MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_005296	GC	3	6	523691	523696	0 %	0 %	50 %	50 %	39933550
13502	NC_005296	CCG	2	6	523756	523761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933550
13503	NC_005296	GC	3	6	523885	523890	0 %	0 %	50 %	50 %	39933550
13504	NC_005296	GC	3	6	523901	523906	0 %	0 %	50 %	50 %	39933550
13505	NC_005296	GAA	2	6	523947	523952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933550
13506	NC_005296	GCA	2	6	524021	524026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933550
13507	NC_005296	AGC	2	6	524062	524067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933550
13508	NC_005296	GC	3	6	524072	524077	0 %	0 %	50 %	50 %	39933550
13509	NC_005296	CAG	2	6	524085	524090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933550
13510	NC_005296	GCACCA	2	12	524093	524104	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	39933550
13511	NC_005296	GAG	2	6	524148	524153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933550
13512	NC_005296	GTG	2	6	524155	524160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933550
13513	NC_005296	GCG	2	6	524192	524197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933550
13514	NC_005296	AGC	3	9	524206	524214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933550
13515	NC_005296	GACA	2	8	524245	524252	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13516	NC_005296	GCG	2	6	524294	524299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_005296	ACG	2	6	524318	524323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_005296	ATC	2	6	524355	524360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_005296	CGC	2	6	524367	524372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13520	NC_005296	TGGC	2	8	524392	524399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13521	NC_005296	CGC	2	6	524437	524442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_005296	CG	3	6	524459	524464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13523	NC_005296	CCGG	2	8	524465	524472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13524	NC_005296	GCC	2	6	524475	524480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13525	NC_005296	GCG	2	6	524571	524576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933551
13526	NC_005296	GGCT	2	8	524600	524607	0 %	25 %	50 %	25 %	39933551
13527	NC_005296	TCGCC	2	10	524683	524692	0 %	20 %	20 %	60 %	39933551
13528	NC_005296	CCG	2	6	524709	524714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933551
13529	NC_005296	CGC	2	6	524722	524727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933551
13530	NC_005296	AGC	2	6	524792	524797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933551
13531	NC_005296	CGG	2	6	524838	524843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933551
13532	NC_005296	CGA	2	6	524895	524900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933551
13533	NC_005296	GGAGCT	2	12	524902	524913	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	39933551
13534	NC_005296	GCTG	2	8	524917	524924	0 %	25 %	50 %	25 %	39933551
13535	NC_005296	CGC	2	6	524938	524943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933551
13536	NC_005296	TGG	2	6	525021	525026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933551
13537	NC_005296	GAA	2	6	525034	525039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933551
13538	NC_005296	CGA	2	6	525045	525050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933551
13539	NC_005296	GC	4	8	525063	525070	0 %	0 %	50 %	50 %	39933551
13540	NC_005296	CGG	2	6	525102	525107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933551
13541	NC_005296	CGG	2	6	525138	525143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933551
13542	NC_005296	CGC	2	6	525148	525153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933551
13543	NC_005296	GCCG	2	8	525169	525176	0 %	0 %	50 %	50 %	39933551
13544	NC_005296	GGC	2	6	525198	525203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933551
13545	NC_005296	CGGCGA	2	12	525238	525249	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39933551
13546	NC_005296	TGTGG	2	10	525322	525331	0 %	40 %	60 %	0 %	39933551
13547	NC_005296	TGA	2	6	525372	525377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933551
13548	NC_005296	GCC	2	6	525390	525395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933551
13549	NC_005296	CAG	2	6	525413	525418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933551
13550	NC_005296	CG	3	6	525428	525433	0 %	0 %	50 %	50 %	39933551
13551	NC_005296	CGG	2	6	525478	525483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_005296	CGC	2	6	525498	525503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13553	NC_005296	TCGCG	2	10	525517	525526	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13554	NC_005296	CAA	2	6	525544	525549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_005296	CTG	2	6	525585	525590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933552
13556	NC_005296	GCC	2	6	525705	525710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933552
13557	NC_005296	GTG	2	6	525792	525797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933552
13558	NC_005296	CG	3	6	525985	525990	0 %	0 %	50 %	50 %	39933552
13559	NC_005296	GGT	3	9	526001	526009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933552
13560	NC_005296	GCC	3	9	526014	526022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933552
13561	NC_005296	TCGG	2	8	526026	526033	0 %	25 %	50 %	25 %	39933552
13562	NC_005296	TCG	2	6	526039	526044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933552
13563	NC_005296	CGT	2	6	526073	526078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933552
13564	NC_005296	CGG	2	6	526088	526093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933552
13565	NC_005296	CTGG	2	8	526109	526116	0 %	25 %	50 %	25 %	39933552
13566	NC_005296	GC	3	6	526159	526164	0 %	0 %	50 %	50 %	39933552
13567	NC_005296	TGCG	2	8	526177	526184	0 %	25 %	50 %	25 %	39933552
13568	NC_005296	CGG	2	6	526223	526228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933552
13569	NC_005296	GCCT	2	8	526242	526249	0 %	25 %	25 %	50 %	39933552
13570	NC_005296	CTG	2	6	526280	526285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933552
13571	NC_005296	CG	3	6	526330	526335	0 %	0 %	50 %	50 %	39933552
13572	NC_005296	CGA	2	6	526409	526414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933552
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13575	NC_005296	CTG	2	6	526581	526586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13576	NC_005296	CCG	2	6	526672	526677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13577	NC_005296	GCG	2	6	526748	526753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_005296	GTC	2	6	526807	526812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13579	NC_005296	GGC	2	6	526865	526870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_005296	TCGG	2	8	527081	527088	0 %	25 %	50 %	25 %	39933553
13581	NC_005296	GGC	2	6	527119	527124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933553
13582	NC_005296	CGA	2	6	527164	527169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933553
13583	NC_005296	CGT	2	6	527257	527262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933553
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13587	NC_005296	CTG	2	6	527390	527395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933553
13588	NC_005296	GAT	2	6	527449	527454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933553
13589	NC_005296	CAA	2	6	527467	527472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933553
13590	NC_005296	GTC	2	6	527473	527478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933553
13591	NC_005296	GAT	2	6	527480	527485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933553
13592	NC_005296	ACG	2	6	527505	527510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933553
13593	NC_005296	CAA	3	9	527512	527520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933553
13594	NC_005296	ACT	2	6	527526	527531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933553
13595	NC_005296	CAC	2	6	527557	527562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933553
13596	NC_005296	TGC	2	6	527574	527579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933553
13597	NC_005296	GCA	2	6	527590	527595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933553
13598	NC_005296	ACCGCG	2	12	527606	527617	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39933553
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13600	NC_005296	TGA	2	6	527754	527759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933553
13601	NC_005296	TAA	2	6	527824	527829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	39933553
13602	NC_005296	CAC	2	6	527865	527870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933553
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13604	NC_005296	CGA	2	6	527905	527910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933553
13605	NC_005296	ACC	2	6	528023	528028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933553
13606	NC_005296	AAG	2	6	528059	528064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933553
13607	NC_005296	AAG	2	6	528209	528214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933553
13608	NC_005296	CG	3	6	528226	528231	0 %	0 %	50 %	50 %	39933553
13609	NC_005296	CCG	2	6	528276	528281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13610	NC_005296	GCCG	2	8	528324	528331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13611	NC_005296	CAC	2	6	528358	528363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13612	NC_005296	AGG	2	6	528367	528372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_005296	CG	3	6	528418	528423	0 %	0 %	50 %	50 %	39933554
13614	NC_005296	GCG	2	6	528448	528453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933554
13615	NC_005296	GCT	2	6	528485	528490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933554
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13618	NC_005296	GGC	2	6	528615	528620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933554
13619	NC_005296	CGG	2	6	528638	528643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933554
13620	NC_005296	CGGC	2	8	528646	528653	0 %	0 %	50 %	50 %	39933554
13621	NC_005296	CGGG	2	8	528664	528671	0 %	0 %	75 %	25 %	39933554
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13988	NC_005296	CG	3	6	542879	542884	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568
13989	NC_005296	GTC	2	6	542901	542906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933568
13990	NC_005296	GAT	2	6	542910	542915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933568
13991	NC_005296	GCA	2	6	542930	542935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933568
13992	NC_005296	CGT	2	6	542936	542941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933568
13993	NC_005296	CG	3	6	542956	542961	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568
13994	NC_005296	GC	4	8	543040	543047	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568
13995	NC_005296	CGA	2	6	543167	543172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933568
13996	NC_005296	TCACC	2	10	543173	543182	20 %	20 %	0 %	60 %	39933568
13997	NC_005296	GGC	2	6	543224	543229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933568
13998	NC_005296	CGA	2	6	543254	543259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933568
13999	NC_005296	ATTT	2	8	543296	543303	25 %	75 %	0 %	0 %	39933568
14000	NC_005296	CG	3	6	543311	543316	0 %	0 %	50 %	50 %	39933568

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