MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005296	GAT	2	6	56651	56656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933130
1502	NC_005296	GCCG	2	8	56668	56675	0 %	0 %	50 %	50 %	39933130
1503	NC_005296	GCC	2	6	56687	56692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933130
1504	NC_005296	TGC	2	6	56739	56744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933130
1505	NC_005296	GCG	2	6	56901	56906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933130
1506	NC_005296	CGA	3	9	56908	56916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933130
1507	NC_005296	TCG	2	6	56922	56927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933130
1508	NC_005296	TCG	2	6	56981	56986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933130
1509	NC_005296	CGTC	2	8	57016	57023	0 %	25 %	25 %	50 %	39933130
1510	NC_005296	CGG	2	6	57034	57039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933130
1511	NC_005296	CTGG	2	8	57040	57047	0 %	25 %	50 %	25 %	39933130
1512	NC_005296	TAT	2	6	57095	57100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39933130
1513	NC_005296	CTGC	2	8	57154	57161	0 %	25 %	25 %	50 %	39933130
1514	NC_005296	CTGG	2	8	57172	57179	0 %	25 %	50 %	25 %	39933130
1515	NC_005296	GC	4	8	57181	57188	0 %	0 %	50 %	50 %	39933130
1516	NC_005296	GC	3	6	57196	57201	0 %	0 %	50 %	50 %	39933130
1517	NC_005296	CAG	2	6	57239	57244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933130
1518	NC_005296	TTC	2	6	57251	57256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933130
1519	NC_005296	CG	3	6	57336	57341	0 %	0 %	50 %	50 %	39933130
1520	NC_005296	CAA	2	6	57349	57354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933130
1521	NC_005296	TTC	2	6	57395	57400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933130
1522	NC_005296	CCG	2	6	57417	57422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933130
1523	NC_005296	CGG	2	6	57424	57429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933130
1524	NC_005296	GAT	2	6	57509	57514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933130
1525	NC_005296	TCG	2	6	57519	57524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933130
1526	NC_005296	CG	3	6	57553	57558	0 %	0 %	50 %	50 %	39933130
1527	NC_005296	CA	3	6	57640	57645	50 %	0 %	0 %	50 %	39933130
1528	NC_005296	AGCATC	2	12	57770	57781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	39933131
1529	NC_005296	GAG	2	6	57818	57823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933131
1530	NC_005296	TGC	2	6	57825	57830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933131
1531	NC_005296	CGGCTT	2	12	57880	57891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933131
1532	NC_005296	CGA	2	6	58126	58131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933131
1533	NC_005296	ATC	2	6	58163	58168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933131
1534	NC_005296	CCA	2	6	58176	58181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933131
1535	NC_005296	GGT	2	6	58213	58218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933131
1536	NC_005296	GGT	3	9	58243	58251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933131
1537	NC_005296	CAT	2	6	58282	58287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933131
1538	NC_005296	CGC	2	6	58292	58297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933131
1539	NC_005296	CCG	2	6	58325	58330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933131
1540	NC_005296	ACC	2	6	58373	58378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_005296	CCG	2	6	58432	58437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_005296	CGG	2	6	58443	58448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_005296	CCG	2	6	58450	58455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_005296	GCC	2	6	58469	58474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_005296	CG	3	6	58540	58545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_005296	CCG	2	6	58579	58584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_005296	TGA	2	6	58625	58630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933132
1548	NC_005296	AAG	2	6	58687	58692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933132
1549	NC_005296	TGC	3	9	58763	58771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933132
1550	NC_005296	CAC	2	6	58788	58793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933132
1551	NC_005296	CG	3	6	58863	58868	0 %	0 %	50 %	50 %	39933132
1552	NC_005296	CGAT	2	8	58880	58887	25 %	25 %	25 %	25 %	39933132
1553	NC_005296	CTG	3	9	58927	58935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933132
1554	NC_005296	ACC	2	6	58958	58963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933132
1555	NC_005296	CGCC	2	8	58983	58990	0 %	0 %	25 %	75 %	39933132
1556	NC_005296	TGC	2	6	58991	58996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933132
1557	NC_005296	AAG	2	6	59014	59019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933132
1558	NC_005296	GC	3	6	59022	59027	0 %	0 %	50 %	50 %	39933132
1559	NC_005296	GCG	2	6	59080	59085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933132
1560	NC_005296	CCGGG	2	10	59106	59115	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1561	NC_005296	CG	3	6	59212	59217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_005296	TGA	2	6	59228	59233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_005296	TGA	2	6	59248	59253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_005296	CGA	2	6	59321	59326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_005296	GAG	2	6	59353	59358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_005296	CCT	2	6	59369	59374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_005296	GAT	2	6	59405	59410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_005296	CTC	2	6	59427	59432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_005296	TCA	2	6	59469	59474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_005296	CGT	3	9	59519	59527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_005296	GTT	2	6	59546	59551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_005296	CTG	2	6	59594	59599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_005296	CAG	2	6	59630	59635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_005296	CGCGT	2	10	59660	59669	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1575	NC_005296	GCT	2	6	59740	59745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933133
1576	NC_005296	GTA	2	6	59938	59943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933133
1577	NC_005296	CTC	2	6	59966	59971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_005296	ATT	2	6	60007	60012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39933134
1579	NC_005296	TCCGGC	2	12	60048	60059	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39933134
1580	NC_005296	TCGA	2	8	60069	60076	25 %	25 %	25 %	25 %	39933134
1581	NC_005296	CAA	2	6	60077	60082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933134
1582	NC_005296	TTC	2	6	60087	60092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933134
1583	NC_005296	CTG	2	6	60194	60199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933134
1584	NC_005296	TGC	2	6	60304	60309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933134
1585	NC_005296	TGT	2	6	60325	60330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933134
1586	NC_005296	G	6	6	60333	60338	0 %	0 %	100 %	0 %	39933134
1587	NC_005296	GAC	2	6	60356	60361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933134
1588	NC_005296	TCG	2	6	60384	60389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933134
1589	NC_005296	CAG	2	6	60395	60400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933134
1590	NC_005296	GTCCA	2	10	60503	60512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1591	NC_005296	AAG	2	6	60544	60549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_005296	CCA	2	6	60566	60571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_005296	CGG	2	6	60600	60605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933135
1594	NC_005296	CGG	2	6	60613	60618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933135
1595	NC_005296	GCG	3	9	60637	60645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933135
1596	NC_005296	CGG	2	6	60671	60676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933135
1597	NC_005296	C	7	7	60709	60715	0 %	0 %	0 %	100 %	39933135
1598	NC_005296	ACC	2	6	60741	60746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933135
1599	NC_005296	TCC	2	6	60873	60878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933135
1600	NC_005296	GCG	2	6	60907	60912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933135
1601	NC_005296	CAG	2	6	60950	60955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933135
1602	NC_005296	CGG	2	6	60962	60967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933135
1603	NC_005296	GTC	2	6	60993	60998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933135
1604	NC_005296	GCG	2	6	61021	61026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933135
1605	NC_005296	TCA	2	6	61054	61059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933135
1606	NC_005296	GTG	2	6	61119	61124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933135
1607	NC_005296	TCG	2	6	61200	61205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933135
1608	NC_005296	GCC	2	6	61265	61270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933135
1609	NC_005296	GC	3	6	61319	61324	0 %	0 %	50 %	50 %	39933135
1610	NC_005296	CG	3	6	61338	61343	0 %	0 %	50 %	50 %	39933135
1611	NC_005296	TGT	3	9	61390	61398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933135
1612	NC_005296	CGGC	2	8	61456	61463	0 %	0 %	50 %	50 %	39933135
1613	NC_005296	CGT	2	6	61468	61473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933135
1614	NC_005296	GAC	2	6	61475	61480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933135
1615	NC_005296	GCC	2	6	61484	61489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933135
1616	NC_005296	CAC	3	9	61729	61737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933136
1617	NC_005296	CGG	2	6	61744	61749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933136
1618	NC_005296	GTC	2	6	61849	61854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933136
1619	NC_005296	GTG	2	6	61859	61864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933136
1620	NC_005296	CAG	2	6	61867	61872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933136
1621	NC_005296	GCC	2	6	61922	61927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933136
1622	NC_005296	GCA	2	6	61947	61952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933136
1623	NC_005296	AGA	2	6	61962	61967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933136
1624	NC_005296	GAA	2	6	62029	62034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933136
1625	NC_005296	CAG	2	6	62044	62049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933136
1626	NC_005296	CAG	2	6	62101	62106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933136
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1628	NC_005296	GCA	2	6	62157	62162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933136
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1750	NC_005296	CG	3	6	66620	66625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1751	NC_005296	CGA	2	6	66648	66653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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