MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005296	TCGG	2	8	36910	36917	0 %	25 %	50 %	25 %	39933110
1002	NC_005296	CGC	2	6	36920	36925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933110
1003	NC_005296	AGC	2	6	36931	36936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933110
1004	NC_005296	AGC	2	6	36943	36948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933110
1005	NC_005296	GAC	2	6	36965	36970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933110
1006	NC_005296	TCG	2	6	36977	36982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933110
1007	NC_005296	GC	3	6	37001	37006	0 %	0 %	50 %	50 %	39933110
1008	NC_005296	GTC	2	6	37062	37067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933110
1009	NC_005296	GCG	2	6	37074	37079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933110
1010	NC_005296	GCA	2	6	37085	37090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933110
1011	NC_005296	GCG	2	6	37116	37121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933110
1012	NC_005296	CAG	2	6	37188	37193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_005296	GAG	2	6	37194	37199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_005296	CGC	2	6	37203	37208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_005296	CG	3	6	37216	37221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_005296	TGA	2	6	37284	37289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_005296	CG	3	6	37299	37304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_005296	GAA	2	6	37307	37312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_005296	CCG	2	6	37319	37324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_005296	CCA	2	6	37350	37355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933111
1021	NC_005296	CGC	2	6	37368	37373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933111
1022	NC_005296	GC	3	6	37399	37404	0 %	0 %	50 %	50 %	39933111
1023	NC_005296	GCCGAA	2	12	37409	37420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933111
1024	NC_005296	CGC	2	6	37424	37429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933111
1025	NC_005296	GCC	2	6	37436	37441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933111
1026	NC_005296	GC	4	8	37454	37461	0 %	0 %	50 %	50 %	39933111
1027	NC_005296	TCA	2	6	37565	37570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_005296	ATT	2	6	37590	37595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_005296	GAAC	2	8	37645	37652	50 %	0 %	25 %	25 %	39933112
1030	NC_005296	CGGC	2	8	37720	37727	0 %	0 %	50 %	50 %	39933112
1031	NC_005296	TGC	2	6	37732	37737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933112
1032	NC_005296	GCT	2	6	37751	37756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933112
1033	NC_005296	GCC	2	6	37775	37780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933112
1034	NC_005296	GGC	2	6	37819	37824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933112
1035	NC_005296	GC	3	6	37823	37828	0 %	0 %	50 %	50 %	39933112
1036	NC_005296	GCC	2	6	38004	38009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933112
1037	NC_005296	GCT	2	6	38027	38032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933112
1038	NC_005296	ACA	2	6	38056	38061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933112
1039	NC_005296	CGT	2	6	38087	38092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933112
1040	NC_005296	CGG	2	6	38144	38149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933112
1041	NC_005296	CGG	3	9	38165	38173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933112
1042	NC_005296	GGC	2	6	38230	38235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933113
1043	NC_005296	TCGGCT	2	12	38257	38268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933113
1044	NC_005296	CGA	2	6	38336	38341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933113
1045	NC_005296	CAC	2	6	38406	38411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933113
1046	NC_005296	CGCGC	2	10	38480	38489	0 %	0 %	40 %	60 %	39933113
1047	NC_005296	GAT	2	6	38571	38576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933113
1048	NC_005296	ATC	2	6	38605	38610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933113
1049	NC_005296	GAT	2	6	38664	38669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933113
1050	NC_005296	AGCCGA	2	12	38684	38695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933113
1051	NC_005296	AC	3	6	38757	38762	50 %	0 %	0 %	50 %	39933113
1052	NC_005296	GCG	2	6	38792	38797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933113
1053	NC_005296	GCG	2	6	38890	38895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933113
1054	NC_005296	TGA	2	6	38924	38929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933113
1055	NC_005296	CAG	2	6	38958	38963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933113
1056	NC_005296	ATG	2	6	38980	38985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933113
1057	NC_005296	CTTC	2	8	39035	39042	0 %	50 %	0 %	50 %	39933113
1058	NC_005296	CAC	2	6	39081	39086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933113
1059	NC_005296	TGC	2	6	39114	39119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_005296	GAT	2	6	39143	39148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_005296	CAC	2	6	39208	39213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_005296	GCCG	2	8	39222	39229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_005296	CGG	2	6	39288	39293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_005296	ACG	2	6	39294	39299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_005296	GTC	2	6	39348	39353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_005296	CGC	2	6	39369	39374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_005296	GCCG	2	8	39375	39382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_005296	GCC	2	6	39411	39416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_005296	CCATG	2	10	39433	39442	20 %	20 %	20 %	40 %	39933114
1070	NC_005296	TGC	2	6	39501	39506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933114
1071	NC_005296	GGGC	3	12	39514	39525	0 %	0 %	75 %	25 %	39933114
1072	NC_005296	CG	3	6	39540	39545	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1073	NC_005296	GTG	2	6	39557	39562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933114
1074	NC_005296	CGGCGC	2	12	39565	39576	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1075	NC_005296	CG	3	6	39592	39597	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1076	NC_005296	GGC	2	6	39607	39612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933114
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1078	NC_005296	G	6	6	39653	39658	0 %	0 %	100 %	0 %	39933114
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1081	NC_005296	GC	3	6	39752	39757	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1082	NC_005296	CGC	2	6	39812	39817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933114
1083	NC_005296	CG	3	6	39828	39833	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1084	NC_005296	GGC	2	6	39850	39855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933114
1085	NC_005296	GCG	2	6	39950	39955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933114
1086	NC_005296	CGA	2	6	39981	39986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933114
1087	NC_005296	GC	4	8	40000	40007	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1088	NC_005296	ACCGC	2	10	40038	40047	20 %	0 %	20 %	60 %	39933114
1089	NC_005296	GCT	2	6	40048	40053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933114
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1091	NC_005296	GCCG	2	8	40175	40182	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1092	NC_005296	GC	4	8	40190	40197	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1093	NC_005296	CAT	2	6	40198	40203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933114
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1096	NC_005296	CG	3	6	40353	40358	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1097	NC_005296	CAT	2	6	40366	40371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933114
1098	NC_005296	CGA	2	6	40381	40386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933114
1099	NC_005296	CGG	2	6	40417	40422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933114
1100	NC_005296	CGC	2	6	40471	40476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933114
1101	NC_005296	CGG	3	9	40611	40619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933114
1102	NC_005296	CGG	2	6	40624	40629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933114
1103	NC_005296	GC	3	6	40741	40746	0 %	0 %	50 %	50 %	39933114
1104	NC_005296	CGC	2	6	40753	40758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933114
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1107	NC_005296	GCCC	2	8	40854	40861	0 %	0 %	25 %	75 %	39933114
1108	NC_005296	CGT	2	6	40881	40886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933114
1109	NC_005296	GCC	2	6	40919	40924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933115
1110	NC_005296	TCT	2	6	40927	40932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933115
1111	NC_005296	CG	3	6	40996	41001	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
1112	NC_005296	CTT	2	6	41093	41098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933115
1113	NC_005296	GCGCG	2	10	41110	41119	0 %	0 %	60 %	40 %	39933115
1114	NC_005296	CGA	2	6	41149	41154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933115
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1117	NC_005296	CCA	2	6	41266	41271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933115
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1119	NC_005296	CAGC	2	8	41437	41444	25 %	0 %	25 %	50 %	39933115
1120	NC_005296	GCCG	2	8	41503	41510	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
1121	NC_005296	GGA	2	6	41519	41524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933115
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1123	NC_005296	CGC	2	6	41542	41547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933115
1124	NC_005296	GCG	3	9	41646	41654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933115
1125	NC_005296	GCA	2	6	41665	41670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1126	NC_005296	GCC	3	9	41732	41740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933115
1127	NC_005296	CG	3	6	41797	41802	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
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1129	NC_005296	GCG	2	6	41822	41827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933115
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1256	NC_005296	GAA	2	6	47109	47114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_005296	CCG	2	6	47115	47120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1259	NC_005296	GCA	2	6	47166	47171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1385	NC_005296	GAC	2	6	52013	52018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933125
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