MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_005296	CCGG	2	8	543353	543360	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568
14002	NC_005296	CGA	2	6	543365	543370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14003	NC_005296	GCC	2	6	543417	543422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933568
14004	NC_005296	GCT	2	6	543526	543531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14005	NC_005296	GACA	2	8	543560	543567	50 %	0 %	25 %	25 %	39933568
14006	NC_005296	GC	3	6	543665	543670	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568
14007	NC_005296	GC	3	6	543716	543721	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568
14008	NC_005296	GCA	2	6	543758	543763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14009	NC_005296	GC	3	6	543821	543826	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568
14010	NC_005296	GGT	2	6	543834	543839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933568
14011	NC_005296	CCG	2	6	543877	543882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933568
14012	NC_005296	CCG	2	6	543896	543901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933568
14013	NC_005296	GGC	2	6	543908	543913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933568
14014	NC_005296	CGAGC	2	10	544068	544077	20 %	0 %	40 %	40 %	39933568
14015	NC_005296	ACC	2	6	544078	544083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933568
14016	NC_005296	GCG	2	6	544084	544089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933568
14017	NC_005296	CCG	2	6	544090	544095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933568
14018	NC_005296	TCG	2	6	544132	544137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14019	NC_005296	GCA	2	6	544244	544249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14020	NC_005296	ATC	2	6	544258	544263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933568
14021	NC_005296	AGC	3	9	544285	544293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14022	NC_005296	TCG	2	6	544297	544302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14023	NC_005296	TCG	2	6	544372	544377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14024	NC_005296	CG	3	6	544403	544408	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568
14025	NC_005296	TCT	2	6	544457	544462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933568
14026	NC_005296	CGA	2	6	544505	544510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14027	NC_005296	TTG	2	6	544513	544518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933568
14028	NC_005296	CG	3	6	544526	544531	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568
14029	NC_005296	CAG	2	6	544658	544663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933568
14030	NC_005296	CGC	2	6	544741	544746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14031	NC_005296	TCGG	2	8	544806	544813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14032	NC_005296	CCCA	2	8	544826	544833	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14033	NC_005296	CGG	2	6	544914	544919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_005296	CCG	2	6	544938	544943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14035	NC_005296	GCC	2	6	544963	544968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14036	NC_005296	CGG	2	6	544972	544977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_005296	GCG	2	6	544981	544986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_005296	CGG	2	6	545018	545023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933569
14039	NC_005296	GCCA	2	8	545127	545134	25 %	0 %	25 %	50 %	39933569
14040	NC_005296	GCT	2	6	545149	545154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933569
14041	NC_005296	GATC	2	8	545395	545402	25 %	25 %	25 %	25 %	39933569
14042	NC_005296	CGC	2	6	545404	545409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933569
14043	NC_005296	GTCA	2	8	545420	545427	25 %	25 %	25 %	25 %	39933569
14044	NC_005296	GTC	2	6	545438	545443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933569
14045	NC_005296	CGG	3	9	545447	545455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933569
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14049	NC_005296	GCC	2	6	545606	545611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933569
14050	NC_005296	ATC	2	6	545666	545671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933569
14051	NC_005296	GCGA	2	8	545715	545722	25 %	0 %	50 %	25 %	39933569
14052	NC_005296	GC	3	6	545732	545737	0 %	0 %	50 %	50 %	39933569
14053	NC_005296	CAG	2	6	545792	545797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933569
14054	NC_005296	CCCA	2	8	545798	545805	25 %	0 %	0 %	75 %	39933569
14055	NC_005296	GGC	2	6	545848	545853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933569
14056	NC_005296	ACGA	2	8	545865	545872	50 %	0 %	25 %	25 %	39933569
14057	NC_005296	CCTG	2	8	545876	545883	0 %	25 %	25 %	50 %	39933569
14058	NC_005296	CTGCG	2	10	546042	546051	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14059	NC_005296	ATG	2	6	546110	546115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_005296	CTG	2	6	546127	546132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14061	NC_005296	CGG	2	6	546139	546144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_005296	GCG	2	6	546244	546249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933570
14063	NC_005296	GTGCG	2	10	546300	546309	0 %	20 %	60 %	20 %	39933570
14064	NC_005296	GGT	2	6	546353	546358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933570
14065	NC_005296	GC	3	6	546421	546426	0 %	0 %	50 %	50 %	39933570
14066	NC_005296	AAG	2	6	546434	546439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933570
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14068	NC_005296	CGC	2	6	546474	546479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14069	NC_005296	TTGA	2	8	546494	546501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_005296	CGG	2	6	546507	546512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_005296	CGTG	2	8	546540	546547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14072	NC_005296	TTCG	2	8	546637	546644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14073	NC_005296	TCG	2	6	546699	546704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_005296	GCA	2	6	546732	546737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_005296	GCC	3	9	546741	546749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14076	NC_005296	ACC	2	6	546848	546853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933571
14077	NC_005296	GTC	2	6	546884	546889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
14078	NC_005296	GCTCA	2	10	546932	546941	20 %	20 %	20 %	40 %	39933571
14079	NC_005296	GCT	2	6	546946	546951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
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14081	NC_005296	CTG	2	6	547022	547027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
14082	NC_005296	GCG	3	9	547053	547061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933571
14083	NC_005296	ATC	2	6	547145	547150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933571
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14088	NC_005296	ACTT	2	8	547256	547263	25 %	50 %	0 %	25 %	39933571
14089	NC_005296	AAGG	2	8	547265	547272	50 %	0 %	50 %	0 %	39933571
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14093	NC_005296	GCA	2	6	547470	547475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933571
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14096	NC_005296	TGC	2	6	547512	547517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
14097	NC_005296	CG	3	6	547530	547535	0 %	0 %	50 %	50 %	39933571
14098	NC_005296	GAC	2	6	547574	547579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933571
14099	NC_005296	CTG	2	6	547598	547603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
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14104	NC_005296	TGG	2	6	547800	547805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933571
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14106	NC_005296	TCG	2	6	547872	547877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
14107	NC_005296	GCG	2	6	547890	547895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933571
14108	NC_005296	CGG	3	9	547915	547923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933571
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14110	NC_005296	TGC	2	6	548034	548039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
14111	NC_005296	CG	3	6	548116	548121	0 %	0 %	50 %	50 %	39933571
14112	NC_005296	CGTT	2	8	548168	548175	0 %	50 %	25 %	25 %	39933571
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14115	NC_005296	TCGGC	2	10	548283	548292	0 %	20 %	40 %	40 %	39933571
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14123	NC_005296	GCC	2	6	548575	548580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933571
14124	NC_005296	AG	3	6	548591	548596	50 %	0 %	50 %	0 %	39933571
14125	NC_005296	CATCG	2	10	548660	548669	20 %	20 %	20 %	40 %	39933571
14126	NC_005296	TCG	2	6	548748	548753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
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14128	NC_005296	AGA	2	6	548817	548822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933571
14129	NC_005296	CGG	2	6	548845	548850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933571
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14131	NC_005296	CAT	2	6	548902	548907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933571
14132	NC_005296	GGC	2	6	548965	548970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933571
14133	NC_005296	CGCGG	2	10	548975	548984	0 %	0 %	60 %	40 %	39933571
14134	NC_005296	GCT	3	9	548995	549003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
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14138	NC_005296	CTG	2	6	549077	549082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933571
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14149	NC_005296	CGGT	2	8	549564	549571	0 %	25 %	50 %	25 %	39933571
14150	NC_005296	TGG	2	6	549588	549593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933571
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14157	NC_005296	TCC	2	6	549870	549875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933571
14158	NC_005296	GAT	2	6	549913	549918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933571
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14160	NC_005296	GCCA	2	8	549935	549942	25 %	0 %	25 %	50 %	39933571
14161	NC_005296	GGC	2	6	549952	549957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933571
14162	NC_005296	ACC	9	27	549965	549991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933571
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14164	NC_005296	CGGC	2	8	550031	550038	0 %	0 %	50 %	50 %	39933571
14165	NC_005296	CGG	2	6	550059	550064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14166	NC_005296	GCA	3	9	550089	550097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933572
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14179	NC_005296	GCC	2	6	550654	550659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933572
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14184	NC_005296	CGA	2	6	550818	550823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933572
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14189	NC_005296	TCG	2	6	551009	551014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933572
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14193	NC_005296	CGT	3	9	551116	551124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933572
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14196	NC_005296	GTC	2	6	551158	551163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933572
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14200	NC_005296	CGA	2	6	551366	551371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933573
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14202	NC_005296	CGT	2	6	551385	551390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933573
14203	NC_005296	GCCGAT	2	12	551392	551403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933573
14204	NC_005296	GAT	2	6	551443	551448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933573
14205	NC_005296	GTC	2	6	551500	551505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933573
14206	NC_005296	ATC	3	9	551525	551533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933573
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14215	NC_005296	GC	3	6	551771	551776	0 %	0 %	50 %	50 %	39933573
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14222	NC_005296	GATC	2	8	551964	551971	25 %	25 %	25 %	25 %	39933573
14223	NC_005296	CG	3	6	551976	551981	0 %	0 %	50 %	50 %	39933573
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14228	NC_005296	TCG	2	6	552140	552145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933573
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14231	NC_005296	TCG	2	6	552176	552181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933573
14232	NC_005296	CG	3	6	552213	552218	0 %	0 %	50 %	50 %	39933573
14233	NC_005296	TCG	2	6	552287	552292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933573
14234	NC_005296	TCG	2	6	552344	552349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933573
14235	NC_005296	TCG	2	6	552464	552469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933573
14236	NC_005296	ATC	2	6	552484	552489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933573
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14239	NC_005296	GCG	2	6	552639	552644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933573
14240	NC_005296	GCG	2	6	552693	552698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933573
14241	NC_005296	CG	3	6	552703	552708	0 %	0 %	50 %	50 %	39933573
14242	NC_005296	TCG	2	6	552719	552724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933573
14243	NC_005296	TCG	2	6	552746	552751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933573
14244	NC_005296	CGCC	2	8	552777	552784	0 %	0 %	25 %	75 %	39933573
14245	NC_005296	CCG	2	6	552787	552792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933573
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14247	NC_005296	CG	3	6	552810	552815	0 %	0 %	50 %	50 %	39933573
14248	NC_005296	CGC	2	6	552837	552842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933573
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14251	NC_005296	GC	3	6	553073	553078	0 %	0 %	50 %	50 %	39933573
14252	NC_005296	TCGG	2	8	553088	553095	0 %	25 %	50 %	25 %	39933573
14253	NC_005296	CTTC	2	8	553098	553105	0 %	50 %	0 %	50 %	39933573
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14270	NC_005296	TGA	2	6	554022	554027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933575
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14273	NC_005296	CGGC	2	8	554102	554109	0 %	0 %	50 %	50 %	39933575
14274	NC_005296	TCG	2	6	554117	554122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933575
14275	NC_005296	CA	3	6	554263	554268	50 %	0 %	0 %	50 %	39933575
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14281	NC_005296	TCC	2	6	554554	554559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14282	NC_005296	TGG	2	6	554594	554599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14283	NC_005296	AG	3	6	554629	554634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14284	NC_005296	CGC	2	6	554653	554658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14285	NC_005296	GAG	2	6	554813	554818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14322	NC_005296	GGAC	2	8	556157	556164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14323	NC_005296	AGC	2	6	556207	556212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14349	NC_005296	GCTGG	2	10	557218	557227	0 %	20 %	60 %	20 %	39933579
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14355	NC_005296	CAG	2	6	557452	557457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933579
14356	NC_005296	CAG	2	6	557473	557478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933579
14357	NC_005296	CCGGCT	2	12	557520	557531	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39933579
14358	NC_005296	CGA	2	6	557581	557586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933579
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14361	NC_005296	GCA	2	6	557652	557657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933579
14362	NC_005296	GAG	2	6	557665	557670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933579
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14483	NC_005296	GCCCC	2	10	562861	562870	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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14485	NC_005296	CGC	2	6	562949	562954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14486	NC_005296	CCGCC	2	10	562994	563003	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14487	NC_005296	CCG	2	6	563121	563126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14488	NC_005296	CG	3	6	563157	563162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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