %	50 %	50 %	39933172
2773	NC_005296	TGC	2	6	104242	104247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933172
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2781	NC_005296	CG	3	6	104561	104566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2782	NC_005296	GCCCC	2	10	104577	104586	0 %	0 %	20 %	80 %	39933173
2783	NC_005296	AGC	2	6	104591	104596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933173
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2868	NC_005296	GACC	2	8	107189	107196	25 %	0 %	25 %	50 %	39933175
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2871	NC_005296	TCG	2	6	107323	107328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933175
2872	NC_005296	GC	3	6	107343	107348	0 %	0 %	50 %	50 %	39933175
2873	NC_005296	CGCC	2	8	107371	107378	0 %	0 %	25 %	75 %	39933175
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2875	NC_005296	CGC	2	6	107450	107455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933176
2876	NC_005296	GCT	2	6	107495	107500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933176
2877	NC_005296	CGC	2	6	107536	107541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933176
2878	NC_005296	CGA	2	6	107554	107559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933176
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2884	NC_005296	TCG	3	9	107814	107822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933176
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2896	NC_005296	CATCGG	2	12	108278	108289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933176
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2942	NC_005296	CGGTGC	2	12	110098	110109	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39933176
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2948	NC_005296	TGA	3	9	110326	110334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933176
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2950	NC_005296	GGCGC	2	10	110396	110405	0 %	0 %	60 %	40 %	39933176
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2955	NC_005296	TGT	2	6	110636	110641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2968	NC_005296	GAC	2	6	111240	111245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2982	NC_005296	GCCGCT	2	12	111796	111807	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39933178
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2984	NC_005296	GCC	2	6	111840	111845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933178
2985	NC_005296	CGG	2	6	111848	111853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933178
2986	NC_005296	AGC	2	6	111870	111875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933178
2987	NC_005296	CGGCG	2	10	111949	111958	0 %	0 %	60 %	40 %	39933178
2988	NC_005296	ATG	2	6	112044	112049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933178
2989	NC_005296	CGC	2	6	112054	112059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933178
2990	NC_005296	ACC	2	6	112065	112070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933178
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2992	NC_005296	CGA	2	6	112141	112146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933178
2993	NC_005296	GGT	2	6	112154	112159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933178
2994	NC_005296	GAAC	2	8	112198	112205	50 %	0 %	25 %	25 %	39933178
2995	NC_005296	CAC	2	6	112247	112252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933178
2996	NC_005296	ATC	2	6	112311	112316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933178
2997	NC_005296	GCG	2	6	112319	112324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933179
2998	NC_005296	GCG	2	6	112377	112382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933179
2999	NC_005296	CGAC	2	8	112393	112400	25 %	0 %	25 %	50 %	39933179
3000	NC_005296	CTC	2	6	112501	112506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933179

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